Fitriana, Yuyun;Tampubolon, Desi Apriani Teresa;Suharjo, Radix;Lestari, Puji;Swibawa, I Gede
The Plant Pathology Journal
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v.38
no.5
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pp.449-460
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2022
This study was performed to reveal phenotypic characters and identity of symbiont bacteria of Nasutitermes as well as investigate their potential as antagonist of plant pathogenic fungi. Isolation of the symbiont bacteria was carried out from inside the heads and the bodies of soldier and worker termite which were collected from 3 locations of nests. Identification was performed using phenotypic test and sequence of 16S ribosomal DNA (16S rDNA). Antagonistic capability was investigated in the laboratory against 3 phytopathogenic fungi i.e., Phytophthora capsici, Ganoderma boninense, and Rigidoporus microporus. Totally, 39 bacterial isolates were obtained from inside the heads and the bodies of Nasutitermes. All the isolates showed capability to inhibit growth of P. capsici, however, 34 isolates showed capability to inhibit growth of G. boninense and 32 isolates showed capability to inhibit growth of R. microporus. Two bacterial strains (IK3.1P and 1B1.2P) which showed the highest percentage of inhibition were further identified based on their sequence of 16S rDNA. The result showed that 1K3.1P strain was placed in the group of type strain and reference strains of Lysinibacillus fusiformis meanwhile 1B1.2P strain was grouped within type strain and reference strains Paenibacillus alvei. The result of this study supply valuable information on the role of symbiont bacteria of Nasutitermes, which may support the development of the control method of the three above-mentioned phytopathogenic fungi.
Ethanol extract obtained from bark, roots, stem, leaves and seeds of 30 species of plants and mushroom, Dicyophora indusiata were examined antimicrobial effect on fish pathogenic bacteria, Listoneria anguillamm, Lactococcus garvieae, Streptococcus iniae by disk method. Ethanol extract of D. indusiata was found to be the most active against all fish pathogenic bacteria in test system. Ethyl acetate fraction from ethanol extract of D. indusiata showed the strongest compared with those from other solvent fractions such as dichloromethane, n-buthanol and water. The antimicrobial effect of ethyl acetate fraction was particularly evident against S. iniae.
Bacterial population density on soybean leaves was $10^2~10^5CFU/cm^2$. Bacterial population density was increased by progress of plant growth stage. Population density of soybean sprout rotting bacteria on soybean leaves was $0~10^3CFU/cm^2$. Population density of soybean sprouts rotting bacteria was related to cultivating area, but not related to plant growth stage. Cultivar and population density of soybean sprout rotting bacteria were less corelated, and varied by plant growth stages and plant parts. Erwina cypripedii, E. carotovora subsp. carotovora, Xanthomonas campestris pv. glycines, Staphylococcus sp., and Micrococcus sp. were identified as pathogenic bacteria causing soybean sprout rot. In generally population density of E. cypripedii, E. carotovora subsp. carotovora, Micrococcus sp., and X. campestris pv. glycines were high.
Essential oils are mixtures of volatile, lipophilic compounds originating from plants. Some essential oils have useful biological activities including antimicrobial, spasmolytic, antiplasmodial, and insect-repelling activities. In this study, we tested the antimicrobial activity of essential oil prepared from the aromatic plant, Cymbopogon citrates, against three important plant pathogenic and medical microorganisms, Pectobacterium carotovorum, Colletotrichum gloeosporioides, and Aspergillus niger. It effectively inhibited the growth of the bacterium, Pectobacterium carotovorum, in a dose-dependent fashion, and 0.5% of the oil inhibited the growth of bacteria completely. Similarly, the essential oil inhibited the growth of plant pathogenic fungus, Colletotrichum gloeosporioides, and the addition of 1% of essential oil completely inhibited the growth of fungus even after 5 days of culture. Finally, it effectively inhibited the growth of the medically and industrially important fungal species, Aspergillus spp. These results suggest that the essential oil from Cymbopogon citrates may be an environmentally safe alternative to inhibit antimicrobial agents for various uses.
Antibacterial and antifungal activities of liquid culture filtrate, water and ethanol extract (solid culture) of Stereum ostrea were evaluated against 5 bacteria and 3 plant pathogenic fungi. To determine the minimal inhibitory concentration (MIC), we studied $5{\sim}300\;mg/ml$ concentrations against bacteria and fungi separately. The MIC was 10 mg/ml for Bacillus subtilis and 40 mg/ml for Colletotrichum gloeosporioides and Colletotrichum miyabeanus. Liquid culture filtrate was more effective against Gram positive than Gram negative bacteria, and Staphylococcus aureus was the most inhibited (20.3 mm) bacterium. Water and ethanol extracts were effective against both Gram positive and Gram negative bacteria, and water extract was better than ethanol extract. In water and ethanol extract, inhibition zones were 23.6 and 21.0 mm (S. aureus) and 26.3 and 22.3 mm (Pseudomonas aeruginosa), respectively. For plant pathogenic fungi, the highest and lowest percent inhibition of mycelial growth (PIMG) was found 82.8 and 14.4 against C. miyabeanus and Botrytis cinerea in liquid culture filtrate, respectively. In water extract, the PIMG was found to be the highest 85.2 and lowest 41.7 for C. miyabeanus and C. gloeosporioides, respectively. The inhibitory effect of ethanol extract was better against C. miyabeanus than C. gloeosporioides and B. cinerea. Among 3 samples, water extract was the best against tested pathogenic fungi. This study offers that the extracts isolated from S. ostrea contain potential compounds which inhibit the growth of both bacteria and fungi.
Six strains of an obligate predatory bdellovibrio isolate that preys on Burkholderia glumae in rice paddy field water and rhizosphere soil, were identified and characterized. The numbers of Bdellovibrio cells varied from $3.2{\times}10^3$ to $9.2{\times}10^3$ plaque-forming unit/g after enrichment in cells of B. glumae. Prey range tests with six Bdellovibrio strains and 17 prey strains of rice-pathogenic, antibiosis-related, or nitrogen-fixing bacteria resulted in unique predation patterns in related prey cells. Strain BG282 had the widest prey range on 7 plant pathogenic bacteria among the 17 prey strains tested. However, no predation occurred with strains of Azospirillum brasilense, Paenibacillus polymyxa, Pseudomonas fluorescens, P. putida, and Serratia marcescens that are associated with antibiosis or nitrogen fixation in the rice ecosystem. Identification was confirmed by the presence of typical bdelloplast in the prey cells of B. glumae and by a PCR assay using B. bacteriovorus-specific primers. Furthermore, 16S rDNA sequencing of the six bdellovibrio strains showed a homology range of 97.2% to 99.2% to the type strain of B. bacteriovorus.
Phytopathogenic bacteria causing soft-rot many vegetables; extracellular enzymes produced by them, pectate lyase(Pel) is important pathogenicity facotrs which cause tissue maceration and cell death. Ten of seventeen plant pathogenic bacteria showed weak Pel activity, four of them showed low Pel activity and Erwinia acrotovora subsp. carotovora, E. chrysanthemi, Pseudomonas marginalis and Xanthomonas campestris pv. campestris showed high Pel activity in the polygalacturonate yeast extract agar (PAY) plate. High Pel activity of the four bacteria species produced the highest Pel activity when pectin or polygalacturonic acid (PGA) was added to minimal salts (MS) medium. Pel activity of the four bacterial species was the highest at 2$0^{\circ}C$ among different temperature conditions. The rate and amount of maceration of potato tuber tissue were highest at 2$0^{\circ}C$ in E. carotovora subsp. carotovora, E. chrysanthemi and P. marginalis, while those were the highest at $25^{\circ}C$ in X. campestris pv. campetris.
An antagonistic bacterial strain KLF01 was isolated from rhizosphere of tomato and identified to be Lactobacillus sp. by biochemical and genetic analysis. This strain showed antagonism against the used plant pathogenic bacteria like Ralstonia solanacearum, (bacterial wilt), Xanthomonas axonopodis pv. citri, (Citrus canker), Xanthomonas campestris pv. vesicatoria (Bacterial spot), Eriwinia pyrifoliae (Shoot-blight) and Eriwinia carotovora subsp. carotovora group (Potato scab) through agar well diffusion method. In planta test done by drench application of strain KLF01 $(4{\times}10^8 cfu/ml)$ into the experimental plot containing tomato (Solanum lycopersicum L.) cultivar 'Lokkusanmaru' and red pepper (Capsicum annuum L.) cultivar 'Buja' plants, in pot test post-inoculated with the plant pathogenic bacteria, R. solanacearum significantly reduced the disease severity, compared to the non-treated plants.
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