• 제목/요약/키워드: QTL Mapping

검색결과 164건 처리시간 0.027초

What Holds the Future of Quantitative Genetics? - A Review

  • Lee, Chaeyoung
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
    • /
    • 제15권2호
    • /
    • pp.303-308
    • /
    • 2002
  • Genetic markers engendered by genome projects drew enormous interest in quantitative genetics, but knowledge on genetic architecture of complex traits is limited. Complexities in genetics will not allow us to easily clarify relationship between genotypes and phenotypes for quantitative traits. Quantitative genetics guides an important way in facing such challenges. It is our exciting task to find genes that affect complex traits. In this paper, landmark research and future prospects are discussed on genetic parameter estimation and quantitative trait locus (QTL) mapping as major subjects of interest.

QTL Mapping of qBK1WD to Improve Bakanae Disease Resistance in Rice

  • Lee, Sais-Beul;Hur, Yeon-Jae;Kim, Tae-Heon;Kang, Ju-Won;Cho, Jun-Hyun;Lee, Ji-Yoon;Kwon, Yeongho;Jo, Sumin;Lee, Jong-Hee;Park, No-Bong;Song, You-Cheon;Ko, Jong-Min;Park, Dong-Soo
    • 한국작물학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국작물학회 2019년도 추계학술대회
    • /
    • pp.27-27
    • /
    • 2019
  • PDF

고추 탄저병 저항성 관련 양적형질 유전자좌 분석 (Identification of Quantitative Trait Loci Associated with Anthracnose Resistance in Chili Pepper (Capsicum spp.))

  • 김수;김기택;김동휘;양은영;조명철;;채영;배도함;오대근;황주광
    • 원예과학기술지
    • /
    • 제28권6호
    • /
    • pp.1014-1024
    • /
    • 2010
  • 고추 탄저병은 국내외에서 고추 생산에 있어 많은 피해를 주는 병중의 하나로서, $Colletotrichum$ spp.에 의해 발생하며 현재 가장 많은 빈도를 나타내는 종은 $C.$ $acutatum$으로 보고되고 있다. 살균제에 대한 내성이 있는 것으로 보고되어 저항성 품종의 육성이 요구되어지고 있다. 본 연구의 목적은 $Capsicum$ $baccatum$ 종내 교잡을 통해 고추 탄저병 저항성 육종을 위한 MAS(marker assisted selection) 체계를 개발하는 기초연구로서 저항성과 관련한 QTL분석을 수행하였다. 저항성 검정결과 고추 탄저병저항성은 85%의 높은 광의의 유전력을 보였다. 양적형질 유전자좌 분석 결과 신뢰수준 이상의 LOD 수준을 보인 2개의 QTL($An8.1$, $An9.1$)이 탐색되었고, $R^2$가 2.04%와 14.36%이었다. 유전적인 효과는 $An8.1$은 상가적 효과가 0.46으로, $An9.1$은 상가적 효과가 -4.52로 나타났다. $An8.1$$An9.1$은 상처접종에 의해 나타나는 저항성 반응과 관련이 있는 것으로 생각되었다. 포장검정(08NR)과 관련한 QTL들은 신뢰수준이상의 LOD수준을 보이는 QTL은 탐색할 수 없었으나, $R^2$가 19.9%인 $An3.1$와 30.8%인 $An3.1$을 포함한 5개 QTL의 전체 $R^2$가 60.73%로 나타나 고추 탄저병저항성 유전과 관련한 인자가 다수 존재하는 것을 확인하였다. 따라서 이들 QTL은 더욱 정밀한 집단과 종간교잡 후대에서 적용성을 검정하여 고추 탄저병저항성 품종육성을 위한 MAS체계를 확립할 것이다.

Combined Genome Mapping of RFLP-AFLP-SSR in Pepper

  • Lee, Je Min;Kim, Byung-Dong
    • Genomics & Informatics
    • /
    • 제1권2호
    • /
    • pp.108-112
    • /
    • 2003
  • We have constructed a molecular linkage map of pepper (Capsicum spp.) in an interspecific $F_2$ population of 107 plants with 320 RFLP, 136 AFLP, and 46 SSR markers. The resulting linkage map consists of 15 linkage groups covering 1,720 cM with an average map distance of 3.7 cM between framework markers. Most RFLP markers ($80\%$) were pepper-derived clones and these markers were evenly distributed all over the genome. Genes for defense and biosynthesis of carotenoids and capsaicinoids were mapped on this linkage map. By using 30 primer combinations, AFLP markers were generated in the $F_2$ population. For development of SSR markers in Capsicum, microsatellites were isolated from two small-insert genomic libraries and the GenBank database. This combined map provides a starting point for high-resolution QTL analysis, gene isolation, and molecular breeding.