• Environmental Analysis Health and Toxicology
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• 제26권
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• pp.5.1-5.11
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• 2011

Objectives: In order to identify the possibility of slender bitterling (SB) (Acheilognathus yamatsutae) being used as a test species for estrogenic endocrine disrupting chemicals (EEDCs), we carried out the cloning and sequence characterization of the estrogen receptor (ER). Methods: The ER from a slender bitterling was obtained by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR), 5'- and 3'-rapid amplification of cDNA ends (5'-RACE and 3'-RACE) and T-vector cloning. The expression of ER mRNA was also analyzed in six tissues (brain, liver, kidney, gill, gonad, and intestines) by real-time PCR. Results: We obtained an ER from the slender bitterling. The SB ER cDNA was 2189 base pairs (bp) in length and contained a 1707 bp open reading frame that encoded 568 amino acid residues. The SB ER amino acid sequence clustered in a monophyletic group with the $ER{\alpha}$ of other fish, and was more closely related to zebrafish $ER{\alpha}$(88% identity) than to the $ER{\alpha}$ of other fish. The SB ER cDNA was divided into A/B, C, D, E and F domains. The SB ER has conserved important sequences for ER functions, such as the DNA binding domain (D domain), which are consistent with those of other teleosts. Conclusions: The ER of the slender bitterling could provide basic information in toxicological studies of EEDCs in the slender bitterling.

• 한국어류학회지
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• 제22권2호
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• pp.115-120
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• 2010

납자루 Acheilognathus lanceolatus의 유전 변이와 집단 구조를 알아보기 한국의 5개 집단(한강과 금강, 동진강, 섬진강, 낙동강)과 일본의 1개 집단(Katsura River)을 대상으로 AFLP 분석을 수행하였다. 5개의 선택적 프라이머 조합에 의 해 검출된 집단별 유효 밴드의 수는 345~374개였으며, 다형성 밴드 수는 55 (15.0%)~131 (24.9%)개였다. 평균 유전적 다양성은 낙동강 집단이 가장 높은 값을 보였고 한강 집단이 가장 낮은 값을 보였다. 계통도 상에서 각 수계별로 채집된 개체는 각 집단별로 함께 분기하으며, 이들은 높은 bootstrap 값으로 지지되는 2개의 단계통군 또는 집단 그룹으로 나누어졌다. 한편 유전적 분화도($F_{ST}$)는 모든 집단 간에 유의적 차이를 보였다(P<0.01). 집단 그룹 간의 유전적 변이 수준을 알아보기 위해 AMOVA 분석을 실시한 결과 총 25.49%의 변이(P<0.01)을 보여 이들 집단 그룹은 유전적으로 명확히 구분되었다.