• 제목/요약/키워드: Physiological groups of bacteria

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Effects of Antibiotics on the Uterine Microbial Community of Mice

  • Sang-Gyu Kim;Dae-Wi Kim;Hoon Jang
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제26권4호
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    • pp.145-153
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    • 2022
  • The gut microbiota is involved in the maintenance of physiological homeostasis and is now recognized as a regulator of many diseases. Although germ-free mouse models are the standard for microbiome studies, mice with antibiotic-induced sterile intestines are often chosen as a fast and inexpensive alternative. Pathophysiological changes in the gut microbiome have been demonstrated, but there are no reports so far on how such alterations affect the bacterial composition of the uterus. Here we examined changes in uterine microbiota as a result of gut microbiome disruption in an antibiotics-based sterile-uterus mouse model. Sterility was induced in 6-week-old female mice by administration of a combination of antibiotics, and amplicons of a bacteria marker gene (16S rRNA) were sequenced to decipher bacterial community structures in the uterus. At the phylum-level, Proteobacteria, Firmicutes, and Actinobacteria were found to be dominant, while Ralstonia, Escherichia, and Prauserella were the major genera. Quantitative comparisons of the microbial contents of an antibiotic-fed and a control group revealed that the treatment resulted in the reduction of bacterial population density. Although there was no significant difference in bacterial community structures between the two animal groups, β-diversity analysis showed a converged profile of uterus microbiotain the germ-free model. These findings suggest that the induction of sterility does not result in changes in the levels of specific taxa but in a reduction of individual variations in the mouse uterus microbiota, accompanied by a decrease in overall bacterial population density.

오이 시설재배에서 키토산 처리가 토양 미생물상에 미치는 효과 (Effect of Chitosan on Microbial Community in Soils Planted with Cucumber under Protected Cultivation)

  • 박기춘;장태현
    • 원예과학기술지
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    • 제30권3호
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    • pp.261-269
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    • 2012
  • 오이시설하우스 토양에 키토산의 분말과 액상을 처리하여 90일, 160일 및 200일이 경과한 후에 인지질지방산을 추출하여 토양 미생물상 구성 및 토양 미생물의 생리적 지표를 분석하였다. 확인된 총지방산을 주요인 분석으로 분석한 결과 키토산 처리 후 90일에 키토산 분말 처리구는 PC(주요인)1 대하여 키토산을 처리하지 않은 대조구와 완전히 구분되었고, 키토산 용액 처리구는 PC2 모두에 대하여 대조구와 뚜렷이 구분되었다. 키토산 분말 처리 후 160일에 대조구와 비교하여 키토산 분말 처리구는 PC2에 대하여 완전히 구분되었지만 키토산 용액 처리구는 PC1과 PC2 모두에 대하여 뚜렷이 구분되지 못하였다. 키토산 처리 후 200일에는 PC1과 PC2 모두에 대하여 처리 간 차이가 없었다. 지표 지방산을 이용한 미생물군과 생리적 지표의 차이를 보면, 키토산을 토양에 처리한 후 90일에는 토양미생물군에 미치는 효과가 나타나지 않았지만, 곰팡이/세균 비율은 키토산 용액 처리구에서 유의성 있게 증가하였다. 키토산 처리 후 160일은 균근이 키토산 분말 처리구에서 증가하였다. 세균은 그램 음성균/그램 양성균 비율이 키토산 용액 처리구에서 증가하였고, cyclo-지방산/전구체 비율은 대조구가 키토산 분말 처리구보다 높았다. 곰팡이/세균 비율은 키토산 처리구 모두가 통계적으로 유의성 있게 높았다. 키토산 처리 후 200일 조사에서 호기성균/혐기성균 세균의 비율이 키토산 분말 처리구가 키토산 용액 처리구보다 높았고, 포화지방산/불포화지방산 비율은 키토산 용액 처리구가 키토산 분말 처리구보다 통계적으로 유의성 있게 높았다. 키토산은 처리 후 160일까지 토양 미생물상을 변화시켰으며 분말에서 효과가 컸다. 미생물 생리적 지표에 미치는 키토산의 영향은 처리 160일 이후에 나타나기 시작하여 200일까지 나타났다.

Soil salinity shifts the community structure and diversity of seed bacterial endophytes of salt-sensitive and tolerant rice cultivars

  • Walitang, Denver I.;Ahmed, Shamim;Jeon, Sunyoung;Pyo, Chaeeun;Sa, Tongmin
    • 한국작물학회:학술대회논문집
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    • 한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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    • pp.244-244
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    • 2017
  • Soil salinity due to accumulation of salts particularly sodium chloride affects agricultural lands and their vegetation. Generally, rice is a moderately sensitive plant with some cultivars with varying tolerance to salinity. Though there are physiological differences between salt-sensitive and salt-tolerant rice cultivars, both are still affected especially during high salinity and prolonged exposure. This also ultimately affects their indigenous bacterial endophytes particularly those that inhabit the rice seed endosphere. This study investigates the dynamic structure of seed bacterial endophytes of salt-sensitive and tolerant rice cultivars grown in different levels of soil salinity. Endophytic bacterial diversity was studied Terminal-Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP) analysis. Results revealed a very interesting pattern of diversity and shifts in community structure of bacterial endophytes in the rice seeds. There is a general decrease in diversity for the salt-sensitive rice cultivar, IR29 as soil salinity increases. For the salt-tolerant cultivars, IC32 and IC37, diversity interestingly increased at moderate salinity then decreased at high soil salinity. The patterns of community structure is also strikingly different for the salt-sensitive and salt-tolerant rice cultivars. IR29 has a more even distribution of abundance, but under soil salinity, the community shifted where Curtobacterium, Pantoea, Flavobacterium and Microbacterium become the more dominant bacterial communities. For IC32 and IC37, the dominant bacterial groups under normal stress conditions were also the dominant bacterial groups during salt stress conditions. Their seed bacterial community is dominated by endophytes belonging to Microbacterium, Flavobacterium, Pantoea, Kosakonia and Enterobacter. Stenotrophomonas and Xanthomonas have not changed in terms of abundance under different salinity stress level in the salt-sensitive and salt-tolerant rice cultivars. This study showed that soil salinity greatly influenced the seed bacterial communities of rice seeds irrespective of their physiological tolerance to salinity.

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대산인근 해역에서 간만조에 따른 종속영양세균의 일일 분포와 세포외 효소 활성력의 변화 (Diurnal Fluctuations of Saprophytic Bacterial distribution and Their Extracellular Enzyme Activities in the Overlying Waters of Sediment of the Yellow Sea near Daesan, Korea)

  • Lee, Geon-Hyoung;Gang-Guk Choi;Chun-Bong Baek
    • The Korean Journal of Ecology
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    • 제18권3호
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    • pp.409-418
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    • 1995
  • As a part of studying the function and structure of the mudflat environment of the Yellow Sea, seawater samples in the overlying waters of sediment near Daesan were collected every hour on March 29 (spring tides) and on April 5 (neap tides), 1995 to study the diurnal distribution of aerobic saprophytic bacteria and their extracellular enzyme activities. The diurnal distribution of aerobic saprophytic bacteria ranged from 1.0 X $10^{2}$ to 7.07 X $10^{3}$ cfu /ml at spring tides and from 1.0 X $10^{2}$ to 8.3 X $10^{3}$ cfu /ml at neap tides. The diurnal variations of aerobic saprophytes at the suface waters were greater than those of middle and bottom waters. However, th diurnal fluctuation of saprophyte numbers at spring tides showed no significant difference compared with that at neap tides. The numbers of three physiological groups of aerobic hacteria (proteolytic, lipolytic and amylolytic bacteria) at the surface waters during spring and neap tides were lower than those at the middles and bottom waters. The diurnal variations of five extracellular enzyme activities at the surface waters during the survey period showed lower values than those at the middle and botton waters. Among the measured extracellular enzyme activities, phosphatase showed the highest. However, the activities of amylase, chitinase and cellulase showed a similar tendency.

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우량질소고정균(優良窒素固定菌)의 탐색분리(探索分離) 및 생리적(生理的) 특성(特性) (Isolation and Physiological Characteristics of Rhizobia with Good Nitrogen Fixation Ability)

  • 박우철;이광희;김진호;이인구;조진기
    • Current Research on Agriculture and Life Sciences
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    • 제5권
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    • pp.40-51
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    • 1987
  • 광교(光敎)를 비롯한 12개품종(個品種)의 대두근류(大豆根瘤)로부터 탐색분리(探索分離)한 질소고정균(窒素固定菌)의 생리적(生理的) 특성(特性) 및 숙주작물(宿主作物)과의 접종친화성(接種親和性)을 조사(調査)한 결과(結果)는 다음과 같다. 1. YMA배지(培地)에서 자란 질소고정균(窒素固定菌)의 색상(色相)은 백색상(白色相), 반투명색상(半透明色相), 투명색상(透明色相)이 각각(各各) 60%, 30%, 10%였으며 Litmus milk 반응(反應)은 alkali, acid serum, alkali serum, acid가 각각(各各) 51%, 29%, 9%, 11%로 나타났다. 2. 우량질소고정균(優良窒素固定菌)의 YM배지(培地)에서의 생육속도(生育速度) 및 pH의 변화(變化)는 S 022, S 096이 생육속도(生育速度)가 느리고, alkali를 생성(生成)하였으며 S 080, S 090, S 118은생육속도(生育速度)가 빠르고 산(酸)을 생성(生成)하였다. 3. YM배지(培地)의 초기(初期) pH가 6.0~7.0의 범위(範圍)에서 Rhizobia의 생육(生育)이 가장 좋았다. 4. 질소원(窒素源)으로서 glutamine, asparagine, allantion 등(等)은 Rhizobia의 생육(生育)을 촉진(促進)시켰다. 5. 분리(分離)한 균주(菌株) 전부(全部)가 대두(大豆)에 근류(根瘤)를 형성(形成)시켰으며, 우량질소고정균주(優良窒素固定菌株)는 그중 색상(色相)이 백색(白色)이고 colony가 소형(小型)이며 질산환원력(窒酸還元力)이 있고 아질산환원력(亞窒酸還元力)이 없으나 비교적(比較的) 높은 질소고정력(窒素固定力)을 나타냈다. 6. 동일균주(同一菌株)라도 숙주작물(宿主作物)의 친화성(親和性)에 따라서 질소고정능력(窒素固定能力)에 차이(差異)가 있었으며, 질소고정능력(窒素固定能力)이 없는 무효근류(無效根瘤)를 형성(形成)하는 균주(菌株)도 있었다.

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Carvacrol과 thymol을 병행처리한 키토산 코팅이 냉장저장 시 흰다리 새우의 미생물 및 품질 특성에 미치는 효과 (The Effect of Chitosan Coating Combined with Carvacrol and Thymol on Microbial and Quality Characteristics of Litopenaeus vannamei during Cold Storage)

  • 고봉수;박미정;곽승해;오세욱
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제32권5호
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    • pp.363-370
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    • 2017
  • 본 실험에서는 냉동 새우(Litopenaeus vannamei)를 $4^{\circ}C$에서 12일동안 저온 저장하며, 키토산 코팅과 천연보존제의 병행처리(0.05% carvacrol, 0.05% thymol)가 미생물(중온균, 저온균, Pseudomonas spp., $H_2S$ 생성균)의 성장과 새우의 이화학적 특징(총 휘발성 질소화합물, pH) 및 관능적 품질(외관, 냄새, 전반적 수용도)에 미치는 영향을 살펴보았다. 키토산 코팅과 carvacrol 병행 처리, 키토산 코팅과 thymol 병행 처리는 모든 대상 미생물의 성장을 억제하였고 특히 중온균, 저온균, $H_2S$ 생성균의 경우 실험의 마지막 날인 12일째까지 유의적인 항균효과(p < 0.05)를 보였다. 이 처리구들은 총 휘발성 질소화합물과 관능적 특성(외관, 냄새, 전반적 수용도)에서도 12일째까지 유의적인 차이(p < 0.05)를 보였으나 pH에서는 유의적 차이가 없었다. 따라서 키토산 코팅과 carvacrol 병행 처리, 키토산 코팅과 thymol 병행 처리는 새우의 주요 부패 미생물의 성장을 효과적으로 억제하는 것으로 보이며 냉장 새우의 유통기간 연장에 활용할 수 있을 것으로 보여진다.

$\pi$-Water 처리를 통한 닭고기의 신선도 유지 효과 (A Effect on the Maintenance of Chicken Freshness through $\pi$-Water Treatment)

  • 김윤태
    • 한국조리학회지
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    • 제8권2호
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    • pp.197-206
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    • 2002
  • 생체수 파이-워터($\pi$-water)가 닭고기의 신선도 유지에 어떠한 영향을 미치는가에 대한 기초자료를 얻기 위하여 파이-워터의 희석농도를 달리 하여 닭고기육에 인젝션한 후 닭고기 신선도의 판정지표와 관련한 이화학적 성질이 보관기간이 경과함에 따라 어떻게 변하는지에 대하여 실험한 결과를 다음과 같이 요약한다. 1. 닭고기의 지방산패정도(TBA-Value)는 Control군의 경우 보관기간 3일 경과 시점부터 경시적인 변화를 보이며 불쾌한 냄새 등으로 인하여 제품으로서의 가치를 상실하였으며 20% 희석군과 5% 희석군의 경우 보관기간 5일 경과 시점부터 경시적인 변화를 보이기 시작하였으며 7일 경과 시점까지는 제품에 이상이 없었다. 2. 닭고기의 pH는 도계직후 평균 pH가 5.50수준이나 본 실험을 위한 원료육의 pH는 8.0으로 높게 나타나고 있다. 이는 원료육에 주입한 염지액(pH : 8.38)의 영향으로 인한 것이며 보관기간의 경과에 따른 pH의 경시적 변화현상은 볼 수 없었다. 장시간 보관에 따른 닭고기의 신선도 판정지표로써 pH 변화 측정은 적당하지 않은 것으로 판단된다. 3. 닭고기의 일반세균수 변화는 Control군의 경우 1일 경과 시점부터 일반 균수가 증가하기 시작 보관기간 3일 경과 시점부터 급격하게 증가하였으며 20% 희석군과 5%희석군의 경우 4일 경과 시점까지는 크게 증가하지 않았으나 보관 5일경과 이후부터 일반 세균수가 급격하게 증가하였다. 4. 관능검사는 닭고기의 육색과 냄새를 평가하였으며 육색은 Control군의 경우3일경과 시점부터 품질의 변화를 보이기 시작하여 5일 경과 시점에는 녹변 현상을 보였고 냄새는 3일 경과시점부터 암모니아 냄새와 같은 불쾌취를 발생 초기 부패과정에 있다는 것을 알 수 있다. 20%희석군의 경우 육색은 7일 경과 시점, 냄새는 5일 경과 시점부터 초기부패과정을 보였으며 5%희석군의 경우 육색은 10일 경과 시점, 냄새는 7일 경과시점부터 초기 부패과정을 보였다. 이상의 결과에서 보는 바와 같이 생체수 파이-워터는 닭고기의 신선도 유지와 관련하여 지방산패를 억제하고 일반세균의 증식을 막아줌으로써 제품의 신선도를 연장시킬 수 있으며 희석농도의 차이에 따른 유의차가 있음을 알 수 있었다.

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국산 한약재 추출물을 이용한 전통 콩된장의 생리활성 (Physiological Properties of Extracts of Traditional Soybean Doenjang Prepared with Korean Herb Medicines)

  • 박석규;정회정;김홍출;이상원
    • 한국식품저장유통학회지
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    • 제13권2호
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    • pp.241-245
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    • 2006
  • 국산 한약계 추출물을 첨가하여 제조한 전통 콩된장의 아질산염 소거작용, 수소공여능, 항균활성 및 혈전용해능 등을 검토하였다. 한약재 추출물을 첨가하여 제조한 된장은 대조구 된장에 비하여 대부분이 높은 아질산염 소거능을 나타내었다. 한약재 추출물 첨가 농도가 높을수록 아질산염 소거능은 증가되었으며, III군과 IV군의 된장이 다른 I군과 II군의 된장보다 약간 높은 아질산염 소거능을 나타내었다. 수소공여능은 한약재 추출물 첨가 된장이 대조구 된장보다 약간 높은 경향을 나타내었으나 각 된장군 사이에는 큰 차이가 나타나지 않았다. 된장의 추출물을 사용하여 Str. mutans 및 Sal. enteritidis 등의 병원성 미생물에 대한 항균활성 및 fibrin배지 상에서의 혈전용해능은 대조구보다 모든 시험구에서 높게 나타났다. 이상의 결과로 한약재 추출물을 첨가하여 제조한 III군과 군은 색깔이 대조구와 유사하고, 기호도, 생리활성 및 항균활성 등이 우수하여 기능성이 강화된 새로운 전통된장의 개발 가능성이 높은 것으로 판단된다.

수동천에서의 종속영양세균 군집에 대한 수리학적 분석 (Numerical Analysis of Heterotrophic Bacterial Community in the Sudong Stream)

  • 최성찬;김상종
    • 미생물학회지
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    • 제25권4호
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    • pp.318-327
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    • 1987
  • 북한강의 지류인 수동천 수층에서 세균 군집의 구성 맺 다양성을 통계학적으로 조사하였다. 4계절에 걸쳐 분리된 282개의1 균주를 계통분류한 결파, 진 정점에서 FLavob$\alpha$cten$\mu$m, Aero,pmas와 Enterobacterianae가 50% 이상으후 주종을 이루었다. 각 쟁점별로 분리된 세균들은 수리학적 분석을 행하여 각가 다른 형태학적, 생화학적 및 생리학적 특정을 나타내는 15-28개 집단으로 분류되어다. 각각의 수리학적 세균 집만은 계통분류에 의한 세균 집단(속병)들과 반드시 일치하지는 않았으며, 특히 독특한 당 분해능을 지닌 균주들은 수리학직 분석에 의하면 각각의 균주가 옥딩된 씌침-집만을 이음으로써 인관적인 관년상을 보이지 않았다. 80%의 유사도 수준에서 나위어진 각각의 집단을 하나의 종으로 하여 세균 다양성 지표(dlversity mdex:H)를 구한 결과, 2.37-3.149의 범위로 계산되어 조사 대상 지역은 밴영양-중영영 상태의 다양성을 갖는 세균 군집이 존재함이 밝혀졌다. 유기물질이나 세균 집단의 대량 유입 영향을 직접 받는 정선에서 세균 군집의 다양성 지표가 가장 높았으며 이러한 유입 현상이 전 수동천 생태계에서의 세균균집의 분포에 가장중요한 요인으로 작용함이 관찰되었다.

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The Use of Fermented Soybean Meals during Early Phase Affects Subsequent Growth and Physiological Response in Broiler Chicks

  • Kim, S.K.;Kim, T.H.;Lee, S.K.;Chang, K.H.;Cho, S.J.;Lee, K.W.;An, B.K.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제29권9호
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    • pp.1287-1293
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    • 2016
  • The objectives of this experiment was to evaluate the subsequent growth and organ weights, blood profiles and cecal microbiota of broiler chicks fed pre-starter diets containing fermented soybean meal products during early phase. A total of nine hundred 1-d-old chicks were randomly assigned into six groups with six replicates of 25 chicks each. The chicks were fed control pre-starter diet with dehulled soybean meal (SBM) or one of five experimental diets containing fermented SBM products (Bacillus fermented SBM [BF-SBM], yeast by product and Bacillus fermented SBM [YBF-SBM]; Lactobacillus fermented SBM 1 [LF-SBM 1]; Lactobacillus fermented SBM 2 [LF-SBM 2]) or soy protein concentrate (SPC) for 7 d after hatching, followed by 4 wk feeding of commercial diets without fermented SBMs or SPC. The fermented SBMs and SPC were substituted at the expense of dehulled SBM at 3% level on fresh weight basis. The body weight (BW) during the starter period was not affected by dietary treatments, but BW at 14 d onwards was significantly higher (p<0.05) in chicks that had been fed BF-SBM and YBF-SBM during the early phase compared with the control group. The feed intake during grower and finisher phases was not affected (p>0.05) by dietary treatments. During total rearing period, the daily weight gains in six groups were 52.0 (control), 57.7 (BF-SBM), 58.5 (YBF-SBM), 52.0 (LF-SBM 1), 56.7 (LF-SBM 2), and 53.3 g/d (SPC), respectively. The daily weight gain in chicks fed diet containing BF-SBM, YBF-SBM, and LF-SBM 2 were significantly higher values (p<0.001) than that of the control group. Chicks fed BF-SBM, YBF-SBM, and LF-SBM 2 had significantly lower (p<0.01) feed conversion ratio compared with the control group. There were no significant differences in the relative weight of various organs and blood profiles among groups. Cecal microbiota was altered by dietary treatments. At 35 d, chicks fed on the pre-starter diets containing BF-SBM and YBF-SBM had significantly increased (p<0.001) lactic acid bacteria, but lowered Coli-form bacteria in cecal contents compared with those fed the control diet. The number of Bacillus spp. was higher (p<0.001) in all groups except for LF-SBM 1 compared with control diet-fed chicks. At 7 d, jejunal villi were significantly lengthened (p<0.001) in chicks fed the fermented SBMs vs control diet. Collectively, the results indicate that feeding of fermented SBMs during early phase are beneficial to the subsequent growth performance in broiler chicks. BF-SBM and YBF-SBM showed superior overall growth performance as compared with unfermented SBM and SPC.