• 식물병연구
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• 제23권3호
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• pp.241-248
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• 2017

강원도 고랭지배추 포장에서 검출된 사탕무씨스트선충(H. schachtii)과 콩씨스트선충(H. glycines)을 구별할 수 있는 신속진단법을 개발하고자 하였다. 이를 위해 mtDNA COI 유전자 영역의 계통분석으로 동정된 사탕무씨스트선충 GC147, GC408, PM001 개체군과 콩씨스트선충 YS224, DA142, BC115 개체군을 대상으로 PCR-RFLP와 본 연구에서 개발한 특이 프라이머 세트를 이용한 PCR을 수행하였다. 사탕무씨스트선충과 콩씨스트선충 각각 3개 개체군의 mtDNA COI 영역 PCR 증폭산물에 8종류의 제한효소를 처리하여 DNA 절편길이다형성을 확인하였으며, 2종류의 제한효소 RsaI과 HinfI을 처리하면 DNA 밴드 양상의 차이로 사탕무씨스트선충과 콩씨스트선충 두 종을 구별할 수 있었다. 또한, 본 연구에서 개발한 프라이머 세트(JBS1, JBG1과 JB3R)는 사탕무씨스트선충 mtDNA COI 영역의 277과 339 bp, 콩씨스트선충의 339 bp의 특정 DNA 단편을 증폭시켰으며, 뿌리혹선충 3종과 뿌리썩이선충 2종의 식물기생선충은 증폭시키지 않았다. 따라서, 본 연구에서 개발한 프라이머 세트를 이용하여 PCR을 수행하면 사탕무씨스트선충과 콩씨스트선충을 구별할 수 있었다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제39권3호
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• pp.196-204
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• 2012

본 실험은 오일팜나무에서 somatic embryo mass(SEM)를 유도한 후 이로부터 식물체 분화를 통한 클론묘 대량증식 시스템을 확립하고, 기내 배양에 의하여 야기된 체세포변이의 확인 방법을 확립하기 위하여 수행되었다. 오일팜 조직배양묘의 정단 부분을 $NaH_2PO_4{\cdot}2H_2O$와 카제인이 첨가된 1/2MS 수정 배지에 배양하여 체세포배성 캘러스를 유도하였다. 유도된 체세포배성 캘러스는 몇 번의 계대배양을 통하여 SEM으로 발달하였다. SEM 조직은 단단하며, 강하게 붙어있어서 개개의 체세포배를 따로 분리하는 것이 매우 어려웠다. SEM 조직을 $NH_4NO_3$, 카제인, L-ascorbic acid가 첨가된 MS 수정 배지에 배양하였을 때 신초가 성공적으로 분화하였다. 기내 오일팜나무를 야외로 순화하여 완전한 오일팜나무 클론묘를 획득할 수 있었다. 기내 배양묘 중 건강하고 생장이 양호한 신초를 무작위로 95 개체를 선발하여 RAPD 분석을 실시하였다. 총 19개의 random primer를 사용하여 95 개체에 대한 RAPD를 수행한 결과, 대부분의 primer에서는 동일한 밴드 형태를 보여 어떠한 변이도 감지할 수 없었다. 그러나, MspI으로 절단된 genomic DNA를 BNR36 primer로 PCR을 수행하였을 때, 개체 간 차이를 보이는 밴드 형태를 나타내어 체세포변이를 감지할 수 있었다. 95 개체 중 #22, #28, #35, #77 의 4 개체에서 약 1kb 부근의 밴드 하나가 없었으며, 그 중 #28, #35, #77의 밴드 강도는 정상 밴드보다 월등히 강한 것을 확인하였다. NCBI 분석 결과, 이 변이 밴드는 오일팜나무의 엽록체 게놈과 관련이 있는 것으로 확인되었다. 본 연구 결과로부터 오일팜나무의 클론묘 대량증식 시스템을 확립할 수 있었고, RAPD 분석을 통하여 기내 상태에 있는 조직배양묘의 체세포 변이 여부를 판별할 수 있는 방법 확립할 수 있었다.

• 한국응용곤충학회지
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• 제35권3호
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• pp.209-215
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• 1996

복숭아혹진딧물(Myzus persicae Sulzer)은 두가지 서로 다른 기주선호성을 가지는데 이 기주선호성과 형태적 특징에 기초하여 담배진닷물(Myzus nicotinae Blackman)과 담배 이외의 다른 채소류에 서식하는 복숭아 혹진딧물(M. persicae)로 분류하였지만(Blachmean, 1987) 이 분류 방법에 동의하지 않는 학자들도 많다. 이런 이유로 RAPD-PCR 기법을 이용하여 한국에 서식하는 복숭아혹진딧물에 대하여 그들의 2차 숙주선호성에 따른 DNA의 변이 정도를 살펴보았다. 실험곤충으로는 담배와 배추에서 채집하여 사육한 진딧물 각 4 clones 씩을 사용하였다. 각 clone은 한 개체를 사육하여 얻은 자손들과 그들의 후손으로 이루어졌으며, 사육한 진딧물에서 핵 DNA를 추출하고, 10개 nucleotide 길이의 random primer 100가지를 사용하여 PCR한 후 1 % agarose gel 전기영동법으로 분석하였다. 사용한 100종류의 random primer 중 83가지에서 DNA 단편이 합성되었다. 증폭된 1개의 primer당 단편의 수는 1개에서 22개였고 평균 단편 수는 약 13개였으며, 각 각 단편의 길이는 500에서 20,000 base pair사이에 분포하였다. 82가지 primer의 경우에 일부 단편의 짙기에는 차이가 있었으나 단편종류의 분포는 동일하게 나타났다. 한가지 primer경우에만 담배섭식형 1개 c clone에서 다른 7가지 clones에 없는 band가 1개 나타났다. 이때 나머지 7 clones의 단편 분포 형태는 모두 동일하였다. 따라서 이 band는 숙주 선호성과는 무관한 것으로 보인다. 결국 이 실험에 사용한 100종류의 primer에 기초하여 RAPD-PCR기법으로 DNA를 증폭한 결과 복숭아혹진딧물의 숙주선호성이 개체군간의 유전적인 차이점에 기인한다는 가설을 뒷받침할 만한 증거를 찾지 못하였다.

• The Journal of Advanced Prosthodontics
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• 제9권2호
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• pp.85-92
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• 2017

PURPOSE. The aim of this study was to evaluate the effect of tooth surface pre-treatment steps on shear bond strength, which is essential for understanding the adhesive cementation process. MATERIALS AND METHODS. Shear bond strengths of different cements with various tooth surface treatments (none, etching, priming, or etching and priming) on enamel and dentin of human teeth were measured using the Swiss shear test design. Three adhesives (Permaflo DC, Panavia F 2.0, and Panavia V5) and one self-adhesive cement (Panavia SA plus) were included in this study. The interface of the cement and the tooth surface with the different pre-treatments was analyzed using SEM. pH values of the cements and primers were measured. RESULTS. The highest bond strength values for all cements were achieved with etching and primer on enamel ($25.6{\pm}5.3-32.3{\pm}10.4MPa$). On dentin, etching and priming produced the highest bond strength values for all cements ($8.6{\pm}2.9-11.7{\pm}3.5MPa$) except for Panavia V5, which achieved significantly higher bond strengths when pre-treated with primer only ($15.3{\pm}4.1MPa$). Shear bond strength values were correlated with the micro-retentive surface topography of enamel and the tag length on dentin except for Panavia V5, which revealed the highest bond strength with primer application only without etching, resulting in short but sturdy tags. CONCLUSION. The highest bond strength can be achieved for Panavia F 2.0, Permaflo DC, and Panavia SA plus when the tooth substrate is previously etched and the respective primer is applied. The new cement Panavia V5 displayed low technique-sensitivity and attained significantly higher adhesion of all tested cements to dentin when only primer was applied.

• 원예과학기술지
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• 제32권4호
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• pp.525-534
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• 2014

Microsatellite 표지를 이용하여 국내에서 시판되고 있는 멜론 58품종의 식별과 멜론 육종 계통 '10H08'을 이용하여 $F_1$ 종자 순도를 평가하였다. 412개의 microsatellite 표지 중 다형성 정도가 높은 29개는 품종 그룹 내에서도 다양한 유전 변이를 나타내었으며 분자표지의 유전자형에 의해 모든 품종을 식별할 수 있었다. Microsatellite 표지의 대립유전자를 이용하여 멜론 58품종에 대한 계통도를 작성하였을 때 멜론의 형태적 특성과 일치하면서 2개의 대그룹으로 구분되었다. $F_1$ 종자의 순도 검정에 microsatellite 표지를 활용하기 위하여 29개의 표지를 '10H08' 계통의 양친에 대하여 검정하였을 때 5개의 프라이머가 다형성을 보였으며, 이 중 한 개의 프라이머 'CMGAN12'는 양친간에 뚜렷한 다형성 밴드를 나타내었다. 이 프라이머를 192개의 $F_1$ 종자에 대하여 검정하였을 때 자식주로 보이는 개체가 분석된 종자 내에서 명확하게 구분되었다. 본 연구 결과에서 선정된 멜론 품종 식별용 microsatellite 표지는 멜론 품종의 지문화뿐만 아니라 $F_1$ 종자의 순도 검정이 가능하여 종자회사에서 매우 유용하게 활용될 수 있는 것으로 나타났다.

• BMB Reports
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• 제37권2호
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• pp.213-222
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• 2004

A randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis was used to identify the species- and population-specific markers of abalone; Haliotis asinina, H. ovina, and H. varia in Thai waters. Fifteen species-specific and six population-specific RAPD markers were identified. In addition, an 1650 bp band (UBC195) that was restricted to H. ovina from the Gulf of Thailand (east) was also found. All of the specific RAPD markers were cloned and sequenced. Twenty pairs of primers were designed and specificity-tested (N = 12 and 4 for target and non-target species, respectively). Seven primer pairs (CUHA1, 2, 4, 11, 12, 13, and 14) were specifically amplified by H. asinina DNA, whereas a single pair of primers showed specificity with H. ovina (CUHO3) and H. varia (CUHV1), respectively. Four primer pairs, including CUHA2, CUHA12, CUHO3, and CUHV1, were further examined against 216 individuals of abalone (N = 111, 73, and 32, respectively). Results indicated the species-specific nature of all of them, except CUHO3, with the sensitivity of detection of 100 pg and 20 pg of the target DNA template for CUHA2 and CUHA12 and CUHV1, respectively. The species-origin of the frozen, ethanol-preserved, dried, and boiled H. asinina specimens could also be successfully identified by CUHA2.

• 대한치과보철학회지
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• 제32권3호
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• pp.378-395
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• 1994

The purpose of this study was to investigate the effect of various metal surface treatments and adhesive systems on the flexural bond strength of composite resin to Au-Ag-Cu-Pd alloy. The specimens were divided into nine groups by the combinations of surface treatment methods and adhesive systems. The types of surface treatment in this study were alumina blasting only, alumina blasting-Sn plating, alumina blasting-heating and three kinds of adhesive system used in this study were Silicoater system(Heraeus Kulzer GmbH,Germany), Superbond C & B(Sun Medical Co.,Ltd.,Japan) and Cesead opaque primer(Kurary Co.,Ltd.,Japan). After surface treatments and adhesive systems were applied, each specimen was built up with Dentacolor composite resin (Heraeus Kulzer GmbH,Germany). Four-point flexural bond strength was measured by Instron universal testing machine (Model 4301,U.S.A.) and modes of failure were observed by SEM(JEOL,SSM-840A,Japan). The obtained results were as follows: 1. The group that was bonded with Superbond C & B after alumina blasting-heating shelved the highest bond strength with significant difference among the groups, except the group with Cesead opaque primer after alumina blasting-Sn plating(P<0.05). 2. In the groups bonded with Cesead opaque primer, there was significant difference only in the bond strength between the alumina blasting-Sn plating group and alumina blasting group, where the former showed a higher bond strength(P<0.05). 3. In the groups bonded with Silicoater system, there were no significant differences in bond strength regardless of the surface treatment method(P<0.05). 4. In SEM evaluation, the groups of high bond strength, especially bonded with Superbond C & B after alumina blasting-heating and Cesead opaque primer after alumina blasting-Sn plating, revealed mainly cohesive-adhesive failure, whereas the others showed the tendency of adhesive failure.

• 대한치과보철학회지
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• 제49권1호
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• pp.49-56
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• 2011

연구 목적: 최근 지르코니아가 전부도재관의 코어로 많이 사용되고 있다. 지르코니아와 레진 시멘트의 결합 강도를 높이기 위한 기계적, 화학적인 표면 처리 방법들이 연구되고 있다. 이 연구에서 여러 표면 처리 방법에 따른 지르코니아와 레진 시멘트의 전단결합강도를 알아보고자 한다. 연구 재료 및 방법: 80개의 지르코니아 (Lava, 3M ESPE, St. Paul, MN, USA) 시편과 80개의 지르코니아/알루미나 복합체 (Zirace, Acucera Co Inc, Korea) 시편을 디스크형태로 제작하여 에폭시레진에 매립하였다. 이들을 각각 4개의 군으로 나누어 $50\;{\mu}m$ $Al_2O_3$ sandblasting, $110\;{\mu}m$ $Al_2O_3$ sandblasting, $50\;{\mu}m$ $Al_2O_3$ sandblasting과 프라이머 (Z-PRIME Plus, Bisco Inc, Schaumburg, IL, USA) 사용, $110\;{\mu}m$ $Al_2O_3$ sandblasting과 프라이머 (Z-PRIME Plus) 사용 군으로 나누었다. 표면 처리한 지르코니아 표면에 2가지 레진 시멘 (Calibra, Panavia F)으로 접착하였다. 그 후 증류수 ($37^{\circ}C$)에 24시간 보관 후 전단 결합 강도 실험을 시행하였고, SEM을 사용하여 표면 처리한 표면과 전단강도 실험 후 파절양상을 관찰하였다. 결과: ANOVA분석에 따르면, 두 가지 종류의 시편 모두에서, 프라이머 (Z-PRIME Plus)를 사용하여 표면 처리한 군들이 전단 결합 강도가 높았다 (P < .05). 결론: 기계적 결합 강도와 함께 새로운 프라이머를 사용하는 것이 지르코니아와 레진 시멘트의 접착 강도를 증가시킨다.

• BMB Reports
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• 제32권5호
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• pp.492-496
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• 1999

We have investigated the biochemical properties of the herpes simplex virus type 1 (HSV-1) DNA polymerase without the UL42 protein (Pol), purified from insect cells infected with a recombinant baculovirus containing the UL30 gene. BSA and DTT have inhibitory effects on dAMP incorporation. Pol showed a greater turnover rate of steady-state single nucleotide incorporation at 12 mM $MgCl_2$ than at 2 mM $MgCl_2$. However, it showed a greater processivity of DNA synthesis at lower $MgCl_2$ concentration (1 mM, 2 mM) than at a higher $MgCl_2$ concentration (12.5 mM). These results are consistent with a slow DNA dissociation at lower $MgCl_2$ concentrations. Pol does not incorporate a correct nucleotide into the primer with an incorrect nucleotide at the end; instead, it preferentially excises the incorrect nucleotide at the 3' end of the primer. Pol has DNA polymerase activity at pHs 6.5 and 7.5 but little at pHs 5.5, 8.5, and 9.5. It has exonuclease activity at pHs 6.5, 7.5, and 8.5 but little at pHs 4.5, 5.5, and 9.5. The finding that Pol has exonuclease activity but not DNA polymerase at pH 8.5 suggests that DNA binds to Pol, but deoxynucleotide binding or incorporation does not occur at pH 8.5.

• 한국균학회지
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• 제23권3호통권74호
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• pp.202-208
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• 1995

본 실험결과 느타리버섯속에서의 재현성 있는 최적 RAPD 조건은 $50\;{\mu}l$ 반응액에서 80 ng template DNA, 30 pmole primer, $200\;{\mu}M$ dNTP, 2 mM $MgCl_2$, 50 mM KCl, 10 mM Tris-HCI(pH 9.0), 0.1% Triton X-100, 1.5 unit Taq polymerase(promega)였다. 여섯 개의 primer가 Pleurotus속 8종의 균주에서 RAPD polymorphism을 보임을 알 수 있었으며, 이들의 염기배열은 PR2(GGG GGG AAG C), PR3(GCG GTT GAG G), PR4(CGC ACC GCA C), PR10(CAA TCG CCG T), PR11(CAG CAC CCA C), PR17(TAG GCG TAT CAG GAG GCC CT)이었다.