During the last decade, genomic cohort study has been developed in many countries by linking health data and genetic data in stored samples. Genomic cohort study is expected to find key genetic components that contribute to common diseases, thereby promising great advance in genome medicine. While many countries endeavor to build biobank systems, biobank-based genome research has raised important ethical concerns including genetic privacy, confidentiality, discrimination, and informed consent. Informed consent for biobank poses an important question: whether true informed consent is possible in population-based genomic cohort research where the nature of future studies is unforeseeable when consent is obtained. Due to the sensitive character of genetic information, protecting privacy and keeping confidentiality become important topics. To minimize ethical problems and achieve scientific goals to its maximum degree, each country strives to build population-based genomic cohort research project, by organizing public consultation, trying public and expert consensus in research, and providing safeguards to protect privacy and confidentiality.
Lee, Sangjun;Ko, Kwang-Pil;Lee, Jung Eun;Kim, Inah;Jee, Sun Ha;Shin, Aesun;Kweon, Sun-Seog;Shin, Min-Ho;Park, Sangmin;Ryu, Seungho;Yang, Sun Young;Choi, Seung Ho;Kim, Jeongseon;Yi, Sang-Wook;Kang, Daehee;Yoo, Keun-Young;Park, Sue K.
Journal of Preventive Medicine and Public Health
/
제55권5호
/
pp.464-474
/
2022
Objectives: We introduced the cohort studies included in the Korean Cohort Consortium (KCC), focusing on large-scale cohort studies established in Korea with a prolonged follow-up period. Moreover, we also provided projections of the follow-up and estimates of the sample size that would be necessary for big-data analyses based on pooling established cohort studies, including population-based genomic studies. Methods: We mainly focused on the characteristics of individual cohort studies from the KCC. We developed "PROFAN", a Shiny application for projecting the follow-up period to achieve a certain number of cases when pooling established cohort studies. As examples, we projected the follow-up periods for 5000 cases of gastric cancer, 2500 cases of prostate and breast cancer, and 500 cases of non-Hodgkin lymphoma. The sample sizes for sequencing-based analyses based on a 1:1 case-control study were also calculated. Results: The KCC consisted of 8 individual cohort studies, of which 3 were community-based and 5 were health screening-based cohorts. The population-based cohort studies were mainly organized by Korean government agencies and research institutes. The projected follow-up period was at least 10 years to achieve 5000 cases based on a cohort of 0.5 million participants. The mean of the minimum to maximum sample sizes for performing sequencing analyses was 5917-72 102. Conclusions: We propose an approach to establish a large-scale consortium based on the standardization and harmonization of existing cohort studies to obtain adequate statistical power with a sufficient sample size to analyze high-risk groups or rare cancer subtypes.
Won, Chang Won;Lee, Yunhwan;Choi, Jaekyung;Kim, Ki Woong;Park, Yongsoon;Park, Hyuntae;Oh, In-Hwan;Ga, Hyuk;Kim, Young Sun;Jang, Hak Chul;Korean Frailty Cohort and Intervention Study Group
Annals of Geriatric Medicine and Research
/
제20권3호
/
pp.114-117
/
2016
A research project, the "Construction of Frailty Cohort for Elderly and Intervention Study," funded by the Ministry of Health and Welfare, has been ongoing since December 2015. The Korean Frailty and Aging Cohort Study (KFACS) aims to identify risk factors for adverse outcomes associated with frailty in community-dwelling older adults, as well as means of prevention. KFACS is a multicenter, longitudinal study, with the baseline survey being conducted in 2016-2017. The sample (n=3,000) consists of those aged 70-84 years, stratified by age and gender, recruited from urban and rural regions nationwide. An in-person interview and health examination are performed every 2 years. This project is also conducting many intervention studies. Project interventions focus on nutrition and exercise. The nutritional intervention study compares the effects of 1.2 g/kg versus 1.5 g/kg daily protein intake on sarcopenia and frailty in older Koreans. The exercise trial examines the effectiveness of an information and communication technology-based program in preventing or reducing frailty.
We evaluated cigarette smoking as a risk factor for prostate cancer in a prospective, population-based cohort study. The subjects were 14,450 males among the participants in the Seoul Male Cancer Cohort Study who had at least 1-year follow-up. They were followed up between 1993 and 2008. During the 16-year follow-up period, 87 cases of prostate cancer occurred over the 207,326 person-years of the study. The age-adjusted relative risks of past and current smokers at entry were 0.60 (95%CI: 0.34-1.06) and 0.70 (95%CI: 0.43-1.13), respectively, suggesting that cigarette smoking may not be a risk factor for prostate cancer. The relationship between prostate cancer and other modifiable factors, such as Westernized diet, should be studied with the goal of establishing prevention programs for prostate cancer.
Hwang, Young-Jae;Kim, Nayoung;Yun, Chang Yong;Yoon, Hyuk;Shin, Cheol Min;Park, Young Soo;Son, Il Tae;Oh, Heung-Kwon;Kim, Duck-Woo;Kang, Sung-Bum;Lee, Hye Seung;Park, Seon Mee;Lee, Dong Ho
Journal of Cancer Prevention
/
제23권4호
/
pp.183-190
/
2018
Background: As the number of big-cohort studies increases, validation becomes increasingly more important. We aimed to validate administrative database categorized as colorectal cancer (CRC) by the International Classification of Disease (ICD) 10th code. Methods: Big-cohort was collected from Clinical Data Warehouse using ICD 10th codes from May 1, 2003 to November 30, 2016 at Seoul National University Bundang Hospital. The patients in the study group had been diagnosed with cancer and were recorded in the ICD 10th code of CRC by the National Health Insurance Service. Subjects with codes of inflammatory bowel disease or tuberculosis colitis were selected for the control group. For the accuracy of registered CRC codes (C18-21), the chart, imaging results, and pathologic findings were examined by two reviewers. Sensitivity, specificity, positive predictive value (PPV), and negative predictive value (NPV) for CRC were calculated. Results: A total of 6,780 subjects with CRC and 1,899 control subjects were enrolled. Of these patients, 22 subjects did not have evidence of CRC by colonoscopy, computed tomography, magnetic resonance imaging, or positron emission tomography. The sensitivity and specificity of hospitalization data for identifying CRC were 100.00% and 98.86%, respectively. PPV and NPV were 99.68% and 100.00%, respectively. Conclusions: The big-cohort database using the ICD 10th code for CRC appears to be accurate.
Objectives: The objective of this study was to calculate sample size and power in an ongoing cohort, Korea radiation effect and epidemiology cohort (KREEC). Method: Sample size calculation was performed using PASS 2002 based on Cox regression and Poisson regression models. Person-year was calculated by using data from '1993-1997 Total cancer incidence by sex and age, Seoul' and Korean statistical informative service. Results: With the assumption of relative risk=1.3, exposure:non-exposure=1:2 and power=0.8, sample size calculation was 405 events based on a Cox regression model. When the relative risk was assumed to be 1.5 then number of events was 170. Based on a Poisson regression model, relative risk=1.3, exposure:non-exposure=1:2 and power=0.8 rendered 385 events. Relative risk of 1.5 resulted in a total of 157 events. We calculated person-years (PY) with event numbers and cancer incidence rate in the nonexposure group. Based on a Cox regression model, with relative risk=1.3, exposure:non-exposure=1:2 and power=0.8, 136 245PY was needed to secure the power. In a Poisson regression model, with relative risk=1.3, exposure:non-exposure=1:2 and power=0.8, person-year needed was 129517PY. A total of 1939 cases were identified in KREEC until December 2007. Conclusions: A retrospective power calculation in an ongoing study might be biased by the data. Prospective power calculation should be carried out based on various assumptions prior to the study.
The KoreaN Cohort Study for Outcomes in Patients With Chronic Kidney Disease (KNOW-CKD) was launched in 2011 with the support of the Korea Disease Control and Prevention Agency. The study was designed with the aim of exploring the various clinical features and characteristics of chronic kidney disease (CKD) in Koreans, and elucidating the risk factors for CKD progression and adverse outcomes of CKD. For the cohort study, nephrologists at 9 tertiary university-affiliated hospitals participated in patient recruitment and follow-up. Biostatisticians and epidemiologists also participated in the basic design and structuring of the study. From 2011 until 2016, the KNOW-CKD Phase I recruited 2238 adult patients with CKD from stages G1 to G5, who were not receiving renal replacement therapy. The KNOW-CKD Phase II recruitment was started in 2019, with an enrollment target of 1500 subjects, focused on diabetic nephropathy and hypertensive kidney diseases in patients with reduced kidney function who are presumed to be at a higher risk of adverse outcomes. As of 2021, the KNOW-CKD investigators have published articles in the fields of socioeconomics, quality of life, nutrition, physical activity, renal progression, cardiovascular disease and outcomes, anemia, mineral bone disease, serum and urine biomarkers, and international and inter-ethnic comparisons. The KNOW-CKD researchers will elaborate a prediction model for various outcomes of CKD such as the development of end-stage kidney disease, major adverse cardiovascular events, and death.
Lee, Joonki;Choe, Sunho;Park, Ji Won;Jeong, Seung-Yong;Shin, Aesun
Journal of Preventive Medicine and Public Health
/
제51권6호
/
pp.281-288
/
2018
Objectives: We investigated the association between cholecystectomy or appendectomy and the subsequent risk of colorectal cancer (CRC) in the Korean population. Methods: A retrospective cohort study was conducted with the National Health Insurance Service-National Sample Cohort of Korea; this sample was followed up from January 1, 2002, until the date of CRC incidence, loss to follow-up, or December 31, 2015. The exposure status of cholecystectomy and appendectomy was treated as a time-varying covariate. The calculated risk of CRC was stratified by follow-up period, and the association between these surgical procedures and CRC was investigated by a Cox regression model applying appropriate lag periods. Results: A total of 707 663 individuals were identified for analysis. The study population was followed up for an average of 13.66 years, and 4324 CRC cases were identified. The hazard ratio (HR) of CRC was elevated in the first year after cholecystectomy (HR, 1.71; 95% confidence interval [CI], 1.01 to 2.89) and in the first year and 2-3 years after appendectomy (HR, 4.22; 95% CI, 2.87 to 6.20; HR, 2.34; 95% CI, 1.36 to 4.03, respectively). The HRs of CRC after applying 1 year of lag after cholecystectomy and 3 years of lag after appendectomy were 0.80 (95% CI, 0.57 to 1.13) and 0.77 (95% CI, 0.51 to 1.16), respectively. Conclusions: The risk of CRC increased in the first year after cholecystectomy and appendectomy, implying the possibility of bias. When appropriate lag periods after surgery were applied, no association was found between cholecystectomy or appendectomy and CRC.
Objectives : The aim of this study was to evaluate the roles of cigarette smoking, alcohol consumption, tuberculosis, and their interactions in the risk of lung cancer in a Korean cohort. Methods : The study subjects comprised 13,150 males and females aged above 20 years old. During the follow up period from 1993 to 2002, 79 lung cancer cases were identified by the central cancer registry and the national death certificate database. Information on cigarette smoking, alcohol consumption and the history of physician-diagnosed tuberculosis was obtained by interview. Indirect chest X-ray findings were also evaluated to ascertain tuberculosis cases. Cox proportional hazard models were used to estimate relative risks (RR) and 95% confidence intervals (CI) after adjusting for age and gender. Results : Cigarette smoking was statistically significantly associated with an increased risk of lung cancer [for current smokers, RR = 2.33 (95% CI = 1.23 - 4.42) compared to non-smokers]. After further adjustment for cigarette smoking, both alcohol consumption and tuberculosis showed no statistically significant association with the risk of lung cancer [for current drinkers, RR = 0.80 (95% CI = 0.48 - 1.33) compared to non-drinkers] [for tuberculosis cases, RR = 1.17 (95% CI = 0.58 - 2.36) compared to non-cases]. There was no statistically significant interaction between cigarette smoking and alcohol consumption (p-interaction = 0.38), or cigarette smoking and tuberculosis (p-interaction = 0.74). Conclusions : Although cigarette smoking was confirmed as a risk factor of lung cancer in this cohort study, this study suggests that alcohol consumption and tuberculosis may not be associated with the risk of lung cancer.
Focusing on complex diseases of public health significance, strategic issues regarding the on-going Korean Genome Cohort were reviewed: target size and diseases, measurements, study design issues, and follow-up strategy of the cohort. Considering the epidemiologic characteristics of Korean population as well as strengths and drawbacks of current research environment, we tried to tailor the experience of other existing cohorts into proposals for this Korean study. Currently 100,000 individuals have been participating the new Genome Cohort in Korea. Target size of de novo collection is recommended to be set as between 300,000 to 500,000. This target size would allow acceptable power to detect genetic and environmental factors of moderate effect size and possible interactions between them. Family units and/or special subgroups are recommended to parallel main body of adult individuals to increase the overall efficiency of the study. Given that response rate to the conventional re-contact method may not be satisfactory, successful follow-up is the main key to the achievement of the Korean Genome Cohort. Access to the central database such as National Health Insurance data can provide enormous potential for near-complete case detection. Efforts to build consensus amongst scientists from broad fields and stakeholders are crucial to unleash the centralized database as well as to refine the commitment of this national project.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.