Objective: This study estimated the genetic parameters for productive and reproductive traits. Methods: The data included production and reproduction records of animals that have calved between 1979 and 2013. The genetic parameters were estimated using multivariate mixed models (DMU) package, fitting univariate and multivariate mixed models with average information restricted maximum likelihood algorithm. Results: The estimates of heritability for milk production traits from the first three lactation records were $0.03{\pm}0.03$ for lactation length (LL), $0.17{\pm}0.04$ for lactation milk yield (LMY), and $0.15{\pm}0.04$ for 305 days milk yield (305-d MY). For reproductive traits the heritability estimates were, $0.09{\pm}0.03$ for days open (DO), $0.11{\pm}0.04$ for calving interval (CI), and $0.47{\pm}0.06$ for age at first calving (AFC). The repeatability estimates for production traits were $0.12{\pm}0.02$, for LL, $0.39{\pm}0.02$ for LMY, and $0.25{\pm}0.02$ for 305-d MY. For reproductive traits the estimates of repeatability were $0.19{\pm}0.02$ for DO, and to $0.23{\pm}0.02$ for CI. The phenotypic correlations between production and reproduction traits ranged from $0.08{\pm}0.04$ for LL and AFC to $0.42{\pm}0.02$ for LL and DO. The genetic correlation among production traits were generally high (>0.7) and between reproductive traits the estimates ranged from $0.06{\pm}0.13$ for AFC and DO to $0.99{\pm}0.01$ between CI and DO. Genetic correlations of productive traits with reproductive traits were ranged from -0.02 to 0.99. Conclusion: The high heritability estimates observed for AFC indicated that reasonable genetic improvement for this trait might be possible through selection. The $h^2$ and r estimates for reproductive traits were slightly different from single versus multi-trait analyses of reproductive traits with production traits. As single-trait method is biased due to selection on milk yield, a multi-trait evaluation of fertility with milk yield is recommended.
본 연구는 국내 특정 종돈장에서 보유하고 있는 종돈에 대한 번식형질 및 산육형질들에 대한 유전변이를 추정하고자 연구를 실시하였다. 본 분석에 이용된 자료는 2000년부터 2008년까지 개량을 진행한 국내 모종돈장에 있는 돼지(Landrace, Large white, Duroc) 2,447두에서 조사된 9,886복의 번식자료(실산자수, 이유자 돈수)와 10,181두의 산육검정자료(등심단면적, 90 kg 도달일령, 등 지방두께, 정육률)을 이용하여 분석을 실시하였다. 번식형질 및 산육형질에 적합한 모형을 찾기 위해 분산분석을 실시하였으며, 그 결과 번식형질에서 품종효과, 교배웅돈효과, 산차효과, 분만시 년도-계절효과, 산육형질에서 품종효과, 분만시 년도-계절효과, 성의 효과, 모산차 등이 환경요인으로 작용하는 것으로 나타나 이들을 혼합모형방정식에 적합시켜 유전모수를 추정하였다. 그 결과, 번식 형질의 실산자수에 대한 유전력은 0.07, 모체 유전효과에 대한 유전력은 0.02로 추정되었고 이유자돈수의 유전력은 0.03, 모체 유전효과에서 0.02로 추정되었으며 이들 두 형질 간의 유전상관은 0.14, 모체 유전효과에 대한 상관은 0.06로 추정되었다. 또한 등심 면적의 경우 0.19, 90 kg 도달일령은 0.39, 등지방두께 및 정육률은 각각 0.36 및 0.43으로 번식형질에 비해 높은 유전력을 나타내는 것으로 추정되었다. 또한 등심단면적과 등지방두께 간에는 0.04로 유전적 상관관계가 없으며, 등심단면적과 정육률 간에는 0.35로 중도의 유전적 상관관계를 갖는 것으로 추정되었다. 반면에 등지방 두께와 정육률 간은 -0.42로 중도의 부의 상관관계를 나타냈으며, 등지방두께와 90 kg 도달일령 간에는 유전상관이 없는 것(0.00)으로 추정되었다. 또한 번식형질과 산육형질 간 유전상관은 등지방두께를 제외한 나머지 산육형질에서 번식형질과의 부의 상관을 보여, 번식형질 또는 산육형질을 독자적으로 개량하고자 할 때, 부의 관계가 있는 형질과의 유전적 관계를 고려한 개량목표 설정이 필요할 것으로 사료된다.
Objective: The purpose of this study was to investigate a single step genome-wide association study (ssGWAS) for identifying genomic regions affecting reproductive traits in Landrace and Large White pigs. Methods: The traits included the number of pigs weaned per sow per year (PWSY), the number of litters per sow per year (LSY), pigs weaned per litters (PWL), born alive per litters (BAL), non-productive day (NPD) and wean to conception interval per litters (W2CL). A total of 321 animals (140 Landrace and 181 Large White pigs) were genotyped with the Illumina Porcine SNP 60k BeadChip, containing 61,177 single nucleotide polymorphisms (SNPs), while multiple traits single-step genomic BLUP method was used to calculate variances of 5 SNP windows for 11,048 Landrace and 13,985 Large White data records. Results: The outcome of ssGWAS on the reproductive traits identified twenty-five and twenty-two SNPs associated with reproductive traits in Landrace and Large White, respectively. Three known genes were identified to be candidate genes in Landrace pigs including retinol binding protein 7, and ubiquitination factor E4B genes for PWL, BAL, W2CL, and PWSY and one gene, solute carrier organic anion transporter family member 6A1, for LSY and NPD. Meanwhile, five genes were identified to be candidate genes in Large White, two of which, aldehyde dehydrogenase 1 family member A3 and leucine rich repeat kinase 1, associated with all of six reproduction traits and three genes; retrotransposon Gag like 4, transient receptor potential cation channel subfamily C member 5, and LHFPL tetraspan subfamily member 1 for five traits except W2CL. Conclusion: The genomic regions identified in this study provided a start-up point for marker assisted selection and estimating genomic breeding values for improving reproductive traits in commercial pig populations.
This study was performed to estimate the effect of age at first calving and first two calving intervals on productive life and life time profit in Korean Holsteins. Reproduction data of Korean Holsteins born from 1998 to 2004 and lactation data from 276,573 cows with birth and last dry date that calved between 2000 and 2010 were used for the analysis. Lifetime profit increased with the days of life span. Regression of Life Span on Lifetime profit indicated that there was an increase of 3,800 Won (approximately $3.45) of lifetime profit per day increase in life span. This is evidence that care of each cow is necessary to improve net return and important for farms maintaining profitable cows. The estimates of heritability of age at first calving, first two calving intervals, days in milk for lifetime, lifespan, milk income and lifetime profit were 0.111, 0.088, 0.142, 0.140, 0.143, 0.123, and 0.102, respectively. The low heritabilities indicated that the productive life and economical traits include reproductive and productive characteristics. Age at first calving and interval between first and second calving had negative genetic correlation with lifetime profit (-0.080 and -0.265, respectively). Reducing age at first calving and first calving interval had a positive effect on lifetime profit. Lifetime profit increased to approximately 2,600,000 (2,363.6) from 800,000 Won ($727.3) when age at first calving decreased to (22.3 month) from (32.8 month). Results suggested that reproductive traits such as age at first calving and calving interval might affect various economical traits and consequently influenced productive life and profitability of cows. In conclusion, regard of the age at first calving must be taken with the optimum age at first calving for maximum lifetime profit being 22.5 to 23.5 months. Moreover, considering the negative genetic correlation of first calving interval with lifetime profit, it should be reduced against the present trend of increase.
In this study, the Italian milk recorded buffalo population from 1974 to 1996 was analysed with the purpose to estimate genetic and environmental variability and provide genetic parameters for the most important economic traits. High variability between herds was evident due to the poor knowledge of feeding requirements and husbandry technology in this species compared to cattle. Age at first calving was reduced by 57 days during the considered years following efforts made in better feeding and management from 1990; on the contrary, calving interval has increased by 17 days as a consequence of forcing buffaloes to calve in spring, in order to have the peak milk yield when milk is much better paid. Average milk yield increased by 1853 kg during these years, while lactation duration was reduced by 30 days. Season of calving has no effect on all traits. Calving order has a positive effect on milk yield especially because older cows produce more milk in shorter lactations. Heritability for the age at first calving and calving interval was 0.26 and 0.05 respectively. Heritability of productive traits, milk yield and duration of the lactation was 0.19 and 0.13 respectively, with repeatabilities of 0.40 and 0.26. Genetic trend for milk yield was 2.1 kg milk/year for the bulls and 1 kg for all population. The high genetic variability of milk production as well as duration of the lactation, indicates that there are good opportunities for genetic improvement when including these traits in a selection scheme. The low genetic trend registered over 15 years of recording activity can be explained by the fact that neither progeny testing was performed or selection schemes were implemented, due to the difficulties to use artificial insemination in buffalo.
Data from 22837 lambings of Lohi and Kajli ewes from 1962 through 1994 were used to analyse productive and reproductive traits and wool production, Overall litter size at birth averaged 1.33 being 1.45 for Lohi and 1.21 for Kajli ewes. The corresponding values at weaning were 1.23, 1.32 and 1.14, respectively. Litter size was consistently lowest for one year old, with a substantial increase at two, three and four years of ewe age and marginal increase thereafter, Ewes lambing in spring weaned 0.08 more lambs per parturition than ewes lambed in Autumn (p<0,01). Lamb birth weights were affected by ewe breed (p<0.01) and increased with ewe age. Overall lamb weaning weight (120 d) of 17993 lambs was 20.3 kg. Weaning weight was affected by breed, sire, year of birth, sex, rearing rank and weaning age (p<0.01). The highest mean weaning weight was 21.9 kg for Lohi lambs followed by Kajli lambs (18.8 kg), Lambs from Kajli ewes were 9% heavier at birth but 14% lighter at weaning. Twin born lambs were 18% lighter at birth and 13% at weaning than single born lambs. Male lambs were 3% heavier at birth and 4.5% heavier at weaning than female lambs. Overall annual mean wool production was 2,64 kg, Kajli ewes were heavier at breeding than Lohi ewes (i.e. 46.2 vs 44.8 kg). Lohi ewes being 3% less body weight produced 38% more wool and 18% more litter weaning weight than Kajli ewes, When average weight of lamb weaned per ewe weaning lambs was adjusted for ewe average metabolic body size, Lohi ewes were most efficient (i.e. arbitrary assigned value of 100) compared to Kajli ewes achieving only 83% of Lohi level.
Data were collected on productive and reproductive performance of different $F_1$ crossbred cows (Deshi cows joined by A.I. to Sindhi, Sahiwal, Jersey or Holstein-Friesian Bull semen) reared by farmers in and around the Bangladesh Agricultural University campus at Mymensingh. The traits considered were birth weight, age at first heat, age at first calving, gestation length, post-partum heat period, milk yield, lactation length, dry period and calving interval. Data were analyzed statistically using a completely randomized design and Duncan's Multiple Range Test to compare and determine the significance of between individual group means. It was observed that the Holstein $\times$ Deshi had the highest birth weight (21.4 kg) followed by Sahiwal (17.6 kg), Jersey (16.7 kg) and Sindhi (16.1 kg). Shortest age at first heat (854 and 920 days) and age at first calving (1002 and 1201 days) were found for the Jersey $\times$ Deshi and Holstein $\times$ Deshi crosses respectively. The post-partum heat period were significantly different between breeds with Jersey and Holstein sired calves having the shortest intervals. There was no difference in the gestation length of the four crosses. Holstein $\times$ Deshi and Jersey $\times$ Deshi cows gave the highest milk yields due to longer lactation periods and higher daily milk production. Similarly, Holstein $\times$ Deshi and Jersey $\times$ Deshi crosses had significantly shorter dry periods and Jersey $\times$ Deshi had a shorter calving interval. From this study it may be concluded that exotic genotypes such as Holstein-Friesian and Jersey can perform very well under rural conditions in Bangladesh.
일반적으로 병아리의 성감별은 생식돌기 감별법이나 반성 유전 형질을 이용한 자가 성별법으로 이루어지고 있다. 이들 중 우모 발생 속도에 관여하는 만우성 유전자를 이용한 깃털 성감별법이 산업적으로 가장 널리 이용되고 있는데, 이는 발생 시 깃털의 형태적 차이로 쉽게 판별이 가능하기 때문이다. 그러나 깃털 자가 성별종의 계통 조성을 위하여 반드시 모계가 만우성이어야 하므로 깃털의 조만성이 생산 능력에 미치는 영향을 구명할 필요가 있다. 따라서 본 연구에서는 깃털 자가 성감별 계통으로 조성 중인 한국 재래닭 적갈색종 만우성 개체들과 조우성 개체들을 대상으로 이들 간의 생산능력의 차이를 비교 분석하였다. 조우성과 만우성 개체들의 번식 능력 분석 결과, 수정율과 부화율 모두에서 이들 간에 차이가 없는 것으로 나타났고, 발생 후 60주령까지 생존율에서도 두 집단 간에 차이가 없었다. 또한 성장 능력의 비교 분석에서 발생 시부터 50주령까지 모든 주령에서 집단 간 평균 체중의 차이는 없는 것으로 나타났다. 깃털의 조만성이 산란능력에 미치는 영향으로 초산 일령의 경우 조우성 개체들의 시산 일령이 만우성 개체들에 비해 평균 3일 정도 빨랐으나, 일계 산란율에 있어서는 조우성 개체와 만우성 개체 간에 차이가 없었다. 깃털의 조만성이 난질에 미치는 영향에 대해서도 난각색을 비롯한 난중, 난백 높이, 하우유니트, 난황색, 난각 두께, 난각 무게 및 난각 밀도 등 모든 난질 지표의 차이는 없는 것으로 나타났다. 결론적으로 한국 재래닭에 있어 깃털 조만성에 따른 생산 능력의 차이는 없는 것으로 사료되어, 이를 이용한 자가 성감별 계통 조성 시 깃털 조만성에 따른 생산능력의 영향은 고려하지 않아도 되는 것으로 판단된다.
Data from 5,311 ewes and 13,076 lambing from 1977 through 1994 were used to analyse both annual and cumulative outputs in terms on total number of lambs born, total lamb weight weaned and total wool produced per ewe for ewe longevity 1 to 8 depending on their productive life in the flock. Ewes at Khushab produced 0.08 more lambs per parturition than ewes at Khizerabad; however, 0.39 less lambs were weaned at Khushab than at Khizerabad. Similarly, cumulative number of lambs born was more at Khushab flock than Khizerabad flock (p < .01). However, total weight of lambs weaned was greater at Khizerabad than Khushab flock (p < .01) for each ewe longevity. Most ewes (35%) were sold/replaced just after their first parturition (i. e. ewe longevity 1). The overall mean for annual sale/replacement was 32 and 23% at Khushab and Khizerabad, respectively. Distribution of growth and reproductive traits from 1977-94 did not show upward or downward trend inspite of heavy sale/replacement except yearly variation. Lack of any genetic progress over the year suggested that random breeding was employed without any scientific selection programme. Annual means for lambs born, lambs weaned and weight of lambs weaned per ewe present in the flock were the highest for ewe longevity 2 compared with other ewe longevity groups. Relative efficiency in terms of net income was highest for ewe longevity 5 followed by ewe longevity 4 and 6 in both flocks.
The present study analysed the various productive and reproductive characteristics of 1/2 Pabna Milking Cows (PMC)-1/2 Sahiwal (S) and 1/4 PMC-3/4 S collected from the Pabna milkshed area at Baghabarighat, Sirajgonj, Bangladesh. The studied traits were birth weight (BWT), age at puberty (AP), number of services per conception (NSC), post partum heat period (PPHP), gestation period (GP), daily milk yield (DMY), lactational production (LP), lactation length (LL), fat percentage and solids-not-fat percentage (SNFP). Five individual Sahiwal sires were used for the upgrading of Pabna Milking Cows. The used data covered from 1987 to 1994. Least-squares analysis of variance showed that genetic group had a significant effect on BWT (P < 0.05), AP (p < 0.01), DMY (p < 0.01), LP (p < 0.001), LL (p < 0.05), FP (p < 0.05) and SNFP (p < 0.01). Genetic group had non-significant effect on NSC, GP and PPHP. The effect of sire was significant on BWT (p < 0.01), NSC (p < 0.01), LP (p < 0.05) and LL (p < 0.05). The AP, NSC, DMY, LP, LL and SNFP were higher in 1/2 PMC-1/2S cows; BWT and PPHP were higher in 1/4 PMC-3/4S but GP and FP were almost same in both genetic groups. From this study it may be concluded that production and use of 1/2 PMC-1/2S would seem more profitable for commercial milk production in the Bangladesh Milk Producers' Cooperative Union Limited (BMPCUL) area and at the same time emphasis should be given on rigorous sire selection.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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