The partial cDNA of the MT-c clone encoding snake venom metalloprotease was subcloned and expressed in E. coli. The expressed metalloprotease was purified by affinity chromatography in the presence of urea, and then successfully refolded into its functional form, retaining metalloprotease activity that hydrolyzes fibrinogen. The simple and convenient refolding strategy established in this work was highly efficient in recovering the recombinant enzyme activity. Experimental evidence suggests that the C-terminal amino acid stretch of 16 residues is a critical sequence for proper folding of the metalloprotease domain.
Achromobacter xylosoxidans KF701 and Pseudomonas putida (NAH7) were significantly different in degradative capability of aromatic compounds including benzoates, biphenyls, and naphthalene. However, both of the bacterial strains can grown on catechol as the sole carbon and energy source. Catechol 2, 3-dioxygenase gene for naphthalene oxidation or biphenyl oxidation was cloned into Escherichia coli HB 701. A E. coli HB 101 clone containing catechol 2, 3-dioxygenase gene from P. putida (NAH7) contains a recombinant plasmid with 3.60kb pBR322 and 6-kb insert DNA. Another E. coli HB101 clone containing catechol 2, 3-dioxygenase gene from A. xylosoxidans KF 701 has a recombinant plasmid with 4.4kb pBR322 and 10-kb insert DNA. Physical maps of the recombinant plasmids were constructed, and catechol 2, 3-dioxygenase gene in the recombinant plasmide was further localized and subcloned int M13. The cloned-catechol 2, 3-dioxygenase game products were identified as yellow bands on nondenaturaing polyacrylamide gel after electrophoresis followed by activity staining with catechol solution.
The identification of tumor antigens is essential for the development of anticancer therapeutic vaccines and clinical diagnosis of cancer. SEREX (serological analysis of recombinant cDNA expression libraries) has been used to identify such tumor antigens by screening sera of patients with cDNA expression libraries. SEREX-defined antigens provide markers for the diagnosis of cancers. Potential diagnostic values of these SEREX-defined antigens have been evaluated. SEREX is also a powerful method for the development of anticancer therapeutics. The development of anticancer vaccines requires that tumor antigens can elicit antigen-specific antibodies or T lymphocytes. More than 2,000 antigens have been discovered by SEFEX. Peptides derived from some of these antigens have been evaluated in clinical trials. This review provides information on the application of SEREX for identification of tumor-associated antigens (TAA) for the development of cancer diagnostics and anticancer therapeutics.
In order to use heat shock promoter for the detection of toxic substances, dnaK promoter was amplified from E. coli genomic DNA by using a polymerase chain reaction(PCR) followed by sequencing and sub-cloning into the multi-cloning site of the plasmid, pUCD615. The pUCD615 is a broad-host-range vector containing promoterless lux operon originated from V.fischeri. The recombinant plasmid was transfered to E. coli DH5$\alpha$ through electroporation. The recombinant E. coli showed several patterns of bioluminescent responses to ethanol stress. The bioluminescent E. coli also showed responses to other toxic substances including FeK3(CN)6, CdCl2, p-nitrophenol and HgCl2. The increases of RLU(Relative Light Unit) were observed at 100ppm of FeK3(CN)6, 10ppm and 100ppm and 100ppm of CdCl2, 1ppm of 10ppm of p-nitrophenol and at 1ppm of HgCl2.
PAP-I cDNA was synthesized from total RNA of Phytolacca americana leaves by RT-PCR, and then subcloned to recombinant vector pBluescript II SK-. Using PCR with primers designed in our laboratory, we could get the 9 deletion mutant PAP-I cDNA fragments. The first of the fragments was deleted by 66bp from immature N-terminal and then the rest were deleted by 90bp sequentially. Sequentially deletion mutant PAP-I cDNAs were inserted to pAc55M, on down-stream of gall promoter. Recombinant pAc55M was transformed to yeast cells, psy1 and the cells were spreaded on SC_urn-/glucose plate media. Colonies on SC_ura-/glucose plate were streaked on the same position of SC_ura-/glucose and SC_ura-/galactose plate, and we selected colonies growing on both plates, which carry non-cytotoxic deleted mutant PAP-I cDNA. We selected 4 deletion mutant PAP-I cDNAs which have not cytotoxicity.
Enterococcus faecalis KBL703 has three plasmids(p703/9, p703/5 and p703/4). Within p703/5, the specific DNA region that would confer replication function(replication origin) was searched by transformation experiments. In order to use as the recipient of transformation, two plasmid-cured strainsd were made from this strain. Four recombinant DNA constructs, each containing fragment of p703/5 and CAT(chloramphenicol acetyl transferase) gene were also made. And they were used to transform the plasmid-cured strains. Only one DNA construct containing 3.6 kb SalI fragment was stably maintained as plasmid in these strains. Additional experiment using another Enterococcus faecalis strain(ATCC29212) as a recipient was successfully done and it was confirmed that this newly constructed recombinant plasmid plasimid contained the replication origin from p703/5 plamid.
An expression vector in a mammalian cell was constructed using the origin of replication (OR) and the promoters of SV40. The plasmid pSVOE was constructed by inserting SV40 DNA fragment (1, 118bp) containing SV40 OR and promoters into pBR322-1, and then a multiple cloning sequence was inserted at the immediate downstream of the late promoter of SV40 in the pSVOE vector. The plasmid was named pSVML. As a selection marker, thymidine kinase gene of herpes simplex virus with its promoter was inserted into EcoRI site of pSVML and the recombinant was named pSVML-TKp. To test the expression capacity of foreigen gene inserted at the multiple cloning site of pSVML, the thymidine kinase gene without its own promoter was inserted at the BamHI site of pSVML. The recombinant was named pSVML-TK. These plasmids, pSVML-TKp and pSVML-TK, were transfected into COS cells with calcium phosphate precipitation method. The thymidine kinase activity was significantly increased in both transfected cells.
장염비브리오균의 숙주 내 감염을 일으키는 기작을 이해하기 위하여 세포외 효소 중의 하나인 콜라겐분해효소의 유전자가 불활성화된 돌연변이체를 제작하였다. 콜라겐분해효소의 유전자인 vppC 유전자에 항생제 내성 유전자인 nptII를 삽입하여 제작된 재조합 DNA를 suicide vector인 pDMS197에 클로닝하여 pVCM03이라 명명하였다. 재조합 suicide 플라스미드 pVCM03을 E. coli 7213에 형질전환하여 접합을 통하여 원 균주인 V. varahaemolyticus 04에 전달하였다. 전달된 pVCM03 유래의 재조합 vvpC::npfII DNA는 homologous recombination에 의해 wild-type allele와 교환되어 돌연변이체를 형성하게 되고, 돌연변이체는 10% sucrose가 함유된 TCBS 배지에서 선별되었다. Allele exchange는 PCR에 의한 증폭된 DNA의 크기 비교로 확인하였다. 돌연변이체인 V. parahaemolyticus CM은 원 균주와 비교하였을 때 약 4배정도 낮은 콜라겐 분해 활성을 나타내었고, vero cell을 이용한 MTT assay에서도 원 균주에 비하여 낮은 세포독성을 보였다.
본 연구의 목적은 인간의 Poly(ADP-ribose) synthetase (PARS)의 cDNA를 클로닝하여 발현시키기 위해 수행하였다. 먼저, 인간의 PARS cDNA 전체를 포함한 pPARS3.1을 pGEM-7Zf(+) 등의 발현 벡터 클로닝하였다. 이 결과로 생성된 재조합 플라스미드 pPARS6.1이 인간의 PARS cDNA 전체를 포함하고, 올바른 방향으로 삽입되었는지를 확인하기 위해 제한효소 지도를 작성하였고, random primed DNA probe을 이용한 Southern blot 분석에 의해서 PARS가 클로닝되었다는 것을 확인하였다. 또한, 염기서열 분석 결과, 단백질 합성이 시작되는 유전 암호가 정확한 순서로 위치하고 있음을 확인하였다. 재조합된 pPARS6.1의 발현을 위해 배양시 0.4 mM IPTG로 처리하여 만들어진 인간의 PARS 단백질이 10% SDS-PAGE에서 120 kDa 위치에 이동하였다는 것을 nick-translated된 DNA를 probe로 이용하여 확인하였고, Southwestern blot 실험 결과 120 kDa과 98kDa에 위치하는 단백질이 DNA와 결합함을 알 수 있었다.
Park, Jin-ho;Chae, Joon-seok;Kim, Dae-hyuk;Jang, Yong-suk;Kwon, Oh-deog;Lee, Joo-mook
대한수의학회지
/
제39권4호
/
pp.797-805
/
1999
T sergenti cDNA library were constructed to get a more broad information about the structural, functional or antigenic properties of the proteins, and analyzes for their partial cDNA sequences and expression sequences tags(ESTg). The mRNA were purified from T sergenti isolates to identify the information of antigen gene, then first and second strand cDNA was synthesized. EcoR I adaptor ligation and Xho I enzyme restriction were used to the synthesized cDNA, and ligated into a Uni-ZAP XR vector. T sergenti cDNA library was constructed with packaging and amplification in vitro. Antibody screening was performed with constructed T sergenti cDNA library using antisera against T sergenti. Among those clones, eight phagemids were rescued from the recombinant in vivo excision with f1 helper phage. Using the analysis of endonuclease restriction and PCR, the recombinant cDNA were proved having a 0.5-3.0kb of inserts. The eight of partial cDNA clones' sequences were obtained and examined for their homology using BLASTN and BLASTX. The eight of sequenced clones were classified into three groups according to the basis of database searches. A total 3,045bp of partial cDNA sequence were determined from six clones. The putatively identified clones contain a cytochrome c gene, a heat shock protein gene, a cyclophilin gene, and a ribosomal protein gene. The unidentified clones have a homology to ATP-binding protein(mtrA) gene of S argillaceus, DNA-binding protein(DBP) gene of Pseudorabies virus 85kDa merozoite protein gene of B bovis, mRNA spm1 protein of T annulata and glycine-rich RNA-binding protein mRNA of O sativa etc.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.