Escherichia coli transcription termination factor Rho catalyzes the unwinding of RNA/DNA duplex in reactions that are coupled to ATP binding and hydrolysis. We report here the kinetic mechanism of presteady state ATP binding and hydrolysis by the Rho-RNA complex. Presteady state chemical quenched-flow technique under multiple turnover condition was used to probe the kinetics of ATP binding and hydrolysis by the Rho-RNA complex. The quenched-flow presteady state kinetics of ATP hydrolysis studies show that three ATPs are bound to the Rho-RNA complex with a rate of $4.4\;{\times}\;10^5M^{-1}s^{-1}$, which are subsequently hydrolyzed at a rate of $88s^{-1}$ and released during the initiation process. Global fit of the presteady state ATP hydrolysis kinetic data suggests that a rapid-equilibrium binding of ATP to Rho-RNA complex occurs prior to the first turnover and the chemistry step is not reversible. The initial burst of three ATPs hydrolysis was proposed to be involved in the initialization step that accompanies proper complex formation of Rho-RNA. Based on these results a kinetic model for initiation process for Rho-RNA complex was proposed relating the mechanism of ATP binding and hydrolysis by Rho to the structural transitions of Rho-RNA complex to reach the steady state phase, which is implicated during translocation along the RNA.
Journal of the Korean institute of surface engineering
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v.41
no.2
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pp.48-50
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2008
Solid phase crystallization (SPC) of amorphous silicon is usually conducted at around $600^{\circ}C$ since it is used in the application of flat panel display using thermally susceptible glass substrate. In this study we conducted SPC experiments at temperatures higher than $600^{\circ}C$ using silicon wafers. Crystallization rate becomes dramatically rapid at higher temperatures since SPC kinetics is controlled by nucleation with high value of activation energy. We report SPC kinetics of high temperatures compared to that of low temperatures.
Proceedings of the Korean Society of Soil and Groundwater Environment Conference
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2002.04a
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pp.118-121
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2002
The kinetics and stoichiometry of the reduction of hexavalent chromium (Cr(Ⅵ)) with ferrous iron (Fe(II)) were examined in systems with and without aquifer solids. Cr(Ⅵ) reduction was rapid in the absence of solids, but demonstrated slower and more complex kinetics in the presence of aquifer solids. The aquifer solids removed Fe(II) from solution and a portion of the reducing capacity of Fe(II) was transferred to the aquifer solids. The solid phases were then able to continue to remove Cr(Ⅵ). This suggests in-situ treatment of Cr(Ⅵ) by Fe(II) injection would be feasible in the aquifer environment. In general, re-oxidation of reduced chromium by molecular oxygen was not observed in our systems over time periods of nearly one year.
Proceedings of the Korean Powder Metallurgy Institute Conference
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2006.09a
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pp.250-251
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2006
It is known that powder characteristics including particle size and distribution, particle shape, and chemical composition are important parameters which influence direct laser sintering of metal powders. In this paper, we introduce a first order kinetics model for densification of steel powders during laser sintering. A densification coefficient (K) is defined which express the potential of different powders to be laser-sintered to a high density dependent on their particle characteristics.
Journal of Korea Technical Association of The Pulp and Paper Industry
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v.39
no.5
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pp.39-44
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2007
In order to utilize unsorted ONP, which contains leaflets (printed coated papers), as a raw material to produce pulp mold, optimum conditions for repulping were investigated with the pilot Helico pulper at Centre Technique du Paper (CTP), France. Two major process factors were focused: repulping concentration and rotor speed. Repulping at a higher concentration showed more rapid defibering kinetics. Increasing the rotational speed of rotor at the optimum repulping concentration accelerated the defibering kinetics while it also led to higher fines generation and faster decrease in drainage property of the produced pulp. Hence, an alternative way was suggested: starting repulping at a conventional rotor speed and then accelerating the rotor speed for the last minute(s) of repulping.
The intramolecular proton transfers of 2-hydroxy-4,5-naphthotropone in room temperature solutions are studied using static and time-resolved absorption and emission spectroscopy. Dual normal and tautomer fluorescence is observed in ethanol solution, while only the tautomer fluorescence is observed in cyclohexane solution. The fluorescence lifetimes and quantum yields in ethanol and cyclohexane solutions indicate that in hydrocarbon solvents, rapid intersystem crossing competes with proton transfer in the first excited singlet state. Transient absorption spectra and kinetics indicate that proton transfer also undergoes in the first triplet state with a transfer time of ∼ 3 ns. No transient absorption from the tautomer ground state indicates a rapid back proton transfer in the ground state.
Kinetics and mechanism for alkaline hydrolysis of C. I. Disperse Blue 79(B-79) which is 4-N, N-diacetoxyethyl-2-acylamino-5-ethoxy -2′-bromo-4′,6′-dinitroazobenzene were investigated. The color strength of B-79 in acetone/water solutions of various NaOH concentrations decreased continuously. The hydrolysis rate of B-79 increased with increasing alkali concentration and appeared following first order reaction. The observed rate constants for various concentrations of B-79 showed similar values, and B-79 was hydrolyzed by first order reaction for dye concentration. Therefore, it was confirmed that the overall reaction follow second order kinetics and proceed via S/sub n/2 reaction. From the study on kinetics and spectrometric analysis, it was proposed that the rate determining step of the hydrolysis reaction of B-79 is the nucleophilic substitution reaction - that is the reaction of the rapid attack of $OH^{-}$ on the carbon atom, which is in acceptor ring, adjacent to azo group to break the C-N bond. And it was also found that the final hydrolysis products of B-79 include both the acceptor ring in the form of sodium salt and the donor ring possessing 4-N,N-dihydroxyethyl group converted from 4-N,N-diacetoxyethyl group.
Kinetics and mechanism for alkaline hydrolysis of C. I. Disperse Blue 79(B-79) which is 4-N, N- diacetoxyethyl -2- acylamino-5-ethos y -2'-bromo-4',6'-dinitroazobenzene were investigated. The color strength of B-79 in acetone/water solutions of various NaOH concentrations decreased continuously. The hydrolysis rate of B-79 increased with increasing alkali concentration and appeared following first order reaction. The observed rate constants for various concentrations of B-79 showed similar values, and B-79 was hydrolyzed by first order reaction for dye concentration. Therefore, it was confirmed that the overall reaction follow second order kinetics and proceed via $S_N2$ reaction. From the study on kinetics and spectrometric analysis, it was proposed that the rate determining step of the hydrolysis reaction of B-79 is the nucleophilic substitution reaction - that is the reaction of the rapid attack of OH- on the carbon atom, which is in acceptor ring, adjacent to auto group to break the C-N bond. And it was also found that the final hydrolysis products of B-79 include both the acceptor ring in the form of sodium salt and the donor ring possessing 4-N,N-dihydroxyethyl group converted from 4-N, N-diacetoxyethyl group.
Protein adsorption kinetics was studied with the amount of proteins adsorbed to contact lens hydrogels over time scales. Hydroxyethylmethacrylate (HEMA) and silicone hydrogels were dipped in protein solutions (albumin or IgG) and adsorption amounts were measured over time scales. The amount of protein adsorbed to both hydrogel types increased rapidly in 10 min, and remained consistently in 90 min. Decreasing interfacial energetics was taken slowly up to an hour in spite of rapid diffusion of protein molecules. This is due to the fact that water deprivation from three dimensional interphase initially formed by protein diffusion took over an hour. Interpretation of adsorption kinetics on contact lens hydrogels was discussed with understanding of relationship between surface energy and protein adsorption capacity.
The dissolution behavior of gold and silver from gold-silver alloys in aerated cyanide solutions has been investigated by an electrochemical means as well as a direct measurement of gold and silver ions reported in the bulk solution as a function of time using rotating disc electrodes. The variables studied included oxygen partial pressure, rotating speed of the disc, concentration of cyanide, temperature and composition of the allyos. The dissolution potential and the rate of dissolution were obtained in view of the anodic and cathodic current-potential relationships. The results were discussed in terms of the mixed potential theory. The results showed that the dissolution rate of gold and silver from the alloys was controlled partially by chemical reaction. but largely by transport of either oxygen or cyanide, depending on their relative concentration under the experimental conditions employed in this study.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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