Journal of Physiology & Pathology in Korean Medicine
/
v.22
no.6
/
pp.1572-1578
/
2008
In previous report, Seungmagalgeun-tang (SGT) could exert its anti-inflammatory actions in the BV-2 microglial cells. However, study on the anti-inflammatory effect of SGT in mast cells has not been identified. Therefore, we examined on the anti-inflammatory effect of SGT on the phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) and calcium ionophore A23187-induced rat basophilic leukemia (RBL-2H3) cells. SGT inhibited the release of ${\beta}$-hexosaminidase and secretion and expression of pro-inflammatory cytokines such as tumor necrosis factor (TNF)-${\alpha}$ and interleukin (IL)-4 on RBL-2H3 cells, without affecting cell viability. The protein expression level of nuclear factor (NF)-${\kappa}B$ (p65) was decreased in the nucleus by SGT. In addition, SGT suppressed the degradation of inhibitory protein $I{\kappa}B-{\alpha}$ protein, the activation of p38 mitogen-activated protein kinase (MAPK), and the expressions of cyclooxygenase (COX)-2 mRNA and protein level in RBL-2H3 cells. These results suggest that SGT could be involved anti-allergic effect by control of NF-${\kappa}B$ (p65) translocation into the nucleus through inhibition of $I{\kappa}B-{\alpha}$ degradation and suppression of COX-2 expression.
Neoagaro-oligosaccharides are produced only by enzymatic degradation of agarose by ${\beta}-agarase.^{1)}$ Neoagaro-oligosaccharides inhibit the growth of bacteria, slow the rate of degradation of starch, are used as low-calorie additives to improve food quality, and have macrophage-stimulating activity. Furthermore, neoagarobiose is a rare reagent that has both moisturizing effect on skin and whitening effect on melanoma $cells.^{2)}$ An agar-degrading marine bacterium was isolated from the sea water at the northeast coast in Cheju island, Korea. The strain was gram negative, aerobic, and motile rod. The 16S rRNA of the strain had the closest match of 98% homology, with that from Agarivorans albus. On the basis of several phenotypic characters and a phylogenetic analysis, this strain was designated Agarivorans sp. JA-1. In solid agar plate, Agarivorans sp. JA-1 produced a diffusible agarase that caused agar softening around the colonies. Agarivorans sp. JA-1 was cultured for 36 hr in marine broth 2216 (Difco, USA) and the supernatant that containing an extracellular ${\beta}-agarase$ was prepared by centrifugation of culture media. The enzyme exhibited relatively strong activity at $40^{\circ}C$ and was stable up to $60^{\circ}C$. Using PCR primers derived from the ${\beta}-agarase$ gene of Vibrio sp., the gene encoding ${\beta}-agarase$ from Agarivorans sp. JA-1 was cloned and sequenced. The structural gene consists of 2931 bp encoding 976 amino acids with a predicted molecular weight of 107,360 Da. The deduced amino acid sequence showed 99% and 34% homology to $agaA^{2)}$ and $agaB^{2)}$ genes for ${\beta}-agarase$ from Vibrio sp., respectively. The expression plasmid for ${\beta}-agarase$ gene of Agarivorans sp. JA-1 is being constructed and the recombinant enzyme will be biochemically characterized.
Kim, Tae-Hyun;Lee, Jung-Hyun;Oh, Young-Sook;Bae, Kyung-Sook;Kim, Sang-Jin
Journal of Microbiology
/
v.37
no.3
/
pp.128-135
/
1999
Among oil-degrading microorganisms isolated from oil-polluted industrial areas, one yeast strain showed high degradation activity of aliphatic hydrocarbons. From the analyses of 18S rRNA sequences, fatty acid, coenzyme Q system, G+C content of DNA, and biochemical characteristics, the strain was identified as Yarrowia lipolytica 180. Y. lipolytica 180 degraded 94% of aliphatic hydrocarbons in minimal salts medium containing 0.2% (v/v) of Arabian light crude oil within 3 days at 25$^{\circ}C$. Optimal growth conditions for temperature, pH, NaCl concentration, and crude oil concentration were 30$^{\circ}C$, pH 5-7, 1%, and 2% (v/v), respectively. Y. lipolytica 180 reduced surface tension when cultured on hydrocarbon substrates (1%, v/v), and the measured values of the surface tension were in the range of 51 to 57 dynes/cm. Both the cell free culture broth and cell debris of Y. lipolytica 180 were capable of emulsifying 2% (v/v) crude oil by itself. They were also capable of degrading crude oil (2%). The strain showed a cell surface hydrophobicity higher than 90%, which did not require hydrocarbon substrates for its induction. These results suggest that Y. lipolytica has high oil-degrading activity through its high emulsifying activity and cell hydrophobicity, and further indicate that the cell surface is responsible for the metabolism of aliphatic hydrocarbons.
Journal of Korean Society of Environmental Engineers
/
v.36
no.4
/
pp.265-270
/
2014
Protease producing microorganisms were isolated from many kinds of food waste and fermented foods, which contains high amount and variable kinds of degraded substances. Several microorganisms were identified by 16S rRNA full sequencing analysis methods. The activity of protease was analyzed and identified in variable conditions for the application. For industrial use for biowaste treatment some proteases were isolated, identified and selected from microbial cells. And the tests were carried for the further use. The protein degrading activity at low temperature is useful for the treatment of organic waste, which contains much proteins. By the protein degradation process the organic waste can be utilized in variable fields, for example from feedstuff supplement to fertilizer for agriculture. Bacterial cells with protease activity at low temperature were isolated and identified. The optimal conditions for microbial cultivation and protease production were studied.
The skin plays a key role in protecting the body from the environment and from water loss. Cornified envelope (CE) and natural moisturizing factor (NMF) are considered as the primary regulators of skin hydration and barrier function. The CE prevents loss of water from the body and is formed by cross-linking of several proteins. Among these proteins, filaggrin is an important protein because NMF is produced by the degradation of filaggrin. Proteases, including matriptase and prostasin, stimulate the generation of filaggrin from profilaggrin and caspase-14 plays a role in the degradation of filaggrin. This study elucidated the effects of an ethanol extract of Boesenbergia pandurata (Roxb.) Schltr., known as fingerroot, and its active compound panduratin A on CE formation and filaggrin processing in HaCaT, human epidermal keratinocytes. B. pandurata extract (BPE) and panduratin A significantly stimulated not only CE formation but also the expression of CE proteins, such as loricrin, involucrin, and transglutaminase, which were associated with $PPAR{\alpha}$ expression. The mRNA and protein levels of filaggrin and filaggrin-related enzymes, such as matriptase, prostasin, and caspase-14 were also up-regulated by BPE and panduratin A treatment. These results suggest that BPE and panduratin A are potential nutraceuticals which can enhance skin hydration and barrier function based on their CE formation and filaggrin processing.
Proceedings of the Korean Society of Crop Science Conference
/
2007.04a
/
pp.65-73
/
2007
The objective of this study is to understand how regulatory mechanisms respond to sugar status for more efficient carbon utilization and source-sink regulation in plants. So, we need to identify and characterize many components of sugar-response pathways for a better understanding of sugar responses. For this end, genes responding change of sugar status were screened using Arabidpsis cDNA arrays, and confirmed thirty-six genes to be regulated by sucrose supply in detached leaves by RNA blot analysis. Eleven of them encoding proteins for amino acid metabolism and carbohydrate metabolism were repressed by sugars. The remaining genes induced by sugar supply were for protein synthesis including ribosomal proteins and elongation factors. Among them, I focused on three hydrolase genes encoding putative $\beta$-galactosidase, $\beta$-xylosidase, and $\beta$-glucosidase that were transcriptionally induced in sugar starvation. Homology search indicated that these enzymes were involved in hydrolysis of cell wall polysaccharides. In addition to my results, recent transcriptome analysis suggested multiple genes for cell wall degradation were induced by sugar starvation. Thus, I hypothesized that enzyme for cell wall degradation were synthesized and secreted to hydrolyze cell wall polysaccharides producing carbon source under sugar-starved conditions. In fact, the enzymatic activities of these three enzymes increased in culture medium of Arabidopsis suspension cells under sugar starvation. The $\beta$-galactosidase encoded by At5g56870 was identified as a secretory protein in culture medium of suspension cells by mass spectrometry analysis. This protein was specifically detected under sugar-starved condition with a specific antibody. Induction of these genes was repressed in suspension cells grown with galactose, xylose and glucose as well as with sucrose. In planta, expression of the genes and protein accumulation were detected when photosynthesis was inhibited. Glycosyl hydrolase activity against galactan also increased during sugar starvation. Further, contents of cell wall polysaccharides especially pectin and hemicellulose were markedly decreased associating with sugar starvation in detached leaves. The amount of monosaccharide in pectin and hemicellulose in detached leaves decreased in response to sugar starvation. These results supported my idea that cell wall has one of function to supply carbon source in addition to determination of cell shape and physical support of plant bodies.
Olaniran, Ademola O.;Stafford, William H.L.;Cowan, Don A.;Pillay, Dorsamy;Pillay, Balakrishna
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
v.17
no.4
/
pp.560-570
/
2007
The effective and accurate assessment of the total microbial community diversity is one of the primary challenges in modem microbial ecology, especially for the detection and characterization of unculturable populations and populations with a low abundance. Accordingly, this study was undertaken to investigate the diversity of the microbial community during the biodegradation of cis- and trans-dichloroethenes in soil and wastewater enrichment cultures. Community profiling using PCR targeting the l6S rRNA gene and denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE) revealed an alteration in the bacterial community profiles with time. Exposure to cis- and trans-dichloroethenes led to the disappearance of certain genospecies that were initially observed in the untreated samples. A cluster analysis of the bacterial DGGE community profiles at various sampling times during the degradation process indicated that the community profile became stable after day 10 of the enrichment. DNA sequencing and phylogenetic analysis of selected DGGE bands revealed that the genera Acinetobacter, Pseudomonas, Bacillus, Comamonas, and Arthrobacter, plus several other important uncultured bacterial phylotypes, dominated the enrichment cultures. Thus, the identified dominant phylotypes may play an important role in the degradation of cis- and trans-dichloroethenes.
Quan Zhe-Xue;Rhee Sung-Keun;Bae Jin-Woo;Baek Jong-Hwan;Park Yong-Ha;Lee Sung-Taik
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
v.16
no.2
/
pp.232-239
/
2006
The microbial activity and bacterial community structure of activated sludge reactors, which treated free cyanide (FC), zinc-complexed cyanide (ZC), or nickel-complexed cyanide (NC), were studied. The three reactors (designated as re-FC, re-ZC, and re-NC) were operated for 50 days with a stepwise decrease of hydraulic retention time. In the re-FC and re-ZC reactors, FC or ZC was almost completely removed, whereas approximately 80-87% of NC was removed in re-NC. This result might be attributed to the high toxicity of nickel released after degradation of NC. In the batch test, the sludges taken from re-FC and re-ZC completely degraded FC, ZC, and NC, whereas the sludge from re-NC degraded only NC. Although re-FC and re-ZC showed similar properties in regard to cyanide degradation, denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis of the 16S rRNA gene of the bacterial communities in the three reactors showed that bacterial community was specifically acclimated to each reactor. We found several bacterial sequences in DGGE bands that showed high similarity to known cyanide-degrading bacteria such as Klebsiella spp., Acidovorax spp., and Achromobacter xylosoxidans. Flocforming microorganism might also be one of the major microorganisms, since many sequences related to Zoogloea, Microbacterium, and phylum TM7 were detected in all the reactors.
Bae, Hansol;Choi, Soo Min;Yang, Seong Wook;Pai, Hyun-Sook;Kim, Woo Taek
Molecules and Cells
/
v.28
no.1
/
pp.57-65
/
2009
CDC48 is a member of the AAA ATPase superfamily. Yeast CDC48 and its mammalian homolog p97 are implicated in diverse cellular processes, including mitosis, membrane fusion, and ubiquitin-dependent protein degradation. However, the cellular functions of plant CDC48 proteins are largely unknown. In the present study, we performed virus-induced gene silencing (VIGS) screening and found that silencing of a gene encoding a tobacco CDC48 homolog, NgCDC48, resulted in severe abnormalities in leaf and shoot development in tobacco. Furthermore, transgenic tobacco plants (35S:anti-NgCDC48), in which the NgCDC48 gene was suppressed using the antisense RNA method, exhibited severely aberrant development of both vegetative and reproductive organs, resulting in arrested shoot and leaf growth and sterile flowers. Approximately 57-83% of 35S:anti-NgCDC48 plants failed to develop mature organs and died at early stage of development. Scanning electron microscopy showed that both adaxial and abaxial epidermal pavement cells in antisense transgenic leaves were significantly smaller and more numerous than those in wild type leaves. These results indicate that NgCDC48 is critically involved in cell growth and development of tobacco plants. An in vivo targeting experiment revealed that NgCDC48 resides in the endoplasmic reticulum (ER) in tobacco protoplasts. We consider the tantalizing possibility that CDC48-mediated degradation of an as-yet unidentified protein(s) in the ER might be a critical step for cell growth and expansion in tobacco leaves.
The 90-kDa heat shock protein (HSP90) normally functions as a molecular chaperone participating in folding and stabilizing newly synthesized proteins, and refolding denatured proteins. The HSP90 inhibitor geldanamycin (GA) occupies the ATP/ADP binding pocket of HSP90 so inhibits its chaperone activity and causes subsequent degradation of HSP90 client proteins by proteasomes. Here we show that GA reduces the level of endogenous c-Jun in human embryonic kidney 293 (HEK293) cells in a time and dose dependent manner, and that this decrease can be reversed by transfection of HSP90 plasmids. Transfection of HSP90 plasmids in the absence of GA increases the level of endogenous c-Jun protein, but has no obvious affect on c-Jun mRNA levels. We also showed that HSP90 prolongs the half-life of c-Jun by stabilizing the protein; the proteasome inhibitor N-benzoyloxycarbonyl (Z)-Leu-Leu-leucinal (MG132) blocks the degradation of c-Jun promoted by GA. Transfection of HSP90 plasmids did not obviously alter phosphorylation of c-Jun, and a Jun-2 luciferase activity assay indicated that over-expression of HSP90 elevated the total protein activity of c-Jun in HEK293 cells. All our evidence indicates that HSP90 stabilizes c-Jun protein, and so increases the total activity of c-Jun in HEK293 cells.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.