• 한국동물위생학회지
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• 제44권4호
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• pp.195-207
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• 2021

Species A rotaviruses (RVAs) replicate and assemble their immature particles within electron dense compartments known as viroplasms, where lipid droplets (LDs) interact with the viroplasm and facilitate viral replication. Despite the importance of LD formation in the life cycle of RVAs, the upstream molecules modulating LD formation remain unclear. This study aimed to find out the role of sterol regulatory element-binding proteins (SREBPs) in reprogramming of LD formation after RVA infection. Here, we demonstrate that RVA infection reprograms the sterol regulatory element-binding proteins (SREBPs)-dependent lipogenic pathways in virus-infected cells, and that both SREBP-1 and -2 transactivated genes, which are involved in fatty acid and cholesterol biosynthesis, are essential for LD formation. Our results showed that pharmacological inhibition of SREBPs using AM580 and betulin and inhibition of their downstream cholesterol biosynthesis (simvastatin for HMG-CoA reductase) and fatty acid enzymes (TOFA) negatively modulated the intracellular triacylglycerides and cholesterol levels and their resulting LD and viroplasm formations. Interestingly, pharmacological inhibition of SREBPs significantly reduced RVA protein synthesis, genome replication and progeny production. This study identified SREBPs-mediated lipogenic reprogramming in RVA-infected host cells, which facilitates virus replication through LD formation and its interaction with viroplasms, suggesting that SREBPs can be a potential target for the development of efficient and affordable therapeutics against RVA infection.

• 생명과학회지
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• 제28권10호
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• pp.1233-1243
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• 2018

SREBPs는 지질의 항상성 및 대사를 조절하는 전사 인자이다. 이들은 내인성 콜레스테롤, 지방산(FA), 트리아실글리세롤(TG) 및 인지질 합성에 필요한 효소의 발현을 정밀하게 조절한다. 3종류의 SREBP 단백질은 2개의 다른 유전자에 의해 암호화 된다. SREBP1 유전자는 SREBP-1a와 SREBP-1c를 만든다. 이는 RNA의 alternative splicing에 의한 대체 프로모터의 이용으로부터 유도된다. SREBP-2는 별도의 유전자에서 유래한다. 또한, SREBPs는 ER 스트레스, 염증, 자가포식 및 세포사멸과 같은 수많은 병인과정에 관여하며, 비만, 이상 지질혈증, 당뇨병 및 비알콜성 지방간 질환 등을 유발하는 것으로 알려져 있다. 유전체의 분석은 SREBPs가 생물학적 신호 전달, 세포 신진 대사, 및 성장을 조절하는 중요한 연결고리임을 보여 주었다. 이 과정에서 SREBP는 PI3K-Akt-mTOR 경로를 통해 활성화 된다고 알려져 있다. 하지만 정확한 분자 메커니즘은 좀더 밝혀져야 한다. 이 리뷰에서는 세포, 기관 및 생물개체 수준의 생리학 및 병태 생리학 영역에서 SREBP의 역할에 대한 포괄적인 이해를 넓혀 줄 것이다.

• 응용통계연구
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• 제29권7호
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• pp.1247-1255
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• 2016

Kim과 Lee (2015)는 한우의 등급과 지방산을 향상시키는 우수한 FABP4 유전자를 선별하였다. 본 연구의 목적은 유전자를 확장하여 한우의 경제형질에 영향을 미치는 우수한 유전자형을 선별하는 것이다. 확장된 유전자는 한우의 등급과 지방산과 깊은 연관이 있다고 밝혀진 FABP4, SCD, FASN, SREBPs이다. 우리는 환경적인 요인을 제거하여 보정된 경제형질 값을 활용하여 보정된 경제형질 값에 다중인자차원축소 방법을 적용한다. 그 결과 한우의 등급, 지방산을 향상시키는 우수한 유전자와 유전자형을 선별했다.

• 동의생리병리학회지
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• 제24권6호
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• pp.989-995
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• 2010

The aim of this study was to investigate the effect of Taeeumjowuitanggagam-bang(TJV) on the mRNA expression of adipocytokines (TNF-${\alpha}$ and IL-6), and SREBPs. Mice were divided into 4 groups ; a normal group of db/+ mice, a control group of db/db mice, a group (db/db mice) treated with TJV 200 mg/kg, and a group (db/db mouse) treated with TJV 500 mg/kg. They were treated orally with TJV and measured their body weight every other day during 9 weeks. After that, we measured the mRNA expression of adipocytokines (TNF-${\alpha}$ and IL-6) and SREBPs (SREBE-1a and SREBP-1c) in liver, and blood concentration of total cholesterol, triglyceride, too. In addition, liver samples were fixed in 4% PFA for 2 hours and stored in $-70^{\circ}C$. Liver tissues were embedded in Optical cutting temperature(OCT) compound and 30 ${\mu}m$ sections were cut. Tissue sections were stained Oil-Red-O to visualize neutral lipids. Nuclei were stained with hematoxylin solution. In result, the TJV reduced the mRNA expressions of TNF-${\alpha}$ and IL-6 and SREBPs in liver and stained liver tissue less red than control group. However, there was no significant differences in total cholestreol and triglyceride blood concentration and body weight among groups. The TJV has inhibitory effect on the mRNA expression of adipocytokines and SREBPs. Therefore, it is assumed that the TJV is related to inhibiting lipogenesis in the liver

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제26권3호
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• pp.677-685
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• 2015

인간의 질병 또는 가축의 경제적인 특성은 단일 유전자보다는 여러 유전자들의 상호작용에 의한 영향을 많이 받는다. 본 연구에서는 이러한 유전자들의 상호작용을 규명하기 위해 기존에 사용되었던 방법들의 단점을 보완한 에스엔피 하비스트 방법을 이용하였다. 사용된 유전자는 최근 한우의 육질에 영향을 미치는 지방산 조성과 깊은 연관이 있다고 밝혀진 단일염기다형성 중 SREBPs (g.3270+10274 C>T, g.13544 T>C)와 FABP4 (g.2634+1018 A>T, g.2988 A>G, g.3690 G>A, g.3710 G>C, g.3977-325 T>C, g.4221 A>G)이며, 경제형질은 한우의 맛과 향에 영향을 주는 올레인산, 불포화지방산, 근내지방도를 이용하였다. 먼저 에스엔피 하비스트 방법을 이용하여 경제형질에 영향을 주는 우수 유전자 조합을 찾은 뒤 다중인자차원축소방법을 이용하여 단일염기다형성 조합 내의 우수 유전자형도 함께 규명하였다.

• 한국균학회소식:학술대회논문집
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• 한국균학회 2015년도 춘계학술대회 및 임시총회
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• pp.15-15
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• 2015

Aspergillus fumigatus is a major cause of invasive aspergillosis (IA), a significant health issue worldwide with high mortality rates up to 95%. Our lab is interested in how A. fumigatus adapts to low oxygen conditions 'hypoxia', which is one of the important host microenvironments. A. fumigatus SrbA is a basic helix-loop-helix (bHLH) transcriptional regulator and belongs to sterol regulatory element binding protein (SREBP) family members. Loss of SrbA completely blocks growth in hypoxia and results in avirulence in murine models of IA suggesting an essential role of SrbA in hypoxia adaptation and virulence in A. fumigatus. We conducted chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) with A. fumigatus wild type using a SrbA specific antibody, and 97 genes were revealed as SrbA direct targets. One of the 'SrbA regulons' (AFUB_099590) was a putative bHLH transcriptional regulator whose sequence contained a characteristic tyrosine substitution in the basic portion of the bHLH domain of SREBPs. Therefore, we designated AFUB_099590 SrbB. Further characterization of SrbB demonstrated that SrbB is important for radial growth, biomass production, and biosynthesis of heme intermediates in hypoxia and virulence in A. fumigatus. A series of quantitative real time PCR showed that transcription of several SrbA regulons is coordinately regulated by two SREBPs, SrbA and SrbB in hypoxia. This suggests that SrbA and SrbB have both dependent and independent functions in regulation of genes responsible for hypoxia adaptation in A. fumigatus. Together, our data provide new insights into complicated roles of SREBPs in adaptation of host environments and virulence in pathogenic fungi.

• 생명과학회지
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• 제31권9호
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• pp.796-805
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• 2021

간 소포체(ER) 스트레스는 비알콜성지방간과 인슐린 저항성의 발달에 기여하고, unfolded protein response(UPR)의 구성요소는 지질 대사를 조절한다. 최근 연구에 따르면 ER 스트레스와 비정상적인 세포 지질 대사 사이의 연관성이 보고되었으며, 이 과정에서 지질 대사의 중심 조절자인 sterol regulatory element binding proteins(SREBPs)의 관련성이 확인되었다. 그러나 ER 스트레스 동안 지질 대사를 조절하는 SREBP의 정확한 역할과 비알콜성지방간에 대한 기여는 아직 밝혀지지 않았다. 본 연구에서 SREBP-1c 결핍은 UPR, 염증 및 지방산 산화 조절을 통해 ER 스트레스에 의해 유도된 비알콜성지방간으로부터 생쥐를 보호한다는 것을 보여준다. SREBP-1c는 inositol requiring kinase 1α (IRE1α) 발현을 직접적으로 조절하고 ER 스트레스에 의해 유도된 tumor necrosis factor-α의 활성화를 매개하여 peroxisome proliferator-activated receptor γ coactivator 1-α (PGC1α)의 감소와 그에 따른 지방산 산화의 장애를 유발한다. 그러나, SREBP-1c의 유전적 결핍은 이러한 현상을 보호하여 간 염증과 지방 축적을 완화시킨다. SREBP-1c 결핍이 ER 스트레스에 의해 유도된 염증 신호를 방지하는 메커니즘은 아직 밝혀지지 않았지만, SREBP-1c가 결핍된 Kupffer 세포에서 IRE1α 신호의 변화가 염증 신호에 관여할 수 있을 것으로 생각된다. 본 연구결과는 SREBP-1c가 ER 스트레스에 의해 유도된 비알콜성지방간에서 UPR 및 염증의 조절에 중요한 역할을 함을 시사한다.

• 동의생리병리학회지
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• 제24권4호
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• pp.638-645
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• 2010

The aim of this study was to investigate the effect of Taeeumjowuitanggagam-bang (TJV) on the mRNA expression of Sterol regulatory element binding proteins (SREBPs), Tumor necrosis factor-$\alpha$ (TNF-$\alpha$) and Interlukin-6 (IL-6) that are considered to play an important role in lipid and glucose metabolism. For diet-induced obese studies, we split mice into 2 groups. The low fat diet group (LFD, n=8) were supplied with general diet for 10 weeks and the high fat diet group (HFD, n=18) were supplied with 60 kcal% fat diet for 10 weeks. And then The HFD group, the diet-induced obese group, were divided into 3 groups ; a group supplied with normal saline, a group treated with TJV 200 mg/kg and a group treated with TJV 500 mg/kg. They were treated orally with TJV and measured their body weight every day during 10 weeks. After that, we measured mRNA expressions of TNF-$\alpha$, IL-6 and SREBP-1c in liver, and blood concentrations of glucose, total cholesterol and triglyceride too. The results are as follows. The TJV reduced glucose and total cholesterol of blood concentration. The TJV reduced the mRNA expressions of TNF-$\alpha$ and SREBPs in liver. However, We couldn't find the TJV effects on the mRNA expression of IL-6, triglyceride blood concentration, and body weight among groups. The TJV stained liver tissue less red than control group. These results suggest that TJV may be effective for regulation of lipid and glucose metabolism in liver.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제25권5호
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• pp.1011-1024
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• 2014

동물 유전학에 있어 한우의 우수한 품질개발과 통계학의 역할을 살펴본다. 본 연구는 한우에서 25 30개월에 특이적으로 유전자 발현이 일어나, 쇠고기 맛에 영향을 미치는 불포화지방산 및 육질등급에 직접적인 연관이 있는 것으로 알려진 6개의 유전자 (SCD, SREBPs, $PPAR{\gamma}$, FABP4, FASN, LPL)내의 30개 에스엔피와 가계 정보가 정확하고 도체 기록이 되어있으며, 포화지방산 및 불포화 지방산과 다가불포화 지방산을 분석한 한우 개체 513두에 대하여 연관 분석을 실시하였다. 그 중 FABP4; g.3977-325 T>C 에스엔피가 우수한 결과를 나타내고 있었다. 특히 선정된 에스엔피의 F-값은 91.36 및 30.00으로 다른 29개의 에스인피들 보다 우수한 효과를 보여주고 있었으며, 현장 농가에 직접적으로 재 검정한 결과 1+등급 이상이 나올 확률이 70.10%로 우수한 마커임을 입증할 수 있었다.

• 한국응용과학기술학회지
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• 제31권1호
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• pp.101-112
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• 2014

본 연구는 고콜레스테롤 식이를 섭취한 랫드에서 파리유충 에탄올추출물(Ethanolic extract of fly maggot, EM)의 경구투여가 혈액 지질감소에 미치는 영향을 조사하였다. Sprague-Dawley 수컷 랫드를 이용하여 4 처리구(EM 투여량; 대조군=0, 5.0, 7.0, 9.0 mg/100 g 체중)로 구분해서 6주 동안 진행하였다. EM 투여군은 대조군과 비교할 때 혈청 중성지방, 총콜레스테롤, LDL-C가 유의하게 낮았다(p<0.05). HMG-CoA reductase activity는 대조군과 비교할 때 EM 투여군에서 낮았으나 총스테롤, 중성스테롤 및 담즙산 배설량은 EM 투여군에서 유의하게 높았다(p<0.05). EM의 혈액 콜레스테롤 감소와 관련한 생물학적 작용기작을 규명하기 위해서 고콜레스테롤 식이를 섭취한 랫드에서 유도된 생체유전자 sterol response element binding proteins (SREBPs) 및 the peroxisome proliferator-activated receptors ($PPAR{\alpha}$) 발현을 측정하였다. EM은 고콜레스테롤 식이를 공급받은 랫드의 간에서 SREBP-$1{\alpha}$, SREBP-2 mRNA 발현을 억압함과 동시에 $PPAR{\alpha}$ mRNA 발현을 촉진시키는 것으로 나타났다(p<0.05). 본 연구의 결과는 파리유충 에탄올추출물이 고콜레스테롤 식이를 섭취한 랫드에서 지질대사와 관련한 생화학적 매개변수 및 유전자발현 조절을 통하여 혈액 콜레스테롤을 낮춘다는 새로운 사실을 발견하였다.