Pluripotent stem cells (PSCs) have enormous potential in the biomedical sciences because they can grow continuously and differentiate into any kind of cell in the body. However, for future application in regenerative medicine, it is still a challenge to control the differentiation of PSCs without using genetic materials. To control the differentiation of PSCs, small molecules might be the best substitute for genetic materials considering the following advantages: small size, which enables penetration of plasma membrane; easy-to-modify structure; and low chance of genetic recombination in treated cells. Herein, we introduce small molecules that induce the neuroectodermal differentiation of mouse embryonic stem cells (ESCs). The small molecules were identified via ESC-based consecutive screenings of small-molecule libraries composed of 324 natural compounds or 93 selected drugs. The natural compounds discovered in the first screening were used to select 93 structurally similar drugs out of 1,200 approved drugs. In the second screening, among the 93 compounds, we found 4 drugs that induced the neuroectodermal differentiation of ESCs. These drugs were progesteroneor corticoid-derivatives. Our results suggest that small molecules targeting the progesterone receptor or glucocorticoid receptor could be used as chemical tools to induce the differentiation of PSCs into a specific germ lineage.
Ran is a small GTP-binding protein that binds and subsequently hydrolyzes GTP. The functions of Ran in nuclear transport and mitotic progression are well conserved in plants and animals. In animal cells, stress treatments cause Ran relocalization and slowing of nuclear transport, but the role of Ran proteins in plant cells exposed to stress is still unclear. We have therefore compared Ran genes from three EST libraries construed from different cell types of sweetpotato and the distribution pattern of Ran ESTs differed according to cell type. We further characterized two IbRan genes. IbRan1 is a specific EST to the suspension cells and leaf libraries, and IbRan2 is specific EST to the root library. IbRan1 showed 94.6 % identity with IbRan2 at the amino acid level, but the C-terminal region of IbRan1 differed from that of IbRan2. These two genes showed tissue-specific differential regulation in wounded tissues. Chilling stress induced a similar expression pattern in both IbRan genes in the leaves and petioles, but they were differently regulated in the roots. Hydrogen peroxide treatment highly stimulated IbRan2 mRNA expression in the leaves and petioles, but had no significant effect on IbRan1 gene expression. These results showed that the transcription of these two IbRan genes responds differentially to abiotic stresses and that they are subjected to tissue-specific regulation. Plant Ran-type small G-proteins are a multigenic family, and the characterization of each Ran genes under various environmental stresses will contribute toward our understanding of the distinctive function of each plant Ran isoform.
한 책, 한 도시' 독서운동은 금세기 공공도서관에서 시도된 대표적인 성공사례로 평가되고 있다. 이 연구의 목적은 우리나라 '한 책, 한 도시' 운동의 현단계를 점검하고 이 운동이 정착될 수 있는 실천적인 방안을 모색하는 것이다. 이를 위해 연구자는 부산에서 5년째 시도되고 있는 '원북원부산' 운동에 대한 사례연구를 수행하여, 이 운동의 현상과 전개과정에 대해 구체적이고 심층적으로 파악하였다. 연구의 결과, 원북원부산운동은 한국의 대도시 부산에서 지속적으로 전개되어 시민들에게 점차 인지도가 높아지고 있고 현재 공공도서관 주도로 진행되고 있어 전반적으로 긍정적 효과를 내고는 있으나, 기획 도서선정 프로그램 운영 홍보 등 여러 측면에서 여전히 한계를 가지고 있음이 제시되었다. 이를 바탕으로 이 논문에서는 한국 사회에 적합한 '한 책, 한 도시' 운동의 발전전략을 제안하였다.
2013년 일본 서점기업 CCC가 다케오시립도서관의 지정관리자로서 도서관의 관리 운영을 수탁하였다. 관내에 상업시설을 병설하고 독자적인 분류체계를 사용하는 등 도서관 운영 및 공간구성을 종래의 공공도서관과 달리 하고, 재개관 첫 해 기존의 약 3.7배에 달하는 방문이용자를 동원하면서 일본과 국내 언론의 화제를 모았다. 본 연구에서는 다케오시립도서관에 대하여 문헌조사, 신문기사 내용분석, 인터뷰 조사를 수행함으로써 서점기업이 공공도서관을 위탁운영하게 된 배경과 언론이 어떠한 관점에서 다케오시립도서관을 논하고 있는지 이해하고자 하였다. 연구 결과, 신문기사들은 소도시 주민에게 도서관을 매개로 '복합문화공간'을 제공한 점, 방문자가 증가한 점, 지역경제 효과가 발생한 점은 긍정적으로 평가하였나, 운영적자가 계속되고 장서구입과정에 문제가 발생한 점은 한계로 평가하고 있음을 확인하였다.
본 연구는 2004년에서 2012년까지 9년간의 KERIS 문헌복사 트랜잭션 데이터를 대상으로 문헌복사 서비스 참여기관에 대한 통계 분석과 네트워크 분석을 수행하였다. 연구 결과 발견한 주요 사실은 다음과 같다. 첫째, 신청건수가 제공건수에 비해 많은 기관이 전체 기관 중에서 약 80%를 차지하고 있었다. 둘째, 신청과 제공면 모두 건수가 많은 상위기관들에게 문헌복사 서비스 의존도가 높으며, 특히 제공면에서 그 집중도가 더욱 높았다. 셋째, 2012년 대학도서관 학술지를 대상으로 주제별 네트워크 분석 결과 각 주제별로 단일기관 집중형, 복수기관 주도형, 다수기관 분산형과 같은 세 가지 유형의 협력체제가 나타남을 파악하였다.
A positional scanning synthetic peptide combinatorial library (PS-SCL) was screened in order to identify antimicrobial peptides against the cariogenic oral bacteria, Streptococcus mutans. Activity against Streptococcus gordonii and Aggregatibacter actinomycetemcomitans was also examined. The library was comprised of six sub-libraries with the format $O_{(1-6)}XXXXX-NH_2$, where O represents one of 19 amino acids (excluding cysteine) and X represents equimolar mixture of these. Each sub-library was tested for antimicrobial activity against S. mutans and evaluated for antimicrobial activity against S. gordonii and A. actinomycetemcomitans. The effect of peptides was observed using transmission electron microscopy (TEM). Two semi-mixture peptides, RXXXXN-$NH_2$ (pep-1) and WXXXXN-$NH_2$ (pep-2), and one positioned peptide, RRRWRN-$NH_2$ (pep-3), were identified. Pep-1 and pep-2 showed significant antimicrobial activity against Gram positive bacteria (S. mutans and S. gordonii), but not against Gram negative bacteria (A. actinomycetemcomitans). However, pep-3 showed very low antimicrobial activity against all three bacteria. Pep-3 did not form an amphiphilic ${\alpha}$-helix, which is a required structure for most antimicrobial peptides. Pep-1 and pep-2 were able to disrupt the membrane of S. mutans. Small libraries of biochemically-constrained peptides can be used to generate antimicrobial peptides against S. mutans and other oral microbes. Peptides derived from such libraries may be candidate antimicrobial agents for the treatment of oral microorganisms.
Nam, Bo-Hye;Park, Eun-Mi;Kim, Young-Ok;Kim, Dong-Gyun;Jee, Young-Ju;Lee, Sang-Jun;An, Cheul Min
한국패류학회지
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제29권3호
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pp.181-187
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2013
In order to investigate environmental stress inducible genes in abalone, we analyzed differentially expressed transcripts from a Pacific abalone, Haliotis discus hannai, after exposure to heat-, cold- or hyposalinity-shock by suppression subtractive hybridization (SSH) method. 1,074 unique sequences from SSH libraries were composed to 115 clusters and 986 singletons, the overall redundancy of the library was 16.3%. From the BLAST search, of the 1,316 ESTs, 998 ESTs (75.8%) were identified as known genes, but 318 clones (24.2%) did not match to any previously described genes. From the comparison results of ESTs pattern of three SSH cDNA libraries, the most abundant EST was different in each SSH library: small heat shock protein p26 (sHSP26) in heat-shock, trypsinogen 2 in cold-shock, and actin in hyposalinity SSH cDNA library. Based on sequence similarities, several response-to-stress genes such as heat shock proteins (HSPs) were identified commonly from the abalone SSH libraries. HSP70 gene was induced by environmental stress regardless of temperature-shock or salinity-stress, while the increase of sHSP26 mRNA expression was not detected in cold-shock but in heat-shock condition. These results suggest that the suppression subtractive hybridization method is an efficient way to isolate differentially expressed gene from the invertebrate environmental stress-response transcriptome.
순천만 갯벌의 세균 군집의 다양성을 조사하기 위해 16S rDNA의 다양성을 조사하였다. 갯벌로부터 전체 핵산을 분리한 후, 세균에 상보적인 universal primer로 증폭된 16S rDNA로부터 클론 라이브러리를 만들었다. 총 111개의 클론으로부터 HaeIII를 이용하여 amplified rDNA restriction analysis (ARDRA)를 수행하고, Gelcompar II 프로그램을 이용하여 pattern을 clustering하였다. 111개의 클론 중 100가지의 서로 다른 RFLP type이 조사되었고, 이들 중 전체 클론 라이브러리를 대표할 수 있는 20개의 클론을 선별하여 부분적인 염기서열을 분석하여 세균 다양성을 분석하였다. 20개의 클론중에는 RDP와 GenBank에서 제공하는 small subunit RNA database와 동일한 클론은 존재하지 않았으며, 이미 알려진 배양 가능한 세균의 16S rRNA 염기서열과 비교 하였을때 77∼96.8%의 유사도를 보였다. 또한 이들 20개의 클론은 alpha-, delta-, gamma-Proteobacteria, low G+C Gram positive bacteria, high G+C Gram positive bacteria, Sphingobacteria (Cytophaga); Cyanobacteria (Chloroplast)등 주요한 7개 lineage에 속했으며, 클론들 중 Proteobacteria가 우점종을 차지하고 있었다.
The aim of this study was to identify community-level childcare infrastructure for infants and toddlers and to use the data to categorize community types using K-Means cluster analysis with spatial constraints. Seven indicators of childcare resource supply were used for the purpose of categorization and the results revealed six types of community cluster. Communities in the Type 1 cluster provided sufficient parks, libraries, and kindergartens, but lacked pediatric facilities and private education institutions. This cluster comprised small cities and rural areas in Gangwon-do, Gyeongsangbuk-do, Chungcheongbuk-do, and Jeollabuk-do. The Type 2 cluster had numerous pediatric facilities and childcare centers, but lacked other childcare infrastructure. This comprised small and medium-sized cities in Gyeonggi-do, some areas in Chungcheongnam-do, Chungcheongbuk-do, and Gangwon-do bordering Gyeonggi-do. The Type 3 cluster comprised Busan, Daegu, and Gyeongsangnam-do, but had insufficient childcare infrastructure as a whole. Type 4 had the largest number of childcare centers, libraries, and private education institutions and comprised Jeollabuk-do, areas near Gwangju, and Jeju-do. Type 5, consisting of Seoul, Incheon and the southern part of Gyeonggi-do had many pediatric facilities and certified childcare centers, but lacked other childcare infrastructure. Type 6, being the rural areas and islands in Jeollanam-do, had sufficient kindergartens, but other infrastructure was insufficient. These results are expected to provide local government with policy implications in terms of relieving the childcare burden on residents with infants and toddlers.
중 대형 도서관에는 상당히 많은 양의 도서 및 미디어 관리대상이 있어 이를 효율적으로 관리하는 것이 쉽지 않다. 최근 마그네틱이나 바코드를 대신하여 RFID 기술을 적용하고 있으나 아직까지는 단순한 도서관리나 도난망지용으로만 한정되어 사용되고 있다. 최근 RFID 및 USN 기술의 발전으로 인하여 다양한 산업분야에서 이를 응용한 시스템이 활용되고 있고 기술적 한계를 좁혀감에 따라 도서관에서 효율적으로 도서를 관리할 수 있는 시스템에 대하여 연구하였다. 본 논문에서 제안하는 지능형 도서관리 시스템은 상기 기술을 적용하여 보다 효율적인 도서관리 체계와 사용자에게 다양한 컨텐츠와 편리성을 제공할 수 있는 시스템을 개발하여 기존의 도서관리 시스템의 단순관리 작업을 보다 다양하게 활용할 수 있는 지능형 도서관리 시스템을 개발하였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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