유전자의 재조합 균주의 생산성을 향상시키기 위한 발효시스템 개발을 목적으로 regulated promoter 인 SUC2 gene 갖는 유전자 재조합 S. cerebisiae를 모델로하여 유전자 산물인 Invertase 발현에 미치는 글루코오스 농도의 영향, 발효 중 플라스미드의 불안정성, 생육특성 및 continuous fed batch system을 연구하였다. 유전자 재조합 균주는 biphasic growth 현상을 보였으며 글루코오스 농도가 0.9g/$\ell$에서 2.2g/L로 증가함에 따라 비증식 속도는 0.224 h$^{-1}$에서 0.226 h$^{-1}$로 증가했으며 숙주효모보다 낮은 값을 나타내었다. 유전자 재조합 균주의 invertase 생산은 발효조내의 글루코오스 농도에 크게 영향을 받아 글루코오스 농도가 0.25~0.4g/L로 감소될 때 invertase 생산이 시작되었으며 회분발효중 플라스미드의 분리는 글루코오스 자화기간 동안에 빈번히 일어났으나 에탄을 자화기간에는 완만해지는 경향을 보였다. 또한 통기를 해주지 않고 배지의 용존산소만으로 배양시킨 결과 통기를 한 경우에 비하여 invertase의 비활성과 총활성이 각각 1.5 및 1.3 배 증가되었다. 균체의 증식단계와 유전자의 발현단계로 구분하여 발효시키기 위하여 영양분을 함유한 글루코오스 용액을 48m1/h(0.096g 글루코오스/48L의 유량으로 12시간 연속적으로 공급하여 fed batch 배양한 결과 invertase의 비활성과 총활성이 비통기적 회분배양 보다 각각 1.74, 2.74배 증가되었다.
The INU2 gene encoding an endoinulinase of Aspergillus ficuum was expressed by the Kluyveromyces marxianus INU1 promoter in a SUC2-deleted Saccharomyces cerevisiae to produce the endoinulinase free of an exoinulinase and an extracellular invertase in the culture medium. When inulin was included in the medium, a recombinant yeast strain produced the sufficient amount of the enzyme to make a halo around its colony. An expression of endoinulinase was dependent on the culture temperature and shaking. The highest expression of endoinulinase was observed at $30^{\circ}C$, and 150rpm.
인천 연안의 심하게 오염된 갯벌로부터 강력한 세포외 알카리성 단백질 분해효소를 생산하는 호알카리성 Bacillus clausii I-52를 분리하였으며, 이 균주로부터 알카리성 단백질 분해효소의 유전자를 cloning하여 서열 분석을 하였다. Chromosome 서열이 완전히 밝혀진 Bacillus subtilis의 서열을 기초로 하여 알카리성 단백질 분해효소 및 promoter를 포함하도록 primer를 고안하여 PCR을 수행하여 2,277 bp의 DNA 단편을 얻었으며 BLAST 분석 결과 29 개의 아미노산으로 이루어진 signal peptide, 77 개의 아미노산으로 이루어진 propeptide 및 275 개의 아미노산을 갖는 활성형의 BCAP으로 구성된 총 381 개의 아미노산을 코딩하는 1,143 bp의 open reading frame을 확인하였다. 활성형 BCAP의 N-말단 아미노산은 Ala이며, 분자량 및 pI 값은 각각 27698.7 Da과 6.30으로 계산되었다. 아미노산 상동성을 분석한 결과, B. subtilis 유래의 nattokinase precursor 및 B. subtilis BSn5 유래의 subtilisin E precursor와 99%의 서열 상동성을 나타내어 B. clausii I-52 유래의 BCAP은 subtilisin 계열의 단백질 분해효소임을 확인하였다. E. coli BL21(DE3)에서 발현한 재조합 BCAP는 N-Suc-Ala-Ala-Pro-Phe-pNA 를 효율적으로 분해하였다. Refolding한 재조합 BCAP은 전형적인 serine protease inhibitor인 PMSF에 의하여 강하게 효소 활성이 억제됨으로써 serine protease 계열의 단백질 분해효소임을 알 수 있었다.
The enzyme, cis,cis-muconate lactonizing enzyme has been proposed to play a key role in the $\beta$-ketoadipate pathway of benzoate degradation. A 3.2-kb EcoRI fragment termed as pRSU2, isolated from a Pseudomonas cepacia genomic library was able to complement the catB defective mutant. Several relevant restriction enzyme sites were determined within the cloned fragment. In Pseudomonas putida SUC2 carrying pRSU2, the enzyme activity was relatively higher than those of the induced or partially induced state of wild type P. putida PRS2000. It was probably due to higher expression of P. cepacia catB in P. putida PRS2000. It was probably due to higher expression of P. cepacia catB in P. putida. One possible interpretation of these results is that the catB promoter in P. cepacia is recognized within P. putida, resulting in the almost same expression level.
The effects of medium pH and culture temperature on the expression and secretion of inulinase and invertase were investigated with recombinant Saccharomyces cerevisiae cells. These cells were obtained by transformation of 2$\mu$-based plasmids pYI10 and pYS10 which contain Kluyveromyces marxianus inulinase gene (INU1A) and S. cerevisiae invertase gene (SUC2), respectively, in the downstream of GAL1 promoter. The expression level and localization of inulinase and invertase were not affected significantly by the initial medium pH: secretion efficiencies of inulinase and invertase into the medium were about 90% and 60%, respectively, in the pH ranges of 4.0 to 6.5. However, the expression and secretion of both enzymes were strongly dependent on the culture temperature. The highest expression (7.7 units/mL) and secretion (6.7 units/mL) of inulinase were observed at 28$\circ$C and 30$\circ$C. As a consequence of decreased localization of inulinase in the periplasmic space, the secretion efficiency increased from 68% at 20$\circ$C, to 95% at 35$\circ$C,. The total expression level and secretion efficiency of invertase increased from 19 units/mL and 55% at 20$\circ$C to 25 units/mL and 68% at 35$\circ$C, respectively. Irrespective of the culture temperature, the invertase activity in the cellular fraction (periplasmic space and cytoplasmic fractions) was kept constant at around 33-45%.
Eight Escherichia coli cells with aerobic growth deflects were isolated by the insertion of ${\lambda}placMu53$, a hybrid bacteriophage of ${\lambda}$ and Mu, which created transcriptional fusion to lacZY. Two of these mutants, CLIO and CLl2, were irradiated with UV to obtain specialized transducing phages. The phages that took out the neighboring chromosomal DNA of the related gene responsible for deflective aerobic growth were identified. The in vivo cloned chromosomal sequence revealed that the mutated gene of CLIO was located at min 34.5 on the Escherichia coli linkage map and 1,599,515 on the physical map. The physical map indicated that there were 7 cistrons in the operon. We named this operon oxg10. The promoter sequence of oxg10 exhibited a possible binding site far SoxS, a transcriptional regulator that activates the transcription of various SoxRS regulon genes. Transferring the oxg10:: ${\lambda}placMu53$ mutation into the wild-type strain, RZ4500, resulted in the inhibition of normal aerobic growth, while the salute mutation in strain MO inhibited aerobic cell growth completely. The full operon sequences of oxg10 were cloned from the Excherichia coli genomic library. The mutated gene of CLl2 was identified to be a sucA gene encoding the ${\alpha}$-ketoglutarate dehydrogenase El component in the TCA cycle.
Kim, Il-Man;Lee, Yong-Chan;Won, Jae-Seon;Choe, Mu-Hyeon
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제13권6호
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pp.976-983
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2003
Seven Escherichia coli cells defective with aerobic growth were isolated by the insertion of ${\lambda}placMu53$, a hybrid bacteriophage of ${\lambda}$ and Mu, which created a transcriptional fusion to lacZY. These insertion mutant cells were tested on an XG ($5-bromo-4-chloro-3-indolyl-{\beta}-D-galactopyranoside$) medium for anaerobic expression of lacZ by fusion to a promoter. The chromosomal DNA from these strains were digested by EcoRI, and the EcoRI fragments that contained the fused gene and lacZ sequence were identified by Southern hybridization, using lacZ containing plasmid as a probe. The EcoRI fragment from each strain was cloned and sequenced. The sequence data were compared with the GenBank database. The mutated gene of three strains, CYT4, CYT5, and OS11, was found to be identical, and it was nrdAB that encoded ribonucleoside diphosphate reductase. The gene nrdAB was at min 50.5 on the Escherichia coli linkage map and 2,348,084 on the physical map, and is involved in hemAe-related reduction-oxidation reaction. OS6 and OS14 mutant strains had insertion at min 8.3 and the mutated gene was hemB. The hemB encodes 5-aminolevulinate dehydratase or porphobilinogen synthase. The OS3 mutant had insertion in cydB at min 16.6. The cydAB encodes cytochrome d oxidase. In the case of OS1, the fusion was made with sucA, the E1 component of ${\alpha}-ketoglutarate$ dehydrogenase.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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