Xu, Kui;Stern, Alvin S.;Levin, Wayne;Chua, Anne;Vassilev, Lyubomir T.
BMB Reports
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제36권4호
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pp.421-425
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2003
The serine/threonine protein kinase family is a large and diverse group of enzymes that are involved in the regulation of multiple cellular pathways. Elevated kinase activity has been implicated in many diseases and frequently targeted for the development of pharmacological inhibitors. Therefore, non-radioactive antibody-based kinase assays that allow high throughput screening of compound libraries have been developed. However, they require a generation of antibodies against the phosphorylated form of a specific substrate. We report here a time-resolved fluorescence assay platform that utilizes a commercially-available generic anti-phosphothreonine antibody and permits assaying kinases that are able to phosporylate threonin residues on protein substrates. Using this approach, we developed an assay for Cdc7/Dbf4 kinase activity, determined the $K_m$ for ATP, and identified rottlerin as a non-ATP competitive inhibitor of this enzyme.
Protein kinase는 진핵생물과 원핵생물을 포함하는 모든 생명체에서 세포생존에 절대적으로 중요한 조절 기능을 담당한다. 일반적으로 원핵생물은 histidine 과 aspartic acid kinase로 구성된 bacterial two-component regulatory system에 의하여 환경변화에 따른 유전자의 발현이 조절되지만, 방선균을 비롯한 고등 원핵생물에서는 진핵생물성의 serine/threonine kinase들이 세포분화와 같은 분화과정을 조절하고 있다. Streptomycin 생산균인 Streptomyces griseus 균주에서도 다양한 serine/threonine kinase들이 존재하는 것으로 추정되며, 이들의 기능을 밝히는 것은 생명현상을 이해하는 중요한 열쇠를 제공해 줄 것으로 기대된다. 따라서, S. griseus로부터 protein kinase 를 동정하는 연구를 실시하였으며, 기존의 복잡한 chromatography법의 단점을 보완하기 위해 anti-phosphothreonine, anti-phosphoserine, anti-phosphotyrosine antibody를 이용한 immunoaffinity column chromatography 방법을 도입하였다. 실험 결과 약 14, 29, 31, 35, 40, 52, 56, 60 kDa의 단백질을 효과적으로 동정 할 수 있었으며, nonradioactive protein kination assay 방법으로 이들의 인산화능을 확인하였다.
Random sequencing of expressed sequence tags in roots of Chinese cabbage led to isolation of a partial cDNA clone, BR77, which encoded a putative protein kinase. Using the BR77 cDNA as a probe, we isolated a full-length cDNA encoding the Brassica campestris protein kinase 1 (Bcpk1). The Bcpt1 cDNA contained one open reading frame encoding a polypeptide of 439 amino acids. The putative polypeptide consisted of a short N-terminal region and a protein kinase catalytic domain. The catalytic domain of Bcpkl showed a high homology to cAMP- and calcium- phospholipid-dependent subfamilies of serine/threonine protein kineses. Eleven major catalytic domains in protein kineses were well conserved in Bcpk1. However, Bcpk1 contained a unique nonhomologous intervening sequence between subdomains VII and VIII, which was not found in protein kineses of animals and lower eukaryotes. Genomic DNA gel blot analysis showed that Bcpt1 genes might be present as three copies in the Chinese cabbage genome. These imply that Bcpk1 belongs to a plant-specific serine/threonine protein kinase subfamily.
Onocogene의 일종인 c-raf protein kinase는 세포질 속에 존재하는 serine / threonine-speccific protein이며, 이것은 mitogene signal에 의해 활성화된다. c-raf protein kinase의 구조와 기능은 protein kinase C와 매우 유사한 것으로 생각된다. 면역세포화학적으로 c-raf protein kinase의 signal transduction을 조사하기 위하여 EC-4 세포에 tumor promotor인 12-0-tet-radecanoylphorbol-13-acetae와 mitogenic gactor인 platelet-derived growth factor로 time-course에 따라서 처리하였다. Translocotion되는 c-raf는 먼저 perinuclear membrane에 모이고 그 후에 핵내로 이동되었다. 그런데 TPA와 PDGF로 처리한 c-raf의 translocotion은 각각의 다른 경로를 가짐을 알 수 있었다. TPA와 PAGF을 장기간 처리하였을 때, c-raf protein kinase의 down regulation이 유도됨을 알 수 있었다.
Nek6 belongs to NIMA1 (never in mitosis, gene A) related kinase, which was originally identified in Aspergillus nidulans as a serine/threonine kinase critical for cell cycle progression. We noticed that the putative SUMOylation site is localized on the $K^{252}$ residue in $^{251}FKsD^{254}$ of Nek6, based on the consensus sequence ${\Phi}KxE$; where ${\Phi}$ represents L, I, V or F and x is any amino acid. We observed that the Nek6 SUMO mutant (K252R) has decreased protein kinase activity, nuclear speckle localization and protein stability, compared with that of the Nek6 wild type. However, the Nek6 SUMO mutant increased the cell survival rate of COS-1 cells as determined by FACS analysis. Therefore, our data suggest that SUMOylation on the $K^{252}$ residue of Nek6 is required for its normal functions, such as proper nuclear localization, kinase activity and protein stability, to control cell cycle.
Protein kinase C (PKC) is a family of kinases involved in the transduction of cellular signals that promote lipid hydrolysis. PKC plays a pivotal role in mediating cellular responses to extracellular stimuli involved in proliferation, differentiation and apoptosis. Comparative analysis of the PKC-${\alpha},{\beta},{\varepsilon}$ isozymes of 200 recently sequenced microbial genomes was carried out using variety of bioinformatics tools. Diversity and evolution of PKC was determined by sequence alignment. The ser/thr protein kinases of Streptomyces coelicolor A3 (2), is the only bacteria to show sequence alignment score greater than 30% with all the three PKC isotypes in the sequence alignment. S.coelicolor is the subject of our interest because it is notable for the production of pharmaceutically useful compounds including anti-tumor agents, immunosupressants and over two-thirds of all natural antibiotics currently available. The comparative analysis of three human isotypes of PKC and Serine/threonine protein kinase of S.coelicolor was carried out and possible mechanism of action of PKC was derived. Our analysis indicates that Serine/ threonine protein kinase from S. coelicolor can be a good candidate for potent anti-tumor agent. The presence of three representative isotypes of the PKC super family in this organism helps us to understand the mechanism of PKC from evolutionary perspective.
단백질의 serine 및 threonine 잔기에 O-linked N-acetylglucosamine (O-GlcNAc)의 수식은 핵단백질과 세포질 단백질의 주요 조절인자로 부각되고 있다. 본 연구에서는 GlcNAc를 인산화시켜 GlcNAc 6-phosphate로 만드는 GlcNAc kinase (NAGK, EC2.7.1.59)의 세포내 표현을 면역화학적 방법으로 조사하였다. 배양한 해미신경세포에서 NAGK는 가지돌기를 따라 점박이(punctae)를 형성하였으며, 이 점박이들은 caveolin-1 혹은 flotillin 항체에도 염색이 되었다. 이들은 각각 caveolac와 lipid raft의 표지단백질이기 때문에 본 연구결과는 NAGK가 세포막의 이러한 특수 미세부분(microdomain)에 존재함을 의미하며, 이 미세부분에서 아직 알려지지 않은 어떤 기능을 할 것을 시사한다.
Wei, Youheng;Fu, Guolong;Hu, Hairong;Lin, Gang;Yang, Jingchun;Guo, Jinhu;Zhu, Qiquan;Yu, Long
BMB Reports
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제40권5호
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pp.749-756
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2007
Phosphorylation on serine/threonine or tyrosine residues of target proteins is an essential and significant regulatory mechanism in signal transduction during many cellular and life processes, including spermatogenesis, oogenesis and fertilization. In the present work, we reported the isolation and characterization of mouse testis-specific serine/threonine kinase 5 (Tssk5), which contains four alternatively spliced variants including, Tssk5$\alpha$, Tssk5$\beta$, Tssk5$\gamma$ and Tssk5$\delta$. Moreover, the locus of Tssk5 is on chromosome 14qC3 and the four variants had a similar high expression in the testis and the heart; however, had a low expression in other tissues, except for Tssk5$\alpha$ which also had comparably high expression in the spleen. Each variant of Tssk5 expression began in the testis 16 days after birth. Aside from TSSK5$\alpha$, the other isoforms have an insertion of ten amino acid residues (RLTPSLSAAG) in region VIb (HRD domain) (His-Arg-Asp). Moreover, only TSSK5$\alpha$ exhibited kinase activity and consistently, a further Luciferase Reporter Assay demonstrated that TSSK5$\beta$, TSSK5$\gamma$ and TSSK5$\delta$ cannot be stimulated at the CREB/CRE responsive pathway in comparison to TSSK5$\alpha$. These findings suggest that TSSK5$\beta$, TSSK5$\gamma$, TSSK5$\delta$ may be pseudokinases due to the insertion, which may damage the structure responsible for active kinase activity. Pull-down assay experiments indicated that TSSK5$\beta$, TSSK5 $\gamma$ and TSSK5$\delta$ can directly interact with TSSK5$\alpha$. In summary, these four isoforms with similar expression patterns may be involved in spermatogenesis through a coordinative way in testis.
Raf protein kinases and protein kinase C는 세포질내 serine/threonine-specific protein에 속한다. 그리고 기능적인 구조와 세포내의 분포 양상은 서로 비슷하다. Raf family oncogene를 발현시키는 a-raf와 c-raf protein kinase에 대한 antibodies로써 남생이 대뇌의 raf protein kinase의 분포를 조사하였다. 일반적으로 raf protein kinase는 제한된 지역에서 즉,general pallium,hippocampal formation, pdmordiuin hippocampi,nucleus of lateral olfactory tract, basal amygdaloid nucleus와bed of stria terminalis에 나타났으며, c-raf protein kinase의 면역학적 labeling은 a-raf보다 그 범위가 넓었다. 그렇지만 labeling되는 intensity는 오히려 a-raf보다 낮았다. 그런데 a-raf에서 가장 명확한 좋은 예는 basal amygdaloid nucleus내의 구형모양의 세포인데, 이 세포는 세포질이 매우 강하게 labeling되어 지므로 ring모양과 같이 나타났다. 특히 c-raf는 protein kinase C 가 많이 나타나는 pyramidal 세포나 Purkinje세포에 많이 존재하는 것을 볼 때 protein kinase에 의하여 활성화되는 myc와 서로 상협작용을 유도한다고 제안하는 바이다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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