Kim, Dong-Hyun;Kong, Won-Sik;Kim, Kyung-Soo;Kim, Young-Ho;You, Chang-Hyun;Kim, Young-Bae
The Korean Journal of Mycology
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v.26
no.2
s.85
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pp.173-181
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1998
To identify genetic difference of 13 strains in three Pleurotus species, analyses of rDNA, AP-PCR and RFLP were carried out. IGRI and $ITSI{\sim}II$ regions of rDNA amplified by PCR were about 0.9 and 0.7 kb, respectively. These PCR products were digested with six restriction enzymes to analyse polymorphism. Especially, treatment of HaeIII enzyme on $ITSI{\sim}II$ regions showed specific bands in three Pleurotus sajor-caju strains. Genetic differences among three species were classified by similarity analyses based on rDNA polymorphism. Various band patterns of $2,500{\sim}150\;bp$ were showed by AP-PCR. Identification of species and varieties in 13 Pleurotus strains was possible according to primers used in AP-PCR. In order to develop genetic markers, RFLPs using IGRI and $ITSI{\sim}II$ probes derived from ASI 2180 and 2070 were carried out on eight Pleurotus varieties. RFLP patterns using IGRI probe were more various than that of $ITSI{\sim}II$ probe.
Hepatoprotective effects of polysaccharides extracted from liquid cultured mycelia were screened by measuring the glutamic pyruvate transaminase activity of the primary cultured rat hepatocytes intoxicated with carbon tetrachloride. Sixty among 75 isolates of higher fungi showed to be hepatoprotective effect, and these were 13 of Ganoderma lucidum, 5 of Lentinus edodes, 1 of Pleurotus ostereatus, 4 of Coriolus versicolor, 2 of Lyophyllum spp., 7 of Grifora frondosa, 3 of Agaricus spp., 14 of Schizophyllum commune and 11 of Cordyceps spp.. Especially, 10 isolates, Ganoderma lucidum IY003 and IY009, Lentinus edodes IY103, Lyophyllum sp. IY402, Agaricus sp. IY701 and IY703, Schizophyllum commune IY804, IY810 and IY818, Cordyceps sp. IY902, were indicated below 80% of glutamic pyruvate transaminase activity.
Pleurotus spp. have been used for edible and medicinal purposes in Asian countries for a long time. The fruiting bodies of the Pleurotus ostreatus, Pleurotus citrinopileatus and Pleurotus salmoneostramineus contained many physiologically beneficial substances for human health. Therefore, it is necessary to study the genetic diversity of Pleurotus mushroom cultivars commercially cultivated in Korea. Eleven strains of Pleurotus spp. were collected from different geographical regions in South-East Asia and ITS regions of rDNA and RAPD of genomic DNA were analyzed. The size of the ITS1 and ITS2 regions of rDNA from the different strains varied from 167 to 254 bp and 156 to 213 bp, respectively. The sequence of ITS1 was more variable than that of ITS2, and the 5.8S sequences were identical. A phylogenetic tree based on the ITS region sequences indicated that selected strains could be classified into 4 clusters. Eleven Pleurotus species were also analyzed by RAPD with 20 arbitrary primers. Ten of these primers were efficiently amplified the genomic DNA. The number of amplified bands varied with the primers and strains, with polymorphic fragments in the range from 0.1 to 2.0kb. The results revealed that genetic diversity of selected strains of P. ostreatus, P. citrinopileatus and P. salmoneostramineus is low.
This study was carried out to investigate the genetic relationship of Pleurotus ferulae, an edible mushroom found on a medicinal plant, Ferula assa-foetida, in central China. The genetic relationships of 15 Pleurotus species strains, including five P. ferulae strains were analyzed. The strains were divided into seven groups at 80% genetic similarity level according to random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis. Four out of the seven groups consisted of two to four strains, while the other three groups consisted of three strains. In each of the three groups, the three strains were from each of three different Pleurotus species (P. cornucopiae, P. florida and P. sajorcaju). Other strains grouped together for genetic similarity were P. eryngii 26060 and P. fuscus var. ferulae 26065, three strains of P. ostreatus, and four P. ferulae strains (Bakdal, Awi, Cheonsan 1, and Yesan). However, Japanese Seolyi which belongs to P. ferulae and Heukpyung which belongs to P. ostreatus were together in a separate group.
Kim, Beom-Gi;Jeong, Mi-Jeong;Lee, Chang-Soo;Lee, Hee-Kyung;Yoo, Young-Bok;Ryu, Jin-Chang
The Korean Journal of Mycology
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v.23
no.3
s.74
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pp.202-208
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1995
This study describes the effects of several components on PCR amplification used for RAPD. We used different concentrations of reaction components to obtaine discrete and reproducible PCR products from Pleurotus cornucopiae. The optimum concentrations of reaction components were found to be 80 ng of template DNA, 30 pmole of 10-mer primer, $200\;{\mu}M$ dNTP, 2mM $MgCl_2$, 50 mM KCl, 10 mM Tris-HCl(pH 9.0), 0.1% Triton X-100, 1.5 unit of Taq DNA polymerase (promega) in $50\;{\mu}l$ reaction volume. The optimum annealing temperature was $35^{\circ}C$. These results proved to be valuable for characterization of Pleurotus spp.
This study aimed to investigate possible cause of slow and abnormal growth of oyster mushrooms, Pleurotus florida and P. ostreatus collected from bad crop farms. Spherical virus particles of 30 nm in diameter from P. florida, 23 nm particles from P. ostreatus, and both 23 and 30 nm particles were also found from interspecies mated culture between P. florida and P. osreatus. The virus particles might be associated with the bad crop of Pleurotus species.
Seo, Kyoung-In;Jang, Kab-Yeul;Yoo, Young-Bok;Park, Soon-Young;Kim, Kwang-Ho;Kong, Won-Sik
The Korean Journal of Mycology
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v.36
no.2
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pp.130-137
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2008
To distinct the commercial strains in Pleurotus spp., 81 strains in eight Pleurotus species were used. DNA fingerprinting using URP-PCR was conducted to determine the phylogenetic relationships among Pleurotus strains. DNA profiles of Pleurotus species obtained by twelve URP primers were analyzed for genetic similarity by NTSYS program. We could divide strains into ten clusters, in which three of them belong to P. ostreatus and the others to the different species, respectively. At the 76% similarity level, 70 P. ostreatus strains were distinguished into three clusters. Cluster I contained 35 strains and some of them showed almost 100% similarity, one strain closely related to Weonhyeong and six strains closely related to Wangheukpyeong. In cluster II, twenty-one out of 23 strains showed 100% to Suhan. Cluster III contained twelve strains, including six strains closely related to Chunchu-2. The results suggested that there are many same strains with different names in mushroom spawn market.
Agrocybe aegerita is an important mushroom cultivated in Korea, with good feel and a peculiar fragrance. A. aegerita can be cultivated throughout the year using culture bottles but is more susceptible to contamination than other mushrooms. Twenty-two pathogens were isolated from the fruiting bodies and compost of A. aegerita, and seven isolates were isolated from Pleurotus ostreatus to compare with the A. aegerita isolates, collected from Gimje, Iksan, Gunsan of Chonbuk, and Chilgok of Gyeongbuk Province in 2009. These isolates were identified based on morphological and molecular characteristics. Of the 29 isolates, 26 were identified as Trichoderma spp. and the remaining three were Aspergillus spp., Mucor spp., and Penicillium spp. A phylogenetic analysis revealed that the 26 isolates of Trichoderma were divided into four taxa, namely T. harzianum, T. pleuroticola, T. longibrachiatum, and T. atroviride. Among the Trichoderma spp., 16 isolates (55.2%) were identified as T. harzianum, six as T. pleuroticola (20.7%), two as T. longibrachiatum, and the remaining two were T. atroviride.
As the pest of the Letinus edoeds, five insect species and six animal species are investigated injuring the fresh mushroom. Of these, insect and animals, Achorutes armatus, Scaphidium amurense and Philomycus confusa caused severe damage to mushroom fruitbody, and a greate deal of damage was done to mushroom lamella by mites (Rhizoglyphis sp., and Histiostoma sp.). As the pest of Lentinus edodes bed logs, two insect species from immature bed logs, eight insects and one isopod species from matured bed logs were investigated. Of those, Moechotypa diphysis was found to be the most injurious species from both immature and matured bed logs. As the pest of Pleurotus ostreatus, six insects and the two mite species were investigated from sporophore. Of those, Lycoriella sp. and Mycophilla sp. are considered to be very serious. while two insects and five mite species were investigated from the mushroom bed. Of those, one insect (Lycoriella sp.) and two mites (Histiostoma feroniarum and Throglyphus bankslogior) found to be abundant and caused serious damage.
A total of 12 strains of fluorescent Pseudomonas isolated from the cultivated mushrooms such as Agaricus bisporus and Pleurotus ostreatus were collected. They consisted of pathogenic Pseudomonas spp. and epiphytic Pseudomonas spp. of the cultivated mushroom. To analyze the phylogenetic relationship of these strains, ITS I region, the 16S-23S intergenic spacer region in the ribosomal RNA (rRNA) operon, was cloned and sequenced. The spacer regions of these strains were 495∼527 nucleotides in length and contained the genes encoding isoleucine-tRNA (tRNAIle) and alanine-tRNA (tRNAAla). The reciprocal homologies of each ITS I sequence among these strains were in the range of 84.2%∼98.8%. According to the analysis of ITS I sequences, the fluorescent Pseudomonas spp. were phylogenetically classified into three clusters. Cluster I consisted of Pseudomonas fluorescens, P. tolaasii, P. gingeri’, and P.‘reactans’(WLRO). Cluster II comprised Pseudomonas fluorescens biovar C and F. Cluster III composed P. agarici. Cluster I and II could be classified into P. fluorescens complex. P. agarici formed an independent taxon clearly separable from P. florescens complex.
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