Padilha, Alessandro Haiduck;Cobuci, Jaime Araujo;Costa, Claudio Napolis;Neto, Jose Braccini
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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제29권6호
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pp.759-767
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2016
The aim of this study was to compare two random regression models (RRM) fitted by fourth ($RRM_4$) and fifth-order Legendre polynomials ($RRM_5$) with a lactation model (LM) for evaluating Holstein cattle in Brazil. Two datasets with the same animals were prepared for this study. To apply test-day RRM and LMs, 262,426 test day records and 30,228 lactation records covering 305 days were prepared, respectively. The lowest values of Akaike's information criterion, Bayesian information criterion, and estimates of the maximum of the likelihood function (-2LogL) were for $RRM_4$. Heritability for 305-day milk yield (305MY) was 0.23 ($RRM_4$), 0.24 ($RRM_5$), and 0.21 (LM). Heritability, additive genetic and permanent environmental variances of test days on days in milk was from 0.16 to 0.27, from 3.76 to 6.88 and from 11.12 to 20.21, respectively. Additive genetic correlations between test days ranged from 0.20 to 0.99. Permanent environmental correlations between test days were between 0.07 and 0.99. Standard deviations of average estimated breeding values (EBVs) for 305MY from $RRM_4$ and $RRM_5$ were from 11% to 30% higher for bulls and around 28% higher for cows than that in LM. Rank correlations between RRM EBVs and LM EBVs were between 0.86 to 0.96 for bulls and 0.80 to 0.87 for cows. Average percentage of gain in reliability of EBVs for 305-day yield increased from 4% to 17% for bulls and from 23% to 24% for cows when reliability of EBVs from RRM models was compared to those from LM model. Random regression model fitted by fourth order Legendre polynomials is recommended for genetic evaluations of Brazilian Holstein cattle because of the higher reliability in the estimation of breeding values.
통행자 수단선택 연구에는 확률 효용 최대화 원칙(RUM)에 입각한 다항로짓모형이 주로 사용되어졌다. 그러나 최근 들어 RUM 원칙을 대신할 대안적 방법론의 제시가 이루어지고 있으며, 이러한 대안적 방법의 하나로 제시된 것이 확률적 후회 이론모형(RRM)이다. 본 연구는 지역간 통행자의 수단선택 행태를 모사함에 있어 RRM 모형을 적용하고, RUM 원칙을 적용한 다항로짓모형의 구축결과와 비교를 통하여 RRM 모형의 적용가능성을 검토하였다. 분석결과, RUM 모형과 RRM 모형 모두 모수 추정결과는 직관과 부합하는 결과를 보였으며, 모형의 자료 적합도는 RUM 모형보다 RRM 모형이 조금 더 높게 도출되었다. 결론적으로 자료적합성 측면에서 RRM 모형이 RUM 모형보다 낫다고 판단할 수 있으나, 아직 일부 사례에만 검토되어졌기 때문에 추후 경로선택, 화물 운송수단 선택 등 더 많은 통행자의 선택상황에 대한 추가적인 검토가 필요하다고 하겠다.
종자 새싹에 대한 소비자의 관심이 세계적으로 증가하면서 영양학적으로 가능성 있는 새싹 잎에 대한 연구가 필요한 실정이다. 흰색(WRM), 청색(BRM) 및 적색(RRM)의 광원에 따른 홍화새싹 성분과 비타민 C 함량을 연구하였다. 대략적인 수분, 회분 및 총 지방의 함량은 BRM 또는 WRM 보다는 RRM 광원으로 재배한 홍화 새싹에서, 조단백질 함량은 BRM이나 RRM 보다는 WRM으로 재배한 홍화 새싹에서 높게 측정되었다. 클로로필 함량은 WRM이나 BRM 보다는 RRM에서 재배한 홍화새싹이 높게 측정되었으며, 비타민 C 함량은 WRM, BRM, 그리고 RRM에서 재배한 홍화새싹에서 각각 157.57, 164.64, 그리고 158.10 mg%이었다. 본 연구 결과는 다양한 광원에서 홍화 새싹을 재배하는 것이 홍화 새싹의 영양학적 품질을 향상시키는 효과적인 방법이라는 것을 보여주었다.
Increasing scientific evidence suggests that ribonucleotide reductase M1 (RRM1) may be a powerful predictor of survival in patients with pancreatic cancer treated with adjuvant gemcitabine-based chemotherapy after operative resection, but many existing studies have yielded inconclusive results. This meta-analysis aimed to assess the prognostic role of RRM1 in predicting survival in patients with pancreatic cancer treated with gemcitabine. An extensive literature search for relevant studies was conducted on PubMed, Embase, Web of Science, Cochrane Library, and CBM databases from their inception through May 1st, 2013. This meta-analysis was performed using the STATA 12.0 software and crude hazard ratios (HRs) with 95% confidence intervals (CIs) were calculated. Eight clinical studies were included in this meta-analysis with a total of 665 pancreatic cancer patients treated with adjuvant gemcitabine-based chemotherapy, including 373 patients in the high RRM1 expression group and 292 patients in the low RRM1 expression group. Our meta-analysis revealed that high RRM1 expression was associated with improved overall survival (OS) of pancreatic cancer patients (HR=1.56, 95%CI=0.95-2.17, P<0.001). High RRM1 expression also was linked to longer disease-free survival (DFS) than low RRM1 expression (HR=1.37, 95%CI=0.25-2.48, P=0.016). In conclusion, our meta-analysis suggests that high RRM1 expression may be associated with improved OS and DFS of pancreatic cancer patients treated with adjuvant gemcitabine-based chemotherapy. Detection of RRM1 expression may be a promising biomarker for gemcitabine response and prognosis in pancreatic cancer patients.
Background: To explore mRNA expression and clinical significance of ERCC1, BRCA1, RRM1, TYMS and TUBB3 genes in tumor tissue of postoperative patients with non-small cell lung cancer (NSCLC). Materials and Methods: Sixty NSCLC patients undergoing radical operation in our hospital from Nov., 2011 to Jun., 2012 were selected. Plasmid standards of ERCC1, BRCA1, RRM1, TYMS and TUBB3 were established and standard curves were prepared by SYBR fluorescent real-time quantitative PCR analysis. Samples from tumor centers were taken to detect mRNA expression of ERCC1, BRCA1, RRM1, TYMS and TUBB3 genes in cancerous tissue during operation. The total mRNA expression quantities were compared according to different clinical characteristics. Results: The total expression quantities of 5 genotypes from high to low were ERCC1>RRM1>TUBB3>TYMS>BRCA1 in turn. By pairwise comparisons, other differences showed statistical significance (p<0.05 or p<0.01) except for TYMS and TUBB3 (p>0.05); the low expression rates from high to low were ERCC1>TYMS>TUBB3>TUBB3>RRM1>BRCA1 in turn. The expression quantities of BRCA1, RRM1 and TYMS in males, smokers and patients without adenocarcinoma were all significantly higher than that in females, non-smokers and patients with adenocarcinoma, and significant differences were present (p<0.05 or p<0.01). In terms of pathological staging, the expression quantities of BRCA1, RRM1 and TYMS in phases IIa~IIb and IIIa~IIIb had a tendency to be greater than in phases I and IV. Conclusions: Resistance to chemotherapy and sensitivity to targeted therapy differ among patients with NSCLC. Differences in gene expression in different individuals were also revealed. Only according to personalized detection results can individualized therapeutic regimens be worked out, which is a new direction for oncotherapy.
전자문서를 대상으로 하는 다양한 보안 기술들이 연구 제시되고 있으나, 키 관리에 대한 어려움과 암호 알고리즘의 무거운 특성으로 안전성과 효율성의 반비례 관계가 발생하고 있다. 본 연구의 목적은 위와 같은 문제를 해결하기 위해 전자문서 암호 시스템에 적용 가능한 제안하는 RRM 기법을 응용하여 키 관리 방안에 적용함으로써 효율적인 암호화 과정을 수행하여 전자문서 보호 문제를 개선하는 것이다. 이를 위하여 난수정보에 규칙성을 부여함으로써 키 생성에 대한 이려움을 극복하고 키 테이블과 키셋 정보를 통해 키 관리 문제를 해결하며, 키셋 정보를 통해 복호화를 위한 연산 수행속도를 빠르게 진행할 수 있는 개선된 전자문서 암호화 시스템 수행을 위한 키 관리 방안을 제안한다. 제안하는 키 관리 방안을 통해 키 생성 연관성 문제를 해결함으로써 키 노출문제에 대한 안정성과 단순한 암복호화 과정에 비해 동일한 복잡도와 수행시간을 갖는 연산 기법을 이용하여 효율성을 높였으며, 전자 문서를 암호화 수행 후 관리를 함으로써 유출문제에 대한 문제도 해결할 수 있다.
연구배경: 약 75% 의 비소세포 폐암에서 loss of heterozygosity (LOH)를 보이는 11p15.5 에 위치한 ribonucleotide reductase M1 subunit gene(RRM1) 유전자는 ras transformed fibroblast를 이용한 실험에서 암세포의 전이능력을 감소시키는 것으로 보고되어 있어서 암억제 유전자로서의 가능성이 높다. RRM1의 promoter 부위인 exon 1 시작에서 (-)37과 (-)524번째 염기에 A/C 그리고 C/T 다형성이 발견되었는데 이 다형성의 양상에 따라 RRM1 유전자의 발현 정도가 조절될 수 있어서 폐암 발생의 위험도가 다를 수 있다. 대상 및 방법: 전남대학교 병원에 내원한 폐암환자들과 비폐암 대조군 환자 127예와 미국인 폐암 환자 140예의 말초혈액 백혈구로부터 얻은 DNA를 이용하여 미국인과 한국인에서의 유전자 다형성의 분포 및 임상적 의의를 조사하였다. 결 과: RRM1 유전자의 Exon 1 으로 부터 (-)37 염기에서 A/C 유전자 다형성은 127예 중 CC가 64예(50.4%), AC는 55예(43.3%), 그리고 AA는 8예(6.3%)에서 발견되었다. Allele A의 빈도는 미국인들의 27.9%에 비하여 한국인에서 28.0%로 차이가 없었고, 폐암군과 비폐암군 간에도 유의한 차이는 관찰되지 않았다. RRM1 유전자의 (-)524 염기에서 C 또는 T 유전자 다형성의 양상은 CC가 24예(18.9%), CT는 44예(34.6%), 그리고 TT는 59예(46.5%)에서 발견되었다. Allele C의 빈도는 36.2%로써 미국인의 34.6%와 차이가 없었고, 폐암군과 비폐암군 간에도 차이는 관찰되지 않았다. RRM1 유전자의 (-)37 염기는 인종에 관계없이 70% 이상에서 C 이었고, (-)524 염기는 65% 정도에서 T를 보이고 있었다. 또한 (-)37과 (-)524 염기는 서로 밀접한 상관관계를 보이고 있었다. 즉 (-)37염기가 모두 C 인 경우 (-)524 염기도 모두 T인 빈도가 높았고, (-)37 염기가 한 개라도 A를 가지고 있는 경우 (-)524 염기도 C를 가지고 있는 빈도가 높았다 (p<0.001). 결 론: RRM1 유전자의 발현을 조절하는 promoter 부위의 두 개의 유전자 다형성의 빈도는 인종 간에 그리고 폐암군과 비폐암군 간에 차이가 없어서 폐암 발생의 위험인자는 아니었다. 그러나 두 유전자 다형성이 서로 특정 조합을 보임으로 그 조합 양상에 따른 promoter 활성도에 대한 연구가 뒤따라야 할 것이다.
Background: Previous studies showed that genetic polymorphisms of glutathione S-transferase P1 (GSTP1) were involved in glutathione metabolism and genetic polymorphisms of ribonucleotide reductase (RRM1) were correlated with DNA synthesis. Here we explored the effects of these polymorphisms on the chemosensitivity and clinical outcome in Chinese non-small cell lung cancer (NSCLC) patients treated with gemcitabine-cisplatin regimens. Materials and Methods: DNA sequencing was used to evaluate genetic polymorphisms of GSTP1 Ile105Val and RRM1 C37A-T524C in 47 NSCLC patients treated with gemcitabine-cisplatin regimens. Clinical response was evaluated according to RECIST criteria after 2 cycles of chemotherapy and toxicity was assessed by 1979 WHO criteria (acute and subacute toxicity graduation criteria in chemotherapeutic agents). Results: There was no statistical significance between sensitive and non-sensitive groups regarding the genotype frequency distribution of GSTP1 Ile105Val polymorphism (p>0.05). But for RRM1 C37A-T524C genotype, sensitive group had higher proportion of high effective genotype than non-sensitive group (p=0.009). And according to the joint detection of GSTP1 Ile105Val and RRM1 C37A-T524C polymorphisms, the proportion of type A (A/A + high effective genotype) was significantly higher in sensitive group than in non-sensitive group (p=0.009). Toxicity showed no correlation with the genotypes between two groups (p>0.05). Conclusions: Compared with single detection of genetic polymorphisms of GSTP1 Ile105Val or RRM1 C37A-T524C, joint detection of both may be more helpful for patients with NSCLC to receive gemcitabine-cisplatin regimens as the first-line chemotherapy. Especially, genetic polymorphism of RRM1 is more likely to be used as an important biomarker to predict the response and toxicity of gemcitabine-cisplatin combination chemotherapy in NSCLC.
최근 스마트 이동 단말기기의 급속한 보급과 더불어 많은 수의WiFi Access Point (AP)가 설치되어 사용되고 있으며, WiFi AP의 증가는 AP 간의 상호 간섭에 의한 트래픽 처리 성능의 저하를 발생시킨다. 이런 현상은 기존 WiFi 망에 활용할 수 있는 트래픽 성능을 향상시키기 위한 방법을 요구한다. 본 연구에서는 트래픽 성능을 향상시키기 위하여 AP의 무선 자원 관리 (RRM : Radio Resource Management)를 최적화하기 위한 채널 할당 방법과 분산형 Wireless LAN (WLAN) 에서의 트래픽 성능 향상 방법에 대하여 연구하였다. 그 결과, AP 단독으로 실행되어 기존방식의 할당 오류를 개선하고 실행속도를 증가시킬 수 있었다.
Background: This study was aimed to establish a novel method to simultaneously detect expression of four genes, ribonucleotide reductase subunit M1(RRM1), X-ray repair cross-complementing gene 1 (XRCC1), thymidylate synthase (TS) and class III ${\beta}$-tubulin (TUBB3), and to assess their application in the clinic for prediction of response of non-small cell lung cancer (NSCLC) to chemoradiotherapy. Materials and Methods: We have designed four gene molecular beacon (MB) probes for multiplex quantitative real-time polymerase chain reactions to examine RRM1, XRCC1, TUBB3 and TS mRNA expression in paraffin-embedded specimens from 50 patients with advanced or metastatic carcinomas. Twenty one NSCLC patients receiving cisplatin-based first-line treatment were analyzed. Results: These molecular beacon probes could specially bind to their target genes in homogeneous solutions. Patients with low RRM1 and XRCC1 mRNA levels were found to have apparently higher response rates to chemoradiotherapy compared with those with high levels of RRM1 and XRCC1 expression (p<0.05). The TS gene expression level was not significantly associated with chemotherapy response (p>0.05). Conclusions: A method of simultaneously detecting four molecular markers was successfully established and applied for evaluation of chemoradiotherapy response. It may be a useful tool in personalized cancer therapy.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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