• 제목/요약/키워드: Phytophthora melonis

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Ribosomal DNA의 PCR-RFLP에 의한 국내산 Phytophthora drechsleri의 3가지 종내그룹 (Three Intraspecific groups in Korean Isolates of Phytophthora drechsleri Based on PCR-RFLP of Ribosomal DNA)

  • 홍승범;지형진;이승임;고승주;류진창;김인수
    • 한국식물병리학회지
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    • 제14권5호
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    • pp.519-525
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    • 1998
  • Intraspecific genetic diversity of Korean isolates of Phytophthora drechsleri was investigated based on PCR-RFLP of rDNA along with closely related species in the genus; P. cryptogea, P. melonis, P. erythroseptica, P. cinnamomi, P. cambivora and P. cactorum. Gene regions of nuclear small subunit and internal transcribed spacer (ITS) in rDNA were amplified with polymerase chain reaction and digested with 9 restriction enzymes. Phytophthora species was readily differentiated from each other based on the digestion patterns, however, P. cryptogea was not separable from some isolates of P. drechsleri. Twenty one isolates of P. drechsleri originated from 15 host plants were divided into three distinct groups designated as PdG1, PdG2 and PdG3, respectively. Four isolates in PdG1 were originated from green vegetables and tomato and nine isolates in PdG2 were mainly isolated from medicinal plants. The two groups showed 95.3% homology and four isolates of P. cyptogea came under the groups. However, Eight isolates in PdG3 collected from cucurbits were clearly differentiated from those of PdG1 and PdG2 by 66.5% homology, but completely matched with a Taiwan isolate of P. melonis. Results indicated that three distinct groups exist in Korean isolates of P. drechleri and each group has host preference. In addition, reclassification of the cucurbits isolates are reserved because of their distinct genetic characters from other intraspecific groups in P. drechsleri.

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Phylogeny of Korean Isolates of Phytophthora Species Based on Sequence Analysis of Internal Transcribed Spacer of Ribosomal DNA

  • Hong, Seung-Beom;Jee, Hyeong-Jin;Kim, Sang-Hee;Go, Seung-Joo
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제16권1호
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    • pp.29-35
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    • 2000
  • The internal transcribed spacer regions (ITS I, 5.8S and ITS II) of the ribosomal DNAs were amplified from Korean isolates of Phytophthora spp. and sequenced to characterize them. Sequences from 33 isolates previously identified as P. boehmeriae, P. cactprum, P. cambivora, P. capsici, P. cinnamomi, P. erythroseptica, P. infestans, P. megasperma, P. melonis, P. nicotianae, P. palmivora and P. sojae were compared with published sequences, and a phylogenetic tree was produced. All isolates belonging to 10 species, P. cactorum, P. cambivora, P. capsici, P. cinnamomi P. citricola, P. infestans, P. nicotianae, P. palmivora and P. sojae were clearly clustered into published isolates of each species above 97% bootstrap value. Cucurbits isolates of Phytophthora previously identified as either P. melonis or P. drechsleri showed distinct evolutionary lineages from the P. megasperma was closely related to isolates of P. cryptogea-P. drechsleri showed distinct evolutionary lineages from the P. cryptogea-P. drechsleri complex group, indicating that P. melonis is a valid species. A Korean isolate of P. megasperma was closely related to isolates of P. erythroseptica showed distant genetic relationship with published isolates of P. erythroseptica (CBS 956.87). It is probable that the two Korean isolates could be genetically different from foreign isolates or misidentified. A grouping of species according to ITS sequence divergence matched, to some degree, the broad classification based on type of papilla. However, a separation of semi-papillate species and papillate species was not wvident in this study.

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Antifungal Effect of Plant Essential Oils on Controlling Phytophthora Species

  • Amini, Jahanshir;Farhang, Vahid;Javadi, Taimoor;Nazemi, Javad
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제32권1호
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    • pp.16-24
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    • 2016
  • In this study, antifungal activity of essential oils of Cymbopogon citratus and Ocimum basilicum and two fungicides Mancozeb and Metalaxyl-Mancozeb in six different concentrations were investigated for controlling three species of Phytophthora, including P. capsici, P. drechsleri and P. melonis on pepper, cucumber and melon under in vitro and greenhouse conditions, respectively. Under the in vitro condition, the median effective concen- tration ($EC_{50}$) values (ppm) of plant essential oils and fungicides were measured. In greenhouse, soil infested with Phytophthora species was treated by adding 50 ml of essential oils and fungicides (100 ppm). Disease severity was determined after 28 days. Among two tested plant essential oils, C. citratus had the lowest $EC_{50}$ values for inhibition of the mycelial growth of P. capsici (31.473), P. melonis (33.097) and P. drechsleri (69.112), respectively. The mean $EC_{50}$ values for Metalaxyl-Mancozeb on these pathogens were 20.87, 20.06 and 17.70, respectively. Chemical analysis of plant essential oils by GC-MS showed that, among 42 compounds identified from C. citratus, two compounds ${\beta}$-geranial (${\alpha}$-citral) (39.16%) and z-citral (30.95%) were the most abundant. Under the greenhouse condition, Metalaxyl-Mancozeb caused the greatest reduction in disease severity, 84.2%, 86.8% and 92.1% on melon, cucumber, and pepper, respectively. The C. citratus essential oil reduced disease severity from 47.4% to 60.5% compared to the untreated control ($p{\leq}0.05$). Essential oils of O. basilicum had the lowest effects on the pathogens under in vitro and greenhouse conditions. These results show that essential oils may contribute to the development of new antifungal agents to protect the crops from Phytophthora diseases.

양송이버섯 재배 후 폐상퇴비의 효과 분석 및 분리 미생물의 특성 (Characteristic of Microorganism and Effect Analysis of Spent Mushroom Compost after Cultivation of Button Mushroom, Agaricus bisporus)

  • 이찬중;윤형식;정종천;전창성;김승환;이순자
    • 한국토양비료학회지
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    • 제42권2호
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    • pp.123-131
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    • 2009
  • 양송이버섯 재배 후 폐상퇴비의 효율적인 재활용과 친환경 자재로서의 이용가능성을 검토하기 위해 작물과 식물병원균에 미치는 영향을 미생물학적인 관점에서 조사하였다. 폐상시기별로 폐상퇴비내 미생물상은 농가마다 차이는 있었지만 형광성 Pseudomonas속, 내열성 세균, 방선균 등 다양한 미생물이 분포하였고, 특히 버섯에는 병원균으로 작용하지만 식물병원균에는 길항균으로 사용되고 있는 Trichoderma 속이 많이 분포하고 있었다. 폐상퇴비에서 분리한 미생물의 여러가지 채소병원균에 대한 항균력을 조사한 결과 식물병원균에 대하여 광범위한 항균 스펙트럼을 나타내었다. 농가마다 채취한 폐상퇴비 중에 항균력을 가지는 미생물의 분포는 달랐지만 분리균의 상당수가 검은무늬병(Alternaria brassicicola), 역병(Phytophthora melonis, Phytophthora capsici), 탄저병(Colletotrichum gloeosporioides) 등에는 강한 항균력을 보였다. 또한 분리 미생물 중 45.8%가 고추 근권에 정착하는 능력을 보였고, 이들 중 5.8%는 $5{\times}10^2cfu\;root^{-1}$ 이상 정착 능력을 보였다. 미생물처리시 균주의 62.7%가 고추 생장을 촉진시켰고, 뿌리 또한 무처리에 비해 생장이 왕성하였다. 폐상퇴비 추출물의 고추 종자 발아 및 생육정도를 조사한 결과 양송이버섯을 정상적으로 수확하고 폐상한 퇴비는 고추의 발아에 전혀 지장이 없었지만 버섯을 거의 수확하지 못한 폐상퇴비의 경우 고추의 발아에 심각한 문제가 발생하였고, 포트시험 결과도 버섯을 거의 수확하지 못한 폐상퇴비를 처리한 경우 고추의 발아 및 생육이 전혀 이루어지지 않았다. 폐상퇴비를 멸균 및 비멸균 조건으로 실험한 결과 폐상시기에 관계없이 멸균시료에 비해 비멸균 시료에서 고추의 생육이 왕성하였다.

길항작용을 나타내는 Trichoderma harzianum SJG-99721의 분리 및 형태학적 특징 (Isolation and Morphological Characterization of Ttichoderma harzianum SJG-99721, a Powerful Biocontrol Agent)

  • 이호용;민봉희
    • 환경생물
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    • 제20권2호
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    • pp.130-135
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    • 2002
  • PDA배지에서 $25^{\circ}C$로 배양할 때 초기 균사의 색은 흰색을 띄고 있었으며 배양 후기에 생성되는 포자의 색은 짙은 푸른색을 나타내고 있었다. 시간당 성장률은 1.1mm보다 빠른 것으로 나타났으며 성숙한 포자의 모양은 부드럽고 구형에 가까운 모양이었다. 이러한 형태학적 결과는 시간당 성장률이 0.5-0.7mm 이하인 Tricho-derma viride 및 T. hamatum의 특징과 성숙 포자의 모양이 실린더 모양인 T. koningii, T longibrachiatum과 구별되는 결과였다(Raifai 1969; Seaby 1996; Gams and Bissett 1998). 또한 Trichoderma harzianum의 분류에 있어 가장 중요한 구조는 phialospore의 형태가 구형이어야 하며, 포자의 겉은 부드럽고 크기는 $2.5-3.0\times{3.4-4.0}\mu{m}$ 정도인 것이 특징이다(Morris and Doyle 1995a, b). 이러한 결과를 종합하여 분리 균주를 동정한 결과 Trichoderma harzianum으로 확인할 수 있었다. Phytophthora capsici에 대한 분리 균주의 성장저해정도를 측정한 결과 $27^\circ{C}$의 조건에서 가장 높은 길항력을 나타내었으며 다른 곰팡이에 대한 성장억제도 이 온도에서 가장 높을 것으로 판단되었다. 또한 $31^\circ{C}$ 이상에서는 T. harzianum SJG-99721의 성장 속도가 급속히 떨어짐을 확인한 바 이러한 성질을 이용하여 느타리버섯의 균사 배양시 고온 배양을 실시할 경우 푸른곰팡이 병 오염을 극히 제한할 수 있을 것으로 판단되었다. 또한 이러한 고온에서의 성장 속도 제한은 식물 병원성 미생물과의 길항 작용에서도 영향을 미치는 만큼 생물농약으로서의 사용은 토양 온도가 $30^\circ{C}$ 넘지 않는 기간에 최대한 토양 내에서 증식이 이루어지도록 조처해야 한다. 진균성 식물 병원균의 세포벽 분해효소인 extracellular chitinase의 높은 활성도를 확인함으로서 Trichoderma harzianum SJG-99721의 강력한 식물 병원균 제어능력은 이들의 높은 chitinase의 활성도에 의한 것으로 유추할 수 있었다.