• Title/Summary/Keyword: PRC2

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The role of EZH1 and EZH2 in development and cancer

  • Soo Hyun, Lee;Yingying, Li;Hanbyeol, Kim;Seounghyun, Eum;Kyumin, Park;Chul-Hwan, Lee
    • BMB Reports
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    • 제55권12호
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    • pp.595-601
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    • 2022
  • Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) exhibits key roles in mammalian development through its temporospatial repression of gene expression. EZH1 or EZH2 is the catalytic subunit of PRC2 that mediates the mono-, di- and tri-methylation of histone H3 lysine 27 (H3K27me1/2/3), H3K27me2/me3 being a hallmark of facultative heterochromatin. PRC2 is a chromatin-modifying enzyme that is recruited to a limited number of "nucleation sites", spreads H3K27 methylation and fosters chromatin compaction. EZH1 and EZH2 exhibit differences in their expression patterns, levels of histone methyltransferase activity (HMT) in the context of PRC2, and DNA/nucleosome binding activity. This suggests that their roles in heterochromatin formation are disparate. Dysregulation of PRC2 activity leads to aberrant gene expression and is implicated in cancer and developmental diseases. In this review, we discuss the distinct function of PRC2/EZH1 and PRC2/EZH2 in the early and late developmental stages. We then discuss the cancers associated with PRC2/EZH1 and PRC2/EZH2.

Polycomb-Mediated Gene Silencing in Arabidopsis thaliana

  • Kim, Dong-Hwan;Sung, Sibum
    • Molecules and Cells
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    • 제37권12호
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    • pp.841-850
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    • 2014
  • Polycomb group (PcG) proteins are conserved chromatin regulators involved in the control of key developmental programs in eukaryotes. They collectively provide the transcriptional memory unique to each cell identity by maintaining transcriptional states of developmental genes. PcG proteins form multi-protein complexes, known as Polycomb repressive complex 1 (PRC1) and Polycomb repressive complex 2 (PRC2). PRC1 and PRC2 contribute to the stable gene silencing in part through catalyzing covalent histone modifications. Components of PRC1 and PRC2 are well conserved from plants to animals. PcG-mediated gene silencing has been extensively investigated in efforts to understand molecular mechanisms underlying developmental programs in eukaryotes. Here, we describe our current knowledge on PcG-mediated gene repression which dictates developmental programs by dynamic layers of regulatory activities, with an emphasis given to the model plant Arabidopsis thaliana.

M6A reader hnRNPA2/B1 is essential for porcine embryo development via gene expression regulation

  • Kwon, Jeongwoo;Jo, Yu-Jin;Yoon, Seung-Bin;You, Hyeong-ju;Youn, Changsic;Kim, Yejin;Lee, Jiin;Kim, Nam-Hyung;Kim, Ji-Su
    • 한국동물생명공학회지
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    • 제37권2호
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    • pp.121-129
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    • 2022
  • Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2/B1 (hnRNPA2/B1) is an N6-methyladenosine (m6A) RNA modification regulator and a key determinant of prem-RNA processing, mRNA metabolism and transportation in cells. Currently, m6A reader proteins such as hnRNPA2/B1 and YTHDF2 has functional roles in mice embryo. However, the role of hnRNPA2/B1 in porcine embryogenic development are unclear. Here, we investigated the developmental competence and mRNA expression levels in porcine parthenogenetic embryos after hnRNPA2/B1 knock-down. HhnRNPA2/B1 was localized in the nucleus during subsequent embryonic development since zygote stage. After hnRNPA2/B1 knock-down using double stranded RNA injection, blastocyst formation rate decreased than that in the control group. Moreover, hnRNPA2/B1 knock-down embryos show developmental delay after compaction. In blastocyste stage, total cell number was decreased. Interestingly, gene expression patterns revealed that transcription of Pou5f1, Sox2, TRFP2C, Cdx2 and PARD6B decreased without changing the junction protein, ZO1, OCLN, and CDH1. Thus, hnRNPA2/B1 is necessary for porcine early embryo development by regulating gene expression through epigenetic RNA modification.

고조파 스펙트럼 확산효과를 개선한 준 랜덤 주파수 캐리어 변조기법 (Pseudo-Randomized Frequency Carrier Modulation Scheme with Improved Harmonics Spectra Spreading Effects)

  • 김종남;정영국;임영철
    • 조명전기설비학회논문지
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    • 제22권12호
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    • pp.64-70
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    • 2008
  • 종래의 준 랜덤 주파수 캐리어(PRC : Pseudo-Randomized Frequency Carrier) 변조기법을 3상 H-브리지 멀티레벨 인버터(HBML: H-Bridge Multi-Level Inverter)에 적용하는 경우, 스위칭 주파수의 2배 주파수 영역에서 큰 스펙트럼 클러스터가 그대로 존재하는 문제점이 있다. 본 연구에서는 서로 2배의 주파수 비율을 갖는 2개의 고정주파수 삼각파 캐리어와 3단계 멀티플렉서(MUX : Multiplexer)를 이용하여 종래의 PRC기법의 고조파 스펙트럼 확산 효과를 개선하였다. 제안된 기법은 1.5[kw]급 3상 HBML인버터 구동시스템에 적용하였으며, 종전의 방법과 제안된 방법의 전압 및 전류 고조파 스펙트럼을 비교 검토하였다.

DGNSS 위치정확도 향상을 위한 PRC 보정정보 모델링에 관한 연구 (A Study on Pseudo-Range Correction Modeling in order to Improve DGNSS Accuracy)

  • 손동효;박관동
    • 대한공간정보학회지
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    • 제23권4호
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    • pp.43-48
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    • 2015
  • 본 논문은 DGNSS(Differential GNSS) 위치정확도 향상을 위한 PRC(Pseudo-Range Correction) 보정정보 모델링에 관한 연구내용이다. PRC는 DGNSS 기법을 이용하여 측위정확도를 향상시키기 위해 사용되는 보정정보로써 사용자가 통신망을 통해 수신한 뒤 사용된다. 그러나 일시적인 통신두절이나 신호간섭 등으로 인해 위치정확도가 급격히 저하되는 일이 발생한다. 그래서 본 논문에서는 이러한 현상을 방지하기 위해 PRC 보정정보를 다항식 곡선접합 방정식을 이용하여 모델링하고 그 정확도를 평가하였다. 모델링 매개변수를 이용하여 계산한 PRC 추정값과 실제 기준국 수신기에서 생산되는 관측값간의 차이를 계산한 결과 GPS의 경우에는 평균 0.1m, RMSE는 1.3m로 나타났고 대부분의 위성들이 ${\pm}1.0m$ 이내의 편향오차와 3.0m 이내의 RMSE를 보였다. GLONASS의 경우에는 평균 0.2m이고 대부분 ${\pm}2.0m$ 이내에 분포하였다. RMSE는 2.6m로 나타났고 다수의 위성들이 3.0m 이내에 분포하였다. 이런 결과는 모델링을 통해 산출한 추정값이 사용자의 위치정확도를 유지하는데 유효하게 사용될 수 있음을 보였다. 그러나 고도각이 낮은 영역에서 두 값의 차이가 크게 나타나 이에 대한 연구를 추가적으로 수행할 필요성이 있다.

주의력결핍 과잉행동장애에서 한국아동 인성평정척도의 임상적 적용 (Clinical Application of the Korean Personality Rating Scale for Children in Attention-Deficit Hyperactivity Disorder)

  • 윤운;박기정;권국주;김효원
    • Journal of the Korean Academy of Child and Adolescent Psychiatry
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    • 제26권3호
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    • pp.217-225
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    • 2015
  • Objectives : The objective of this study was to compare the Korean Personality Rating Scale for Children (K-PRC) profile between children with attention-deficit hyperactivity disorder (ADHD) and typically developing children. We also aimed to investigate the association of K-PRC and ADHD symptoms. Methods : Ninety-nine youth (age $8.3{\pm}2.4$ years, 72 boys) with ADHD and 84 controls (age $9.2{\pm}2.5$ years, 43 boys) were recruited from the Department of Pediatric Psychiatry of the Asan Medical Center Children's Hospital. Diagnoses of ADHD and comorbid psychiatric disorders were confirmed with the Kiddie-Schedule for Affective Disorders and Schizophrenia-Present and Lifetime Version (K-SADS-PL). The parents of the subjects completed the ADHD rating scale, and K-PRC. Independent t-tests, analysis of covariance, partial correlation analyses, and Mc Nemar test were used for analysis. Results : Children and adolescents with ADHD showed higher K-PRC scores in verbal development, physical development, depression, delinquency, hyperactivity, family dysfunction and psychoticism. Delinquency and hyperactivity were significantly correlated with parent-rated ADHD rating scales and ADHD scores on K-SADS-PL. The hyperactive/impulsive and combined subtypes showed higher scores on hyperactivity and delinquency than the inattentive subtype, and the inattentive subtype showed higher scores on depression and social dysfunction of the K-PRC. Conclusion : Our results suggest that K-PRC could be used to comprehensively evaluate symptoms, combined psychopathologies, developmental delay and family dysfunction of children with ADHD.

3단계 MUX와 2개의 고정주파수 캐리어를 이용한 준 랜덤 주파수 캐리어(PRC) 발생기 (A Pseudo-Random Frequency Carrier(PRC) Generator Using Three Stage MUX and Two Carrier with Fixed Frequency)

  • 김종남;정영국;임영철
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 2005년도 추계학술대회 논문집 전기기기 및 에너지변환시스템부문
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    • pp.162-165
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    • 2005
  • 종전의 준 랜덤 주파수 캐리어(PRC) 발생기는 스위칭 주파수의 2배 주파수에서 매우 큰 스펙트럼 클러스터가 존재하는 문제점이 있었다. 본 연구에서는 상호 2배 관계를 갖는 고정 주파수의 삼각파 캐리어와 3단계 MUX를 이용하여 종전의 PRC방법의 파워 스펙트럼 확산 성능을 개선하였다. 제안된 방법을 3상 캐스케이드 멀티레벨 인버터에 적용하였으며, PSIM시뮬레이션에 의하여 종전의 방법과 제안된 방법의 파워 스펙트럼을 비교 검토하였다.

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NLM Medical Text Indexer를 활용한 우리나라 의학문헌의 MeSH Semi Indexing 방안 (MeSH Semi Indexing of the Korean Biomedical Literature, using NLM Medical Text Indexer)

  • 정소나;이춘실
    • 한국정보관리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보관리학회 2010년도 제17회 학술대회 논문집
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    • pp.21-28
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    • 2010
  • 본 연구에서는 PubMed에 등재되었으나 Medical Subject Headings(MeSH)가 부여되지 않은 국내 의학학술지의 문헌을 대상으로 미국국립의학도서관 (NLM: National Library of Medicine)의 Medical Text Indexer(MTI)를 활용하여 MeSH 용어를 추천받은 후, PubMed 레코드의 유사주제문헌 (Relation Citations, PRC)에 부여된 MeSH와의 일치여부를 분석하였다. 또한 논문의 저자가 부여한 키워드(저자키워드)와 PRC MeSH의 일치여부도 비교하였다. PRC MeSH와 MTI MeSH 추천어의 일치율은 주표목이 21.1%였고, 체크태그는 18.1%, 부표목은 16.5%로 나타났다. 우리나라 의학논문에 나타난 저자키워드의 중요한 특징은 MeSH 주표목 위주이고, 체크태그와 부표목은 거의 사용하지 않는 것이다. 따라서 저자키워드와 PRC MeSH 주표목과의 일치율은 23.4%에 이르지만, 체크태그와 부표목의 일치율은 각각 1%, 2.1%였다. 색인전문가가 통제어휘를 사용하여 색인하는 과정에서 PRC와 MTI의 MeSH 주표목과 저자키워드가 일치하는 용어를 주표목으로 부여하고, PRC와 MTI가 추천하는 체크태그와 부표목을 활용하는 등 국내 의학문헌의 MeSH 용어 부여 작업을 반자동화(semi-indexing)하면, 정확하고 신속한 MeSH 부여 작업이 가능할 것이다.

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느린 페이딩 채널에서 공간-시간 트렐리스 부호의 준최적 복호법 (Suboptimum Decoding for Space-Time Trellis Codes in Slowly Fading Channels)

  • 신상섭;김영주
    • 한국통신학회논문지
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    • 제31권8C호
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    • pp.771-776
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    • 2006
  • 공간-시간 트렐리스 부호에서 기존에 제안된 ML(maximum likelihood) 복호법과 PRC(principal ratio combianing) 복호법을 아우르는 준최적 복호법인 GPRC(generalized PRC) 기법을 제안한다. GPRC는 수신안테나들을 K개의 그룹으로 나누어 각 그룹에 PRC 기법을 적용하는 것이다. GPRC에서는 수신안테나 그룹핑 방법이 여러 가지이므로 K가 정해졌을 때 최적의 그룹핑 규칙을 제안한다. 이때 최종 성능 차이를 간단하게 예측할 수 있는 성능지표(PI, performance index)를 이용할 수 있다. 특히 수신안테나 간 상관(correlation)이 있을 때 무선 채널 계수를 구하고, 성능 지표를 평가한다. 마지막으로 컴퓨터 시뮬레이션으로 이론적 성능을 검증한다.