Park, Gwang Hun;Song, Hun Min;Park, Su Bin;Park, Ji Hye;Shin, Myeong Su;Son, Ho-Jun;Um, Yurry;Jeong, Jin Boo
한국자원식물학회지
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제30권6호
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pp.640-646
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2017
In this study, we elucidated anti-cancer activity and potential molecular mechanism of 70% ethanol extracts from Taxilli Ramulus (Taxillus chinensis (DC.) Danser) (TR-E70) against human colorectal cancer cells. Anti-cell proliferative effect of TR-E70 was evaluated by MTT assay. The effect of TR-E70 on the expression of cyclin D1 in the protein and mRNA level was evaluated by Western blot and RT-PCR, respectively. TR-E70 suppressed the proliferation of human colorectal cancer cell lines, HCT116 and SW480. Although TR-E70 decreased cyclin D1 expression in protein and mRNA level, decreased level of cyclin D1 protein by TR-E70 more dramatically occurred than that of cyclin D1 mRNA. Cyclin D1 downregulation by TR-E70 was attenuated in presence of MG132. In addition, TR-E70 phosphorylated threonine-286 (T286) of cyclin D1. TR-E70-mediated cyclin D1 degradation was blocked in presence of LiCl as an inhibitor $GSK3{\beta}$ but not PD98059 as an ERK1/2 inhibitor and SB203580 as a p38 inhibitor. Our results suggest that TR-E70 may downregulate cyclin D1 as one of the potential anti-cancer targets through $GSK3{\beta}$-dependent cyclin D1 degradation. From these findings, TR-E70 has potential to be a candidate for the development of chemoprevention or therapeutic agents for human colorectal cancer.
Protein tyrosine kinase(PTK), protein kinase C(PKC), oxidase, as a mediator, take a significant role in signal transduction pathway of angiogenesis. The authors utilized the inhibitors, targeting the formation of three co-enzyme in signal transduction pathway in order to quantify the suppression of abnormal vascular endothelial cell proliferation induced by DMH, to compare the level suppression in each up-regulated growth factors, CTGF, CYR61, $ITG{\beta}1$, FHL2, and to identify the relationship between abnormal cell proliferation and signal transduction pathway. Five groups were established; Control group, Group of DMH, Group of DMH-mixed Herbimycin, inhibitor of protein tyrosine kinase, Group of DMH-mixed Calphostin C, inhibitor of protein kinase C, Group Of Dmh-Mixed 10U Catalase, Inhibitor Of oxidase. The rise of vascular endothelial cell was compared by MTT assay, and four growth factors were analysed with RT-PCR method, at pre-administration, 4, 8, 12, and 24 hours after administration. In comparison of abnormal proliferation of vascular endothelial cell induced by DMH, suppression was noticed in Herbimycin and Calphostin C group, and Calphostin C group revealed higher suppression effect. Nevertheless, Catalase group did not have any suppression. In manifestation of four growth factors, Herbimycin and Calphostin C group presented similar manifestation with control group, except in $ITG{\beta}$. Catalse group had similar manifestation with DMH group in all four growth factors. Abnormal proliferation of vascular endothelial cell induced by DMH have a direct relationship with PTK and PKC, more specifically to PKC. Oxidase was confirmed not to have any relevance.
As circ_UBE2D2 has been confirmed to have targeted binding sites with multiple miRNAs involved in septic acute kidney injury (SAKI), efforts in this study are directed to unveiling the specific role and relevant mechanism of circ_UBE2D2 in SAKI. HK-2 cells were treated with lipopolysaccharide (LPS) to construct SAKI model in vitro. After sh-circ_UBE2D2 was transfected into cells, the transfection efficiency was detected by qRT-PCR, cell viability and apoptosis were determined by MTT assay and flow cytometry, and expressions of Bcl-2, Bax and Cleaved-caspase 3 were quantified by western blot. Target genes associated with circ_UBE2D2 were predicted using bioinformatics analysis. After the establishment of SAKI rat model, HE staining and TUNEL staining were exploited to observe the effect of circ_UBE2D2 on tissue damage and cell apoptosis. The expression of circ_UBE2D2 was overtly elevated in LPS-induced HK-2 cells. Sh-circ_UBE2D2 can offset the inhibition of cell viability and the promotion of cell apoptosis induced by LPS. Circ_UBE2D2 and miR-370-3p as well as miR-370-3p and NR4A3 have targeted binding sites. MiR-370-3p inhibitor reversed the promoting effect of circ_UB2D2 silencing on viability of LPS-treated cells, but shNR4A3 neutralized the above inhibitory effect of miR-370-3p inhibitor. MiR-370-3p inhibitor weakened the down-regulation of NR4A3, Bax and Cleaved caspase-3 and the up-regulation of Bcl-2 induced by circ_UB2D2 silencing, but these trends were reversed by shNR4A3. In addition, sh-circ_UBE2D2 could alleviate the damage of rat kidney tissue. Circ_UBE2D2 mitigates the progression of SAKI in rats by targeting miR-370-3p/NR4A3 axis.
Kainic acid (KA) causes neurodegeneration, but no consensus has been reached concerning its mechanism. Nitric oxide may be a regulator of the mechanism. We identified differentially expressed genes in the hippocampus of mice treated with kainic acid, together with or without L-NAME, a nonselective nitric oxide synthase inhibitor, using a new differential display PCR method based on annealing control primers. Eight genes were identified, including clathrin light polypeptide, TATA element modulatory factor 1, neurexin III, ND4, ATPase, $H^+$ transporting, V1 subunit E isoform 1, and N-myc downstream regulated gene 2. Although the functions of these genes and their products remain to be determined, their identification provides insight into the molecular mechanism(s) involved in KA-induced neuronal cell death in the hippocampal CA3 area.
Du, Meng-Fang;Yin, Xin-Ming;Guo, Zhong-Jian;Zhu, Liang-Jun
BMB Reports
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제39권6호
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pp.737-742
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2006
Open reading frame 60 of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus (Bm60) is located between 56,673 and 57,479 bp in the BmNPV genome which encodes 268 amino acid residues with predicted molecular weight of 31.0 kDa. Bm60 and its homologues have been identified in 11 completely sequenced lepidopteran NPVs. The transcript of Bm60 was detected by RT-PCR at 18-72 h post-infection (p.i.), while the corresponding protein could be detected at 24-72 h p.i. in BmNPV-infected BmN cells by Western blot analysis using a polyclonal antibody against Bm60. The expression of Bm60 was inhibited in the presence of Ara-c, an inhibitor of viral DNA synthesis. These results together indicated that Bm60 was a late gene. The size of Bm60 product was found to be a 31 kDa in BmNPV-infected BmN cells, consistent with predicted molecular weight. Immuno-fluoresence analysis showed that the Bm60 product was first detected in the cytoplasm at 24 h p.i and also located in nucleus during later infection. In conclusion, the available data suggest that Bm60 is a functional ORF of BmNPV and encodes a 31kDa protein expressed in the later stage of infection cycle.
Transglutaminase2 (TGM2) is a multi-functional calcium dependent enzyme that affects angiogenesis, apoptosis, differentiation, attachment, and changes in the extracellular matrix. However, its function in periodontal tissue has not yet been studied. The aim of this study was to investigate the association of the TGM2 expression and the modulation of inflammatory mediators in inflamed periodontal ligament (PDL) cells induced by pro-inflammatory cytokines such as Interleukin-$1{\beta}$ and the Tumor necrosis $factor-{\alpha}$. The expression of TGM2 was increased in the inflamed periodontal tissue and PDL cells. Over-expressed TGM2 in the PDL cells increased expression of MMP1, MMP3, IL-6, CXCL8, and PTGS2. Conversely, inhibition of TGM2 activity using LDN27219, a TGM2 inhibitor, resulted in decreased expression of MMP1, MMP3, IL-6, and CXCL8. The mRNA expression was confirmed by RT-PCR and quantified by qRT-PCR. Protein levels were also confirmed by immunofluoroscence staining. These results suggest that TGM2 plays an important role in the regulation of inflammatory mediators which exacerbate tissue damage in inflamed periodontal tissue.
PARK, JO-YOUNG;YOUNG-JOO JANG;SEOG-JONG YOU;YOUNG-SOOK KIL;EUN-JUNG KANG;JEE-HEE AHN;YOUNG-KWON RYOO;MIN-YOUN LEE;MISUN WON
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제13권2호
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pp.317-320
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2003
Genome-wide systematic deletion mutants were generated using a PCR-based targeted mutagenesis of Schizosacchaaromyces pombe. In a drug-sensitivity assay using thiabendazole(TBZ), an inhibitor of microtubule assembly, a heterozygous nda2 mutant ($nda2^+/nda2^-$), deleting one copy of nda2 encoding the microtubule subunit alpha1 demonstrated a distinct sensitivity to TBZ, indicating TBZ-induced haploinsufficiency. This result suggests that profiling drug-induced haploinsufficiency can be exploited to identify target genes for drugs and discover new drugs.
목 적 : 소아 신증후군 환자에서 과응고성 경향을 가지고 있으며 Plasminogen activator inhibitor-1(PAI-1)은 강력하게 섬유소의 용해를 감소시키는 당단백으로 최근 몇몇 연구에 의하면 신증후군에서 증가된 PAI-1과 사구체내의 섬유소원이나 섬유소와 관련된 항체의 침착이 연관되어 있음을 시사하고 있다. 저자는 PAI-1 유전자 다형성 중에서 A-844 G 대립유전자 다형성의 빈도와 유전형을 소아의 신증후군에서 임상경과와의 연관성을 비교 평가하였다. 방 법 : 2001년 10월부터 2003년 1월까지 경희대학교 부속병원 동서신장병연구소에 방문한 146명의 신증후군 환아와 249명의 대조군을 대상으로 하였고 신증훈군 환아는 infrequent relapser(IR)와 frequent relapser(FR)로 다시 나누었다. 이들에 대해 PAI-1 promoter gene의 A-844 G에 대한 중합효소 연쇄반응-제한효소절편길이 다형현상(PCR-RFLP)을 이용하여 유전자형을 A/A, A/G, G/G로 분류하여 비교 분석하였다. 통계는 Graph Pad Prism 통계분석 소프트웨어 version 2.0을 사용하였고 95% 신뢰구간과 P value는 0.05보다 작은 것을 의미 있게 보았다. 결 과 : PAI-1 promoter gene의 A- 844G 다형성의 분포는 대조군애서 G/G 81(32.5%), A/A 42(16.9%), G/A 126(50.6%)이였고 신증후군 그룹 중 IR 그룹은 G/G 29(34.1%), A/A 15(17.7%), G/A 41(48.2%)이였으며 FR 그룹에서는 G/G 17(27.9%), A/A 18(29.5%), G/A 26(42.6%)이었다. 단지 PAI-1 gene의 A-844G의 다형성중 A/A 유전자형이 신증후군 환아 중 FR군에서만 대조군에 비하여 유의하게 증가하였다(16.9% vs 29.5%, OR=2.06, P=0.0251). 반면 A/G 유전자형(OR=0.73, P=0.2639)이나 G/G 유전자형(OR=0.80, P=0.4828)은 통계학적인 의의가 없었고 IR군에서 대조군에 비하여 A/A(OR=1.06, P=0.8690), A/G(OR=0.91, P=0.7063), G/G(OR=1.07, P=0.7880)으로 모두 통계학적으로 유의하지 않았다. 결 론 : A-844G AA 유전자형을 가진 신증후군 환자와 FR와 통계적인 상관관계가 있음을 알수 있었다. 이는 향후 PAI-1 유전자와 과응고성과 관련된 생화학적 검사와의 연관성에 대한 추가적인 조사와 특히, 신증후군의 과응고성과 신증후군 재발과의 연관성이 있는지에 관한 연구가 더 필요할 것으로 사료된다.
배경: 저자들은 FLT3-ITD (fms-like tyrosine kinase-internal tandem duplication) 돌연변이의 정량 및 반복 염기 길이를 동시에 측정하는 정량 절편 분석법(fragment analysis)의 민감도를 평가하고, 분석적 성능을 검증하였다. 방법: FLT3-ITD 돌연변이의 정량과 수는 절편분석법으로 측정하였다. 변이 대립유전자와 정상 대립유전자를 혼합한 계대희석 표준물질로 절편 분석법, 일반 PCR법, 염기서열분석법의 FLT3-ITD 변이 검출한계를 측정하였다. 정상 공여자 50검체를 이용하여 특이도를 평가하였다. 급성골수성백혈병 환자의 481검체에 대하여 절편 분석법과 일반 PCR법으로 검사를 시행하고 그 결과를 비교 분석하였다. 결과: 절편 분석법의 돌연변이 최소 검출 농도는 5%였으며, 일반 PCR 검사법과 직접염기서열분석법은 각각 10%, 20%의 결과를 보였다. 급성골수성백혈병 환자의 481 검체를 분석한 결과, FLT3-ITD는 40.1% (193/481)에서 양성이었다. 변이 대립유전자의 정량값은 1.7-94.1% (중앙값 28.2%)로 다양하였으며, 반복 염기의 길이의 범위는 14bp-153 bp (중앙값 49bp)였다. 일반 PCR 검사법과 비교한 결과 방법간 일치도는 97.7% (470/481)였다. 절편 분석법이 일반 PCR 검사법에 비해 더 높은 민감도를 보였고, 11건의 돌연변이가 더 검출되었다. 이 중 7검체는 변이 대립유전자의 양이 10% 미만으로 일반 PCR 검사에서 검출되지 않았다(3.3-9.5%). 또 다른 불일치 세 검체에서는 PCR inhibitor의 영향으로 일반 PCR 방법에서 위음성 결과를 보였으며, 다른 한 검체는 돌연변이 중복 길이가 14 bp로 매우 짧아 일반 PCR에서 정상 밴드와 구별되지 않는 경우였다. 결론: 본 연구에서 저자들이 사용한 절편 분석법은 FLT3-ITD 돌연변이의 정량값과 중복된 길이를 동시에 측정할 수 있는 검사법으로, 민감하고 정확하여 급성골수성백혈병 환자에서 FLT3-ITD의 진단 및 추적 검사에 유용할 것으로 기대된다.
연구배경: ACE 억제제는 고혈압 및 신장질환의 치료제로서, 투약 중 발생하는 건성 기침은 이 약제의 사용을 제한하는 부작용으로 알려져 있다. ACE 억제제로 인한 건성 기침의 발생 빈도는 ACE의 활성도가 낮은 사람에서 높고, 그 활성도는 ACE 유전자의 다형성과 관계가 있다는 가설이 있으나, 그간의 국내외 임상 연구들은 그에 대해 각각 상이한 보고를 하고 있다. 이에 본 연구는 국내의 ACE 억제제를 투약 받고 있는 신장 질환 환자들을 대상으로, 건성 기침의 발생 반도와 ACE의 활성도를 결정하는 유전자 다형성과의 관계를 고찰하고자 하였다. 방 법: 1998년 8월 현재, 외래에서 ACE 억제제를 투약 받고 있는 339명의 환자들을 대상으로, 투약 중 건성 기침을 호소하고, 약제 중단 후 기침이 소실된 환자들을 기침 발생군, 기침을 호소하지 않은 환자들을 기침 미발생군으로 하였다. 환자들의 병력, 투약력, 증상 등의 임상적 특성은 의무기획을 이용하여 조사하였고, ACE 유전자 다형성은 환자들의 말초 혈액에서 얻은 DNA 의 종합효소 연쇄반응기법 (PCR) 과 전기영동(electrophoresis)으로 결정하였다. 결 과: 기침 발생군은 37명으로, 빈도는 10.9% 이었고, 미발생군은 302명이었다. 양군간에 연령, 기저 질환, ACE 억제제의 종류 및 용량에 있어서 유의한 차이는 없었으나, 남녀 비는 기침 발생군에서 M : F=24.3% : 75.7%, 미발생군에서는 49.7% : 50.3%로, 기침 발생군에서 여성의 비율이 유의하게 높았다(p=0.004). ACE 유전자 다형성의 유전자형의 비는 기침발생군에서 I:I : I/D : D/D=16.2% : 18.9% : 64.9%, 미발생군에서 18.9% : 18.2% : 62.9%로 양군간에 유의한 차이가 없었으며(p= 0.926), I allele과 D allele의 비도 기침 발생군에서 I : D=25.7% : 74.3%, 미발생군에서 28.0% : 72.0%로 유의한 차이를 보이지 않았다 (p=0.676). 결 론: ACE 억제제를 사용하고 있는 환자에서, 건성 기침의 발생 빈도는 10.9%이었고, 여성에서 유의하게 높았으며, ACE 억제제에 의한 기침과 ACE 유전자 다형성과는 관련성이 없었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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