• 제목/요약/키워드: Pseudomonas putida.

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다양한 난분해성 방향족 탄화수소를 분해하는 Pseudomonas의 균주개발 (Development of Versatile Strains of Pseudomonas Degrading Various Persistent Aromatic Hydrocarbons)

  • 이지현;최인성;박경량;박용근;이영록
    • 미생물학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.236-242
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    • 1990
  • 여러가지 난분해성 방향족 화합물을 분해하는 균주들을 개발하기 위해 2,4-D 분해 유전자를 갖는 재조합 플라스미드 pKG2. 나프탈렌 분해 유전자를 갖는 재조합 플라스미드 pKG3 그리고 TOL 플라스미드를 합성세제 분해능을 갖는 P p pulida KUD12와 프탈산에스테르를 분해하는 P.pUlida KUPlO에 각각 형질전환 또는 접합시켰다. P.pulida KUD12로부터 KUDIOl(pKG2), KUDI02(pKG3). KUDI03(TOL), KUD202(pKG3, TOL) 균주판, 또 P.pulida KUPlO으로부터 KUD 106(pKG2). KUD107(pKG3), KUD108(TOL) 균주을 각각 개발하였다. 개발균주의 분해능은 KUD101과 KUD102 그리고 KUD107이 원분해 균주와 비솟하였고, KUDI03과 KUD106 그리고 K KUD202는 원분해 균주보다 분해능이 떨어졌고 KUD108의 분해능은 원균주보다 우수하였다. 개발균주들의 혼합배양 에서는 KUD 107과 KUD108의 혼합배양이 다른 혼합배양틀보다 분해능이 우수한 것으로 나타났다.

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Pseudomonas putida에서 분리한 플라스미드 pKU 10의 특성 (Characteristics of the R plasmid pKU10 isolated from Pseudomonas putida)

  • 임영복;이영록
    • 미생물학회지
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    • 제25권4호
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    • pp.282-289
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    • 1987
  • Pseudomonas putida KU816에서 분리한 플라스미드 pKU10의 여러가지 특성을 조사하고 그 제한 효소 지도를 작성하였다. pKU 10은 암펴설런, 테트라사이클린, 클로람페니콜에 대한 내성 유전자를 갖는 작은 R factor로서 마이토마이신 C에 의하여 큐어링 된다. 플라스미드의 크기는 9.4Kb로 측정되었다. pKU 10은 Pseudomonas와 E.coli블 숙주로 하였을 때 안정하게 형질 발현이 되다. 또한 pKU 10의 불화합성균은 IncP-I으로 조사되었다. Eco RI, Xho I. SaiI, BglII, SmaI은 pKU 10 DNA를 한 부위에서 자르고, Pst I은 두 부위, Hind Ill는 여섯 부위에서 자른다. 제한 효소 지도는 제한 효소를 이중, 삼중으로 완전 소화시키거나, 부분 소화시켜서 얻었다. pKU 10은 Pseudomonas속에서 유용한 클로닝 벡터호 이용된 것으로 기대된다.

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Inactivation of mutS Leads to a Multiple-Drug Resistance in Pseudomonas putida ATCC12633

  • KIM JEONG-NAM;LEE SUNG-JAE;LEE HO-SA;RHIE HO-GUN
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제15권6호
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    • pp.1214-1220
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    • 2005
  • Decreased porin-mediated outer membrane penetration of hydrophilic antibiotics is a common mechanism of antibiotic resistance in Gram-negative bacteria. This study was undertaken to determine whether a null mutation in Pseudomonas putida would suppress porin synthesis, and therefore reduce the susceptibility of the organism to streptomycin, norfloxacin, and tetracycline. Inverse PCR amplification and double-stranded DNA sequencing were used to identify chromosomal genes carrying TnphoA'-1 inserts. Genome database available was used to identify putative homologue genes, one of which encodes protein with homology to domains of the MutS of P. putida, suggesting a crucial role in the multidrug resistance. Increased resistance to streptomycin, norfloxacin, and tetracycline might be due to accumulation of compensatory mutations. Either no growth or slow growth was observed in P. putida KH1027 when grown in minimal medium containing gluconate, glucose, or citrate; however, it is not clear whether the growth patterns contributed to the multidrug resistance.

Major Fe-Superoxide Dismutase (FeSOD) Activity in Pseudomonas putida is Essential for Survival Under Conditions of Oxidative Stress During Microbial Challenge and Nutrient Limitation

  • Kim, Young-Cheol;Kim, Cheol-Soo;Cho, Baik-Ho;Anderson, Anne-J.
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제14권4호
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    • pp.859-862
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    • 2004
  • An isolate of Pseudomonas putida has been found to aggressively colonize root tips and induce plant resistance to Fusarium wilt. However, P. putida mutants lacking Fe-superoxide dismutase (SOD) or both FeSOD and MnSOD activities are less competitive in root tip colonization. In the current study, the growth of an FeSOD mutant was found to be more sensitive than that of the wild-type or a MnSOD mutant to oxidative stress imposed by paraquat treatment and culturing with the soil fungus Talaromyces flavus, which generates reactive oxygen species. Also, the loss of culturability with an aging stationary-phase culture was greater for a double SOD mutant than an FeSOD mutant, while no reduction in culturability was observed with the wild-type and a MnSOD mutant under the same protracted stationary-phase conditions. Accordingly, it was concluded that FeSOD activity is the major form of SOD in P. putida and plays an essential role in survival under stress conditions when increased oxidative stress is encountered.

Pseudomonas putida의 Protocatechuate 경로에 관여하는 초기 효소들의 유전자의 클로닝 및 염기서열 분석비교 (Cloning, Sequencing and Comparison of Genes for early Enzymes of the Protocatechuate (ortho-Cleavage) Pathway in Pseudomonas putida)

  • 홍범식;신동훈;김재호
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제39권6호
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    • pp.472-476
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    • 1996
  • P.putida NCIMB 9869와 P. putida NCIMB 9866의 분해 plasmid pRA 4000과 pRA500으로부터 p-cresol mothylhydroxylase(PCMH)의 flavoprotein(pchF) 및 cytochrome(pCHC) subunit의 구조유전자를 sequencing하였다. 이 두개의 유전자의 DNA 및 아미노산의 염기 서열은 이미 발표를 하였다. 이 두 개의 유전자 이외에도 aldehyde dehydrogenase 유전자가 확인되었다. 이 aldehyde dehydrogenase는 p-hydroxybezaldehyde를 p-hydroxybenzonate로 전환시키는데 p-hydroxybezaldehyde는 P-cresol의 PCMH에 의한 분해 산물이다. 그 외에도 P. putida 9869의 protocatechuate 3,4-dioxigenase의 alpha(pcaG) 및 beta(pcaH) subunit 가 확인되었다. 반면에 P. putida 9866는 상응하는 영역에 이 유전자들을 가지고 있지 않았다(protocatechuate는 p-hydroxyben-zonate hydroxylase에 의해 p-hydroxybenzonate로부터 생성된다). pchC와 pchF사이에 open reading frame이 존재하며 9866로 부터는 추가로 다른 하나의 open reading frame (ORF')가 존재한다. 9869과 9866의 유전자 구조는 각각 dhal-pchC-ORF-pchF-pcaGH과 ORF'-dhal-pchC-ORF-pchF다.

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Carbapenemase를 생산하는 imipenem 내성 세균의 특성 및 항생제 감수성 (Characteristics and Antibiotic Susceptibility of Imipenem-Resistant Clinical Isolates Producing Carbapenemase)

  • 최한나;박철;김형락;백근식;김세나;성치남
    • 생명과학회지
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    • 제20권8호
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    • pp.1214-1220
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    • 2010
  • 대한민국 순천의 병원 입원 환자의 검체로부터 imipenem 내성 세균을 분리하였다. 54개의 분리균을 16S rRNA 유전자와 gyrB 유전자 염기서열 비교를 기초로 하여 계통분류학적으로 동정하였다. 분리균들은 Pseudomonas aeruginosa (30균주; 55.6%), Acinetobacter baumannii (21; 38.9%), Enterobacter hormaechei (2)와 Pseudomonas putida (2)에 속했다. 22개의 균주가 metallo-$\beta$-lactamase (MBL)를 생산하였으며 종별 구성은 다음과 같다; Acinetobacter baumannii 12균주, Pseudomonas aeruginosa 7균주, P. putida 2균주 그리고 Enterobacter hormaechei 1균주. 분리균들의 항생제 감수성은 디스크 확산법과 Vitek 을 이용하여 조사하였다. IMP 와 VIM 형의 metallo-$\beta$-lactamase를 생산하는 균주들은 OXA 와 SHV 형 $\beta$-lactamase를 생산하는 균주들에 비해 ceftazidime, aztreonam, amikacin과 gentamicin에 대한 내성율이 높았다.

Pseudomonas putida P84 균주를 이용한 토마토 풋마름병의 억제 (Suppression of Bacterial Wilt in Tomato Plant Using Pseudomonas putida P84)

  • 서상태;박종한;김경희;이상현;오은성;신상철
    • 식물병연구
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    • 제14권1호
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    • pp.32-36
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    • 2008
  • Ralstonia solanacearum에 의한 풋마름병은 토마토, 감자 등의 작물에 심각한 피해를 주고 있으나, 효과적인 방제법이 없는 실정이다. 일반 병원균의 생물적 방제를 위해 Pseudomonas속의 세균이 가장 일반적으로 이용되고 있는데, 이번 연구에서는 각종 작물의 재배지 토양에서 형광성 세균을 분리하여 Pseudomonas속 특이적 PCR과 항생물질(2,4-diacetylphloroglucinol) 생산 관련 유전자의 유무를 조사하였다. 분리된 150개의 Pseudomonas속 세균 중 항생물질 관련 유전자가 검출된 균은 2균주뿐이였으며, 그중 토마토 근권토양으로 분리된 P. putida P84 세균이 각종 식물 병원 세균에 대해 가장 높은 실내 항균력을 나타내었다. P84 균주의 탄소원별 증식효과는 glucose 첨가시에 가장 좋았으며, arabionse, inositol, melibiose 첨가시에도 우수한 증식효과를 나타내었다. P84세균을 이용한 토마토 풋마름병의 포트실험 결과에서는 60%의 방제효과를 나타내었다.

Optimization of Catechol Production Using Immobilized Resting Cells of Pseudomonas putida in Aqueous/organic Two-phase System

  • Chae, Hee-Jeong;Yoo, Young-Je
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제7권5호
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    • pp.345-351
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    • 1997
  • An aqueous/organic two-phase reaction system was applied to the production of catechol using immobilized resting cells of Pseudomonas putida CY 400. Water/ethyl ether system was used because of high partition coefficient of catechol and thus to reduce the product inhibition and degradation. Among the tested immobilization carriers, polyacrylamide gel gave the highest catechol productivity. The immobilization seemed to protect the cells against solvent toxicity. From the simulation of reaction conditions based on two-phase models, it was found that there was an optimum acetate concentration at fixed benzoate and cell concentrations for the catechol productivity. A lower phase volume ratio (lower fraction of organic phase) gave a higher productivity. However, the substrate conversion was low at low phase volume ratio.

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Biodegradation of Trichloroethylene by Phenol-degrading Pseudomonas putida

  • Shin, Hyun-Jae;Lee, Moo-Yeal;Yang, Ji-Won
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제8권2호
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    • pp.185-187
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    • 1998
  • Pseudomonas putida KCTC 2401 degrades 1,1, 2-trichloroethylene (TCE) using phenol as a cosubstrate. The initial TCE degradation rate decreased with the initial TCE concentration up to 20mg/l of TCE at $30^{\circ}C$ and pH 6.5. The initial degradation rate and total removal efficiency increased with inoculum size. The strain also degraded dichloroacetic acid, which was supposed to be a degradation by-product. Phenol monooxygenase apparently participates in the TCE degradation mechanism.

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Construction of a Reporter Strain Pseudomonas putida for the Detection of Oxidative Stress Caused by Environmental Pollutants

  • Lee Yun-Ho;Ahn Eun-Young;Park Sung-Su;Madsen Eugene L.;Jeon Che-Ok;Park Woo-Jun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제16권3호
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    • pp.386-390
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    • 2006
  • A green fluorescent protein-based Pseudomonas putida reporter was successfully constructed and shown to be capable of detecting oxidative stress. In this whole-cell reporter, the promoter of the paraquat-inducible ferredoxin-$NADP^+$ reductase (fpr) was fused to a promoterless gfp gene on a broad-host-range promoter probe vector. Pseudomonas putida KT2440 harboring this reporter plasmid exhibited an increased level of gfp expression in the presence of redox-cycling agents (paraquat and menadione), hydrogen peroxide, and potential environmental pollutant chemicals such as toluene, paint thinner, gasoline, and diesel. Induction of fpr in the presence of these chemicals was confirmed using Northern blot analysis.