The diverse microbial communities in kimchi are dependent on fermentation period and temperature. Here, we investigated the effect of enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) during the fermentation of kimchi at two temperatures using high-throughput sequencing. There were no differences in pH between the control group, samples not inoculated with ETEC, and the ETEC group, samples inoculated with ETEC MFDS 1009477. The pH of the two groups, which were fermented at 10 and 25℃, decreased rapidly at the beginning of fermentation and then reached pH 3.96 and pH 3.62. In both groups, the genera Lactobacillus, Leuconostoc, and Weissella were predominant. Our result suggests that microbial communities during kimchi fermentation may be affected by the fermentation parameters, such as temperature and period, and not enterotoxigenic E. coli (ETEC).
Journal of Korean Society of Coastal and Ocean Engineers
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v.11
no.4
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pp.201-215
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1999
Field measurements were made for long- and short-period waves and current velocities at the harbor mouth using pressure-type wave gauges and a current meter, respectively, at the Gamcheon Harbor which has a rectangular shape with a narrow entrance. The measured pressure data were subjected to spectral analyses after removing tidal effects by applying trend removal and high-pass filtering. For the band averaging of the raw spectra, in order to obtain good resolution over the entire frequency, instead of a constant band width, variable band widths were used, which gradually increase as marching from the lowest frequency towards higher frequencies. The Helmholtz resonance mode at the Gamcheon Harbor shows the relative amplification ratio of 9.2 at the wave period of 31.7 minutes, which is quite large compared with those at the harbors located on the east coast of Korea. The second and the third resonance period was 10.3 and 5.4 minute, respectively. On the other hand, the analysis of every 24 hours data shows that during storms the spectral densities are very large compared to those during calm seas and also the second and third resonances are predominant.
Journal of Korean Society of Coastal and Ocean Engineers
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v.24
no.2
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pp.109-119
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2012
Long-term wave observation was carried out near Busan New Port and the major wave characteristics were analyzed. At Busan New Port, waves from south direction were predominant throughout the year, while waves from the west, developed at the north sea of Geoje island, appeared almost the same frequency in winter season, showing apparent seasonal variation. During the observation period, the significant wave height was mostly less than 1 m, but it reached its maximum of 8.0 m when typhoon Maemi passed on September 2003. Also, the seasonal variation was hardly observed except July. In contrast, seasonal variation was apparent for the significant wave period, whose peak ranges 4~5 s in summer whereas about 3 s in winter. The largest significant wave period was 15.56 s, observed on June 2003. Meanwhile, the annual variation was negligible for mean wave direction as well as significant wave height and period. Further analysis of the wave data acquired for 5 years at 4.5 km south, in the south sea of Daejuk island, confirmed high correlation between the two observation points in summer and vice versa in winter.
Surface sediments (0- 5 cm), mussels (Mytilus coruscus and M. edulis) and oysters (Crassostrea gigas) were sampled at 20 stations in Korean coast during a period of February to July 2000. Samples were analyzed for polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) content using gas chromatography coupled to mass spectrometer detector (GC/MSD). The sediment $\sum PAH$ concentration varied from 7 to 1,214 ng/g dry weight and the level of carcinogenic PAHs of six species ranged from 1 to 563 ng/g dry weight in surface sediments. In organisms, the levels of $\sum PAH$ were in the range of 63-876 ng/g dry weight and the concentrations of carcinogenic PAHs of six species were in the range of 4-582 ng/g dry weight. The highest PAH concentrations in sediments and organisms were in samples from Station 5 in Pohang coast and Station 8 in Jinhae coast, respectively. $\sum PAH$ concentrations in sediments and organisms collected from Korean coast were slightly low or comparable to those in other countries. The contribution of ring aromatic groups to sum of 16 PAHs in sediments and organisms showed a similar pattern for most stations. In sediments, the predominant contributions were four and five ring aromatics like fluoranthene, pyrene, benzo[a]anthracene, chrysene, benzo[b]fluoranthene, benzo[k]fluoranthene and benzo[a]pyrene. In the organisms, four ring aromatics like fluoranthene, pyrene, benzo[a]anthracene and chrysene were predominant PAH species. Several molecular indices such as phenanthrene/anthracene, fluoranthene/pyrene and LMW/HMW ratio were used to identify the origin of PAH contamination in sediments. The results indicate that PAHs of Korean coast were mainly of pyro1ytic contaminants with slight petrogenic input. A high correlation within individual PAH compound in marine sediments was observed, while correlation in organisms showed a highly significant relationship for heavier molecular weight PAHs.
This is the result of pesticide residue monitoring certified Good Agricultural Practice (GAP) by national agricultural cooperative federation (NACF) from 2009 to 2012. NACF evaluated simultaneously 283 pesticide multi-analysis method with GC (ECD, NPD) and HPLC. 6,590 agricultural products were analyzed in this period. As the results 1) detected 20.27% in 2009, 23.42% in 2010, 28.07% in 2011 and finally 31.75% in 2012, respectively. There was the total detected pesticide residue in the agricultural products. The violated ratio of agricultural products were 2.25% in 2009, 1.82% in 2010, 1.67% in 2011 and 3.47% in 2012, respectively. 13 pesticides went over the maximum residue limits (MRLs); carbendazim was the predominant violation. 40 pesticides; endosulfan was the predominant detected pesticide did not registered respectively crops in Korea. Most agricultural products that were under the MRLs met the safety standard, however agricultural products that contain neither registered nor set up MRL any level for example endosulfan in strawberry. Agricultural products that go over the MRLs with permitted pesticides, for example carbendazim in apple, are rejected. Because of these intricacies continual observation and evaluation will be need during GAP agricultural cultivation.
The dynamics and seasonal succession of dinoflagellate community, and their correlations with environmental parameters were investigated during the period from April, 1986 to March, 1987 at 6 selected stations in Masan Bay, Korea. The dinoflagellate standing crops varied extensively with months and stations: ranging from 44 to 2,789,900 cella/ l at surface layer and from 52 to 165,714 cells/ l at bottom layer, respectively. The distribution of standing crops by size class of dinoflagellate species showed that a group of 20-um size class was predominant throughout the present survey, since the most of dominant species have belonged to the size category. Among dominant species, Gyrodinium fissum was most dominant throughout the year in all sampling stations, particulary in June. Scripsiella trochoidea was predominant in May, Protoperidinium bipes and Prorocentrum minimum from June to September, Prorocentrum triestinum, P micans and Ceratium fusus from September to December, and Heterocapsa triquetra from December to April. The stepwise multiple regression analysis between dinoflagellate and environmental parameters revealed that salinity, nitrate-N, pH, and transparency were correlated with the variations of standing crops of dinoflagellate.
Because no reference on trombiculid mites (Acarina: Trombiculidae) in Cheju Island where tsutsugamushi disease is highly endemic had been available, studies on trombiculid mites in Cheju Island were implemented during the period of August 1991-Apil 1992, and the results obtained are summarized as follows: (1) The species and numbers of the field rodents collected were 143 Apodemus agrarius chejuensis (92.3%), 11 Crocidura lasiura (7. l%) and 1 Micromys minutus (0.6%) From total 12,075 chiggers harvested, 9 species of 4 genera in Trombiculidae were identified. (2) The predominant species through all seasons was 1. setum (43.3%), followed by 1. orientale (27.4%) and 1. scutellare (26.6%). However, in autumn when the most cases of tsutsugamushi disease occur, 1. scutellere was prominently predominant, having 79.8% of the collected chiggers. (3) Among 1,1421. scutellare examined for Rickettsia tsutsugpmushi by means of IFA test, 6 individuals were found positive showing 0.5% of infection rate. This is the first finding that 1. scutellere is the second vector species of tsutsugamushi disease in Korea. (4) Antibody positive rate of A. agrarius chejuensis sera were 31.2% (44/139), and 1 M. minutes serum was also found positive. The seropositive rates by season were not so significantly different. Key words: Tsutsugamushi disease, epidemiology, vector species, Cheju Island, Korea.
Purpose : To study the spectrum of epilepsy in children with cerebral palsy. Methods : A total of 93 consecutive patients with cerebral palsy(CP) were retrospectively suited. Criteria for inclusion were a follow-up period of at least 2 years. The study examined the correlation between the incidence of epilepsy and seizure types in the different forms of CP. Other factors associated with epilepsy, such as age of first seizure, occurrence of abnormalities on brain imaging, and electroencephalogram were also analyzed. Results : The overall prevalence of epilepsy in children with CP was 46.2 percent. The incidence of epilepsy was predominant in patients with mixed, diplegic, and quadriplegic palsies : 55.5 percent, 51.6 percent, and 50.0 percent in frequency. The first seizure occurred during the first year of life in 48.8 percent of patients with epilepsy. Generalized tonic-clonic seizures were the most common seizure type(44.2 percent), predominant in diplegic patients(64.3 percent). On the other hand, infantile spasms and myoclonic seizures were the main cause of seizures among quadriplegic children(60 percent and 40 percent, respectively). The occurrence of epilepsy was more popular in the group with abnormal brain imagings; especially encephalomalacia and cortical atrophy. All children with epilepsy in this study showed abnormal electroencephalogram(EEG) findings: Generalized abnormalities were observed in 55.8 percent of children with epilepsy; more dominantly in quadriplegic children(80.0 percent); and 40 percent of children with diplegia showed focal abnormalities. Conclusion : Cerebral palsy is associated with a higher incidence of seizure disorders, which, in the majority, has its onset in the first year of life; brain imaging and EEG are most effective in spotting epilepsy in children with CP.
Park, Kie Young;Park, Kyeang Hun;Lee, Sung Il;Park, Heon Woo;Hong, Sung Eic;Yang, Jae Hyeong;Choi, Soo Ha
Korean Journal of Ichthyology
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v.19
no.2
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pp.101-106
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2007
We investigated the maturity and spawning of black edged sculpin, Gymnocanthus herzensteini caught by gillnet in the East Sea from March 2003 to February, 2004. We analyzed monthly changes in maturity stages, gonadosomatic index (GSI), gonad weight (GW), egg diameter, fecundity, total length at 50% group maturity and sex ratio. The spawning period was December to February. The fecundity ranged form 8,814 eggs at 14.7 cm (TL) to 25,560 eggs at 24.4 cm (TL). The relationship between total length (TL) and fecundity (F) was $F=285.11TL^{1.4092}$ ($R^2$ =0.571) and fecundity increased with total length. The total length at 50% group maturity was estimated to be 15.25 cm. The sex ratio was 60 for female and 40 for male, where the female population was seen to be slightly predominant. For sex ratio by length class, male was a little predominant in small size, but female was 90% more than 24 cm.
Adenoviruses are an important cause of respiratory tract infections, particularly in infants, young children, and immuno-compromised patients. In this study, we investigated the characteristics of adenoviruses isolated from outpatients with acute respiratory illness in Gyeonggi province of South Korea during 2009-2011. Adenoviruses were detected in 102 of 1,622 (6.3%) specimens by using PCR or real-time PCR with viral specific primers. 76 isolates were obtained from 102 specimens using the A549 cells. Serotypic distributions of isolated adenovirus were analyzed by sequencing of hexon gene. Six different serotypes were identified, which included adenovirus serotypes 1-6. Adenovirus 3 (n=40, 52.6%) was the predominant serotype. The predominant types of adenovirus every year were serotypes 1 and 3 in 2009, serotype 3 in 2010, and serotype 5 in 2011, respectively. Adenoviruses 1, 2, 4, 5, and 6 were isolated sporadically throughout the study period. Adenovirus 3 was present both during outbreaks and in sporadic cases. These results indicate that adenovirus 3 played major causative agent of adenovirus outbreaks in Gyeonggi province of South Korea during 2009-2011. Continuous surveillance for specific serotypes of adenovirus that can cause outbreaks is important.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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