• 제목/요약/키워드: Sequence Data Stream

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Molecular Cloning, Phylogenetic Analysis, Expressional Profiling and In Vitro Studies of TINY2 from Arabidopsis thaliana

  • Wei, Gang;Pan, Yi;Lei, Juan;Zhu, Yu-Xian
    • BMB Reports
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    • 제38권4호
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    • pp.440-446
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    • 2005
  • A cDNA that was rapidly induced upon abscisic acid, cold, drought, mechanical wounding and to a lesser extent, by high salinity treatment, was isolated from Arabidopsis seedlings. It was classified as DREB subfamily member based on multiple sequence alignment and phylogenetic characterization. Since it encoded a protein with a typical ERF/AP2 DNA-binding domain and was closely related to the TINY gene, we named it TINY2. Gel retardation assay revealed that TINY2 was able to form a specific complex with the previously characterized DRE element while showed only residual affinity to the GCC box. When fused to the GAL4 DNA-binding domain, either full-length or its C-terminus functioned effectively as a trans-activator in the yeast one-hybrid assay while its N-terminus was completely inactive. Our data indicate that TINY2 could be a new member of the AP2/EREBP transcription factor family involved in activation of down-stream genes in response to environmental stress.

인공 와우를 위한 신호 처리 및 전달부의 구현 (Signal Processing and Implementation of Transmitter for Cochlear Implant)

  • 채대곤;최두일;변정근;백승화;공형호;박상희
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 1993년도 하계학술대회 논문집 A
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    • pp.284-286
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    • 1993
  • Software and hardware for cochlear implant system have been developed to create a speech signal processing system which, in real-time, extracts model parameter including formants, pitch, amplitude information. The system is based on the Texas Instruments TMS320 family. In hardware, computer interface has been desisted and implemented that allows presentation of biphasic pulse stimuli to patients with the hearing handicapped. The host computer sends a stream of bytes to the parallel port. Upon receipt of the data the interface generates the appropriate burst sequence that is delivered to the patient's external transmitter coil. The coded information is interpreted by the Nucleus-22 internal receiver that delivers the pulse to the specified electrodes at the specified amplitude and pulse width.

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비디오의 의미검색과 유사성검색을 위한 통합비디오정보시스템 (Hybrid Video Information System Supporting Content-based Retrieval and Similarity Retrieval)

  • 윤미희;윤용익;김교정
    • 한국정보처리학회논문지
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    • 제6권8호
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    • pp.2031-2041
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    • 1999
  • 본 논문에서는 비정형, 대용량의 비디오데이터의 특징기반 검색과 주석기반 검색을 통합하여 다양한 사용자의 의미검색을 지원하고, 유사성 질의를 지원하는 통합비디오정보시스템(Hybrid Video Information System : HVIS)을 제안한다. HVIS는 메타데이터 모델링을 위해 한편의 비디오를 비디오 다큐먼트, 시퀸스, 장면, 객체로 나누고 물리적인 비디오스트림을 위한 원시데이터계층(raw_data layer)과 주석기반 검색, 특징기반 검색, 유사성 검색을 지원하기 위한 메타데이터계층(meta_data layer)의 두 개의 계층을 가진 통합 계층지향 메타데이터모델(Two layered Hybrid Object-oriented Metadata Model : THOMM)과 이 모델을 기반으로 주석기반 질의, 특징기반 질의, 유사질의가 가능한 비디오질의언어 (Video Query Language)와 질의를 처리하기 위한 비디오질의처리기 (Video Query Processor : VQP)와 질의처리알고리즘을 제안한다. 특히 유사한 장면, 객체를 찾는 유사질의시 사용자의 관심을 고려한 유사성 정도를 나타내는 식을 제시한다. 제안된 시스템은 Visual C++, ActiveX와 ORACLE를 이용하여 구현되었다.

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DNA Sequences Compression using Repeat technique and Selective Encryption using modified Huffman's Technique

  • Syed Mahamud Hossein; Debashis De; Pradeep Kumar Das Mohapatra
    • International Journal of Computer Science & Network Security
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    • 제24권8호
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    • pp.85-104
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    • 2024
  • The DNA (Deoxyribonucleic Acid) database size increases tremendously transmuting from millions to billions in a year. Ergo for storing, probing the DNA database requires efficient lossless compression and encryption algorithm for secure communication. The DNA short pattern repetitions are of paramount characteristics in biological sequences. This algorithm is predicated on probing exact reiterate, substring substitute by corresponding ASCII code and engender a Library file, as a result get cumulating of the data stream. In this technique the data is secured utilizing ASCII value and engendering Library file which acts as a signature. The security of information is the most challenging question with veneration to the communication perspective. The selective encryption method is used for security purpose, this technique is applied on compressed data or in the library file or in both files. The fractional part of a message is encrypted in the selective encryption method keeping the remaining part unchanged, this is very paramount with reference to selective encryption system. The Huffman's algorithm is applied in the output of the first phase reiterate technique, including transmuting the Huffman's tree level position and node position for encryption. The mass demand is the minimum storage requirement and computation cost. Time and space complexity of Repeat algorithm are O(N2) and O(N). Time and space complexity of Huffman algorithm are O(n log n) and O(n log n). The artificial data of equipollent length is additionally tested by this algorithm. This modified Huffman technique reduces the compression rate & ratio. The experimental result shows that only 58% to 100% encryption on actual file is done when above 99% modification is in actual file can be observed and compression rate is 1.97bits/base.

데이터 스트림에서 그래프 기반 기법을 이용한 슬라이딩 윈도우 다중 조인 처리 (Processing Sliding Window Multi-Joins using a Graph-Based Method over Data Streams)

  • 장량;거준위;김경배;이순조;배해영;유병섭
    • 한국공간정보시스템학회 논문지
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    • 제9권2호
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    • pp.25-34
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    • 2007
  • 데이터 스트림 환경에서 셋 이상의 스트림들에 대한 조인연산을 위해 순서를 선택하는 기존 기법들은 항상 간단한 휴리스틱 방법을 이용하였다 그러나 기존 기법들은 조인 선택도나 데이터 수신 비율과 같은 것만 고려하여 일반적인 응용에서 비효율적이며 낮은 성능을 갖는다. 본 논문에서는 최적의 조인 순서로 그래프 기반의 슬라이딩 윈도우 다중 조인 알고리즘을 제안한다. 이 기법에서 슬라이딩 윈도우 조인 그래프를 먼저 생성하는데, 정점(vertex)은 조인 연산으로 표현되고 엣지(edge)는 슬라이딩 윈도우들 사이의 조인관계를 나타낸다. 그리고 정점 가중치(vertex weight)와 엣지 가중치(edge weight)는 각각의 조인의 비용과 조인 연산들의 상호관계를 표현한다. 이때 데이터 스트림은 빠른 처리를 해야 하므로 메모리 기반의 그래프 기법을 사용한다. 이를 이용하여 최대값만을 이용하여 조인 연산을 수행하는 MVP 알고리즘을 개선하고 이의 그래프에서 최적의 조인 순서를 찾는다. 이를 통한 최종 결과는 중첩-루프(nested loop) 조인 계획을 수행하여 얻어진다. 성능비교를 통하여 제안기법이 기존 기법들보다 우수함을 증명한다.

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인증기능과 자기 키 생성기능을 가진 혼합형 암호시스템 설계에 관한 연구 (A Study of Hybrid Cryptosystem Design with the Authentication and Self-Key Generation)

  • 이선근;송제호;김태형;김환용
    • 대한전자공학회논문지SD
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    • 제40권9호
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    • pp.702-713
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    • 2003
  • 정보통신 및 네트워크의 급격한 발전으로 인하여 정보보호분야의 중요성은 매우 크다. 또한 사용자에 의한 서비스 수요가 증가하면서 개인정보보호에 대한 관심이 증가하였다. 이러한 이유로 대칭형 암호방식보다는 비대칭형 암호방식이 주류를 이루게 되었다. 그러나 비대칭형 암호방식은 대칭형 암호시스템에 비하여 처리속도가 낮아서 적용되는 분야가 한정된다. 그러므로 본 논문에서는 대칭형 암호시스템을 이용하여 비대칭형 암호시스템의 인증기능을 수행할 수 있도록 하는 암호시스템을 설계하였다. 제안된 암호시스템은 블록 암호방식과 스트림 암호방식을 혼용하여 사용하였다. 대칭형/비대칭형 암호시스템은 고정된 키에 의하여 암호/복호를 수행하지만 제안된 암호시스템은 평문의 정보에 의하여 키수열이 변화하도록 함으로써 비도 측면에서 매우 높은 안전성을 가지도록 하였다. 그러므로 비인가자가 키정보를 확보하여도 크랙하기가 매우 어려워진다. 그러므로 제안된 암호시스템은 대칭형 암호시스템의 처리속도와 비대칭 암호시스템의 인증기능을 가지고 있으므로 데이터 인증 또는 중요한 정보의 교환에 매우 유용하게 사용되리라 사료된다.

비금속광상의 황화광염대에 수반되는 산성광산배수의 형성과 지질환경의 오염 : 동래납석광산 산성광산배수의 형성에 관한 반응경로 모델링 (Formation of Acid Mine Drainage and Pollution of Geological Environment Accompanying the Sulfidation Zone of Nonmetallic Deposits: Reaction Path Modeling on the Formation of AMD of Tongnae Pyrophyllite Mine)

  • 박맹언;성규열;고용전
    • 자원환경지질
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    • 제33권5호
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    • pp.405-415
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    • 2000
  • This study was carried out to understand the formation of acid mine drainage (AMD) by pyrophyllite (so-called Napseok)-rainwater interaction (weathering), dispersion patterns of heavy metals, and patterns of mixing with non-polluted water in the Tongnae pyrophyllite mine. Based on the mass balance and reaction path modeling, using both the geochemistry of water and occurrence of the secondary minerals (weathering products), the geochemical evolution of AMD was simulated by computer code of SOLVEQ and CHILLER. It shows that the pH of stream water is from 6.2 to 7.3 upstream of the Tongnae mine. Close to the mine, the pH decreases to 2. Despite being diluted with non-polluted tributaries, the acidity of mine drainage water maintains as far as downstream. The results of modeling of water-rock interaction show that the activity of hydrogen ion increases (pH decreases), the goncentration of ${HCO_3}^-$ decreases associated with increasing $H^+$ activity, as the reaction is processing. The concentration of ${SO_4}^{2-}$first increases minutely, but later increases rapidly as pH drops below 4.3. The concentrations of cations and heavy metals are controlled by the dissolution of reactants and re-dissolution of derived species (weathering products) according to the pH. The continuous adding of reactive minerals, namely the progressively larger degrees of water-rock interaction, causes the formation of secondary minerals in the following sequence; goethite, then Mn-oxides, then boehmite, then kaolinite, then Ca-nontronite, then Mgnontronite, and finally chalcedony. The results of reaction path modeling agree well with the field data, and offer useful information on the geochemical evolution of AMD. The results of reaction path modeling on the formation of AMD offer useful information for the estimation and the appraisal of pollution caused by water-rock interaction as geological environments. And also, the ones can be used as data for the choice of appropriate remediation technique for AMD.

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검색결과 역배열 제시를 통한 순서 기반 정보탐색 유형 실증연구 (An Empirical Study on Click Patterns in Information Exploration)

  • 조봉관;김형중
    • 디지털콘텐츠학회 논문지
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    • 제19권2호
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    • pp.301-307
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    • 2018
  • 일반적으로 검색엔진은 이용자가 검색하고자 하는 내용의 정보를 제공하는 사이트를 우선 탐색할 수 있도록 검색결과의 주요내용을 요약하여 이용자에게 제공하고 있다. 본 연구에서는 이용자의 검색 결과 클릭이 검색 엔진에서 제공하는 요약 내용 기반으로 진행되는 것인지 검색결과 배치 순서에 기인한 것인지를 검색 결과 역배열 제시를 통한 실증 연구 결과를 제시하였다. 검색엔진 업체에서 제공하는 API를 활용하여 검색결과를 정배열과 역배열로 제시해 주는 검색사이트를 제작하여 각 이용자들의 검색결과에 대한 클릭 행동을 실제 클릭 순서와 클릭 위치, 클릭 수, 검색결과 내에서의 페이지 간 이동경로 등과 같은 이용자 검색 유형을 분석하였다. 분석 결과 대부분의 이용자들은 검색결과 정배열 또는 역배열 제시와 상관없이 첫 번째와 두 번째 노출된 검색 결과를 우선 클릭하는 이용자가 60% 이상 차지하였다. 이는 검색 결과 요약 내용과 상관없이 검색 결과 배치 순서에 따라 이용자의 정보탐색 우선순위가 결정되는 것으로 확인되었다.

데이터 스트림에 대한 키워드 검색을 위한, 효율적인 갱신이 가능한 디스크 기반 역색인 구조 (An Update-Efficient, Disk-Based Inverted Index Structure for Keyword Search on Data Streams)

  • 박은주;이기용
    • 정보처리학회논문지:소프트웨어 및 데이터공학
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    • 제5권4호
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    • pp.171-180
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    • 2016
  • 트위터와 같은 소셜 네트워킹 서비스(social networking service)의 확산으로 스트림 형태의 데이터가 크게 증가하고 있다. 스트림 형태로 들어와 누적되는 데이터를 효율적으로 검색하기 위해서는 색인이 반드시 필요하다. 본 논문에서는 스트림 형태로 들어와 계속 누적되는 데이터에 대한 키워드 검색을 효율적으로 할 수 있게 해주는, 효율적인 갱신이 가능한 디스크 기반 역색인(inverted index) 구조를 제안한다. 데이터 스트림을 검색하기 위해서는 데이터의 유입에 따라 역색인을 계속해서 갱신해 주어야 한다. 전통적인 역색인을 사용하는 경우, 역색인을 갱신하기 위해서는 매번 디스크에 저장된 모든 색인 데이터를 읽고 다시 써야 하므로 디스크 I/O 측면에서 매우 비효율적이다. 이러한 문제를 해결하기 위해 본 논문에서는 역색인을 크기가 지수적으로 증가하는 여러 역색인들로 나누어 저장한다. 새로운 데이터가 들어오면 우선 가장 작은 크기의 역색인에 삽입하고, 작은 크기의 역색인들을 더 큰 크기를 가진 역색인들과 나중에 병합함으로써 평균적으로 역색인을 갱신하는 비용을 크게 낮춘다. 또한 디스크에 저장된 역색인들을 병합할 때 발생하는 디스크 I/O 비용을 최소화함으로써 역색인의 갱신 비용을 더욱 낮춘다. 다양한 실험을 통해 기존 방법과 제안 방법의 효율성을 비교하고, 제안 방법이 갱신 비용에 있어 기존 방법에 비해 훨씬 효율적임을 보인다.

하복부 MRI 검사 시 환자의 불편함을 줄이기 위한 아크릴 보조 장치 사용의 타당성 조사 (Feasibility Study of Applying the Acrylic Assistant Equipment (ACR) to Reduce Patient's Discomfort in Lower Abdomen MRI Scan)

  • 박은혜;이민식
    • 한국방사선학회논문지
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    • 제12권4호
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    • pp.475-480
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    • 2018
  • 하복부 MRI 검사에서 환자는 body array coil과 물리적으로 접촉하여 검사를 받는다. 이 연구에서는 아크릴 보조장치(ACR)를 설계하여 코일과 환자의 비접촉식 스캔을 가능하게하고, ACR을 이용해서 획득 한 영상을 ACR 없이 얻은 영상와 비교하여 실현 가능성을 평가하였다. Ingenia 3.0TTM MR 시스템과 dStreamTM torso coil (Philips Healthcare, Netherlands)을 사용하여 10건(F : 5, m : 5)을 테스트하였다. 대표적인 두가지 pulse sequence(T1 AXE TSE, eTHRIVE (GRE))를 사용하여, 스캔 한 영상을 정량적, 정성적으로 비교 분석 하였다. 정성적으로 보면, TSE는 ACR의 유무에 관계없이 4.44와 4.56의 평균값을, GRE에서는 각각 4.34와 4.28을 보여준다. 정량적으로, TSE는 ACR 유무에 관계없이 12.15 CNR, 17.95 SNR 및 12.71 CNR, 18.96 SNR을 보였으며, GRE는 ACR이 있는 경우와 없는 경우 각각 17.72 CNR, 22.59 SNR 및 18.26 CNR, 24.47 SNR을 보여주었다. 즉, ACR의 사용이 환자를 편안하게 하지만, 화질에는 큰 영향이 없음을 확인하였다. 우리는 하복부 환자의 MRI 검사용 아크릴 보조 장치를 설계하고 적용해보았다. 우리의 결과는 환자와의 물리적 접촉없이 현재의 복부 MRI 스캔과 유사한 이미지 품질을 얻을 수 있음을 보여주었다.