• 제목/요약/키워드: Simplex

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볼락류 Sebastes spp.에 있어서 선충류 아니사키스 유충의 감염 (Infection of Parasitic Anisakis Type Larvae (Nematoda) from Some Rockfishes, Sebastes spp.)

  • Chun, Kae-Shik
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제17권4호
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    • pp.206-209
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    • 2002
  • 2002년 2월부터 3월까지 오레건 주에 위치한 오레건 해안 수조와 뉴포트 어시장으로부터 16마리의 볼락류 Sebastes spp.를 채집하여 검사한 결과, 3종의 볼락류로부터 총 157개체의 아니사키스 유충이 검출되었으며 50.0%의 감염률을 나타내었다. 3종의 볼락류인 Sebastes flavidus, S. crameri, S. pinniger로부터 Anisakis simplex유충 110 개체, Contracaecum app. 유충 30개체 그리고 Pseudoteryanova decipiens 유충 17개체가 각각 검출되었다. 아니사키스 유충의 감염부위는 장관, 장간막과 위벽이었다. A. simplex 유충은 S. crameri에서 60%, S. flavidus와 S. pinniger에서 각각 33.3%의 감염률을 나타내었다. Contracaecum spp. 유충과 P. decipiens 유충은 S. pinniger에서 33.3%의 감염률을 나타내었다. A. simplex 유충의 감염강도는 5. flavidus, S. crameri 그리고 S. pinniger에서 1에서 87이었고 Contracaecum spp.유충과 P. decipiens 유충은 S. pinniger에서 0에서 30까지 나타내었다.

그리드 단체 위의 디리슐레 분포에서 마르코프 연쇄 몬테 칼로 표집 (MCMC Algorithm for Dirichlet Distribution over Gridded Simplex)

  • 신봉기
    • 정보과학회 컴퓨팅의 실제 논문지
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    • 제21권1호
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    • pp.94-99
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    • 2015
  • 비모수 베이스 통계학, 확률적 표집에 기반한 추론 등이 기계학습의 주요 패러다임으로 등장하면서 디리슐레(Dirichlet) 분포는 최근 다양한 그래프 모형 곳곳에 등장하고 있다. 디리슐레 분포는 일변수 감마 분포를 벡터 분포로 확장한 형태의 하나이다. 본 논문에서는 감마 분포를 갖는 임의의 자연수 X를 K개의 자연수의 합으로 임의 분할 할 때 각 부분의 크기 비율을 디리슐레 분포에서 표집하는 방법을 제안한다. 일반적으로 디리슐레 분포는 연속적인 (K-1)-단체(simplex) 위에 정의 되지만 자연수로 분할하는 표본은 자연수라는 조건 때문에 단체 내부의 이산 그리드 점에만 정의된다. 본 논문에서는 단체 위의 그리드 상의 이웃 점들의 확률 분포로부터 마르코프연쇄 몬테 칼로(MCMC) 제안 분포를 정의하고 일련의 표본들의 마르코프 연쇄를 구현하는 알고리듬을 제안한다. 본 방법은 마르코프 모델, HMM 및 준-HMM 등에서 각 상태별 시간 지속 분포를 표현하는데 활용 가능하다. 나아가 최근 제안된 전역-지역(global-local) 상태지속 분포를 동시에 모형화하는 감마-디리슐레 HMM에도 응용가능하다.

고래회충유충증 감별 진단을 위한 18S ribosomal DNA (rDNA) PCR-RFLP 법 적용 (Application of the 18S Ribosomal DNA (rDNA) PCR-RFLP Technique for the Differential Diagnosis of Anisakidosis)

  • 김선미;조민경;유학선;차희재;옥미선
    • 생명과학회지
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    • 제19권9호
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    • pp.1328-1332
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    • 2009
  • 고래회충유충증은 해산어류에 기생하는 고래회충과(family Anisakidae)에 속하는 선충류 유충에 의한 질병으로 유충의 직접적인 위장관내 침입으로 인한 병변과 더불어 유충의 분비 배설물에 의한 알레르기 질환도 유발될 수 있다. 고래회충유충증은 A. simplex를 비롯하여 Contracaecum, Pseudoterranova, Hysterothylacium 등의 유충에 의해 야기될 수 있으나 이들에 대한 형태학적 감별 진단은 유충의 형태적 유사성으로 인하여 매우 어려운 경우가 많다. 이러한 형태학적 진단의 어려움을 극복하고 분자생물학적 감별진단 방법을 확립하기 위하여 A. simplex, Contracaecum type A. type C' 및 Goezia 유충을 숭어, 도다리, 고등어, 아나고, 참돔 등 5종의 어류에서 분리하였다. 각각의 유충으로부터 분리한 18S rDNA를 PCR로 증폭한 후 Taq 1, Hinf I, Hha I, Alu 1, Dde I, Hae III, Sau 96I, Sau 3AI 등 8종의 제한효소를 사용하여 PCR-RFLP를 시행하였다. PCR product의 크기는 약 2.0 Kb였으며 Hinf l, Alu 1, Hha I, Dde 1 및 Hae III로 A. simplex와 Contracaecum type C'을 구분할 수 있었다. 그러나 Contracaecum type A의 경우에는 Taq I, Hinf I, Alu I 및 Dde I의 경우에는 2가지 패턴으로 나타났으며 이들 가운데 일부는 A. simplex, Contracaecum type C', 및 Goezia와 동일한 분석 패턴을 보이기도 하였다. Goezia는 사용한 8개의 제한 효소 모두에서 A. simplex 및 Contracaecum type A 및 type C'과 각기 다른 양상을 보였다. 이러한 결과로 18S rDNA PCR-RFLP 방법은 A. simplex와 Contracaecum type C'의 감별 진단에 유용한 것으로 밝혀졌으며, Contracaecum type A의 분류에는 제한적으로 사용되어야 함은 물론 형태학적 분류 기준에 대한 재검토가 뒤따라야 할 것으로 사료되었다.

자연산 조피볼락, Sebastes schlegeli의 소화관에 기생하는 Hysterothylacium sp.와 Anisakis simplex (Nematoda: Anisakidae)의 형태학적 비교 및 숙주의 조직병리학적 반응 (Morphological Comparison Hysterothylacium sp. and Anisakis simplex (Nematoda: Anisakidae) from Wild Black Rockfish, Sebastes schlegeli, and Histopathological Host Reaction)

  • 박정준;박명애;최혜승;김석렬
    • Applied Microscopy
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    • 제41권3호
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    • pp.205-213
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    • 2011
  • 조피볼락, Sebastes schlegeli 소화관 주변에는 다수의 아니사키 스가 기생하고 있었으며, 몇몇 개체들은 간의 표면에 존재하고 있었다. 유전학적 결과 조피볼락에 기생한 아니사키스는 3종으로 분석되었으며, Hysterothylacium sp.가 가장 많이 분포하고 있었다. Hysterothylacium sp.는 Anisakis simplex보다 짧고 가늘었다. 두 종 모두 전방부분에는 lip, 입, 신경환, 분비공, 분비관이 관찰되었다. 두 종 모두 중간부분에는 식도, 위, 장이 존재하고 있었 지만, intestinal ceacum과 ventricular appendage는 Hysterothylacium sp.에서만 관찰되었다. Hysterothylacium sp.의 후방부분 끝에는 conical nodulose apex이 관찰되었지만, A. simplex의 후방부분 끝에는 spine이 관찰되었다. SEM으로 관찰한 결과 Hysterothylacium sp.의 입 주위에는 3개의 lip이 존재하고 있었는데, dorsal lip은 넓이 65 ${\mu}m$ 내외였고, 한쌍의 lateroventral lip은 넓이 60 ${\mu}m$ 내 외였다. Lip의 표면에는 넓이 8 ${\mu}m$ 내외의 유두돌기 한쌍이 존재하고 있었다. Hysterothylacium sp.와 A. simplex의 충체 넓이는 각각 480 ${\mu}m$와 900 ${\mu}m$ 내외로 측정되었다. Hysterothylacium sp. 의 lateral alae는 높이 7 ${\mu}m$ 내외였으며, cornical nodulose apex에 존재하는 돌기는 지름 약 3.3 ${\mu}m$였다. A. simplex의 후방부분 끝 에는 높이 약 20 ${\mu}m$의 spine이 관찰되었다. 조피볼락 장의 내강 에 존재하는 아니사키스들은 대부분 Hysterothylacium sp.였고, 점막주름 근처 혹은 점막하층에 기생하고 있었다. 아니사키스의 기생으로 인하여 숙주의 점막상피에는 다수의 점액세포가 증가하였다.

제주도에서 채집한 해양 해면, Asteropus simplex의 공생세균에 관한 계통학적 분석 (Phylogenetic Analysis of Bacterial Diversity in the Marine Sponge, Asteropus simplex, Collected from Jeju Island)

  • 정인혜;박진숙
    • 미생물학회지
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    • 제48권4호
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    • pp.275-283
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    • 2012
  • 해양 해면 Asteropus simplex를 제주도에서 채집하여 배양에 의한 RFLP와 비배양에 의한 DGGE 분석 방법에 의해 세균군집 구조를 조사하였다. 16S rDNA-RFLP 분석을 위해 변형된 Zobell 배지와 MA를 이용하여 120균주를 선별하고 제한효소, HaeIII와 MspI을 사용하여 각각의 다른 RFLP 패턴으로 구분하였다. RFLP 패턴으로부터 유래한 16S rDNA 염기서열 분석결과, 알려진 세균 종과 94% 이상의 유사도를 나타내었으며 Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, 5개의 문이 관찰되었다. 그 중 Gammaproteobacteria가 우점하였다. 같은 해면, A. simplex의 DGGE 분석을 위해 total genomic DNA로부터 16S rDNA를 증폭하여 DGGE fingerprinting을 수행한 결과 12개의 서로 다른 밴드가 관찰되었다. 각 밴드의 16S rDNA 염기서열은 알려진 세균의 염기서열과 90% 이상의 유사성을 나타내었으며 대부분의 염기서열은 uncultured bacteria에 속하였다. DGGE 분석으로부터 미생물의 군집은 Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Deltaproteobacteria, Actinobacteria, Chloroflexi, Nitrospira, 7개의 문으로 나타났다. RFLP와 DGGE 방법에 의해 Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Actinobacteria가 공통적으로 발견되었으나 전체적인 공생세균의 군집구조는 분석방법에 따른 차이를 나타내었다. 배양에 의한 방법보다 비배양 방법에서 더 다양한 세균군집구조를 나타내었다.

실측(實測)에 의한 『방약합편(方藥合編)』 환제(丸劑)의 복용량에 관한 연구 (Measuring a Dosage of Pills Type Medicine in Bangyakhappyun)

  • 안동선;박용수;이동혁;박진형;남빛누리;김윤경;이장천;이부균
    • 대한한의학방제학회지
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    • 제22권2호
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    • pp.77-85
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    • 2014
  • Objectives : To determine a dose of medicine precisely and conveniently, this study was tried to specify the weight of Bangyakhappyun pills by measuring in terms of grams. Methods : 1. Selected typical prescriptions in order of size and formula written down in Bangyakhappyun. 2. Pulverized each medicine in prescription and weighed one Bangchonbi(方寸匕). 3. Weighed the 10 seeds of Firmiana simplex sized one(梧子大) which were mixed with auxiliary materials such as water, honey, starch paste, etc. 4. The dosages of other type forms were measured based on the weigh of 10 seeds of Firmiana simplex sized one(梧子大). Results : 1. A well-used size of pills is Firmiana simplex sized one(梧子大) 2. Honey and starch paste are typical auxiliary materials for formulating pills. 3. A weigh of starch paste based 10 seeds of Firmiana simplex sized one(梧子大) ranged between 1.09g and 2.55g. 4. A weigh of honey based 10 seeds of Firmiana simplex sized one(梧子大) ranged between 1.18g and 2.77g. Conclusions : A dosage of each prescription can be calculated in terms of grams. 1. In case of Firminia simplex sized one(梧子大) with paste, a daily dose is 5.28g to 17.8g. 2. In case of Firminia simplex sized one(梧子大) with honey, a daily dose is 11.8g to 17.3g. 3. The dosage of pills with toxic herb and mineral medicinal material for baby is the least amount of 0.017g. 4. The dosage of most tonifying medicinals are over 10g. Table 3. shows more details.

Herpes simplex 바이러스의 유전학적 특성에 관한 연구 (Study or The Genetic Characteration of Herpes Simplex Virus)

  • 강봉주;최환수;최선미;신현규;조동욱;박갑주
    • 한국한의학연구원논문집
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    • 제1권1호
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    • pp.477-493
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    • 1995
  • In order to facilitate the molecular characterization of the Herpes simplex Virus types 1 and types 2 genome DNAs, a gene library of cloned restriction frtgments have been produced. The Vero cells were infected with HSV-1 and HSV-2. 48 hours after infection, the infected cells Ivere Iysed, and multinucleated giant cells were observed approximately at seventy-two hours postinfection. The multiplication of HSV-1 and HSV-2 was observed in Vero cells using electromicroscopy. The nucleocapsids in nuclei were obseryed, and the assembled virions were budded out through the vacuole, and the virions were released from the cells. HSV-1 and HSV-2 was analyzed by digestion of their genome DANs with restriction ensymes. HSV-1 and HSV-2 genome DNAs were digested with BarnHI, Bgfl respectively. The BarnHI rlestriction fragments of HSV-1 and HSV-2 genome DNAs were twenty-seven fragments and thair molecular sizes were ranging $0.70{\sim}15.08$, $4.4{\sim}31.0$ tilobases. The BglII restriction fragments of HSV-1 and HSV-2 genome DNAs were sixteen, eighteen fragments and thair molecular sizes were ranging $4.8{\sim}30.0$, $1.2{\sim}25.0$ kilobases. And then BglII restriction frgments were cloned in Escherichia coli(E.coil) using the plasmid vector pBacPAK9.

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해상 실측 자료를 이용한 횡동요 조종 계수 식별 (Parameter Identifications of Roll Maneuvering Coefficients Based on Sea Trial Data)

  • 김찬기
    • 대한조선학회논문집
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    • 제35권2호
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    • pp.29-37
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    • 1998
  • 물수체의 선형 운동방정식은 형상 설계와 제어기 설계의 지배방정식으로 사용되는 중요한 설계인자이다. 그러나, 경험식, 이론적 계산 및 모형 시험으로부터 획득한 운동방정식 내의 조종 계수들은 오차를 포함하고 있어 해상 시험을 동해 이에 대한 검증을 수행하여야 한다. 본 연구에서는 실측 자료에 대해 병렬 확장 칼만 필터, Nelder & Mead Simplex 탐색법 및 유전적 알고리즘을 적용하여 몰수체의 주요 횡 동요 계수들을 식별/비교하였다. 결론적으로 Nelder & Mead Simplex 탐색법이 사용된 수학 모형과 해상 시험 자료에 대해 가장 만족스런 결과를 주고 있다.

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State Machine and Downhill Simplex Approach for Vision-Based Nighttime Vehicle Detection

  • Choi, Kyoung-Ho;Kim, Do-Hyun;Kim, Kwang-Sup;Kwon, Jang-Woo;Lee, Sang-Il;Chen, Ken;Park, Jong-Hyun
    • ETRI Journal
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    • 제36권3호
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    • pp.439-449
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    • 2014
  • In this paper, a novel vision-based nighttime vehicle detection approach is presented, combining state machines and downhill simplex optimization. In the proposed approach, vehicle detection is modeled as a sequential state transition problem; that is, vehicle arrival, moving, and departure at a chosen detection area. More specifically, the number of bright pixels and their differences, in a chosen area of interest, are calculated and fed into the proposed state machine to detect vehicles. After a vehicle is detected, the location of the headlights is determined using the downhill simplex method. In the proposed optimization process, various headlights were evaluated for possible headlight positions on the detected vehicles; allowing for an optimal headlight position to be located. Simulation results were provided to show the robustness of the proposed approach for nighttime vehicle and headlight detection.

IP법을 이용한 유효전력제어에 관한 연구 (A Study on the Real Power Optimization Using Interior-Point Method)

  • 정순영;정재길;이인용;정인학;현승범
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 2000년도 하계학술대회 논문집 A
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    • pp.99-101
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    • 2000
  • Different optimization algorithms have been proposed to solve real and reactive power optimization problems. Most of all, linear programming techniques that employed a simplex method have been extensively used. But, the growth in the size of power systems demands faster and more reliable optimization techniques. An Interior Point(IP) mehod is based on an interior point approach to aim the solution trajectory toward the optimal point and is converged to the solution faster than the simplex method. This paper deals with the use of Successive Linear Programming(SLP) for the solution of the Security Constrained Economic Dispatch(SCED) problem. This problem is solved using the IP method. A comparison with simplex method shows that the interior point technique is reliable and faster than the simplex algorithm.

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