• 제목/요약/키워드: Short Trp-rich peptide

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Enhancement of Antibacterial Activity of Short Tryptophan-rich Antimicrobial Peptide Pac-525 by Replacing Trp with His(chx)

  • Ahn, Mija;Rajasekaran, Ganesan;Gunasekaran, P.;Ryu, Eun Kyoung;Lee, Ga-Hyang;Hyun, Jae-Kyung;Cheong, Chaejoon;Kim, Nam-Hyung;Shin, Song Yub;Bang, Jeong-Kyu
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제35권9호
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    • pp.2818-2824
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    • 2014
  • Trp residue is considered as one of the important constituents in antimicrobial peptides (AMPs) as it presence secured good activities in many cases. However, it is preferable to be changed because of their sensitivity towards light. We have synthesized the short Trp-rich AMP Pac-525 and its analogues to investigate the possibility of His(chx) as possible replacement analogue for Trp in AMPs. Based on the assay result of the antibacterial activity including anti-MRSA activity, His(chx) is considered as good candidate for the Trp replacement. Through these study, we found that His(chx) had several merits to design therapeutic antimicrobial agents compare to Trp in terms of i) increasing antibacterial activity without hemolytic activity, ii) successful in designing the short peptide (only four residues), iii) having anti-MRSA activity, iv) overcoming the light sensitivity. Furthermore, transmission electron microscopy (TEM) and dye leakage experiments suggested that P11 and P16 containing His(chx) kill bacteria via forming pore/ion channels on bacterial cell membranes.

증가된 원핵세포선택성을 가진 짧은 인돌리시딘 유사체의 설계 (Design of Short Indolicidin Analogs with Enhanced Prokaryotic Selectivity)

  • 신송엽
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제40권4호
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    • pp.409-413
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    • 2012
  • 인돌리시딘(indolicidin)은 소의 호중구(bovine neutrophils)로 부터 분리된 13개의 아미노산 잔기로 이루어 지고, 트립토판(tryptophan)을 많이 함유한 항균 펩타이드(antimicrobial peptide)이다. 인돌리시딘은 강력한 항균활성과 더불어 mammalian cells에 대해 독성을 나타낸다. 본 연구에서는 인돌리시딘 보다 서열이 짧으며, 보다 증가된 원핵세포 선택성(박테리아세포에 대해 독성을 나타내지만 mammalian cells에 대해서는 독성을 나타내지 않음을 의미함)을 지닌 새로운 짧은 항균 펩타아드를 개발하기 위해, 몇 종의 인돌리시딘 유사체 펩타이드를 설계하고 합성하였다. 결과적으로, 인돌리시딘 보다 서열이 짧으며(10개의 아미노산 잔기로 이루어짐), 증가된 원핵세포선택성을 지닌 4종의 새로운 펩타이드(SI, SI-PA, SI-WF 및 SI-WL)를 개발하였다. 본 연구를 통하여 가장 높은 원핵세포선택성을 나타내는 인돌리시딘 유사체 펩타이드 SI의 항균활성에는 중앙부위에 위치하는 소수성 및 방향족 아미노산이 중요하며, 2군데의 프로린(proline) 잔기는 중요하지 않다는 것을 알았다. 인돌리시딘과 유사체 펩타이드에 대한 원핵세포 선택성은 SI>SI-PA>SI-WF>SI-WL>ID>SI-WA의 순서 이였다. 따라서, 본 연구에서 설계되고 합성한 4종의 인돌리시딘 유사체 펩타이드(SI, SI-PA, SI-WF 및 SI-WL)는 박테리아 감염의 치료제로서 개발될 수 있을 것이다.