• 제목/요약/키워드: SSPS

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TNT에 대한 세균의 반응기작: 생존율, 스트레스 유도단백질의 SDS-PAGE 및 2-D 전기영동 분석 (Responses of Bacteria to TNT: Cells′Survival, SDS-PAGE and 2-D Electrophoretic Analyses of Stress-Induced Proteins)

  • 오계헌;장효원;강형일;김승일
    • 미생물학회지
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    • 제38권2호
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    • pp.67-73
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    • 2002
  • 폭약 2,4,6-trinitrotoluene (TNT)스트레스 조건하에서 토양세균 Pseudomonas sp. HK-6의 세포반응에 대하여 조사하였다. 다양한 농도의 TNT에 노출됨으로서 약 70-kDa DnaK와 60-kDa GroEL의 스트레스 충격단백질 (stress shock proteins, SSPs)이 단떠질이 유도되었다. 이들 SSPs의 존재는 SDS-PAGE과 anti-DnaK와 anti-GroEL monoclonal antibodies를 이용한 Western bolt을 통하여 확인되었다. SSPs은 0.5 mM TNT로 6-12 시간 처리된 세포에서 나타났으며, TNT에 노출 후8시간대 에서 최대의 단백질 유도가 관찰되었다. $30^{\circ}C$에서 $42^{\circ}C$로 열변환충격을 주었을 때의 SSPs는 TNT노출에서와 유사한 유도양상을 보여주었다. TNT에 노출된 Pseudomonas sp. HK-6세포에서 유도된 SSPs의 존재는 배양된 세포의 수용성 단백질 분획에 대하여 2-D PAGE를 통하여 확인되었다. Coomassie brilliant blue R25O로 염색된 젤로부터 pH 3-10 범위에서 약 450 개의 spots이 탐침되었으며, 이들 가운데 12 개의 spots이 TNT 스트레스에 대하여 현저하게 유도되었다. Gel상에서 가장 짙게 나타난 대표적 인 spot에 대한 N-말단 아미노산 서열을 분석한 결과, $^1XXAKDVKFGDSARKKML^17$로서, Pseudomonas putida의 GroEL의 N-말단 아미노산 염기서열인 $^1XXAKDVKFGDSARKKML^17$과 동일한 것으로 분석되었다.

APEX-paddy 모델을 활용한 SSPs 시나리오에 따른 논 필요수량 변동 평가 (Assessing Future Water Demand for Irrigating Paddy Rice under Shared Socioeconomic Pathways (SSPs) Scenario Using the APEX-Paddy Model)

  • 최순군;조재필;정재학;김민경;엽소진;조세라;오수 당콰 에릭;방정환
    • 한국농공학회논문집
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    • 제63권6호
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    • pp.1-16
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    • 2021
  • Global warming due to climate change is expected to significantly affect the hydrological cycle of agriculture. Therefore, in order to predict the magnitude of climate impact on agricultural water resources in the future, it is necessary to estimate the water demand for irrigation as the climate change. This study aimed at evaluating the future changes in water demand for irrigation under two Shared Socioeconomic Pathways (SSPs) (SSP2-4.5 and SSP5-8.5) scenarios for paddy rice in Gimje, South Korea. The APEX-Paddy model developed for the simulation of paddy environment was used. The model was calibrated and validated using the H2O flux observation data by the eddy covariance system installed at the field. Sixteen General Circulation Models (GCMs) collected from the Climate Model Intercomparison Project phase 6 (CMIP6) and downscaled using Simple Quantile Mapping (SQM) were used. The future climate data obtained were subjected to APEX-Paddy model simulation to evaluate the future water demand for irrigation at the paddy field. Changes in water demand for irrigation were evaluated for Near-future-NF (2011-2040), Mid-future-MF (2041-2070), and Far-future-FF (2071-2100) by comparing with historical data (1981-2010). The result revealed that, water demand for irrigation would increase by 2.3%, 4.8%, and 7.5% for NF, MF and FF respectively under SSP2-4.5 as compared to the historical demand. Under SSP5-8.5, the water demand for irrigation will worsen by 1.6%, 5.7%, 9.7%, for NF, MF and FF respectively. The increasing water demand for irrigating paddy field into the future is due to increasing evapotranspiration resulting from rising daily mean temperatures and solar radiation under the changing climate.

Subaru Strategy for 2020's

  • Arimoto, Nobuo
    • 천문학회보
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    • 제40권2호
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    • pp.27.2-27.2
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    • 2015
  • Strategic plan of Subaru science and operation will be introduced. Currently, Subaru has wide variety of instruments, conducts only classical observations, with less than 5 nights allocation for each proposal. Near future, Subaru will emphasize on surveys, introduce queue mode observations, reduce the number of instruments, and concentrate on large size programs. Large surveys are called Subaru Strategic Programs (SSPs). HSC-SSP is on-going (300 nights for 5 years), PFS-SSP will start at around 2020 (360 nights for 5 years), and IRD-SSP from 2016 (TBD). HSC science includes 1) cosmology with gravitational lensing, 2) lensing studies of galaxies and clusters, 3) photometric redshifts, 4) the Solar system, 5) the Milky Way and the Local Group, 6) AGN/quasars, 7) transients, 8) galaxies at low/high redshifts, and 9) clusters of galaxies. PFS science includes 1) cosmology, 2) galaxy & AGN, and 3) galactic archaeology. Subaru is planning the third pillar instrument, so called ULTIMATE-Subaru, which is the GLAO optical-NIR wide field camera & multi-IFU spectrograph for finding galaxies at ultra high redshift (z>10). Finally the strategy from Subaru to TMT will be presented. Subaru will conduct four major SSPs (HSC, PFS, IRD, ULTIMATE-Subaru) in coming decade to provide targets to TMT. HSC performs wide field surveys to reveal the distribution of dark matter in the Universe. IRD surveys Earth-like young planets to discover ~20 Earth-like habitable planets. PFS studies the expanding Universe to provide a few million emission line galaxies to TMT.

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Yonsei Evolutionary Population Synthesis (YEPS) Model -III. Spectrophotometric Evolutions of Simple Stellar Population Models based on Empirical Spectra

  • Chung, Chul;Yoon, Suk-Jin;Lee, Young-Wook
    • 천문학회보
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    • 제38권2호
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    • pp.38.1-38.1
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    • 2013
  • We present the Yonsei evolutionary population synthesis (YEPS) models based on the high-resolution empirical spectral energy distributions (SEDs). We have adopted the MILES library in the optical wavelength, and our new models based on the MILES library show good agreements with our previous models presented in the YEPS I. The effect of hot horizontal-branch (HB) stars on the integrated properties of simple stellar populations (SSPs) is again confirmed by our models based on empirical SEDs. In addition, we have extended our empirical models to the near-IR wavelength and predicted the strengths of the calcium II triplet (CaT) and the Paschen triplet (PaT) based on the INDO-US and the Cenarro library. We find that the effect of HB stars and the age of SSPs on the CaT is almost negligible. On the other hands, the PaT models are very sensitive to the existence of hot stars, e.g., HB stars and young turn-off stars, and show very similar results with Balmer lines. Interestingly, the CaT distribution of GCs in NGC 1407, which is at odds with the optical (B-I) color distribution, can be explained by the unique feature of the CaT-[Fe/H] relations that show almost the same equivalent widths in the metal-rich regime. We will also discuss the impact of the second-generation populations on the strength of the CaT.

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Surface Brightness Fluctuation of Normal and Helium-enhanced Simple Stellar Populations

  • Chung, Chul;Yoon, Suk-Jin;Cho, Hyejeon;Lee, Sang-Yoon;Lee, Young-Wook
    • 천문학회보
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    • 제45권1호
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    • pp.31.3-32
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    • 2020
  • The surface brightness fluctuation (SBF) is one of the most crucial distance indicators for unresolved stellar systems at large distances. Here, we present an evolutionary population synthesis model of the surface brightness fluctuation (SBF) for normal and He-enriched simple stellar populations (SSPs). Our SBF model for the normal-He population agrees well with other existing models, but the He-rich populations bring about a substantial change in the SBF of SSPs. Our normal-He SBF model well reproduces the observed SBFs of the Milky Way globular clusters, but the SBFs of early-type galaxies in the Virgo Cluster are placed between the normal-He and He-rich SBF models. We show that the SBF-based distance estimation would be affected by up to a 10-20% level in I- and near-IR bands at given colors. Finally, we propose that when combined with independent metallicity and age indicators such as Mg2 and H��, the UV and optical SBFs can readily detect underlying He-rich populations in unresolved stellar systems. Given the degree of the SBF variation resulting from the population difference, we suggest that the distance measurement before the proper in-depth analysis of stellar populations should be done with great caution.

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SSP 시나리오 상세화 자료 기반 생태기후지수를 활용한 고로쇠나무 분포 예측 (Prediction of Acer pictum subsp. mono Distribution using Bioclimatic Predictor Based on SSP Scenario Detailed Data)

  • 김휘문;김채영;조재필;허지나;송원경
    • Ecology and Resilient Infrastructure
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    • 제9권3호
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    • pp.163-173
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    • 2022
  • 기후변화는 종의 생물계절 및 지리적 분포 변화에 많은 영향을 미치는 핵심 요인으로 생태 분야에서는 취약성 평가를 위해 생물의 생리적 특성과 가장 관련이 높은 생태기후지수 (BioClimatic predictor, 이하 BioClim)를 사용하고 있다. 그러나, Shared Socio-economic Pathways (SSPs) 시나리오에 대한 GCM별 미래 기간 기후평균값 이외에 BioClim 값들은 제공되지 않고 있다. 본 연구는 농촌진흥청에서 생산한 1 km 해상도의 SSPs 시나리오 상세화 자료를 이용하여 국내 여건에 적합한 BioClim 자료를 생산하고, 해당 자료를 기반으로 종 분포모형을 적용하여 주로 남부 및 경상북도, 강원도 및 습한 지역에서 생육 환경이 적합한 고로쇠나무의 기준년대 (1981 - 2010년) 및 미래년도 (2011 - 2100년)에 대해 30년 단위로 적합 서식지 분포를 예측했다. 전국자연환경조사자료를 통해 총 819개 지점에서 고로쇠나무 출현 자료를 수집했다. MaxEnt 모형의 성능을 높이기 위해 모형의 매개 변수 (LQH-1.5)를 최적화하고 상세화된 Biolicm 7개 지수와 지형지수 5개를 MaxEnt 모델에 적용했다. 국내 고로쇠나무 분포는 배수, 연 강수량 (Bio12), 경사가 크게 기여하는 것으로 나타났다. 적습하고 비옥한 토양을 선호하는 생육 특성이 반영된 결과로 기후 요인의 영향은 크지 않았다. 이에 따라 기준년도에 고로쇠나무의 높은 수준 적합 서식지는 우리나라 면적의 3.41%, 근미래 (2011 - 2040년) 및 먼미래 (2071 - 2100년)에서 SSP1-2.6은 0.01%, 0.02%를 차지하여 점차 감소하였으나, SSP5-8.5에서는 각각 0.01%, 0.72%로 오히려 기준년도 대비 근미래에는 감소되다가 먼미래로 갈수록 점차 증가하는 경향을 보였다. 본 연구는 기후변화에 보다 적응이 수월한 식생의 미래 분포 양상을 확인한 연구로 기후변화 적응 종이 미래 산림 복원 등에 활용 가능한 기초 연구로 의의가 있다.

MaxEnt를 활용한 기후변화와 토지 피복 변화에 따른 멸강나방 및 혹명나방의 한국 내 분포 변화 분석과 예측 (Analysis and estimation of species distribution of Mythimna seperata and Cnaphalocrocis medinalis with land-cover data under climate change scenario using MaxEnt)

  • 박태철;장호중;엄소은;손기문;박정준
    • 환경생물
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    • 제40권2호
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    • pp.214-223
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    • 2022
  • 멸강나방(Mythimna seperata)과 혹명나방(Cnaphalocrocis medinalis)은 중국 남부 양쯔강 유역에서 봄철 편서풍을 타고 국내로 유입되는 비래 해충(Migratory insect pests)으로 벼를 기주로 삼아 벼 잎을 가해하여 생육을 저해시킨다. 두 나방의 분포를 파악하기 위해서는 서식처의 온습도 뿐만 아니라 주변 환경 요소를 파악하는 것이 중요하다. 본 연구는 두 나방의 분포를 파악하기 위해서 SDM(Species Distribution Model) 중 Machine learning model인 MaxEnt (Maximum Entropy)에 출현 자료, SSPs (Shared Socio-economic Pathways) 시나리오, RCP (Representative Concentration Pathway) 시나리오를 적용하여 현재와 미래의 서식지 적합성 모형을 예측했다. 결과로 시기에 따른 서식처 면적이 큰 차이가 없었으며, SSPs 시나리오가 나빠짐에 따라 분포 면적이 넓어졌다. 두 나방은 중국으로부터 비래 후 생존하기 위한 최적의 장소가 기주가 있는 서해안과 남해안에 집중되어 있다. MaxEnt 결과 토지피복 자료, DEM (Degital Elevation Model) 순으로 기여도가 높게 나타났다. 이는 논에서의 출현 확률 높고 고도가 높아지면서 출현 확률이 낮아졌기 때문이다. 기후 변수에서 멸강나방은 BIO_4 (Temperature seasonality), 혹명나방은 BIO_2 (Mean Diurnal Range)가 높게 나타났다. 멸강나방은 계절에 의한 기온 차가 31.9℃ 이상일 때 서식처가 줄어들고, 혹명나방은 일교차 클수록 서식처가 넓어질 것으로 나타났다. 서식지 적합성 모형에서 두 나방은 대부분의 논에서 서식이 가능할 것이라 예측되었다. 하지만, 두 나방의 출현 위치를 정확하게 예측하는 데 한계가 있으므로, 서식지 적합성 지도를 기초로 조기에 대응하는 것이 중요하다고 판단된다.

대한해협에서 수중음속 구조의 단기변화에 의한 전파손실의 변화정도 (Propagation Loss Variability due to Hourly Variations of Underwater Sound Speed profiles in the Korea Strait)

  • 나영남;심태보;김성일
    • The Journal of the Acoustical Society of Korea
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    • 제14권1E호
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    • pp.5-13
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    • 1995
  • 수중음속 구조의 시간변화에 기인한 전파손실의 변화정도를 추정하기 위해 1993년 10월 대한해협에서 39 시간 동안 1시간 간격의 해양학적 관측을 실시하였다. 수온의 시간 변화를 일으키는 요인을 살펴보기 위하여 해류와 기상학적인 관측도 동시에 실시하였다. 관측기간 동안 표층 혼합층에서 수온의 시간 변화는 관측점 주위 해역의 수괴와 밀접하게 관련되어 있다. 저주파 대역(75-300 Hz) 전파손실은 포물선 방정식 기법을 도입한 모델을 이용하여 계산하고 전 수심에 대해 평균을 취하였다. 수직음속 구조의 시간 변화는 30-50 km 거리에서 10 dB 이상의 전파손실 차이를 일으킬 수 있다. 39 개 수직음속 구조에 대한 전파손실의 표준편차 변화정도는 50 km 거리에서 3 dB에 달한다.

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A TMT-based quantitative proteomic analysis provides insights into the protein changes in the seeds of high- and low- protein content soybean cultivars

  • Min, Cheol Woo;Gupta, Ravi;Truong, Nguyen Van;Bae, Jin Woo;Ko, Jong Min;Lee, Byong Won;Kim, Sun Tae
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제47권3호
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    • pp.209-217
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    • 2020
  • The presence of high amounts of seed storage proteins (SSPs) improves the overall quality of soybean seeds. However, these SSPs pose a major limitation due to their high abundance in soybean seeds. Although various technical advancements including mass-spectrometry and bioinformatics resources were reported, only limited information has been derived to date on soybean seeds at proteome level. Here, we applied a tandem mass tags (TMT)-based quantitative proteomic analysis to identify the significantly modulated proteins in the seeds of two soybean cultivars showing varying protein contents. This approach led to the identification of 5,678 proteins of which 13 and 1,133 proteins showed significant changes in Daewon (low-protein content cultivar) and Saedanbaek (high-protein content cultivar) respectively. Functional annotation revealed that proteins with increased abundance in Saedanbaek were mainly associated with the amino acid and protein metabolism involved in protein synthesis, folding, targeting, and degradation. Taken together, the results presented here provide a pipeline for soybean seed proteome analysis and contribute a better understanding of proteomic changes that may lead to alteration in the protein contents in soybean seeds.

CMIP6 기반 전지구 기온상승에 따른 아시아 지역 기후대 변화분석 (Analysis on Climate Zone Shifts over Asia under Global Warming using CMIP6 Projections)

  • 김정배;배덕효
    • 한국수자원학회:학술대회논문집
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    • 한국수자원학회 2021년도 학술발표회
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    • pp.37-37
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    • 2021
  • 아시아 지역은 전 세계 인구의 60%가 집중되어 있으며, 지역 내에는 다양한 기후대가 혼재되어 있다. 통상, 기후대는 지역의 전반적인 기후 및 가용 수자원 특성을 파악하는데 유용하게 활용된다. 지구온난화의 영향으로 지역의 기후변동성은 심화되고 있으며, 이는 급격한 기후대 이동을 초래할 것으로 전망된다. 본 연구에서는 AR6 기후변화시나리오를 기반으로 전지구 기온상승에 따른 아시아 지역의 기후대 변화특성을 분석하였다. CMIP6 GCMs 및 공유사회경제경로(SSP1-2.6 및 SSP5-8.5) 시나리오를 활용하여 앙상블 기후변화시나리오를 산출하였다. 관측 및 시나리오 자료를 활용하여 산업화 이전 대비 미래 전지구 기온상승(1.5℃~5.0℃) 특성을 추정하였다. 통계적상세화 기법을 적용하여 기후변화시나리오를 상세화하고, 쾨펜 기후구분법을 적용하여 기후특성에 따라 기후대를 구분하였다. 이후, 개별 전지구 기온상승 조건 하에서 아시아 지역의 기후대 분포 및 변화특성을 분석하였다. 전지구 기온이 상승함에 따라 아시아 지역 전반에서 기후대 변화가 가속화되는 것으로 확인되었으며, 이는 모든 SSPs 및 GCMs 시나리오 하에서 동일하였다. 전지구 기온 상승폭은 SSP1-2.6 대비 SSP5-8.5 시나리오 하에서 크게 나타났으며, 동일한 1.5℃ 및 2.0℃ 기온상승 조건에 도달하는 시기도 SSP5-8.5 시나리오에서 현저히 빠른 것으로 분석되었다. 한편, 기후대 이동이 나타나는 지역은 전지구 기온이 상승함에 따라 증가하였으며 5.0℃ (SSP5-8.5) 기온상승 조건 하에서 변화량이 가장 큰 것으로 분석되었다. 다만, 동일한 기온상승 조건 하에서는 SSP 시나리오와 관계없이 기후대 변화 면적 및 공간적 변화패턴이 유사하였다. 기온상승에 따라 아시아 지역 내 열대기후와 건조기후 지역은 확대되는 반면, 온대 및 한랭, 극기후 지역은 줄어들 것으로 전망되었다. 본 연구에서 도출된 전지구 기온상승 조건 별 아시아 지역의 미래 기후대 변화특성은 지역별 기후변화 영향평가 시 기초자료로 활용될 수 있다.

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