Lignin-peroxidase (LiP) has been considered as one of the most important industrial enzymes for biodegradation of various recalcitrant toxic compounds such as chlorinated aromatic hydrocarbons and azo-dyes. Recently, several soil actinomycetes have been reported to secrete a functionally-similar lignin-peroxidase called actinomycetes lig-nin-peroxidase (ALiP). In this manuscript, we isolated over 100 morphologically distinct actinomycetes from the contaminated soils around 10 different gas stations located nearby the Kyung-An river. Among these actinomycetes screened based on the congo-red dye-decolorization activities, one newly-isolated actinomycetes named SMA-2 showed the most significant dye-decoloring activity on the congo-red plate as well as a significant ALiP activity in a yeast-extract-malt-extract liquid media supplemented with starch. The optimum SMA-2 culture condition fur ALiP production was determined and the kinetic parameters fur the SMA-2 AkIP activity were characterized. The optimally-cultured SMA-2 also exhibited the oxidation activities toward various recalcitrant aromatic compounds including phenol, 2- chlorophenol, 4- chlorophenol, 2,4- dichlorophenol ,2,6- dichlorophenol, and 2,4, f-trichlorophe - not, suggesting a potential application of SMA-2 for contaminated soil bioremediation.
In order to decrease level of an organophosphorus fungicide, tolclofos-methyl, from in situ ginseng cultivating soil, we isolated a tolclofos-methyl degrading bacteria from ginseng cultivating soil samples. The bacterial strain removed tolclofos-methyl around 95% after 3 days incubation with complete liquid media. The strain was identified as Sphingomonas sp. by 16S rDNA sequence comparison, and designated as Sphingomonas sp. 224. Through the GC-MS analysis, Sphingomonas sp. 224 was proposed to have an initiative degradation pathway generating the metabolite such as 2,6-dichloro-4-methyl phenol compound from tolclofos-methyl. In addition, Sphingomonas sp. 224 was confirmed representing the effective degrading capability to tolclofosmethyl in situ soil.
The heavy use of petroleum products in modern livings has brought ubiquitous environmental contaminants of aromatic compounds, which persist in aquatic and geo-environment without the substantial degradation. The persistence and accumulation of the aromatic compounds, which include xylene, phenol, toluene, phthalate, and so on are known to cause serious problems in our environments. Some of soil and aquatic microorganisms facilitate their growth by degrading aromatic compounds and utilizing degrading products as growth substrates, the biodegradation helps the reentry of carbons of aromatic compounds, preventing their accumulation in our environments. The metabolic studies on the degradation of aromatic compounds by microoganisms were extensively carried out along with their genetic studies. A Rhodococcus sp. EL-GT isolated in activated sludges has shown the excellent ability to grow on phenol as a sole carbon source. In the present study investigated a gene encoding phenol-degrading enzymes from a Rhodococcus sp. EL-GT.
The present study was conducted to investigate biological degradability of phosphamidon and profenfos. In the biodegradation test of two pesticides by the modified river die-away method from May 20 to July 29, 1999, the biodegradation rate was determined in Nakdong (A) and Kumho(B) River. The residual percentages of phosphamidon were 74.9%, 68.8% and 62.7% in control, A and B samples 7 days after applicaton, respectively. Biodegradation constants and half-lives of phosphamidon were 25.1%, 21.9% and 11.9% in control, A and B samples 7 days after application. Biodegradation constants and half-lives of profenofos were 0.0005 and 58.4 days in A, 0.0013 and 21.6 days in B, respectively. The biodegradation rates of phosphamidon and profenofos were higher in the Kumho River (B) than in the Nackdong River(A). The strains of microorganisms for the degradation of phosphamidon and profenofos were identified as Klebsiella pneumoniae, Aeromonas hydrophila and Acinetobacter calcoaceticus, all Gram-negative bacteria. In order to identify biodegradate products, the extracts of cultivates were analyzed by GC/MS. The mass spectra of biodegradate roducts of phosphamidon were at m/z 153 and 149, those of the profenofos were at m/z 208 and 240, respectively. It was suggested that the biodegradate metabolites of phosphamidon were O, O-dimethyl phosphate(DMP) and N, N-diethylchloroacetamide, those of profenofos were 4-bromo-2-chlorophenol and O-ethyl-S-propyl phosphate.
This paper reported the use of real-time polymerase chain reaction (PCR), denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), and the culture-based method in the intrinsic bioremediation study at a petroleum contaminated site. The study showed that phenol hydroxylase gene was detected in groundwater contaminated with benzene, toluene, ethylbenzene, xylene isomers (BTEX) and methyl tert-butyl ether (MTBE). This indicated that intrinsic bioremediation occurred at the site. DGGE analyses revealed that the petroleum-hydrocarbon plume caused the variation in microbial communities. MTBE degraders including Pseudomonas sp. NKNU01, Bacillus sp. NKNU01, Klebsiella sp. NKNU01, Enterobacter sp. NKNU01, and Enterobacter sp. NKNU02 were isolated from the contaminated groundwater using the cultured-based method. Among these five strains, Enterobacter sp. NKNU02 is the most effective stain at degrading MTBE without the addition of pentane. The MTBE biodegradation experiment indicated that the isolated bacteria were affected by propane. Biodegradation of MTBE was decreased but not totally inhibited in the mixtures of BTEX. Enterobacter sp. NKNU02 degraded about 60% of MTBE in the bioreactor study. Tert-butyl alcohol (TBA), acetic acid, 2-propanol, and propenoic acid were detected using gas chromatography/mass spectrometry during MTBE degraded by the rest cells of Enterobacter sp. NKNU02. The effectiveness of bioremediation of MTBE was assessed for potential field-scale application.
Activated carbon is widely used for the treatment of water, wastewater and other liquid wastes. Biological activated carbon (BAC) process is water and wastewater treatment process developed in the 1970's. In addition to activated carbon adsorption, biodegradation organic pollutants occurs in the BAC bed where a large amount of aerobic biomass grows. This results in a long operation time of the carbon before having to be regenerated and thus a low treatment cost. Although the BAC process has been widely used, its mechanisms have not been well understood, especially the relationship between biodegradation and carbon adsorption, whether these two reactions can promote each other or whether they just simultaneously exist in the BAC bed. Also, the phenomenon of bioregeneration has been confused that previously occupied adsorption sites appear to be made available through the actions of microorganisms. And that, because biological process is influenced by low temperature, the mechanism of the BAC process is also effected by temperature variation in our country of winter temperature near the freezing point. Therefore, the objective of this study examines closely the mechanism of the BAC process by temperature variation using phenol as substrate. From this study, biological activated carbon is good substrate removal better than non adsorbing materials (charcoal, sand) as temperature variation, especially low temperature(near $5^{\circ}C$).
Park, Yeong-Soon;Lee, Geon;Lee, Sang-Joon;Lee, Jong-Kun
Journal of Environmental Science International
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v.3
no.3
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pp.197-207
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1994
Microorganisms capable of utilizing 2,4,5-trichlorophenoxyacetic acid(2,4,5-T) as sole carbon source were isolated from soil by enrichment culture. Among these strains, EL-O7IP had the highest biodegradability of 2,4,5-7, and according to its morphological and physiological characteristics, it was identified as Pseudomonas sp. This strain was resistant to rifampicin, streptomycin, ampicillin, kanamycin and such metal ions as $Zn^{2+}$, $Cu^{2+}$ Various compounds of chlorinated phenol and substrate analogs were more easily utilized than 2,4,5-7, but biodegradation rate for each compound was different. The strain easily utilized the compounds of chlorinated substituents on phenol in the order of ortho-, para-, and meta- position. The biodegradability of this strain was very stable. Key words : 2,4,5- trichlorophenoxyacetic acid, Pseudomonas sp .
Kim, Byung-Hyuk;Oh, Eun-Taex;Ahn, Yeong-Hee;Koh, Sung-Cheol
Journal of Microbiology
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v.41
no.4
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pp.349-352
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2003
Recent studies have shown that some of the PCB (polychlorinated biphenyl)-degraders are able to effectively degrade PCB in the presence of monoterpenes, which act as inducers for the degradation pathway. Rhodococcus sp. T104, an effective PCB degrader, has been shown to induce the degradation pathway by utilizing limonenes, cymenes, carvones, and pinenes as sole carbon sources which can be found in the natural environment. Moreover, the strain T104 proved to possess three separate oxidation pathways of limonene, biphenyl, and phenol. Of these three, the limonene can also induce the biphenyl degradation pathway. In this work, we report the presence of three distinct genes for aromatic oxygenase, which are putatively involved in the degradation of aromatic substrates including biphenyl, limonene, and phenol, through PCR amplification and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). The genes were differentially expressed and well induced by limonene, cymene, and plant extract A compared to biphenyl and/or glucose. This indicates that substrate specificity must be taken into account when biodegradation of the target compounds are facilitated by the plant natural substrates.
Journal of Korean Society for Atmospheric Environment
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v.13
no.1
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pp.31-40
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1997
This study was conducted to investigate the biodegradation of gaseous trichloroethylene (TCE) and tetrachloroethylene (PCE) in an activated carbon biofilter inoculated with phenol-oxidizing microorganisms and to study the effect of surfactant concentration below its critical micelle concentration (CMC) on the re-moval efficiency of TCE or PCE. The investigation was conducted using two specially built stainless steel biofilters, one for TCE and the other for PCE, at residence times of 1.5~7 min. The removal efficiency of gaseous TCE was 100% at a residence time of 7 min and its average inlet concentration of 85 ppm. For gaseous PCE, 100% removal efficiency was obtained at residence times of 4~7 min and its average concentrations of 47~84 ppm. It was found that adsorption by GAC was a minor mechanism for TCE and PCE removal in the activated carbon biofilters. Transformation yields of gaseous TCE and PCE were about 8~48 g of TCE/g of phenol and 6~25g of PCE/g of phenol, according to residence times. This values showed one or two orders of magnitude less than aqueous TCE degradation. The TCE and PCE activated carbon biofilter performances were observed to be a little enhanced but not significantly, when the surfactant was introduced at concentrations of 5~50 mg/L.
Park, Geun-Tae;Cha, Mi-Sun;Nam, Gui-Sook;Cho, Sun-Ja;Son, Hong-Joo;Lee, Geon;Lee, Sang-Joon
Journal of Environmental Science International
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v.11
no.9
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pp.971-977
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2002
The isolated strain, Rhodococcus sp. EL-GT was able to degrade high phenol concentrations up to 10 mM within 24 hours in the medium consisting of 5.3 mM $KH_2PO_4$. 95 mM $Na_2HPO_4$, 18mM $NH_4NO_3$, 1 mM $MgSO_4{\cdot}7H_2O$,\;50{\mu}M CaCl_2$,\;0.5 {\mu}M FeCl_3$, initial pH 8.0, temperature $30^{\circ}C$ in rotary shaker at 200 rpm. This strain was good cell growth and phenol degradation in the alkaline pH range range, and the highest in the pH range of 7 to 9. The microorganism was able to grow at the various chlorinated phenols, benzene, toluene, and bunker-C oil. As Rhodococcus sp. EL-GT was good capable of attachment on the acryl media, it would be used as microorganism to consist of biofilm in wastewater treatment.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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