• 제목/요약/키워드: Seeds localization

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Seeds as Repositories of Recombinant Proteins in Molecular Farming

  • Moloney, Maurice M.
    • 식물조직배양학회지
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    • 제27권4호
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    • pp.283-297
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    • 2000
  • Seeds are an ideal repository for recombinant proteins in molecular farming applications. However, in order to use plant seeds efficiently for the production of such proteins, it is necessary to understand a number of fundamental biological properties of seeds. This includes a full understanding of promoters which function in a seed-specific manner, the subcellular targeting of the desired polypeptide and the final form in which a protein is stored. Once a biologically active protein has been deposited in a seed, it is also critical that the protein can be extracted and purified efficiently. In this review, these issues are examined critically to provide a number of approaches which may be adopted for production of recombinant proteins in plants. Particular attention is paid to the relationship between subcellular localization and protein extraction and purification. The robustness and flexibility of seed-based production is illustrated by examples close to or already in commercial production.

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전립선암 근접치료 시 방사성선원 위치확인을 위한 영상 재구성에 관한 연구 (A Study on Image Reconstruction for Seed Localization for Permanent Prostate Brachytherapy)

  • 홍주영;라정은;서태석
    • Radiation Oncology Journal
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    • 제25권2호
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    • pp.125-133
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    • 2007
  • 목 적: 완벽하게 중복된 방사성선원의 위치를 판별하기 위해 직접 설계 및 제작한 팬톰을 이용하여 영상을 영상처리 과정을 거친 후 3방향 필름 기법과 개발한 프로그램을 이용하여 완벽하게 중복된 방사선원을 분리해내고자 한다. 대상 및 방법: 팬톰 내에 삽입된 방사성선원의 위치확인을 위하여 전후 방향 및 $-30^{\circ}에서 $30^{\circ}까지 $15^{\circ}간격으로 영상을 획득하였다. 획득한 영상은 불필요한 배경제거와 화질개선을 위한 영상처리 과정을 거쳐 프로그램에 사용하였다. 본 연구에서는 1개의 방사성선원이 중복된 상황, 2개 이상의 방사성선원이 중복된 상황 그리고 방사성선원이 중복되어 3장의 영상 모두에서 삽입된 방사성선원의 전체 개수를 확인할 수 없는 상황을 설정하여 실험하였다. 개발된 프로그램은 투사영상에서 일정한 영역을 설정하여 위치를 확인하고자 하는 방사성선원과 기준이 되는 방사성선원의 중심간의 거리를 계산하여 각각의 필름 내에서 동일한 과정을 반복하여 완벽하게 중복된 방사성선원을 분리하게 된다. 또한 전통적인 2방향 필름기법을 이용하여 중복된 방사성선원의 위치를 확인하여 비교하였다. 결 과: 각 방법의 위치 확인율은 ${\pm}15^{\circ}에서는 92.2%, ${\pm}30^{\circ}에서는 94.1% 그리고 2방향 필름기법에서는 70.6%로 나타났다. 1개의 방사성선원이 중복된 상황과 2개 이상의 방사성선원이 중복된 상황에서는 완벽하게 분리가 가능하였지만 3장의 영상에서 확인하고자 하는 방사성선원이 또 다른 방사성선원과 중복되어 나타나지 않는 상황에서는 주목할 만한 결과를 가져오지 못했다. 결 론: 전립선암 근접치료시 본 연구에서 개발한 프로그램을 이용한다면 완벽하게 중복된 방사성선원으로 의해 재구성하는 과정에서 생기는 오차를 줄일 수 있어 치료 효과 향상에 기여할 것으로 예상된다.

Seed의 위치 확인을 위한 제한된 EPID 영상을 이용한 콘빔 재구성 (Cone-beam Reconstruction using Limited EPID Projections for Seeds Localization)

  • 장지나;정원균;박성호;정광호;서태석
    • 한국의학물리학회지:의학물리
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    • 제19권3호
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    • pp.186-190
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    • 2008
  • 본 연구에서는 금속 물체의 묘사를 위한 예비 연구로서 제한된 EPID 영상을 이용한 콘빔 재구성을 수행하였다. 콘빔 재구성에 제한된 영상이 이용되었기 때문에 일반적인 FDK 재구성 알고리즘에 에지 보존 평활화(edge preserving smoothing) 필터가 사용되었다. 사용된 영상의 수와의 상관관계를 비교해 보았을 때 금속 seed의 크기와 위치에 대한 결과는 거의 동일하다고 판명되었다. 콘빔 CT 재구성을 위하여 제한된 영상을 사용하였기 때문에 우리의 방법은 임상 적용에 있어 경제적이고, 효과적인 방법이 될 수 있을 것으로 사료된다.

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인삼 종자의 성숙과 후숙 과정에서 배유세포내 섬유소 가수분해효소의 분포 및 기능 (Localization and Function of Cellulase in Endosperm Cells of Panax ginseng Seeds during Maturation and After-ripening)

  • 유성철
    • Journal of Plant Biology
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    • 제36권4호
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    • pp.327-335
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    • 1993
  • The active sites, intracellular transport, function of cellulase in association with the disintegration of the storage materials of the endosperm cells during seed maturation and after-ripening of Panax ginseng C.A. Meyer seeds were studied by electron microscopy. Cytochemical activities of the cellulase occurred in protein bodies and vesicles of endosperm cells in seed with red seed coat. In after-ripening seed, the activities were strongly found in the cell wall of endosperm near the umbiliform layer and on neighbouring vesicles, so it is assumed that these cells begin to be decomposed. Cellulase activities were initiated before the decomposition of storage materials. But, no activity was observed in the umbiliform layer, so it is suggested that cellulase lose its activity after the completion of lysis process.

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지질 및 전분성 종자에서 지질 및 지질가수분해효소의 분포 (Distribution of Lipid and Lipase in Lipid-and Starch-Rich Seeds)

  • 김우갑
    • Journal of Plant Biology
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    • 제35권3호
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    • pp.219-227
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    • 1992
  • 지질성 종자(해바라기, 피마자, 잣나무)와 전분성 종자(완두, 옥수수)를 대상으로 배유와 자엽세포내의 저장지질의 형성, 분포 및 구조적 변화 등과 지질가수분해효소의 활성부위 및 세포내 분포양상 등을 세포화학적 방법을 이용하여 조사하였다. 채종후의 지질 및 전분성 종자의 배유와 저장성 자엽세포에는 구형의 단백과립과 지질소구인 스페로솜, 전분과립 등의 저장물질이 널리 분포하였으며 세포내소기관은 드물게 관찰되었다. 활면소포체에서 형성되어 방출된 소포들과 스페로솜의 초기 단계로 여겨지는, 전자밀도가 낮은 막성의 과립들은 염색상이 스페로솜의 그것과 동일하였다. 조면소포체에서 방출된 전자밀도가 높은 과립들은 원형질막의 인접부위에서 관찰되었다. 지질염색반응 결과, 일반적인 미세구조의 염색상과는 상이하게 단백과립내의 단백질보다는 구형의 스페로솜의 전자밀도가 높고 균일함이 확인되어 스페로솜의 주요 구성성분은 지질임을 알 수 있었다. 스페로솜과 활면소포체에서 방출하는 물질을 함유한 소포는 염색상이 동일하였다. 지질가수분해효소는 분해과정이 진행중인 스페로솜의 기질과 막 주변부, 그리고 원형질막 부근에서 강한 활성을 보였다.

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Pseudomonas oleovorans Strain KBPF-004 Culture Supernatants Reduced Seed Transmission of Cucumber green mottle mosaic virus and Pepper mild mottle virus, and Remodeled Aggregation of 126 kDa and Subcellular Localization of Movement Protein of Pepper mild mottle virus

  • Kim, Nam-Gyu;Seo, Eun-Young;Han, Sang-Hyuk;Gong, Jun-Su;Park, Cheol-Nam;Park, Ho-Seop;Domier, Leslie L;Hammond, John;Lim, Hyoun-Sub
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제33권4호
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    • pp.393-401
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    • 2017
  • Efforts to control viral diseases in crop production include several types of physical or chemical treatments; antiviral extracts of a number of plants have also been examined to inhibit plant viral infection. However, treatments utilizing naturally selected microorganisms with activity against plant viruses are poorly documented. Here we report isolation of a soil inhabiting bacterium, Pseudomonas oleovorans strain KBPF-004 (developmental code KNF2016) which showed antiviral activity against mechanical transmission of tobamoviruses. Antiviral activity was also evaluated in seed transmission of two tobamoviruses, Pepper mild mottle virus (PMMoV) and Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV), by treatment of seed collected from infected pepper and watermelon, respectively. Pepper and watermelon seeds were treated with culture supernatant of P. oleovorans strain KBPF-004 or control strain ATCC 8062 before planting. Seeds germinated after treatment with water or ATCC 8062 yielded about 60% CGMMV or PMMoV positive plants, whereas < 20% of KBPF-004-treated seeds were virus-infected, a significantly reduced seed transmission rate. Furthermore, supernatant of P. oleovorans strain KBPF-004 remodeled aggregation of PMMoV 126 kDa protein and subcellular localization of movement protein in Nicotiana benthamiana, diminishing aggregation of the 126 kDa protein and essentially abolishing association of the movement protein with the microtubule network. In leaves agroinfiltrated with constructs expressing the coat protein (CP) of either PMMoV or CGMMV, less full-size CP was detected in the presence of supernatant of P. oleovorans strain KBPF-004. These changes may contribute to the antiviral effects of P. oleovorans strain KBPF-004.

Seed-Based Resting-State Functional MRI for Presurgical Localization of the Motor Cortex: A Task-Based Functional MRI-Determined Seed Versus an Anatomy-Determined Seed

  • Ji Young Lee;Yangsean Choi;Kook Jin Ahn;Yoonho Nam;Jin Hee Jang;Hyun Seok Choi;So Lyung Jung;Bum Soo Kim
    • Korean Journal of Radiology
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    • 제20권1호
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    • pp.171-179
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    • 2019
  • Objective: For localization of the motor cortex, seed-based resting-state functional MRI (rsfMRI) uses the contralateral motor cortex as a seed. However, research has shown that the location of the motor cortex could differ according to anatomical variations. The purpose of this study was to compare the results of rsfMRI using two seeds: a template seed (the anatomically expected location of the contralateral motor cortex) and a functional seed (the actual location of the contralateral motor cortex determined by task-based functional MRI [tbfMRI]). Materials and Methods: Eight patients (4 with glioma, 3 with meningioma, and 1 with arteriovenous malformation) and 9 healthy volunteers participated. For the patients, tbfMRI was performed unilaterally to activate the healthy contralateral motor cortex. The affected ipsilateral motor cortices were mapped with rsfMRI using seed-based and independent component analysis (ICA). In the healthy volunteer group, both motor cortices were mapped with both-hands tbfMRI and rsfMRI. We compared the results between template and functional seeds, and between the seed-based analysis and ICA with visual and quantitative analysis. Results: For the visual analysis, the functional seed showed significantly higher scores compared to the template seed in both the patients (p = 0.002) and healthy volunteers (p < 0.001). Although no significant difference was observed between the functional seed and ICA, the ICA results showed significantly higher scores than the template seed in both the patients (p = 0.01) and healthy volunteers (p = 0.005). In the quantitative analysis, the functional seed exhibited greater similarity to tbfMRI than the template seed and ICA. Conclusion: Using the contralateral motor cortex determined by tbfMRI as a seed could enhance visual delineation of the motor cortex in seed-based rsfMRI.

OsDOR1, a novel glycine rich protein that regulates rice seed dormancy

  • Kim, Suyeon;Huh, Sun Mi;Han, Hay Ju;Cho, Mi Hyun;Lee, Gang Sub;Kim, Beom Gi;Kwon, Taek Yun;Yoon, In Sun
    • 한국작물학회:학술대회논문집
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    • 한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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    • pp.90-90
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    • 2017
  • Regulation of seed dormancy is important in many grains to prevent pre-harvest sprouting. To identify and understand the gene related to seed dormancy regulation, we have screened for viviparous phenotypes of rice mutant lines generated by insertion of Ds transposon in a Korean Japonica cultivar (Dongjin) background. One of the mutants, which represented viviparous phenotype, was selected for further seed dormancy regulation studies and designated dor1. The dor1 mutant has single Ds insertion in the second exon of OsDor1 gene encoding glycine-rich protein. The seeds of dor1 mutant showed a higher germination potential and reduced abscisic acid (ABA) sensitivity compared to wild type Dongjin. Over-expression of Dor1 complements the viviparous phenotype of dor1 mutant, indicating that Dor1 function in seed dormancy regulation. Subcellular localization assay of Dor1-GFP fusion protein revealed that the OsDor1 protein mainly localized to membrane and the localization of OsDOR1 was influenced by presence of a giberelin (GA) receptor OsGID1. Further bimolecular fluorescence complementation (BiFC) analysis indicated that OsDOR1 interact with OsGID1. The combined results suggested that OsDOR1 regulates seed dormancy by interacting with OsGID1 in GA response. Additionally, expression of OsDOR1 partially complemented the cold sensitivity of Escherichia coli BX04 mutant lacking four cold shock proteins, indicating that OsDOR1 possessed RNA chaperone activity.

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발아중인 대두콩에서의 Lipoxygenase의 국재(局在) (Localization of Lipoxygenase in Germinating Soybeans)

  • 송영선
    • 한국식품과학회지
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    • 제19권5호
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    • pp.441-445
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    • 1987
  • 발아중인 대두콩에서의 lipoxygenase의 세포내 위치를 차별 원심 분리법과 밀도 구배법을 이용하여 규명하였다. 차별 원심 분리법을 사용하였을때, lipoxygenase활성은 거의 supernatant fraction에서 나타났으며, 1.5%의 활성만이 particulate fractions에서 나타났다. 밀도 구배법에서는 lipoxygenase와 acid phosphatase의 활성이 1.19, 1.23, $1.25g/cm^3$의 높은 밀도들에서 일치하였으며, 이것은 발아중 가수분해되는 단백질체내에 이 효소가 국재되어지는 것으로 사료되어진다. 다른 세포내 소기관인미토콘드리아, ER, 그리고 glyoxysomes에 lipoxygenase가 존재한다는 증거는 보이지 않았다.

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