• 미생물학회지
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• 제53권4호
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• pp.337-339
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• 2017

본 연구에서 남극 킹 조지 섬 인근에서 채집한 지의류 Psoroma 종에서 분리한 Caballeronia sordidicola 균주 PAMC 26633의 초벌 유전체를 분석하였다. 이전의 연구를 통한 극지방의 지의류에 공생하는 Caballeronia 속 세균의 유전체와 마찬가지로 생물공학 및 생태학적으로 활용가능성 있는 다양한 유전자를 발견할 수 있었다. 이는 다양한 대사 관련 유전자를 포함하며, 탄수화물, 아미노산, 질소/황 대사, 스트레스, 세포막 수송체, 항생제 및 중금속 내성에 관련이 있었다. 파아지와 트랜스포존 유전자가 소수 있었으며, CRISPR 관련 유전자 및 서열은 발견되지 않았다.

• 미생물학회지
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• 제53권2호
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• pp.137-140
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• 2017

Caballeronia sordidicola 균주 PAMC 26510은 남극 킹조지섬의 바톤반도에서 채집된 지의류인 Psoroma sp.에서 분리되었다. 균주 PAMC 26510의 초안 유전체 서열은 224개의 콘티그로 이루어졌으며, 총 7,872,143 염기쌍은 59.7% G+C 함량을 나타냈다. 유전체는 7,580개의 단백질 유전자, 6개의 rRNA 유전자와 46개의 tRNA 유전자를 포함하였다. 균주 PAMC 26510는 이전에 연구한 Caballeronia sordidicola에 속하는 북극 균주와 마찬가지로 대사능력에 있어서 광범위한 능력을 가지고 있는 것으로 여겨진다. PAMC 26510의 초안 유전체는 6개의 CRISPR arrays를 각각의 콘티그 상에 가지고 있으며, 이중 두 개의 콘티그 상에 CRISPR-관련 유전자가 연결되어 있었다.