• 제목/요약/키워드: Pseudomonas alcaligenes

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Pseudomonas alcaligenes JCL-43이 생산하는 Carrageenase의 정제 및 특성 (Purification and Characterization of Carrageenase from Pseudomonas alcaligenes JCL-43)

  • 주동식;조순영;이정석;이응호;양승택
    • 생명과학회지
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    • 제9권4호
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    • pp.414-422
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    • 1999
  • Our works performed for preparation of oligosaccharides from carrageenan, seaweed polysaccharide, and one active strain for carrageenan was isolated from sea water and identified to Pseudomonas alcaligenes. Carrageenan degrading enzyme was purified from the culture fluid of isolated strain-Pseudomonas alcaligenes JCL-43, by DEAE-Cellulose, Sephadex G-100, Q-Sepharose and CM Sepharose CL-6B column chromatography. Two enzyme-F-I, F-II- was identified this purifying process, and the molecular weight of the purified carrageenase were estimated to be 23.6kDa and 30.2kDa, respectively. The optimum pH and temperature for two carrageenase activity were 7.0 and 4$0^{\circ}C$. These enzymes were stable in the pH range of 6.0~7.5 and lower than 5$0^{\circ}C$, and required 1.5% NaCl for optimum activity. And these carragennase were inhibited by metal ions such as Cu2+, Zn2+, Hg2+, but increased by Ba2+ and Ca2+, and showed specificity on -carrageenan.

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버섯 세균성회색무늬병균(Pseudomonas agarici)에 대한 Alcaligenes sp. HC12의 항균활성 (Antagonistic Effects of the Bacterium Alcaligenes sp. HC12 on Browning Disease Caused by Pseudomonas agarici)

  • 이찬중;문지원;정종천;공원식
    • 한국균학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.171-175
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    • 2016
  • Pseudomonas agarici에 의해 발생하는 세균성회색무늬병은 양송이 재배에서 문제가 되는 대표적인 병해이다. 본 연구에서는 세균성회색무늬병의 생물학적 방제법에 이용할 수 있는 길항미생물의 항균활성과 선발된 길항미생물에 대해 폿트 수준의 생물검정 실험을 실시하였다. 재배중인 양송이 배지에서 세균성회색무늬병 병원균을 강하게 억제하는 길항세균 HC12를 선발하였으며, 생리 생화학적 실험과 유전적 실험결과 HC12균주는 Alcaligenes sp.로 동정되었다. Alcaligenes sp. HC12를 양송이에 처리한 결과 63%의 방제효과를 보였다. 따라서 Alcaligenes sp. HC12가 양송이버섯 세균성회색무늬병 방제를 위해 합성농약을 대체할 수 있는 친환경 방제제가 될 수 있을 것으로 생각된다.

버섯 세균성회색무늬병균(Pseudomonas agarici)에 대한 길항 세균 Alcaligenes sp. HC12의 대량배양을 위한 최적 배양조건 (Optimum cultivation conditions for mass production of antagonistic bacterium Alcaligenes sp. HC12 effective in antagonistic of browning disease caused by Pseudomonas agarici)

  • 이찬중;문지원;정종천
    • 한국버섯학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.191-196
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    • 2016
  • 버섯 세균갈성색무늬병원균인 Pseudomonas agarici에 대한 길항미생물로 보고된 Alcaligenes sp. HC12 균주의 배양적 특성과 대량 배양을 위한 최적배양 조건을 설정하였다. HC12균주의 생육온도는 $20{\sim}40^{\circ}C$, pH는 6.0 이상에서 왕성한 생육을 보였다. 대량배양을 위한 효율적인 영양원 선발을 위하여 기본배지에 탄소원 fructose 등 18종, 무기질소원 $NH_4Cl$ 등 6종, 유기질소원 peptone 등 6종 그리고 아미노산 asparagine 등 11종을 각각 1%씩 첨가하였고, 무기염류 13종을 첨가하여 각각에 대한 생육에 미치는 영향을 조사하였다. 또한 선발된 각각의 영양성분들에 대한 최적 농도를 조사하기 위하여 각각의 성분을 최소 0.1%에서 최대 4.0%까지 배지에 첨가하여 배양 후 생육정도를 조사하였다. 그 결과, 대량배양을 위한 생육최적조건은 온도 $30^{\circ}C$, pH 9, 탄소원 0.5% dextrine, 유기질소원 1.5% yeast extract, 무기질소원 1.0% $NaNO_3$, 아미노산 1.5% asparagine 그리고 무기염류는 0.5% $KH_2PO_4$에서 왕성한 생육을 보였다.

Pseudomonas alcaligenes JCL-43 유래 Carrageenase를 이용한 카라기난 올리고당의 제조 및 기능 특성 (Preparation of Carrageenan Oligosaccharides Using Carrageenase from Pseudomonas alcaligenes JCL-43 and Its Functional Properties)

  • 주동식;조순영;이응호;양승택
    • 생명과학회지
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    • 제9권4호
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    • pp.423-429
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    • 1999
  • Carrageenan oligosaccharides prepared from -carrageenan by carrageenase from Pseudomonas alcaligenes. The oligosaccharides showed three spots on TLC and the degree of Polymerization of the C1, C2 and C3 spot were each 9.0$\pm$1.0, 6.0$\pm$1.5 and 2.5$\pm$1.5, respectively. Each hydrolysates and spots-C1, C2, C3-were tested the several functionalities such as antimicrobial activity, anticavity activity and anticoagulant activity. The antimicrobial and anticavity activity of carrageenan hydrolysates and oligosaccharide fractions were very low, but the anticoagulant activity was identified in all samples.

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난분해성(難分解性) 공해물질(公害物質) TCAB의 미생물(微生物)에 의(依)한 분해(分解) : (I) TCAB 분해균(分解菌)의 분리(分離) 및 동정(同定) (Microbial degradation of the persistent pollutant TCAB : (I) Isolation and identification of the TCAB-degrading microorganisms)

  • 이재구;임양빈;조용균;경기성;오경석;김학남
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제34권3호
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    • pp.279-286
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    • 1991
  • 우리의 환경(環境) 중(中)에서 난분해성(難分解性) 공해물질(公害物質) TCAB의 미생물(微生物)에 의(依)한 분해(分解) 가능성(可能性)을 연구(硏究)하기 위하여 enrichment technique에 의하여 4종(種)의 미생물(微生物)을 분리(分離)하였다. 이들 균주(菌株)들은 Achromobactor group VD, Pseudomonas alcaligenes, Moraxella spp., 그리고 Alcaligenes faecalis로 각각 동정(同定)되었다. 또한 이들 미생물(微生物)들은 $MM_2$ 무기배지(無機培地)에서 TCAB를 유일(唯一)한 탄소원(炭素源)으로 이용(利用)하였다.

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($\eta^{6}$-Mesitylene) manganese-(Ⅰ) Tricarbonyl hexafluorophosphate를 사용한 Pseudomonas Alcaligenes 5S rRNA의 고차원 구조 분석 (Analysis of Higher Order Structure of 5S rRNA from Pseudomonas Alcaligenes by using($\eta^{6}$-mesitylene) manganese-(Ⅰ) Tricarbonyl hexafluorophosphate)

  • 김상범;박인원
    • 대한화학회지
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    • 제42권2호
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    • pp.209-213
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    • 1998
  • (η6-mesitylene) manganese (Ⅰ) tricarbonyl hexafluorophosphate[MTH-Mn (Ⅰ)]과 황산 이메틸, 피로탄산 이에틸, 과망간산 칼륨 따위 화학탐침들을 사용하여 Pseudomonas alcaligenes 5S rRNA의 고차원 구조를 분석하였다. 5S rRNA의 삼차구조에서 MTH-Mn (Ⅰ)이 강하게 절단하는 자리들은 a고리의 $G_{12}AUGG_{16}$, b-C 구역의 3'쪽 가닥, 즉$G_{51}AAGUGAAGC_{60}$, B-a구역의 $U_{65}-AGCG_{69}$, d고리의 5'쪽 가닥의 $G_{72}AUGG_{76}$ 연속부분 들이다. MTH-Mn(Ⅰ)과 그밖의 화학 탐침들을 사용하여 얻은 절단 양식들에서 우리는, MTH-Mn(Ⅰ)으로 강하게 절단되는 연속부분들이 $tRNA^{Phe}$의 L자 구조의 모서리 부분에서와 같은 주머니 구조를 이룰 것이며, 이러한 구조를 형성할 때 b-C구역과 d고리가 돌쩌귀 구실을 하는 것으로 추정한다.

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Pb(Ⅱ) 이온을 이용한 Pseudomonas alcaligenes 5S rRNA의 고차원 구조 분석 (Analysis of Higher Order Structure of 5S rRNA from Pseudomonas alcaligenes by using Pb(Ⅱ) Ion)

  • 김상범;이영훈;박인원
    • 대한화학회지
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    • 제39권6호
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    • pp.453-458
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    • 1995
  • Pb^{2+}$을 Pseudomonas alcaligenes 5S rRNA의 구조 분석에 응용하였다. Pb^{2+}$이 5S rRNA를 절단하는 방식은 5S rRNA의 삼차구조의 조사에 이용할 수 있을 것으로 기대되는 몇 가지 특징들을 보였다. Pb^{2+}$은 안정한 나선형 줄기들에는 작용하지 않는다. 단일가닥으로된 구역들 또는 내밀린 부분들은 그들의 분자내에서의 위치에 따라 다른 민감도로 작용을 받는다. 불안정한 d 나선은 전혀 작용을 받지 않는다. 불안정한 C 줄기에서는 3'쪽의 가닥만이 작용을 받고 5'쪽의 가닥은 작용을 받지 않는다. Pb^{2+}$에 의한 절단과 Xanthomonas celebensis 5S rRNA의 구조분석의 결과들에 기초하여 우리는5S rRNA에서의 삼차상호작용에 대한 작업가설을 제안하였다.

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Moderate 호염성 세균의 Plasmid 유전자 분리 (Isolation of Plasmids from the Moderately Halophilic Bacteria)

  • 홍용기
    • 한국수산과학회지
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    • 제18권6호
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    • pp.557-562
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    • 1985
  • 천일염으로 부터의 $10\%$ NaCl 농도에서 생육할 수 있는 moderate 호염성 세균들을 대상으로하여 간단한 boiling 법으로 plasmid 유전자를 함유하는 6종을 선별하여 Alkaline-Lysis 법과 고분자 plasmid 추출법인 D. Portnoy & F. White 방법에 따라 plasmid를 추출하여 agarose gel 전기영동으로 확인하였고 각 균을 동정하였다. 그중 Vibrio sp. 14는 최소 7.2kbp, Alcaligenes sp.63은 6.4 kbp, Pseudomonas sp.11은 6.35 kbp, Flavohacterium sp.38은 8.5 kbp, Bacillus sp.16은 8.75 kbp, Alcaligenes sp.52는 6.8kbp 크기의 plasmid를 가지고 있는 것으로 나타났다.

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Molecular Characterization of Extracellular Medium-chain-length Poly(3-hydroxyalkanoate) Depolymerase Genes from Pseudomonas alcaligenes Strains

  • Kim Do Young;Kim Hyun Chul;Kim Sun Young;Rhee Young Ha
    • Journal of Microbiology
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    • 제43권3호
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    • pp.285-294
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    • 2005
  • A bacterial strain M4-7 capable of degrading various polyesters, such as poly$(\varepsilon-caprolactone)$, poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate), poly(3-hydroxyoctanoate), and poly(3-hydroxy-5-phenylvalerate), was isolated from a marine environment and identified as Pseudomonas alcaligenes. The relative molecular mass of a purified extracellular medium-chain-length poly(3-hydroxyalkanoate) (MCL-PHA) depolymerase $(PhaZ_{palM4-7})$ from P. alcaligenes M4-7 was 28.0 kDa, as determined by SDS-PAGE. The $PhaZ_{palM4-7}$ was most active in 50 mM glycine-NaOH buffer (pH 9.0) at $35^{\circ}C$. It was insensitive to dithiothreitol, sodium azide, and iodoacetamide, but susceptible to p-hydroxymercuribenzoic acid, N-bromosuccinimide, acetic anhydride, EDTA, diisopropyl fluorophosphate, phenylmethylsulfonyl fluoride, Tween 80, and Triton X-100. In this study, the genes encoding MCL-PHA depolymerase were cloned, sequenced, and characterized from a soil bacterium, P. alcaligenes LB19 (Kim et al., 2002, Biomacro-molecules 3, 291-296) as well as P. alcaligenes M4-7. The structural gene $(phaZ_{palLB19})$ of MCL-PHA depolymerase of P. alcaligenes LB19 consisted of an 837 bp open reading frame (ORF) encoding a protein of 278 amino acids with a deduced $M_r$ of 30,188 Da. However, the MCL-PHA depolymerase gene $(phaZ_{palM4-7})$ of P. alcaligenes M4-7 was composed of an 834 bp ORF encoding a protein of 277 amino acids with a deduced Mr of 30,323 Da. Amino acid sequence analyses showed that, in the two different polypeptides, a substrate-binding domain and a catalytic domain are located in the N-terminus and in the C-terminus, respectively. The $PhaZ_{palLB19}$ and the $PhaZ_{palM4-7}$ commonly share the lipase box, GISSG, in their catalytic domains, and utilize $^{111}Asn$ and $^{110}Ser$ residues, respectively, as oxyanions that play an important role in transition-state stabilization of hydrolytic reactions.

Alcaligenes sp.와 Pseudomonas sp.의 공동배양 조건에서 박테리아 생장 및 인 제거에 미치는 두 종 중금속의 상호적인 독성효과 평가 (Evaluation for Interactive Toxic Effects of Binary Heavy Metals on Bacterial Growth and Phosphorus Removal under Co-Culture Condition of Alcaligenes sp. and Pseudomonas sp.)

  • 김덕현;박상욱;김덕원;박지수;오은지;유진;정근욱
    • 공업화학
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    • 제31권6호
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    • pp.612-623
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    • 2020
  • 본 연구는 Alcaligenes sp.와 Pseudomonas sp. 균주를 2종 혼합 배양 시, 혼합균주의 생장 및 인 제거에 5종의 중금속(Cd, Cu, Zn, Pb, Ni)이 미치는 저해효과를 정량적으로 평가하고자 수행되었다. 단일 중금속 처리 시 중금속별 Alcaligenes sp.와 Pseudomonas sp. 균주의 IC50는 Cd 0.75 mg/L, Cu 10.93 mg/L, Zn 7.08 mg/L, Pb 13.3 mg/L, Ni 15.78 mg/L 인 것으로 나타났다. 중금속 2종 처리 시 IC50는 Cd + Cu 처리구에서 가장 낮은 농도를 보였고, Ni + Pb 처리구에서 가장 높은 농도를 보였다. 단일 중금속 처리 시 중금속별 EC50 값은 Cd 0.54 mg/L, Cu 11.08 mg/L, Zn 6.14 mg/L, Pb 9.33 mg/L 및 Ni 13.81 mg/L이었다. 2종의 중금속 혼합 처리구별 EC50은 Cd + Zn 처리구에서 가장 낮은 농도, Zn + Ni 처리구에서 가장 높은 농도를 보였다. 2종 혼합 균주에 대한 2종 중금속 처리 결과 도출된 IC50 및 EC50 값을 기반 중금속 별 상호작용 평가 결과, 대부분 길항작용을 보이는 것으로 나타났으나, Cu + Ni 처리구에서는 상승작용을 보이는 것이 확인되었다. 따라서 본 연구 결과는 미생물을 이용한 오폐수 정화 처리 시 미생물의 성장 및 인 제거에 미치는 중금속의 독성으로 인한 저해효과에 대한 기초 자료를 제공할 수 있을 것으로 판단된다.