• BMB Reports
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• 제38권1호
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• pp.24-27
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• 2005

The role of 3' exonuclease excision in DNA polymerization was evaluated for primer extension using inert allele specific primers with exonuclease-digestible ddNMP at their 3' termini. Efficient primer extension was observed in amplicons where the inert allele specific primers and their corresponding templates were mismatched. However, no primer-extended products were yielded by matched amplicons with inert primers. As a control, polymerase without proofreading activity failed to yield primer extended products from inert primers regardless of whether the primers and templates were matched or mismatched. These data indicated that activation was undertaken for the inert allele specific primers through mismatch proofreading. Complementary to our previously developed SNP-operated on/off switch, in which DNA polymerization only occurs in matched amplicon, this new mutation detection assay mediated by $exo^+$ DNA polymerases has immediate applications in SNP analysis independently or in combination of the two assays.

• 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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• 제33권2호
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• pp.231-242
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• 2006

펜 기반 교정 환경에서 정확한 마킹영역을 판별하기 위해서는 사용자가 드로잉한 교정마킹과 문서영역간의 관계를 판별하는 과정에서 발생하는 모호성(ambiguity)을 해결하여야 한다. 또한 웹 및 XML과 같은 구조문서 환경에서는 변경된 문서구조가 반드시 정의된 DTD에 따라야 한다. 본 논문에서는 자유형 마킹에 의한 교정부호 입력이 가능하며, 교정 마킹과 원본문서의 영역을 판별하는 과정에서 발생하는 모호성 문제를 최소화하기 위한 컨텍스트 기반의 영역인식 및 보정 인터페이스(Context-based Proofreading Interface)를 제안한다. 제안 인터페이스에서는 교정부호의 입력에 따른 문서내용 및 구조의 변화가 발생할 경우 올바르게 문서 구조를 유지하기 위한 구조변경 방법을 제공한다. 그 결과 본 논문에서 생성된 교정 마킹 정보는 기존 교정시스템에 비하여 보다 정확한 영역정보를 포함할 수 있으며, 교정부호 입력에 따른 구조문서 변경시에도 원본문서의 DTD에 따르는 문서구조를 유지할 수 있다.

• 생명과학회지
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• 제29권8호
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• pp.916-921
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• 2019

본 연구는 내열성, 에탄올내성 및 에탄올생산성이 향상된 새로운 생물시스템을 육종하기 위해 DNA 복제 시 교정기능이 결여된 변이주(proofreading-deficient mutant)를 이용한 무작위적 돌연변이(random mutagenesis)를 유도하였다. DNA polymerase ${\delta}$와 ${\varepsilon}$의 catalytic subunit를 코드하고 있는 POL3와 POL2 유전자가 변이된 AMY410 균주(pol2-4)와 AMY126 균주(pol3-01)를 이용하여 $30^{\circ}C$, $38^{\circ}C$, $48^{\circ}C$에서 내열성 변이를 유도하였다. AMY410 균주와 AMY126 균주는 $38^{\circ}C$ 이상의 온도에서는 거의 자랄 수가 없기 때문에, 배양 온도를 점차 높여가며 변이를 유도한 결과, $40^{\circ}C$에서도 잘 자라는 AMY410-Ht와 AMY126-Ht 균주를 선별할 수 있었다. 또한 AMY410-Ht와 AMY126-Ht 균주의 에탄올내성을 추가로 획득하기 위해 6%와 8% 에탄올이 함유된 배지에서 변이를 유도하였고, 8% 에탄올 농도에서 내성을 가지는 AMY410-HEt 균주와 AMY126-HEt 균주를 분리하였다. 특히 AMY126-HEt 균주는 10% 에탄올 농도에서도 내성을 가짐을 확인할 수 있었다. AMY126-HEt 균주의 에탄올생산성의 증가를 위한 변이는 고농도 당(glucose)의 첨가에 의해 유도되었고, 50 g/l의 고농도 glucose를 함유한 배지에서 24.7 g/l의 에탄올(95% 이론적 전환수율)을 생산할 수 있는 고효율 에탄올 생산균주(AMY126-HEt3)를 최종 분리하였다. 따라서, 본 연구를 통해서 교정기능이 결여된 균주(proofreading-deficient mutant)를 사용한 돌연변이법으로 산업적으로 유용한 다양한 형질을 가진 생물시스템의 구축이 가능함을 확인하였다.

• 한국정보통신학회:학술대회논문집
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• 한국해양정보통신학회 2007년도 춘계종합학술대회
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• pp.83-86
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• 2007

디지털 계측기를 인터넷에 접속하여 원격지에서 검 교정을 하기 위해서는 계측기의 CPU 사용률이 많은 일반 서버와는 다른 임베디드 운영체제를 이용한 고속 전용서버가 필요하다. 본 연구는 웹 기반 원격 검 교정 시스템을 위한 고속 네트워크 모듈을 구현하는 목적이며 인터넷을 통해 디지털 계측기를 원격으로 검 교정을 하고, 고속 네트워킹을 위해 TCP/IP Offload Engine 처리와 임베디드 TCP/IP 스택인 LwIP를 개선하였다.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제11권6호
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• pp.1077-1082
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• 2007

디지털 계측기를 인터넷에 접속하여 원격지에서 검 교정을 하기 위해서는 계측기의 CPU 사용률이 많은 일반 서버와는 다른 임베디드 운영체제를 이용한 고속 전용서버가 필요하다. 본 연구는 웹 기반 원격 검 교정 시스템을 위한 고속 네트워크 모듈을 구현하는 목적이며 인터넷을 통해 디지털 계측기를 원격으로 검 교정을 하고, 고속 네트워킹을 위해 TCP/IP Offload Engine 처리와 임베디드 TCP/IP 스택인 LwIP를 개선하였다.

• BMB Reports
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• 제36권6호
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• pp.525-528
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• 2003

The role of 3' exonuclease excision in DNA polymerization was evaluated in primer extensions using 3' allele-specific primers that had exonuclease-digestible and exonuclease-resistant 3' termini. With exonuclease-digestible unmodified 3' mismatched primers, the exo+ polymerase yielded template-dependent products. Using exonuclease-resistant 3' mismatched primers, no primer-extended product resulted from exo+ polymerase. As a control, polymerase without proofreading activity yielded primer-dependent products from 3' mismatched primers. These data indicated that a successful removal of the mismatch is required for DNA polymerization from the 3' mismatched primers by exo+ polymerase. In addition to the well-known proofreading from this mismatch removal, the premature termination in DNA polymerization, due to the failure of the efficient removal of the mismatched nucleotides, worked as an off-switch in maintaining the high fidelity in DNA replication from exo+ polymerase.

• 한국컴퓨터그래픽스학회논문지
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• 제27권4호
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• pp.1-9
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• 2021

축삭(axon), 가지돌기(dendrite), 신경세포체(cell body)와 같은 뉴런의 소기관을 분리하는 작업은 신경학적 현상의 분석에 도움을 준다. 최근에 딥러닝 기술을 이용하여 이를 수행하고자 하는 시도들이 있지만, 데이터의 노이즈, 훈련 데이터와의 차이 등으로 인해 결과에 오류를 포함할 가능성이 있다. 따라서, 이러한 기술을 실제 분석에 활용하기 위해서는 결과를 교정하는 과정이 필수적이지만, 이는 전문가가 수작업으로 수행해야 하기 때문에 많은 노력과 시간이 소요된다. 우리는 딥러닝 결과에 존재하는 오류들을 보다 손쉽게 교정할 수 있는 대화형 뉴런 구조 교정 방법을 제안한다. 이 방법은 구조적 일관성을 지니는 뉴런의 특성을 기반으로 뉴런 구조를 교정하여 적은 사용자의 인터랙션으로도 높은 정확도의 교정 결과를 얻을 수 있도록 한다.

• 정보교육학회논문지
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• 제11권1호
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• pp.107-116
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• 2007

전자펜을 이용한 문서교정 시스템에서 정확한 교정결과를 보장하기 위해서는 문서 교정자가 드로잉한 교정부호와 문서내용간의 영역 모호성(ambiguity)을 해결하여야 한다. 한편 교정의 대상이 되는 전자문서가 HTML/XML과 같은 경우 교정된 문서구조가 반드시 기 정의된 DTD를 위배하지 않아야 한다. 본 논문에서는 펜 기반의 교정시스템에서 교정부호(마킹)와 대상문서간의 모호성 문제를 최소화하기 위한 기법을 제안한다. 제안 인터페이스에서는 모호성 문제를 최소화하기 위하여 교정부호와 문서간의 컨텍스트(Context)를 반영하였으며 동시에 대상문서의 문서 구조를 유지하기 위한 방법을 제공한다. 그 결과 본 논문에서 제안한 교정 인터페이스는 기존 교정시스템에 비하여 보다 정확한 영역정보를 포함할 수 있으며, 교정부호 입력에 따른 구조문서 변경시에도 원본문서의 DTD에 따르는 문서구조를 유지할 수 있다.

• Industrial Engineering and Management Systems
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• 제9권3호
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• pp.275-284
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• 2010

Offshore software development (OSD) is international business collaboration. OSD projects often encounter intercultural and inter-linguistic problems disturbing the projects. Business documents are formal media of information and knowledge for OSD. While OSD documents should convey common understanding of the OSD products, the documents may contain unsuitable expressions which draw misunderstanding of the required products and offensive issues for the collaboration. Intercultural and inter-linguistic differences cause mistakes and inappropriate expressions. OSD from Japan to China is the largest in Asia, and Japanese language is often used in OSD documents. Large similarity is found between Japanese and Chinese in their languages, while many differences exist even for the same word. The similarity induces to write unsuitable expressions for both sides of OSD. To introduce risks for OSD projects caused by unsuitable or inappropriate expressions in OSD documents, we propose to apply a proofreading system of Japanese documents for OSD. Japanese consignor uses the system to refine OSD documents written by Japanese engineers for Chinese readers, and Chinese consignee uses it to refine Japanese documents written by Chinese Engineers as derivatives of OSD projects. Effectiveness of applying the proofreading system is discussed for actual projects.

• 한국언어정보학회:학술대회논문집
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• 한국언어정보학회 1998년도 Language, Information and Computation = Selected Papers from the 12th Pacific Asia Conference on Language, Information and Computation, Singapore
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• pp.328-333
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• 1998