Disease control efficacy was evaluated with use of Bacillus subtilis KB-401 against cucumber powdery mildew in a greenhouse and fields. B. subtilis KB-401 showing inhibitory effect on mycelial growth of various phytopathogenic fungi was formulated for the evaluation. The formulated biofungicide of B. subtilis KB-401 was less effective at 1,000 times dilution rate than that at 250 or 500 times dilution rate. The powdery mildew was successfully controlled by the biofungicide at the early stage of disease development. The field performance of the biofungicde was conducted in Asan and Cheonan city. Three or four consecutive applications of the biofungicide at 500 dilution rate with 10-day intervals resulted in considerable efficacy of disease control as high as 83.3%.
Fusarium head blight (FHB) caused by infection with Fusarium graminearum leads to enormous losses to crop growers, and may contaminate grains with a number of Fusarium mycotoxins that pose serious risks to human and animal health. Antagonistic bacteria that are used to prevent FHB offer attractive alternatives or supplements to synthetic fungicides for controlling FHB without the negative effects of chemical management. Out of 500 bacterial strains isolated from soil, Bacillus amyloliquefaciens JCK-12 showed strong antifungal activity and was considered a potential source for control strategies to reduce FHB. B. amyloliquefaciens JCK-12 produces several cyclic lipopeptides (CLPs) including iturin A, fengycin, and surfactin. Iturin A inhibits spore germination of F. graminearum. Fengycin or surfactin alone did not display any inhibitory activity against spore germination at concentrations less than 30 ug/ml, but a mixture of iturin A, fengycin, and surfactin showed a remarkable synergistic inhibitory effect on F. graminearum spore germination. The fermentation broth and formulation of B. amyloliquefaciens JCK-12 strain reduced the disease incidence of FHB in wheat. Furthermore, co-application of B. amyloliquefaciens JCK-12 and chemical fungicides resulted in synergistic in vitro antifungal effects and significant disease control efficacy against FHB under greenhouse and field conditions, suggesting that B. amyloliquefaciens JCK-12 has a strong chemosensitizing effect. The synergistic antifungal effect of B. amyloliquefaciens JCK-12 and chemical fungicides in combination may result from the cell wall damage and altered cell membrane permeability in the phytopathogenic fungi caused by the CLP mixtures and subsequent increased sensitivity of F. graminearum to fungicides. In addition, B. amyloliquefaciens JCK-12 showed the potential to reduce trichothecenes mycotoxin production. The results of this study indicate that B. amyloliquefaciens JCK-12 could be used as an available biocontrol agent or as a chemosensitizer to chemical fungicides for controlling FHB disease and as a strategy for preventing the contamination of harvested crops with mycotoxins.
Previously, we isolated plant growth promoting rhizobacterium (PGPR) Bacillus licheniformis K11 which could produce auxin, cellulase and siderophore. The siderophore of B. licheniformis K11 $(siderophore_{K11})$ was determined to be a catechol type siderophore which is produced generally by Bacillus spp. B. licheniformis K11 could produce the siderophore most highly after 96 h of incubation under nutrient broth at $20^{\circ}C$ with initial pH 9.0. For the production of the $siderophore_{K11}$, trehalose and $NH_4Cl$ were the best carbon and nitrogen sources in Davis minimal medium, respectively. The $siderophore_{K11}$ was Produced in M9 medium (pH 9.0) after 4 days at $20^{\circ}C$, and purified from culture broth of B. licheniformis K11 by using Amberlite XAD-2, Sephadex LH-20 column chromatography, and reversed-phase HPLC. The $siderophore_{K11}$ had the biocontrol activity against spore germination of P. capsici and F. oxysporum on potato dextrose agar (PDA). The results indicate that the $siderophore_{K11}$ is an antifungal mechanism of B. licheniformis K11 against phytopathogenic fungi.
To develop multifunctional microbial inoculant, an insluble phosphate-solubilizing bacterium with antifungal activity was isolated from plant rhizospheric soil. On the basis of its morphological, cultural and physiological characteristics and Biolog analysis, this bacterium was identified as Pseudomonas fluorescens RAF15. P. fluorescens RAF15 showed antifungal activities against phytopathogenic fungi Botrytis cinerea and Rhizoctonia solani. The optimal medium composition and cultural conditions for the solubilization of insoluble phosphate by P. fluorescens RAF15 were 1.5% of glucose, 0.005% of urea, 0.3% $MgCl_2{\cdot}6H_2\;0.01%\;of\;MgSO_4{\cdot}7H_2O\;0.01%,\;of\;CaCl_2{\cdot}2H_2O$, and 0.05% of NaCl along with initial pH 7.0 at $30^{\circ}C$. The soluble phosphate production under optimum condition was 863 mg/L after 5 days of cultivation. The solubilization of insoluble phosphates was associated with a drop in the pH of the culture medium. P. fluorescens RAF15 showed resistance against different environmental stresses like $10-35^{\circ}C$ temperature, 1-4% salt concentration and pH 2-11 range. The strain produced soluble phosphate to the culture broth with the concentrations of 971-1121 mg/L against $CaHPO_4$, 791-908 mg/L against $Ca_3(PO_4){_2}$, and 844 mg/L against hydroxyapatite, respectively. However, the strain produced soluble phosphate to the culture broth with the concentrations of 15 mg/L against $FePO_4$, and 5 mg/L against $AlPO_4$, respectively.
In this study, a total of more than 1,000 bacteria, including 739 species of aerobic bacteria, 80 species of urease producing bacteria and 303 species of photosynthetic bacteria, were isolated from red-pepper field soils located in the Gyeongsan Province of the Republic of Korea. Amongst these, 158 species of aerobic bacteria, 70 species of urease producing bacteria and 228 species of photosynthetic bacteria were found to be auxin producing soil bacteria through quantification analysis with the Salkowski test. The latter groupings were then tested for antifungal activities to ${\beta}$-Glucanase and siderophore using CMC congo red agar and CAS blue agar media. In addition, the selected strains were examined for antifungal activity against various phytopathogenic fungi on PDN agar media. Six strains; BCB14, BCB17, C10, HA46, HA143, and HJ5, were noted for their ability to both produce auxin and act as antifungal substances. 16S rDNA sequence comparison analyses of these six strains identified them as Bacillus subtilis BCB14, B. methylotrophicus BCB17, B. methylotrophicus C10, B. sonorensis HA46, B. subtilis HA143, and B. safensis HJ5.
We classified the previously reported antagonistic strains of Sorangium cellulosum into 5 subspecies (A-E). Four strains were antagonistic to Botrytis cinerea (AB group) and two strains were antagonistic to Colletotrichum acutatum (AC group). According to the genetic and sequential analyses with standard genes, xynB1, bglA2, groEL1 for grouping, all strains of AB group were belonged to subspecies C and all strains of AC group were belonged to subspecies D. In addition, high pressure liquid chromatography with the culture filtrates confirmed the genetic results, because AB group had peaks with retention time at 20-22.5 minutes, whereas AC group had no peak. There was positive relationship ($R^2=0.9652$) between the control values of infecting B. cinerea on cherry tomatoes and the main peak areas of chromatograms among the four isolates of AB group. From the subspecies results of AB group, the main peak of KYC 3270 was expected to be epothilone D. However the retention times of the standard of commercial epothilone D and the main peak of KYC 3270 culture filtrate were different as 9.9 and 11.581 min., respectively. Finally, the antagonistic metabolite of AB group was inferred as 7-ketone epothilone D.
Endophytic Bacillus sp. CY22 was previously isolated from the interior of balloon flower root and showed strong antifungal activity against phytopathogenic fungi such as Rhizoctonia solnni, Fusarium oxysporum, and Phythium ultimum. Many Bacillus strains produce antifungal compound such as iturin, fengycin, and mycosubtilin. We isolated and identified antifungal compound from cell supernatant of the endophytic strain. By the MALDI-TOF mass result, the antifungal compound was similar to the known antifungal lipopeptide iturin. It was found that the purified iturin had three isoforms with protonated masses of m/z 1,043.39, 1,057.42, and 1,071.42 and different structures in combination with $Na^{+}$ ion using MALDI-TOF MS. The ita22 gene, which transacylase gene is associated with production of antifungal iturin, had an open reading frame (ORF) of 1,200 bp encoding 400 amino acids. Results of deduced amino acids sequence homology search, Ita22 was homologous with FenF (BAB69697) of Bacillus subtilis 168.
Park, Jun-Kyung;Kim, JuEun;Lee, Chul-Won;Song, JaeKyeong;Seo, Sun-Il;Bong, Ki-Moon;Kim, Dae-Hyuk;Kim, Pyoung Il
Korean Journal of Organic Agriculture
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v.27
no.1
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pp.65-76
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2019
Bacillus genus are found abundantly in various sites and their secondary metabolites were used as potential agents in agriculture, notably plant growth promoting and bio-control. The objective of this study was to develop the culture conditions of GH1-13 strain including higher cell growth, stable endospore-forming and enhancement of potential agents which are related with plant growth promoting and phytopathogen suppression. The optimal carbon and nitrogen sources were determined by glucose and soy bean flour, respectively, then resulted in $7.5{\times}10^9cells/mL$, $6.8{\times}10^9\;endospore\;cells/mL$ and sporulation yield of 90% after 30 h cultivation in 500 L submerged fermenter at $37^{\circ}C$, pH 7.0. Cells and cell-free supernatant of GH1-13 strains showed the potent antifungal activity against phytopathogenic fungi of Colletotrichum gloeosporioides. It was also confirmed that indole-3-acetic acid (IAA) production of GH1-13 strain was greatly increased by addition of 0.3% tryptophan.
Fungicidal activities against phytopathogenic fungi of diarylthiazole compound of 4-[5-(2-cyclopropylaminopyrimidin-4-yl)-4-(4-fluorophenyl)thiazol-5-yl]-1-methylpiperidine (I) have been determined to be excellent and compound I was used as the leading compounds in this study. Furthermore, the compound was synthesized by reacting them with five functional groups, 4-fluoro-3-methylphenyl, 4-fluoro-3-chlorophenyl, 4-chloro-2-fluorophenyl, 4-bromo-3-methylphenyl and 2,4-dichlorophenyl groups instead of 4-fluorophenyl group. Also, 2-amino-, 2-(N-ethoxycarbonyl)piperidin-4-yl-, and 2-piperidin-4-yl-thiazole were introduced as the leads instead of 2-N-methylpiperidine-4-yl-thiazol of compound I. VIII-1~VIII-5 and XIII-1~XV-5 compounds were newly synthesized and their structures were confirmed by $^1H$-NMR-spectrum. The fungicidal activities of all the synthesized compounds against Phytophthora capsici were examined using the whole plant method. Among the VIII-1~VIII-5 and XIII-1~XV-5 chemicals, XIV-3 showed the most potent antifungal activity in vivo. While the $EC_{50}$ and $EC_{90}$ values of the commercial fungicide dimethomorph and I were $4.26{\pm}0.02$, $14.72{\pm}0.05$ and $1.01{\pm}0.11$, $6.31{\pm}0.09mM$, those of 4-[5-(2-cyclopropylaminopyrimidin-4-yl)-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)thiazol-5-yl]-1-methylpiperidine (XIV-3) was $0.98{\pm}0.21$ and $5.85{\pm}0.05mM$. Therefore, XIV-3 can be considered as a viable candidate for the control of plant diseases caused by P. capsici, and further studies will be conducted on the mode of action XIV-3.
Three species of Fusarium, F. fujikuroi, F. verticillioides and F. proliferatum, are known to be associated with bakanae disease of rice [1, 2]. F. fujikuroi infects rice flowers and survive in endosperm and embryo of the seeds. Infected seed is an important source of primary inoculum of pathogens [3]. Seeds of rice (Oryza sativa cv. Boramchan) collected from bakanae-infected field were found to be 96% infected with Fusarium sp., 52% with F. fujikuroi, 42% with F. verticillioides, and 12% with F. proliferatum as determined by incubation method and species-specific PCR assays. F. fujikuroi was detected at lemma/palea, endosperm and embryo whereas F. verticillioides and F. proliferatum were recovered only from lemma/palea by means of component plating test. Seed disinfection methods have been developed to control bakanae disease and prochloraz has been most widely used for rice seeds. Two chemicals formulated with prochloraz (PC 1) and prochloraz + hexaconazole (PC 2) that inhibit biosynthesis of ergosterol strongly reduced the incidence of Fusarium spp. on selective media to 4.7% and 2.0%, respectively. Disease symptoms of rice seedlings in nursery soil were alleviated by chemical treatment; seedlings with elongated leaves or wide angle between leaf and stem were strikingly reduced from 15.6 to 3.2% (PC 1) and 0 (PC 2), stem rots were reduced from 56.9 to 26.2% (PC 1) and 32.1% (PC 2), and normal seedling increased from 0.4 to 13.3% (PC 2). Prochloraz has some disadvantages and risks such as the occurrence of tolerant pathogens [4] and effects on the sterol synthesis in animals and humans [5]. For these reasons, it is necessary to develop new disinfection method that do not induce fungal tolerance and are safe to humans and animals. Chlorine dioxide ($ClO_2$), that is less toxic, produces no harmful byproducts, and has high oxidizing power, has been reported to be effective at disinfection of several phytopathogenic fungi including Colletotrichum spp. and Alternaria spp. [6]. Gaseous $ClO_2$ applied to rice seeds at a concentration of 20 ppm strongly suppressed mycelial growth of Fusarium fujikuroi, F. verticillioides and F. proliferatum. The incidence of Fusarium spp. in dry seed with 8.7% seed moisture content (SMC) tended to decrease as the concentration of $ClO_2$ increased from 20 to 40 ppm. Applying 40 ppm $ClO_2$ at 90% relative humidity, incidence was reduced to 5.3% and resulted in significant reduction of disease symptoms on MS media. In nursery soil, stem rot was reduced from 56.9 to 15.4% and the number of normal seedlings increased from 0.4 to 25.5%. With water-soaked seeds (33.1% SMC) holding moisture in the endosperm and embryo, the effectiveness of disinfection using $ClO_2$ increased, even when treated with only 20 ppm for four hours. This suggests that moisture was a key element for action of $ClO_2$. Removal of the palea and lemma from seeds significantly decreased the incidence of Fusarium spp. to 3.0%. Seed germination appeared to decrease slightly by water-soaking at $30^{\circ}C$ because of increased SMC and by physical damage of embryos from hulling. These results indicate that the use of gaseous $ClO_2$ was effective as a means to disinfect rice seeds infected with Fusarium spp. and that moisture around the pathogens in the seed was an important factor for the action of $ClO_2$. Further investigations should be conducted to ascertain the best conditions for complete disinfection of Fusarium spp. that infect deep site of rice seeds.
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