Amirah Syafiqah Zamri;Fatin Nabilah Sahadan;Zarirah Zulperi;Fadhil Syukri;Yuzine Esa
Fisheries and Aquatic Sciences
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제27권6호
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pp.366-378
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2024
Application of commercial hormone failed to promote breeding in certain Pangasius species due to the differences of gonadotropin-releasing hormone specific peptide with species-specific bioactivities. Gonadotropin-releasing hormone (GnRH) is a hypothalamic decapeptide in the reproductive system that plays a crucial role in the regulation of reproductive processes. This study was performed to determine and analyse the GnRH genes from commercially important Pangasius sp., Pangasianodon hypophthalmus and Pangasius nasutus. The GnRH1 and GnRH2 genes were amplified and cloned into TOPO vector, followed by phylogenetic analysis of a complete open reading frame (ORF) of GnRH genes. The GnRH1 and GnRH2 genes of P. hypophthalmus and P. nasutus were detected at 300 bp and 360 bp, encoded for 81 and 87 amino acids, respectively. Amino acid sequence identities revealed high homology of P. hypophthalmus and P. nasutus GnRH1 and GnRH2 genes in comparison with other fish and vertebrates. Phylogenetic tree showed that fish from various families were aggregated into a group of the same order due to their highest identity similarities. It revealed that the vertebrate formed clusters and are grouped according to their GnRH decapeptide and GnRH-associated peptide (GAP) region, indicating a close relationship among GnRH decapeptide and GAP in different vertebrate species.
본 연구에서 multiplex PCR과 real-time PCR을 이용하여 창난젓의 원료를 감별할 수 있는 새로운 판별법을 개발하였다. 명태와 가이양의 종 특이 프라이머를 디자인하고, 명태와 가이양의 genomic DNA를 template로 single PCR과 multiplex PCR을 실시하였다. PCR을 실시한 결과, single PCR에서 명태(297 bp)와 가이양(132 bp)에 해당하는 PCR 밴드를 확인하였으며 교차 반응이 일어나지 않는 것을 확인하였다. Multiplex PCR에서 명태와 가이양 사이에 교차반응 없이 증폭이 일어나는 것을 확인하였다. Real-time PCR 결과, 명태 종 판별 프라이머에서 명태의 Ct 평균값은 20.765±0.691, 가이양 시료에서 Ct 평균값은 35.719±1.828이었으며, 가이양 종 판별 프라이머에서 명태 시료의 Ct 평균값은 35.996±1.423, 가이양 시료의 Ct 평균값은 20.096±0.793으로 프라이머의 효율성, 특이성 및 교차 반응성에서 유의한 차이가 나타났다. 이러한 결과를 바탕으로 시중에서 판매되는 7개 제품을 multiplex PCR 및 real-time PCR로 확인하였으며, 모든 시료에서 유효한 결과를 확인하였다. 본 연구에서 제작된 명태와 가이양에 대한 종 특이적 프라이머는 가공된 젓갈 시료의 원료의 판별 가능하며, 이러한 결과는 식품안전관리에 기여할 수 있을 것으로 기대된다.
본 연구는 원주시 내 대형 초밥 뷔페에서 제공되는 초밥, 회 등 26개 수산물 가공품을 대상으로 DNA 바코드를 분석하여 원재료의 종을 동정하였다. DNA 바코드 증폭을 위하여 미토콘드리아의 16S ribosomal RNA 및 cytochrome c oxidase subunit I 유전자 부위를 증폭하는 프라이머 세트를 이용하여 증폭된 PCR 산물의 염기서열을 분석하였다. 확보한 염기서열은 BLAST Search를 이용하여 미국국립보건원 GenBank에 등록되어있는 생물 종의 염기서열과 비교하여 염기서열 유사도와 매칭 점수를 고려하여 최종 종을 동정하였다. 모니터링 결과 분석 제품의 58%는 제품명과 사용된 원재료가 일치하였지만, 27%에서는 불일치가 관찰되었다. 초메기초밥에는 가이양(Pangasianodon hypophthalmus)이 꽃돔회에는 붉평치(Lampris guttatus)가 사용되었으며, 날치알군함 및 청어알무침에는 열빙어(Mallotus villosus) 알이 사용되었음을 확인하였다. 타코와사비군함 및 오징어간장소스에 사용된 원재료는 주꾸미(Amphioctopus fangsiao) 및 남방주꾸미(Amphioctopus membranaceus)로 각각 동정되었다.
Dang Thi Thu Tam;Ly Nguyen Binh;Tran Chi Nhan;Nguyen Bao Loc;Nguyen Nhat Minh Phuong
한국미생물·생명공학회지
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제51권4호
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pp.416-424
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2023
Replacing synthetic additives to preserve food products with natural antimicrobial compounds needs to be considered due to public health. In the present study, the phenolic extract from mango seed kernel (MSK) with the total phenolic content (TPC) value of 5300 ± 380 mg gallic acid equivalent (GAE)/L was used for evaluating the antimicrobial properties against five types of bacterial strains, including Listeria monocytogenes, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, and Salmonella typhimurium in vitro. This extract was also used for in situ method on the storage of Pangasianodon hypophthalmus fish fillets. The minimum inhibitory concentration (MIC) values for all tested strains were determined at an average concentration of 1325 mg GAE/L. Furthermore, the minimum bactericidal concentration (MBC) values of E. coli, S. aureus, and S. typhimurium were seen at 5300 mg GAE/L, while the extract did not show eliminations in the growth of the remaining strains. The bacterial inhibition speed of the extract illustrated that the concentration equal MIC value eliminated S. typhimurium growth after 24 h, the 4 times MIC value had remarkable effects on S. aureus growth after the 9 h of incubation, and 24 h of incubation for E. coli, L. monocytogenes, P. aeruginosa. Additionally, the MSK extract could inhibit the growth of P. aeruginosa on fish fillets in 4 days of storage. These results provide important evidence for the utilization of MSK as a natural source of antimicrobial agents in food products.
The advantages of monounsaturated fatty acids (MUFAs) on insulin resistance and type 2 diabetes mellitus (T2DM) have been well established. However, the molecular mechanisms of the anti-diabetic action of MUFAs remain unclear. This study examined the anti-hyperglycemic effect and explored the molecular mechanisms involved in the actions of fish oil- rich in MUFAs that had been acquired from hybrid catfish (Pangasius larnaudii${\times}$Pangasianodon hypophthalmus) among experimental type 2 diabetic rats. Diabetic rats that were fed with fish oil (500 and 1,000 mg/kg BW) for 12 weeks significantly reduced the fasting plasma glucose levels without increasing the plasma insulin levels. The diminishing levels of plasma lipids and the muscle triglyceride accumulation as well as the plasma leptin levels were identified in T2DM rats, which had been administrated with fish oil. Notably, the plasma adiponectin levels increased among these rats. The fish oil supplementation also improved glucose tolerance, insulin sensitivity and pancreatic histological changes. Moreover, the supplementation of fish oil improved insulin signaling ($p-Akt^{Ser473}$ and p-PKC-${\zeta}/{\lambda}^{Thr410/403}$), $p-AMPK^{Thr172}$ and membrane GLUT4 protein expressions, whereas the protein expressions of pro-inflammatory cytokines (TNF-${\alpha}$ and nuclear NF-${\kappa}B$) as well as p-PKC-${\theta}^{Thr538}$ were down regulated in the skeletal muscle. These data indicate that the effects of fish oil-rich in MUFAs in these T2DM rats were partly due to the attenuation of insulin resistance and an improvement in the adipokine imbalance. The mechanisms of the anti-hyperglycemic effect are involved in the improvement of insulin signaling, AMPK activation, GLUT4 translocation and suppression of pro-inflammatory cytokine protein expressions.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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