A study on the classification of research topics based on COVID-19 academic research using Topic modeling (토픽모델링을 활용한 COVID-19 학술 연구 기반 연구 주제 분류에 관한 연구)
- Yoo, So-yeon;Lim, Gyoo-gun
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- Journal of Intelligence and Information Systems
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- v.28 no.1
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- pp.155-174
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- 2022
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From January 2020 to October 2021, more than 500,000 academic studies related to COVID-19 (Coronavirus-2, a fatal respiratory syndrome) have been published. The rapid increase in the number of papers related to COVID-19 is putting time and technical constraints on healthcare professionals and policy makers to quickly find important research. Therefore, in this study, we propose a method of extracting useful information from text data of extensive literature using LDA and Word2vec algorithm. Papers related to keywords to be searched were extracted from papers related to COVID-19, and detailed topics were identified. The data used the CORD-19 data set on Kaggle, a free academic resource prepared by major research groups and the White House to respond to the COVID-19 pandemic, updated weekly. The research methods are divided into two main categories. First, 41,062 articles were collected through data filtering and pre-processing of the abstracts of 47,110 academic papers including full text. For this purpose, the number of publications related to COVID-19 by year was analyzed through exploratory data analysis using a Python program, and the top 10 journals under active research were identified. LDA and Word2vec algorithm were used to derive research topics related to COVID-19, and after analyzing related words, similarity was measured. Second, papers containing 'vaccine' and 'treatment' were extracted from among the topics derived from all papers, and a total of 4,555 papers related to 'vaccine' and 5,971 papers related to 'treatment' were extracted. did For each collected paper, detailed topics were analyzed using LDA and Word2vec algorithms, and a clustering method through PCA dimension reduction was applied to visualize groups of papers with similar themes using the t-SNE algorithm. A noteworthy point from the results of this study is that the topics that were not derived from the topics derived for all papers being researched in relation to COVID-19 (
) were the topic modeling results for each research topic (
) was found to be derived from For example, as a result of topic modeling for papers related to 'vaccine', a new topic titled Topic 05 'neutralizing antibodies' was extracted. A neutralizing antibody is an antibody that protects cells from infection when a virus enters the body, and is said to play an important role in the production of therapeutic agents and vaccine development. In addition, as a result of extracting topics from papers related to 'treatment', a new topic called Topic 05 'cytokine' was discovered. A cytokine storm is when the immune cells of our body do not defend against attacks, but attack normal cells. Hidden topics that could not be found for the entire thesis were classified according to keywords, and topic modeling was performed to find detailed topics. In this study, we proposed a method of extracting topics from a large amount of literature using the LDA algorithm and extracting similar words using the Skip-gram method that predicts the similar words as the central word among the Word2vec models. The combination of the LDA model and the Word2vec model tried to show better performance by identifying the relationship between the document and the LDA subject and the relationship between the Word2vec document. In addition, as a clustering method through PCA dimension reduction, a method for intuitively classifying documents by using the t-SNE technique to classify documents with similar themes and forming groups into a structured organization of documents was presented. In a situation where the efforts of many researchers to overcome COVID-19 cannot keep up with the rapid publication of academic papers related to COVID-19, it will reduce the precious time and effort of healthcare professionals and policy makers, and rapidly gain new insights. We hope to help you get It is also expected to be used as basic data for researchers to explore new research directions.
Studies on the Method of Ground Vegetation Establishment of Denuded Forest Land in the Mudstone Region - The Characteristics of Mudstone and Speeded-up Reforestation - (니암지대황폐림지(泥岩地帶荒廢林地)의 지피식생(地被植生) 조성방법(造成方法)에 관(關)한 연구(硏究) - 니암특성((泥岩特性)과 조기녹화(早期綠化) -)
- Chung, In Koo
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- Journal of Korean Society of Forest Science
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- v.19 no.1
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- pp.1-23
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- 1973
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The results of ground vegetation experiment conducted at completely denuded forestland in the mudstone region are summerized as follows: On the reaults of soiling quantity the effect of soiling was observed where depth of soiling over 10 cm was practiced, and a plot where treated with 15cm soiling and without fertilizer showed poor growth and it was even worser than the plot where soiling was practiced only 1 cm in thikness but applied adequate amount of fertilizers. The depth of slits between 30cm and 40cm showed no significant difference in the effect. A plot where covered with vegetation bag showed somewhat better results in seed loss and early growth but no differences observed in the fall result over the none covered plot. And then, it is recommendable to have soiling over 10cm in thikness with slit of 30cm and 30cm in depth and to apply 30 gram of fertilizer (22;22:11, 50 gram) per slit. On various soiling materials trial there were no striking differences in the effect of soiling between weathered granite soil, wheathered tuffs soil and weathered mudstone soil. In the treatment with various green materials, a plot treated with straw mat showed a significant difference at 1 percent. The results show that weathered mudstone soil is effective to use as soiling materials and straw mat treatment was better. On forest fertilization trial, in the mudstone region where red and black pine trees already existing at a rate of 2,000-3,000 trees per hectare had applied 110kg of compound fertilizers (9:12:3 and 22:22:11) per hectare basis in terms of plant nutrient. As a result, the difference in effect between the compound fertilizers was not found however the leaf color and leaf length of the fertilizer added plot showed darker and longer at 30 percent over the no fertilizer received plot. Compound fertilizers, 14:37:12 and 9:12:3 were applied to alder trees at a rate of 20 gram and 40 gram per tree in terms of plant nutrient and a remarkable growth accelerantion was observed where 40 grams of plant nutrient applied. The effect difference between the compound fertilizers was not found. On investigation of tree root elongation, forty years old red pine trees showed only 15cm tap root elongation through mudstone while black pine had 23 cm tap root elongation. The total length of supporting root elongtion of red and black pines showed 20 and 13 meters, respectively. The tap roots of Black locusts were not able to elongate through mudstone, however, the supporting roots tended to develop to the underneath of pine tree where some moisture content is available. Black locusts And grown on the residual soil of mudstone normally die between 8 to 10 years. The red pine trees show flat in tree shape while black pine had triangle in the shape. With the results it can be said that in an artificial reforestation in denuded forest land of the mudstone region the adequate slit and enough amount of fertiliizer application must be provided for the succesful performance of the program. On integrated experimental results of 1972. for the establishment of ground vegetation on the completely denuded forest land in mudstone region, soiling could be effectively practiced with weathered mudstone soil and it would not specially necessiate to have either weathered granite or tuffssoil for the soiling. And the soiling depth should be more than 10 cm in thickness. Among green materials used the straw mat proved to be the most effective reatment. Three major factors which enable to establish ground vegetation by the shortest period of time: A. Physical improvement of soil is necessary to breakdown of the horizontal cracks sushas Slit, contour line plot, seeding hole and etc., and soiling with weathered mudstone soil. B. Chemical improvement of soil: is needed sufficient amount of fertilizer application 300~400kg ha,
$N+P_2O_5+K_2O$ ), and increased production of ground covering and expedite resolution of the vegetation (ground vegetation, fallen leaves and twigs). C. Complete establishment of the basic structure for the erosion control (Prevention of surface soil erosion)
Studies on the Species Crossabilities in the Genus Pinus and Principal Characteristics of F1 Hybrids (일대잡종송(一代雜種松)의 교배친화력(交配親和力)과 특성(特性)에 관(關)한 연구(硏究))
- Ahn, Kun Yong
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- Journal of Korean Society of Forest Science
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- v.16 no.1
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- pp.1-32
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- 1972
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By means of the interspecific hybridization in the Sub-genus Diploxylon of the Genus Pinus,
$F_1$ hybrids of Pinus rigida${\times}$ elliottii, Pinus rigida${\times}$ radiata, P. rigida${\times}$ serotina and P. densiflora${\times}$ thunbergii had been produced. And on the basis of the crossabilities of these hybrids the taxonomic affinities of these pines were examined. And the needle characteristics of these hybrid and the occurence of phenolic substances in these$F_1$ hybrid were also investigated to see the potential usefulness of these characteristics for the diagnosis of the taxonomic affinity. And, the growth performances of the$F_1$ hybrids have also been compared with those of parental species. In order to contribute to the establishment of the hybrid seed orchard the introgression phenomena between P. densiflora and P. thunbergii in the eastern coastal area have also been investigated along with the investigation of the heterozygosity of plus trees of P. densiflora growing in the clone bank in Suwon. And the results were summarized as follows. 1. On the basis of crossabilities as well as on the taxonomic affinities according to the systems of Shaw, Pilger and Duffield, it has been proven that the parental species of those hybrids are of close affinities and range of the fertile hybrid seed production rate was as high as 28-58% in the best hybrid combination (Table 13). 2. Among those hybrids, the${\times}$ Pinus, rigiserotina hybrid seemed to be most promising in the growth performance exhibiting 109-155% more volume growth compared to the seed parent with the statistic significance of 1% level (Tables 16 and 17). 3. Notwithstanding the fact that the all of the pollen parents are cold tender, all hybrids exhibit cold hardiness as much as their seed parent and it seems to suggest that the characteristics of cold hardiness were transmitted from the seed parent. 4. Though a striking difference in needle length was observed between the parental species of each hybrid, it was difficult to distinguish each hybrid from their seed parent by the needle length except${\times}$ P. rigiserotina which is characterized by long needle which is 65% more longer than the needle of the seed parent (Table 21). 5. With regard to the anatomical characteristics of needle, the hypoderm is apparently thicker in most of the$F_1$ hybrid pines and the characteristics of resin canals are dominated by medial in most$F_1$ hybrid. And, the fibrovascular bundles were apart as were in their seed parent. Therefore it was found to be possible to distinguish the hybrids pines from their parents by the needle characteristics. And, it is to be noticed that the${\times}$ P. densithunbergii was more close to the pollen parent having RDI value of 0.73 (Fig.l, Table 22). 6. It has been demonstrated that${\times}$ P. rigielliottii,${\times}$ P. rigiradiata and${\times}$ P. rigitaeda have a phenolic substance (No.7) of light yellow at Rf-0.46, same as their seed parent, but no trace of phenolic substance was observed in their pollen parent. This fact will serve as an important criteria for early identification of hybridity in progeny testing. However, the fact that both of${\times}$ P. rigiserotina and${\times}$ P. densithunbergii exhibit the same reactions of phenolic substances as well their parental species seems to indicate the close affinities between the parental species of the respective hybrid (Fig.2, Table 23). 7. The separation and the reaction of phenolic substance developed on TLC were found to be same in the same species showing no variations between the individuals, and no variations due to tree part of sampling, tree age or pollen sources. And the reaction was also observed regardless of the not varied by the kind of developing solvent whether it is Aceton-Chloroform (3:7 v/v) or Benzene-Methanol-Acetic acid (90:16:8 v/v). 8. The introgression phenomena of natural Pinus densifiora stand in both east and west coastal area indicates that the major part of the red pines investigated are all heterozygous and the heterozygosity of pines are higher in the west coast than in the east coast(Tables 24 and 25). 9. Based on the RDI, among the plus trees of Pinus densiflora selected in Korea and Japan as well, no pure P. densiflora has been found. Since all of the sample trees of Pinus densiflora were found to be as heterozygous bearing part of the characteristics of P. thunbergii, those red pines were considered to be natural heterotic hybrid pines(Figs. 3 and 4. Tables 26 and 27).
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- [게시일 2004년 10월 1일]
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