• 식물조직배양학회지
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• 제22권3호
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• pp.169-173
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• 1995

근관 표피세포(border cell)는 근관(root cap)의 최외각 세포층에서 분화된 단일세포로서, 물리적인 힘을 가하면 예를 들어 근관의 근관 표피세포를 물로 씻어내면, 20∼25시간 이후에는 새로운 층의 근관 표피세포가 근관에 형성된다. 이 새로운 층의 완두 근관 표피세포가 형성되는 동안 근관 표피세포가 제거된 근관에서는 새로운 유전자 발현이 일어나고 있음이 mRNA differential display로 확인되었다. 즉, 이들 근관에서 새롭게 발현되는 유전자들의 일부는 근관 표피 세포의 분화에 관련되어 있다고 볼 수 있다. 또한, 단일 세포로 분화된 근관 표피세포에서는 독특한 유전자 발현이 일어나고 있음이 mRNA differential display로 확인되었다. 이 결과로 알 수 있는 것은 근관 표피세포는 다른 조직(잎, 줄기, 뿌리와 근관 표피세포가 제거된 근관)과는 다른 독특한 기능을 가졌다는 것이다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제42권2호
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• pp.123-127
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• 1999

철은 사람에게 필수적인 영양소일 뿐 아니라 해로운 요소로도 작용한다. 이러한 철에 의해 진핵생물체에서 발현이 조절되는 유전자들을 밝히기 위해 철이 첨가되거나, 제거된 조건에서 배양된 HeLa세포로부터 RNA differential display 방법을 이용하여 발현 또는 억제되는 유전자들을 선별하였다. 모두 24개의 유전자가 선별되었으며, 염기배열 확인과 northern blot의 발현 확인과정을 거쳐 4개의 유전자들이 철에 의해 영향을 받는 것으로 확인되었다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제16권7호
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• pp.1066-1070
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• 2003

In order to identify differentially expressed mRNAs (which represent possible candidates for significant phenotypic variances of muscle growth, meat quality between introduced European and Chinese indigenous pigs) in the longissimus dorsi muscle tissue between adult Duroc and Erhualian pigs, mRNA differential display was performed. Five 3' anchor primers in combination with 20 different 5' arbitrary primers (100 primer sets) were used and nearly 5,000 cDNA bands were examined, among which 10 differential display cDNAs were obtained, cloned and sequenced. Six of the 10 cDNAs showed similarity to identified genes from GenBank and the other 4 had no matches in GenBank. Differential expression was tested by Northern blot hybridization and could be confirmed for 2 cDNAs. The method used in this study provides a useful molecular tool to investigate genetic variation that occurs at the transcriptional level between different breeds.

• BMB Reports
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• 제29권3호
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• pp.272-275
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• 1996

The expression of genes induced by Dichloroacetate (DCA) treatment was analyzed by mRNA differential display. Purified total RNAs from rat liver treated with saline or DCA (100 mg/100 g b.w.) were reverse transcribed by using a set of oligonucleotide primers. The PCR products were resolved on a denaturing sequencing gel. PCR band representing mRNA expressed specifically in DCA-treated liver was excised and reamplified by PCR. A 120-bp c-DNA clone named IC1 was isolated and the DNA sequence of IC1 was analyzed. IC1 revealed 50% homology with 3' end of a mouse fibroblast growth factor mRNA This result indicates that DCA induces the expression of a gene which has a 50% homology with a Mouse fibroblast growth factor, and expression of this gene might be involved in non genotoxic process caused by DCA.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제18권12호
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• pp.1684-1690
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• 2005

Using mRNA differential display technique, we investigated differential gene expression in hybrids relative to their parents in a diallel cross involving four chicken breeds in order to provide an insight into the molecular basis of heterosis in chicken. The results indicated that there was extensive differential gene expression between chicken F1 hybrids and their parents which was classified into four kinds of patterns as following: (1) bands only detected in hybrid F1; (2) bands only absent in hybrid F1; (3) bands only detected in parent P1 or P2; (4) bands absent in parent P1 or P2. Forty-two differentially expressed cDNAs were cloned and sequenced, and their expression patterns were confirmed by Reverse-Northern dot blot. Sequence analysis and database searches revealed that genes showed differential expression between hybrid and parents were regulatory and functional genes involved in metabolism, mRNA splicing, transcriptional regulation, cell cycles and protein modification. These results indicated that hybridization between two parents can cause changes in expression of a variety of genes. In conclusion, that the altered pattern of gene expression in hybrids may be responsible for heterosis in chickens.

• KSBB Journal
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• 제14권6호
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• pp.702-706
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• 1999

대표적인 양식 해조류인 방사무늬 김 엽체를 대상으로 하여 산 처리에 의한 유전형질의 표현 변화를 differential display기법으로 비교하여 보았다. 방사무늬 김 엽체를 0.05% HCl을 첨가한 해수(pH 3.0)에서 5분간 처리한 후 각각 10분, 30분, 60분 그리고 4시간동안 멸균 해수에서 정치 배양시키면서, RNA를 추출하여 cDNA합성, PCR 증폭, agarose gel 전기영동 및 DNA 염기배열을 조사하였다. 그 결과 arbitrary primer OPA 1(CAGGCCCTTC)을 사용하여 differential display한 경우, 산 처리 후 30분간 멸균 해수에서 정치 배양한 엽체에서 특이적으로 RNA 합성이 일어나지 않은 유전자를 분리할 수 있었으며, 그 염기서열을 비교한바 이 유전자 fragment(605 bp)는 dethiobiotin synthetase 유전자와 93%의 높은 상동성을 가진 것으로 나타났다.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제4권1호
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• pp.125-131
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• 2000

Differential display-PCR 방법을 이용하여, hCG 처리에 의한 참돔, Pagrus major의 난성숙 능력의 획득 경과시간에 따라 새롭게 발현하는 cDNA를 해석하였다. Differential display-PCR과 5'RACE 방법을 이용하여, 2,662 염기와 434개의 아미노산을 코드하고 있는 cDNA의 전염기배열을 결정하였다. DNA의 데 이터베이스인 GenBank 및 EMBL을 이용하여 상동성을 검색한 결과, 본 cDNA와 높은 상동성을 나타낸 유전자는 검색되지 않았다. 따라서 본 cDNA는 참돔의 난성숙 능력 유도와 함께 그 발현량이 증가하는 난성숙 관련 유전자로 판단되었다. 또한 본 cDNA에서는 protein kinase C 인산화 및 casein kinaseII 인산화 consensus 배열의 존재가 확인되었다. 본 연구에서 cloning된 난성숙 관련 유전자는 난여포에 hCG 처리 9～24시간 후에 그 발현량이 증가하였으며, GH-II (300 ng/ml)로 배양한 난여포에서 특이적으로 증가하였다. 또한 in vivo 실험에서 난성숙 관련 유전자는 난성숙 능력 획득 이전의 난소에서는 거의 발현하지 않았으나, 난성숙 능력을 획득한 난소에서 강하게 발현된 점으로 보아, hCG에 의한 난성숙 능력 유도에 성숙기간 중 새롭게 합성되는 난성숙 관련 유전자가 관여할 가능성이 높다.

• 한국가축번식학회지
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• 제18권3호
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• pp.199-206
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• 1994

본 연구는 생쥐 배 발생과정의 상이한 발현을 RT-PCR법에 의해 무작위 증폭함으로서 새로운 유전자를 손쉽게 크로닝하기 위해 수행되었다. mRNA의 상이한 display법은 Ling 과 Pardee (Science 257, 1992)에 의해 개발되었으며, 최근 Zimermann과 Schultz (PNAS USA 91, 1994)에 의해 재증명되었다. 이 방법은 특정 유전자의 일시적 발현의 변화가 maternal 제어로부터 접합체 제어로의 이행에 따른 발현전이, 다정자 침입과 단일 정자 침입에 의한 배발생의 기능적 차이, 성공적으로 부화한 배반포기 배와 부화에 실패한 배반포기 배에서의 발현의 차이는 물론 세포주기에 따른 유전자 발현 양식의 변화에 따른 새로운 유전자의 크로닝을 가능케 한다. 이 방법에 의해, 2세포기 특이 발현 유전자를 크로닝 하였으며, 이 유전자는 EcoRI제한 효소 처리후 Southern blot을 행한 결과 약 15kb genomic size를 가진 것으로 나타났다. 이 새로운 유전자는 간장 특이적 발현을 나타내었다. 또한, 적어도 2개의 mRNA가 존재하였으며, 이는 RNA splicing에 의한 것으로 추정되었다. (PCR, RT-PCR, cloning, preimplantation, mouse)

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제7권1호
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• pp.45-50
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• 2005

To clone blue and white flower color specific genes, mRNA differential display was carried out with two different Commelina species, C. communis Linne for blue color and C. coreana Leveille for. leucantha Nakai for white color. Fifty two and 100 cDNA clones specific for blue or white flower color, respectively, were ranging from 200 to 700 bp in size. From the reverse northern blot analysis, 12 and 7 positive clones were selected for blue and white flower, respectively. These clones appear to be novel cDNAs for these Commelina plants, but not color specific. This finding was supported by the northern blot analysis. However, two clones, B18 and B19, derived from blue flowered Commelina were highly expressed than in the white Commelina species, implying that further study will be valuable. The results indicated that both mRNA display experiment and dot blot analysis may not sensitive enough to clone color-determining gene from the plant, leading to explore more advanced method, like high-density colony array study (HDCA).

• 한국수산과학회지
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• 제29권6호
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• pp.770-778
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• 1996

A rapid and economical method of simultaneous extraction of DNA and RNA from seaweeds has been developed by the use of lithium chloride. Lithium chloride facilitates the softening of cell walls resulting in a decrease in both compressive and tensile modulus of elasticity. The DNA was characterized by high molecular weight larger than 27 kb and a relative lack of carbohydrate and protein contamination. The DNA and RNA extracted by the method from many seaweeds were of sufficient quality to be used as a template for per amplification with a plant intergenic gene primer set, for RAPD analysis with arbitrary primers, and for differential display with arbitrary primers in the morphologically distinct regions of the matured Porphyra thallus. The cDNA polymorphism indicated that the reproductive tissue types (male, female, patch) had a relatively high degree of similarity; the vegetative tissue types (dividing, non-dividing) also showed a similar pattern with respect to each other. Holdfast tissue had very low similarity with the other tissues, but appeared most similar to vegetative non-dividing tissue type.