• 제목/요약/키워드: Protein export

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분열효모에서 THO 복합체의 구성요소인 Tho2가 생장 및 mRNA export에 미치는 영향 (Effects of Tho2, a component of THO complex, on growth and mRNA export in fission yeast)

  • 고은진;윤진호
    • 미생물학회지
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    • 제51권2호
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    • pp.181-185
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    • 2015
  • Tho2/THOC2는 전사 과정을 mRNA 성숙 및 방출과 연결함으로써 mRNP의 생성에 중요한 역할을 담당하는 THO 복합체의 구성인자이다. 분열효모 Schizosaccharomyces pombe의 유전체 데이터에서 Tho2/THOC2의 이종상동체를 찾아 기능을 분석하였다. 4분체 분석 결과 이 유전자는 생장에 필수적이었다. S. pombe tho2 유전자의 발현을 억제하거나 과발현시키면 생장이 저해되는데, 세포의 길이가 길어지고 비정상적인 DNA분포와 $poly(A)^+$ RNA가 핵 안에 축적되는 표현형을 보였다. 또한 정상적인 기능을 가진 GFP-Tho2 단백질은 주로 핵 안에 존재하였다. Yeast two-hybrid 분석에서 Tho2는 THO 복합체의 또 다른 구성인자인 Tex1과 상호작용을 하였다. 이와 같은 결과들은 S. pombe의 Tho2 상동체도 THO 복합체의 구성인자로 mRNA 방출에 관여하고 있음을 시사한다.

분열효모에서 spNab2 유전자의 결실돌연변이 및 과발현에 대한 분석 (Effects of spNab2 Deletion and Over-Expression on mRNA Export)

  • 윤진호
    • 미생물학회지
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    • 제45권4호
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    • pp.300-305
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    • 2009
  • mRNA의 3' 말단형성 뿐만 아니라, 성숙한 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 중요한 역할을 하는 출아효모 Saccharomyces cerevisiae의 폴리(A)-RNA 결합단백질인 Nab2와 유사한 분열효모 Schizosaccharomyces pombe의 단백질을 암호화하는 유전자(spNab2로 명명)의 결실돌연변이주(deletion mutant)를 제조하여 그 특성을 조사하였다. 이배체인 S. pombe 균주에 하나의 spNab2 유전자만을 결실시킨 후 4분체분석(tetrad analysis)을 수행한 결과, S. cerevisiae NAB2와는 다르게 이 유전자는 생장에 반드시 필요하지 않았다. 또한 spNab2 결실돌연변이는 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동도 정상적으로 보였다. spNab2의 역할을 알아보기 위해, 티아민에 의해 발현이 조절되는 강력한 프러모터를 이용하여 spNab2를 과발현시켰다. spNab2 유전자가 과발현되면, 세포의 생장이 심하게 억제되었으며, 폴리(A)-RNA가 핵 안에 축적되고 세포질에서는 줄어들었다. 또한 GFP 융합단백질을 이용하여 spNab2 단백질의 세포 내 위치를 관찰한 결과, spNab2-GFP는 주로 핵 안에 존재하였지만 세포질에서도 관찰되었다. 이와 같은 결과들은 spNab2 유전자 역시 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 관여하고 있음을 시사한다.

분열효모에서 TREX-2 복합체의 구성요소인 Sus1이 생장 및 mRNA 방출에 미치는 영향 (Effects of Sus1, a component of TREX-2 complex, on growth and mRNA export in fission yeast)

  • 배수정;윤진호
    • 미생물학회지
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    • 제53권1호
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    • pp.49-54
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    • 2017
  • Sus1 / ENY2는 진핵생물에 잘 보존된 작은 단백질로 염색사 리모델링과 mRNA 생성과정에 관여한다. Sus1 단백질은 전사 보조활성자인 SAGA 복합체와 핵공과 연관된 TREX2 복합체 등, 핵에 존재하는 2개 복합체의 구성 요소이다. 분열효모 Schizosaccharomyces pombe의 유전체 데이터에서 Sus1의 이종상동체를 찾아 기능을 분석하였다. 4분체 분석 결과 이 유전자는 생장에 필수적이 아니었으나, Sus1 유전자를 결실시키면 낮은 온도에서 생장이 느렸으며, $poly(A)^+$ RNA도 핵 안에 약간 축적되는 표현형을 보였다. 또한 Sus1-GFP 단백질은 주로 핵에 존재하였다. Yeast two-hybrid 분석과 공동면역침전 실험에서 Sus1 단백질은 TREX-2 복합체의 또 다른 구성인자인 Sac3와 상호작용을 하였다. 이와 같은 결과들은 S. pombe의 Sus1 단백질도 역시 TREX-2 복합체의 구성인자로 mRNA 방출에 관여하고 있음을 시사한다.

분열효모에서 THO 복합체의 구성요소인 Tex1/THOC3가 생장 및 mRNA 방출에 미치는 영향 (Effect of Tex1/THOC3, a component of THO complex, on growth and mRNA export in fission yeast)

  • 배수정;고은진;윤진호
    • 미생물학회지
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    • 제53권4호
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    • pp.292-296
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    • 2017
  • 진핵생물에서 THO/TREX 복합체는 전사 신장, pre-mRNA 가공 및 mRNA의 핵에서 방출에 중요한 역할을 담당한다. 이 복합체는 진화적으로 잘 보존되어 있지만, 생명체에 따라 구성성분과 기능에 차이가 존재한다. 이 논문에서는 출아효모보다는 고등생물과 더 유사한 분열효모 Schizosaccharomyces pombe에서 THO/TREX 복합체의 한 구성요소인 spTex1가 생장과 mRNA의 방출에 필수적이지 않다는 것을 보였다. spTex1 유전자의 결실과 과발현 어느 것도 생장의 결함과 $poly(A)^+$ RNA가 핵 안에 축적되는 현상을 거의 보이지 않았다. 또한 spTex1-GFP 단백질은 주로 핵 안에 위치하였다. Yeast two-hybrid와 Co-immunoprecipitation 분석에서 S. pombe Tex1은 THO/TREX 복합체의 주요 구성인자인 spHpr1 (THOC1), spTho2 (THOC2)과 상호작용을 하였다. 이와 같은 결과들은 S. pombe의 Tex1도 THO/TREX 복합체의 구성인자이지만, 생장과 mRNA 방출에는 중요한 역할을 하지 않음을 의미한다.

양이온약제내성을 유도하는 Bacillus subtilis의 Drug Efflux Pump (A Drug Efflux Pump for Cationic Drugs including Disinfectants in Bacillus subtilis)

  • Yong Joon Chung
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제31권3호
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    • pp.230-234
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    • 2003
  • Small multidrug resistance(SMR) family(TC #2.A.7.1)에 속하는 막단백질 중 하나를 coding하는 Bacillus subtilis의 yvaE유전자의 발현을 유도한 결과, 발현된 YvaE단백질에 의해 대장균세포내에서 살균제를 포함한 다양한 양이온 약제에 대한 efflux활성을 촉매하는 것으로 확인되었다. 같은 operon내에 인접한 yaD유전자의 동시발현을 유도한 결과, 이러한 efflux활성은 억제가 되는 것으로 나타났다. Ethidium bromide를 기질로 하여 fluorimeter를 이용한 efflux transport실험결과, YvaE 단백질이 발현된 대장균세포의 경우 vector만을 함유한 대조세포에 비해 현저히 빠른 efflux활성을 보여주었다 따라서 YvaE 막단백질은 multidrug export를 촉매하는 SMR-type efflux pump임을 확인하였다.

CRM1 inhibitor S109 suppresses cell proliferation and induces cell cycle arrest in renal cancer cells

  • Liu, Xuejiao;Chong, Yulong;Liu, Huize;Han, Yan;Niu, Mingshan
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제20권2호
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    • pp.161-168
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    • 2016
  • Abnormal localization of tumor suppressor proteins is a common feature of renal cancer. Nuclear export of these tumor suppressor proteins is mediated by chromosome region maintenance-1 (CRM1). Here, we investigated the antitumor effects of a novel reversible inhibitor of CRM1 on renal cancer cells. We found that S109 inhibits the CRM1-mediated nuclear export of RanBP1 and reduces protein levels of CRM1. Furthermore, the inhibitory effects of S109 on CRM1 is reversible. Our data demonstrated that S109 significantly inhibits proliferation and colony formation of renal cancer cells. Cell cycle assay showed that S109 induced G1-phase arrest, followed by the reduction of Cyclin D1 and increased expression of p53 and p21. We also found that S109 induces nuclear accumulation of tumor suppressor proteins, Foxo1 and p27. Most importantly, mutation of CRM1 at Cys528 position abolished the effects of S109. Taken together, our results indicate that CRM1 is a therapeutic target in renal cancer and the novel reversible CRM1 inhibitor S109 can act as a promising candidate for renal cancer therapy.

Jab1 as a Mediator of Nuclear Export and Cytoplasmic Degradation of p53

  • Lee, Eun-Woo;Oh, Wonkyung;Song, Jaewhan
    • Molecules and Cells
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    • 제22권2호
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    • pp.133-140
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    • 2006
  • Jun activation domain-binding protein 1 (Jab1) is involved in various cellular mechanisms including development in Drosophila and mouse, cell cycle control and signal transduction pathways. Recent studies also determined that Jab1 functions as a nuclear exporter and inducer of cytoplasmic degradation for several proteins including p53, p27, capsid of West Nile virus, and Smad4/7 proteins. In particular, p53 is shown to bind to and to be exported into the cytoplasm by Jab1, which helps to maintain low levels of p53 under normal conditions. This review was undertaken in an effort to understand the biological significance of the homeostasis of p53 as maintained in the presence of Jab1. Based on our observations, we have provided potential mechanistic hypotheses for the nuclear export of p53 in coordination with Jab1 and the role of other factors in these processes.

Successful Use of Bortezomib for Recurrent Progressive Familial Intrahepatic Cholestasis Type II After Liver Transplantation: A Pediatric Case with a 9-Year Follow-Up

  • Yu Gyoung Bak;Ho Jung Choi;Yeong Eun Kim;Seak Hee Oh;Kyung Mo Kim
    • Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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    • 제27권1호
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    • pp.71-76
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    • 2024
  • Recurrence of progressive familial intrahepatic cholestasis (PFIC) type II poses challenges during postoperative liver transplant care. Posttransplant patients with PFIC type II risk developing recurrent cholestasis with normal gamma-glutamyl transferase activity, which mimics the original bile salt export pump (BSEP) protein deficiency and is related to a form of immunoglobulin G antibody (anti-BSEP)-mediated rejection. Bortezomib effectively induces apoptosis of actively antibody-producing plasma cells that may have a role in antibodymediated rejection. In this case, we used bortezomib to treat PFIC type II recurrence after liver transplantation in a child.

Zoogloea Ramigera 115SLR로부터 다당류 생합성에 관여하는 유전자의 분리 및 염기서열 결정 (Cloning and Sequencing of a Gene Involved in the Biosynthesis of Exopolysaccharide in Zoogloea Ramigera 115SLR)

  • Sam-Pin Lee;Min Yoo
    • 대한의생명과학회지
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    • 제6권1호
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    • pp.1-9
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    • 2000
  • Zoogloea ramigera 115SLR로부터 다당류 생합성에 관여하는 유전자를 분리하기 위해서 균주의 genomic DNA로부터 제조된 gene bank로부터 plasmid pLEX3이 얻어졌다. 이로부터 재조합된 5.0 kb DNA fragment를 포함하는 plasmid pLEX10은 다당류의 형태를 변환시키는 유전자를 포함하고 있으며, 이중에서 upstream 영역에 해당하는 1.7 kb DNA fragment가 분리되었다. 1.7 kb DNA 염기서열의 결과로부터 단백질을 인지 할 수 있는 2개의 ORF가 존재하였으며, 50 kDa 단백질을 인지 할 수 있는 ORF3은 X. campestris의 다당류 생합성 유전자들인 gumC와 R. meliloti의 exoP와 아미노산의 동질성을 나타내었다. ORF4는 N-terminal 영역이 결여된 단백질을 인지하며, Thermotoga maritime의 다당류 export에 관여하는 단백질과 동질성을 보였다. Z. ramigera 115SLR and Z. ramigera 115SLR/pLEX10은 각각 slime또는 capsule 형태의 다당류를 생합성하며 이들로부터 생합성된 다당류양은 각각 0.26% (w/v) and 0.16% (w/v)였다.

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Bacillus subtilis의 단백질 분비기구 SecY의 유전자 수준의 조절이 단백질 분비에 미치는 영향

  • 김상숙;김순옥;서주원
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제24권4호
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    • pp.408-414
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    • 1996
  • The SecY is a central component of the protein export machinery that mediate the translocation of secretory proteins across the plasma membrane, and has been known to be rate-limiting factor of secretion in Escherichia coli. In order to study the extracellular protein secretion in Gram-positive microorganism, we have, constructed strains harboring more than one copy of the gene for SecY. Firstly, the gene, for B. subtilis SecY and its promoter region was subcloned into pDH32 and the chimeric vector was inserted into amyE locus by homologous recombination. Secondly, low copy number vector, pCED6, was also used for subcloning the secY gene and for constructing a strain which harbors several copies of secY. The KH1 cell which harbor two copies of secY on the chromosome excreted more extracellular proteins than the wild type PB2. Moreover, the KH2 cells which harbor several copies of secY in pCED6 vector excreted more extracellular proteins than the KH1 cells. Here, we found that the capacity of protein secretion is partly controlled by the number of secY and it is suggested that SecY has also an important role in protein secretion in B. subtilis, a gram positive microorganism, as like in E. coli. This will promote the use of B. subtilis as a host for the expression of useful foreign gene and excretion of precious proteins.

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