Objective: To investigate the effect of host genetics on gut microbial diversity, we performed a structural survey of the fecal microbiota of four purebred boar pig lines: Duroc, Landrace, Hampshire, and Yorkshire. Methods: The V3-V4 regions of the 16S rRNA genes were amplified and sequenced. Results: A total of 783 operational taxonomic units were shared by all breeds, whereas others were breed-specific. Firmicutes and Bacteroidetes dominated the majority of the fecal microbiota; Clostridia, Bacilli, and Bacteroidia were the major classes. Nine predominant genera were observed in all breeds and eight of them can produce short-chain fatty acids. Some bacteria can secrete cellulase to aid fiber digestion by the host. Butyric, isobutyric, valeric, and isovaleric acid levels were highest in Landrace pigs, whereas acetic and propionic acid were highest in the Hampshire breed. Heatmap was used to revealed breed-specific bacteria. Principal coordinate analysis of fecal bacteria revealed that the Landrace and Yorkshire breeds had high similarity and were clearly separated from the Duroc and Hampshire breeds. Conclusion: Overall, this study is the first time to compare the fecal microbiomes of four breeds of boar pig by high-throughput sequencing and to use Spearman's rank correlation to analyze competition and cooperation among the core bacteria.
Park, Taehwan;Im, Jintaek;Kim, A Reum;Lee, Dongwook;Jeong, Sungho;Yun, Cheol-Heui;Han, Seung Hyun
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.32
no.10
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pp.1234-1244
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2022
Oral streptococci are considered as an opportunistic pathogen associated with initiation and progression of various oral diseases. However, since the currently-available treatments often accompany adverse effects, alternative strategy is demanded to control streptococci. In the current study, we investigated whether short-chain fatty acids (SCFAs), including sodium acetate (NaA), sodium propionate (NaP), and sodium butyrate (NaB), can inhibit the growth of oral streptococci. Among the tested SCFAs, NaP most potently inhibited the growth of laboratory and clinically isolated strains of Streptococcus gordonii under anaerobic culture conditions. However, the growth inhibitory effect of NaP on six different species of other oral streptococci was different depending on their culture conditions. Metabolic changes such as alteration of methionine biosynthesis can affect bacterial growth. Indeed, NaP enhanced intracellular methionine levels of oral streptococci as well as the mRNA expression level of methionine biosynthesis-related genes. Collectively, these results suggest that NaP has an inhibitory effect on the growth of oral streptococci, which might be due to alteration of methionine biosynthesis. Thus, NaP can be used an effective bacteriostatic agent for the prevention of oral infectious diseases caused by oral streptococci.
Objective: The study was conducted to determine the effects of body weight (BW) and fiber sources on nutrient digestibility, fiber fermentation and short chain fatty acids (SCFA) concentration in different intestinal segments of growing pigs fed high-fiber diets. Methods: Nine barrows with initial BW of 25.17±0.73 kg and 9 barrows with initial BW of 63.47±2.18 kg were allotted to a duplicate 9×2 Youden Square design with 3 dietary treatments and 2 periods. The dietary treatments were formulated with 3 different high-fiber ingredients: corn bran, sugar beet pulp, and soybean hulls, respectively. Each diet was fed to 3 barrows with different stage of BW in each period. Results: There were no differences in the apparent ileal digestibility (AID) of most nutrients between pigs at different BW stages. Pigs at 60 kg had greater (p<0.05) apparent total tract digestibility (ATTD) of total dietary fiber (TDF), soluble dietary fiber (SDF) and insoluble dietary fiber (IDF), and had greater (p<0.05) hindgut disappearance of IDF and cellulose than pigs at 25 kg. The acetate, propionate and total SCFA concentrations in ileal digesta and feces of pigs at 60 kg were greater (p<0.05) than those of pigs at 25 kg. In addition, fiber sources affected (p<0.05) the AID of gross energy (GE), organic matter (OM), ether extract (EE), crude protein, SDF and hemicellulose, the hindgut disappearance and ATTD of dietary fiber components, the lactate and propionate concentrations in ileal digesta and the butyrate, valerate and total SCFA concentrations in feces. There were interactions (p<0.05) between BW and fiber sources on the AID of GE, OM, EE, SDF, hemicellulose, the ATTD of EE, TDF, and IDF, and the hindgut disappearance of SDF and hemicellulose. Conclusion: Increasing BW mainly improved the digestibility of dietary fiber fractions, and the dietary fiber sources influenced the digestibility of almost all the dietary nutrients in growing pigs.
Vafa, Toktam S.;Naserian, Abbas A.;Moussavi, Ali R. Heravi;Valizadeh, Reza;Mesgaran, Mohsen Danesh
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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v.25
no.3
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pp.311-319
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2012
This study examined the effects of supplementation of fish oil and canola oil in the diet on milk yield, milk components and fatty acid composition of Holstein dairy cows in early lactation. Eight multiparous early lactation Holstein cows ($42{\pm}12$ DIM, $40{\pm}6kg$ daily milk yield) were fed a total mixed ration supplemented with either 0% oil (Control), 2% fish oil (FO), 1% canola oil +1% fish oil (FOCO), or 2% canola oil (CO) according to a double $4{\times}4$ Latin square design. Each period lasted 3 wk; experimental analyses were restricted to the last week of each period. Supplemental oils were added to a basal diet which was formulated according to NRC (2001) and consisted of 20% alfalfa, 20% corn silage and 60% concentrate. Milk yield was similar between diets (p>0.05), but dry matter intake (DMI) was lower (p<0.05) in cows fed FO diet compared to other diets. Milk fat percentage and daily yield decreased (p<0.01) with the supplementation of fish and canola oil. The daily yield and percentage of milk protein, lactose and solids-not-fat (SNF) were not affected by diets (p>0.05). The proportion (g/100 g fatty acids) of short chain fatty acids (SCFA) decreased and polyunsaturated fatty acids (PUFA) increased (p<0.05) in milk of all cows fed diets supplemented with oil. The proportions of 6:0, 8:0, 10:0 12:0 and 14:0 fatty acids in milk fat decreased (p<0.01) for all diets supplemented with oil, but the proportions of 14:1, 16:0 and 16:1 fatty acids were not affected by diets (p>0.05). The proportion of trans(t)-18:1 increased (p<0.01) in milk fat of cows fed FO and FOCO diets, but CO diet had the highest proportion of cis(c)-11 18:1 (p<0.01). The concentration of t-10, c-12 18:2, c-9 t-11 18:2, 18:3, eicosapentaenoic acid (EPA, 20:5) and docosahexaenoic acid (DHA, 22:6) increased (p<0.05) in FO and FOCO diets in comparison with the other two diets. These data indicate that including fish oil in combination with canola oil significantly modifies the fatty acid composition of milk.
The technical feasibility of removing cholesterol from milk fat by supercritical carbon dioxide $(SC-CO_2)$ extraction followed by adsorption on different adsorbents and of fractionating milk fat into different fatty acid composition at $40^{\circ}C/276$ bar was investigated. Cholesterol could be selectively removed from milk fat by adsorption on a typical commercial florisil with $SC-CO_2$ extraction. Lower weight ratio of milk fat feed to florisil showed higher reduction of cholesterol, but gave lower yield in the milk fat fractions. The effective capacity of florisil for removing cholesterol from milk fat was 2.0g/g, which is the ratio of the fat feed to the adsorbent for 89% cholesterol reduction with a fat yield of 57.5%. Fatty acid composition showed higher short-chain and lower unsaturated long-chain fatty acids in the extracted fractions. Milk fat fractionation method by supercritical fluid extraction in coupled with adsorption would appear suitable for removing undesirable ingredients such as cholesterol and for enriching short-chain fatty acids in the fractions.
Background: Major amino acids in pig diets are Lys, Met, Thr, and Trp, but little is known about the requirements for the other essential amino acids, especially on odorous compounds and microbial characteristics in feces of growing-finishing pigs. To this end, different levels of amino acid composition added to diets to investigate the effects of amino acid composition on microbial characteristics and odorous compounds concentration. Methods: A total eight (n = 8) barrows (Landrace ${\times}$ Yorkshire ${\times}$ Duroc) with an average bodyweight of $89.38{\pm}3.3kg$ were individually fed diets formulated by Korean Feeding Standards 2007 (old version) or 2012 (updated with ideal protein concept) in metabolism crates with two replication. After 15-day adaptation period, fresh faecal samples were collected directly from pigs every week for 4 weeks and analysed for total volatile fatty acids (VFA), phenols and indoles by using gas chromatography. The nitrogen was determined by Kjeldahl method. Bacterial communities were detected by using a 454 FLX titanium pyrosequencing system. Results: Level of VFA tended to be greater in 2012 than 2007 group. Among VFAs, 2012 group had greater (p < 0.05) level of short chain fatty acids (SCFA) than control.Concentration of odorous compounds in feces was also affected by amino acid composition in pig diet. Levels of ammonium and indoles tended to be higher in 2012 group when compared with 2007 group.Concentration of phenols, p-cresol, biochemical oxygen demand, and total Kjeldahl nitrogen, however, were lower (P < 0.05) in 2012 treatment group compare to 2007. The proportion of Firmicute phylum were decreased, while the Bacteriodetes phylum proportion increased and bacterial genera includingCoprococcus, Bacillus, and Bacteroides increased (p < 0.05) in 2012 compare to 2007 group. Conclusion: Results from our current study indicates that well balanced amino acid composition reduces odor by modulating the gut microbial community. Administration of pig diet formulated with the ideal protein concept may help improve gut fermentation as well as reduce the odor causing compounds in pig manure.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.24
no.6
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pp.925-931
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1995
Volatile compounds in Cheddar, Emmentaler, Parmesan and Roquefort cheese and cheese aroma were concentrated using a microsteam distillation-extraction apparatus and those compounds were analyzed with GC. The lipase-treated cheese aroma concentrates showed significantly higher level of short-chain free fatty acids than natural ripened cheese. The sensory properties of rancidity was high in Emmemtaler and Parmesan. Acidity and fruitness were shown high score in Roquefort. Correlation of free fatty acids and cheese flavor 'sharpness, rancidity and soapy' appear to be related(r=0.8239, 0.8918 and 0.7503), respectively. Methyl ketones, the most striking flavor components of Roquefort cheese showed high amounts in the series 2-heptanone > 2-nonanone > 2-pentanone > 2-undecanone. And the intensity of the Roquefort taste sensation 'acidity and fruitness' is linearly correlated with the methyl ketone concentrations(r=0.9284, r=0.9659).
Jo, Eunhye;Kim, Jihye;Lee, Areum;Moon, Keumok;Cha, Jaeho
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.31
no.3
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pp.483-491
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2021
Two putative genes, lip29 and est29, encoding lipolytic enzymes from the thermophilic bacterium Geobacillus thermocatenulatus KCTC 3921 were cloned and overexpressed in Escherichia coli. The recombinant Lip29 and Est29 were purified 67.3-fold to homogeneity with specific activity of 2.27 U/mg and recovery of 5.8% and 14.4-fold with specific activity of 0.92 U/mg and recovery of 1.3%, respectively. The molecular mass of each purified enzyme was estimated to be 29 kDa by SDS-PAGE. The alignment analysis of amino acid sequences revealed that both enzymes belonged to GDSL lipase/esterase family including conserved blocks with SGNH catalytic residues which was mainly identified in plants before. While Est29 showed high specificity toward short-chain fatty acids (C4-C8), Lip29 showed strong lipolytic activity to long-chain fatty acids (C12-C16). The optimal activity of Lip29 toward p-nitrophenyl palmitate as a substrate was observed at 50℃ and pH 9.5, respectively, and its activity was maintained more than 24 h at optimal temperatures, indicating that Lip29 was thermostable. Lip29 exhibited high tolerance against detergents and metal ions. The homology modeling and substrate docking revealed that the long-chain substrates showed the greatest binding affinity toward enzyme. Based on the biochemical and insilico analyses, we present for the first time a GDSL-type lipase in the thermophilic bacteria group.
Shin, Yong Kook;Oh, Nam Su;Lee, Hyun Ah;Nam, Myoung Soo
Food Science of Animal Resources
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v.33
no.4
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pp.542-548
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2013
This study was conducted to investigate effect of psychrotrophic bacteria on the quality of raw milk. Acinetobacter genomospecies 10 was selected as lipolytic species, and Serratia liquefaciens as proteolytic species. Lipase present in inoculated raw milk with Acinetobacter genomospecies 10 did not affect total solid and fat contents. However, the free fatty acid (FFA) content, especially short chain FFAs, of milk with Acinetobacter genomospecies 10 was dramatically increased. FFAs produced by lipolysis of milk fat are important in flavor of dairy products, excessive lipolysis occurring in milk and dairy products could cause off-flavor, and produced FFAs may have an underiable effect on their flavor. In addition, protease influenced the quality of inoculated raw milk with Serratia liquefaciens. In degradation patterns of casein by SDS-PAGE analysis from inoculatred raw milk with Serratia liquefaciens, casein content was gradually decreased during storage at $4^{\circ}C$, and extensive degradation of $\kappa$-casein was observed on the storage day of 13. The free amino acids such as leucine, valine, arginine, and tyrosine were dramatically increased, which causes bitter taste in raw milk. These excessive peptides in dairy products, produced by psychrotrophic bacteria, can be possible to develop off-flavors and be responsible for gelling of milk by degradation.
Robie, Vasquez;Ju Kyoung, Oh;Ji Hoon, Song;Dae-Kyung, Kang
Journal of Animal Science and Technology
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v.64
no.4
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pp.671-695
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2022
The gastrointestinal tract is a complex ecosystem that contains a large number of microorganisms with different metabolic capacities. Modulation of the gut microbiome can improve the growth and promote health in pigs. Crosstalk between the host, diet, and the gut microbiome can influence the health of the host, potentially through the production of several metabolites with various functions. Short-chain and branched-chain fatty acids, secondary bile acids, polyamines, indoles, and phenolic compounds are metabolites produced by the gut microbiome. The gut microbiome can also produce neurotransmitters (such as γ-aminobutyric acid, catecholamines, and serotonin), their precursors, and vitamins. Several studies in pigs have demonstrated the importance of the gut microbiome and its metabolites in improving growth performance and feed efficiency, alleviating stress, and providing protection from pathogens. The use of probiotics is one of the strategies employed to target the gut microbiome of pigs. Promising results have been published on the use of probiotics in optimizing pig production. This review focuses on the role of gut microbiome-derived metabolites in the performance of pigs and the effects of probiotics on altering the levels of these metabolites.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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