• 생명과학회지
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• 제16권4호
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• pp.704-709
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• 2006

본 연구는 DNA 상해유도기작을 규명하기 위하여 꼬마선충 (Caenorhabditis elegans) 으로 부터 subtraction hybridization 방법을 이용하여 자외선 유도 유전자인 UV100과 UV150을 분리하고 그 유전자 구조와 발현양상을 조사하였다. 분리한 유전자의 발현양상을 Northern hybridization 방법으로 살펴본 결과 자외선 조사 후에 최대 2배 이상의 발현 증가를 나타내었다. 이 결과 이미 밝혀진 다른 UV-inducible 유전자와 유사하게 UV100과 UV150 유전자는 자외선에 의해서만 발현이 증가됨을 알 수 있었다. 또한 분리한 유전자의 기능을 알기 위하여 RNAi 실험을 한 결과 분리한 자외선 유도유전자는 발생단계에 따라 다양한 DNA 회복기작을 나타냄을 알 수 있었다.

• 생명과학회지
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• 제16권1호
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• pp.126-130
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• 2006

본 연구는 DNA상해유도기작을 규명하기 위하여 하등 진핵생물인 분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe로부터 subtraction hybridization방법을 이용하여 자외선 유도 유전자인 UVI-155을 분리하고 그 유전자 구조와 발현양상을 조사하였다. UVI-155 유전자의 발현양상을 Northern hybridization 방법으로 살펴본 결과 자외선(ultraviolet-light) 조사 1시간 후에 최대의 발현 증가를 나타내었다. 반면 알킬화제 인 MMS (methyl methanesulfonate) 처리에 의해서도 발현이 증가되었다. 이 결과 다른 UV-inducible 유전자와는 다르게 UVI-l55 유전자는 UV와 MMS 등의 DNA 상해에 모두 발현이 증가됨을 알 수 있었다. 또 한 유전자의 기능을 알기 위하여 null-mutant세포 주를 제조하여 그 특성을 살펴본 결과 이 유전자는 세포의 성장에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.

• 한국초지조사료학회지
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• 제17권4호
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• pp.379-386
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• 1997

대만산 배추 (Brassica campestris M.)로부터 분리한 BcHSPI7.6 cDNA(내열성 유전자)를 pBKSl-l vector에 subcloning하므로서, NPTII 유전자와 P35S-HSPI7.6 cDNA를 가지는 pBKH4 재조합 플라스미드를 제작하였다. 이들 플라스미드를 갖는 A. tumefaciens LBA4404로서 담배잎 단편을 24시간 동안 공배양하므로서 감염시켰으며, 이들 유전자로 형질전환된 shoot는 $100\;{\mu\textrm{g}}/ml$의 가나마이신을 첨가한 MS-n/B 배지에서 선발하였다. 담배((Nicotiana. tabacum)의 열에 대한 치사온도는 $50^{\circ}$에서 15분 이상이었으며, BcHSPI7.6 cDNA를 갖는 형질전환된 식물체는 이 온도에서 내열성을 나타내었다. 식울체의 형질전환 여부는 ${\alpha}^{_32}P$로 표지한 BcHSPI7.6 cDNA 단편을 probe로 이용해서 Southern blot hybridization을 실시하므로서 확인하였다. BcHSPI7.6 cDNA의 발현정도는 Northern blot 분석과 이중면역확산 방법으로 확인하였다. 본 연구에서, 담배에 도입한 BcHSPI7.6 cDNA는 내열성과 관련이 있는 유전자로서, HSPI7.6 단백질은 식물체를 열에 의한 손상으로부터 방지해 주는 protector 역할을 하는 것 으로 사료된다.

• Biomolecules & Therapeutics
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• 제3권2호
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• pp.122-131
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• 1995

Five human cancer cell lines (HeLa S3, Hep 3B, KATO III, Hs 683, HeLa MR) and one human normal cell line (WI-38) were examined cell viability, northern blot analysis, western blot analysis, and in situ hybridization for the expression $O_{6}$ -methylguanine-DNAmethyltransferase (MGMT), which can repair $O_{6}$ -methylguanine produced in DNA by alkylating agents. In cell viability test, the lethal sensitivities of each strain against anti-tumor drug N,N-bis(2-chloroethyl)- N-nitrosourea (BCNU) were counted, and both BCNU treated and untreated cell extracts were examined for their MGMT inducibility by RNA dot blot analysis. Cell lines did not show MGMT induction by BCNU pretreatment. Tlle MGMT activity was assayed by measuring the $^3$H radioactivity transferred from the substrate DNA containing [methyl-$^3$H)-O$_{6}$ -methylguanine to acceptor molecules in the cell extracts. Extracts from the majority of tumor strains and normal cells contained substantial MGMT activity of varying degree, while the known Mer$^{[-10]}$ cell (lacked or severely depleted in MGMT activity) Hela MR, and Hs 683 (proved to be Mer$^{[-10]}$ ) were much more sensitive to BCNU than the rest of tumor strains, as measured by cell viability test. Overall results above, KATO III showed the highest expression level of MGMT among the strains examined. Furthermore, with all the tumor and normal strains tested, a good correlation was observed between MGMT expression and cellular resistance to BCNU. The varying levels of expression of MGMT in human cancer cells found in this study should provide a molecular basis for MGMT expression among tumor strains from different tissue origin, the information of antitumor agents selection for chemotherapy of cancers.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제51권6호
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• pp.517-529
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• 2001

연구배경 : Filter hybridization이나 solution hybridization 방법들은 Northern blot나 slot blot에 비하여 빠르며 재현성이 높고 소량의 RNA를 측정할 수 있으며 한꺼번에 많은 시료들을 동시에 측정하는것이 가능하다. 방 법 : 저자들은 쥐를 대상으로 하여 SP-C mRNA를 filter hybridization과 solution hybridization 방법들로 각각 정량측정하여 방법론에 따른 분자생물학적 정도관리에 대한 관찰을 하기 위하여 이 연구를 시행하였다. 결 과 : 1) Solution hybridization 방법에 의한 SP-C mRNA의 정량측정을 위한 RNA 검체물의 최소량은 3pg 이상이었다. 2) Solution hybridization에 쓰이는 SP-C sense mRN A input 양과 유전자 cpm과의 Y=6.46 X+244(X=SP-C mRNA 전사체 Y=cpm)였고, 양자간의 상관계수 r은 0.99로 매우 밀접한 상관성을 보였다. 3) Filter hybridization방법에 의한 SP-C mRNA의 정량측정을 위한 RNA검체물의 최소량은 0.1ng 이상이었다. 4) SP-C의 sense 전사체 0, 0.1, 0.5, 1.0, 2.5 및 5 ng에 대한 cpm과의 표준곡선은 Y=2541.6 X+252.7 (X=SP-C mRNA 전사체 Y=CPM) 이고 상관계수 r은 0.99로 매우 밀접한 상관성을 보였다. 결 론 : Solution hybridization 방법은 다른 방법에 비해 RNA input 양을 아주 소량 사용하면서도 주위에 높은 배후 방사성 산란을 보이는 비특이성 DNA가 있음에도 불구하고 특정 시료의 양이 한정되어 있는 상황에서 RNA를 분석 검토하는데 매우 유용한 연구방법이며, 뿐만아니라 filter hybridization 방법은 mRNA를 정량 측정하는데 있어서 신속하고 재현성이 높으며, 한꺼번에 많은 시료들을 시행할 수 있고, 사료의 mRNA를 정량측정 하는데 있어서 유용한 방법임을 알 수 있었다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제32권4호
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• pp.243-250
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• 2005

한국 분리주 감자잎말림바이러스 (PLRV)로부터 627bp 크기의 외피단백질 유전자의 ORF (AF296280)를 분리하여 장려품종 감자인 '수미'를 형질전환 하였다. 17계통의 형질전환체를 선발하여 온실과 포장에서 5세대를 증식하면서 PLRV에 대한 저항성이 큰 5계통을 선발 하였다. 도입된 유전자들의 유전적인 안정성을 확인하기위해 PCR, Southern, 그리고 northern blot 분석을 수행하였다. 또한 클론으로 증식된 형질전환 감자들의 특성과 저항성도 검정하였다. 형질전환된 감자들에서 PLRV의 외피단백질 유전자는 안전적으로 발현되며 저항성을 유지하였으며, 유사도가 비교적 낮은 감자 바이러스 Y (PVY)에는 저항성을 나타내지 않았다. 따라서 이러한 저항성은 도입된 유전자와 유사성도가 높은 바이러스에 저항성을 나타내는 homology dependent gene silencing으로 판단되었다. 유망계통 형질전환 감자 계통들의 포장평가를 통해 PLRV에 대한 저항성을 제외한 주요한 농업적 특성과 식물학적 특성은 형질전환 되지 않은 감자와 큰 차이를 보이지 않았다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제46권2호
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• pp.167-172
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• 2003

목 적 : 소아 심장병의 주종을 이루고 있는 선천성 심장병 환아들에서 폐동맥 고혈압은 비교적 흔히 발생하지만 매우 치료하기 어려운 합병증이다. 폐동맥 고혈압의 원인과 치료 및 예방에 대해서는 아직 많이 알려지지 않은 실정이므로 이의 원인을 산소결핍이라는 전형을 이용하여 VEGF란 유전인자의 차원에서 규명하고, 나아가서는 폐동맥 고혈압의 치료 및 예방책을 마련하기 위하여 이 연구를 시행하였다. 방 법 : 폐동맥 평활근 세포는 생후 6주 Fischer rat의 주폐동맥을 적출하여 작은 조각으로 잘라 20% fetal bovine serum을 첨가한 DMEM 배지를 사용하여 5% 이산화탄소 배양기에서 배양하였다. 배양된 세포는 평활근 세포에만 선택적으로 염색되는 평활근 myosin과 ${\alpha}$-actin 항체를 이용하여 염색함으로써 순수 평활근 세포임을 확인하였다. 5% 이산화탄소 배양기에서 배양한 대조군 세포와 1 또는 3% $O_2$ tension에서 배양한 실험군 세포에서의 VEGF 발현 차이와 starvation한 군과 하지 않은 군에서의 VEGF 발현 차이를 RT-PCR과 northern blotting을 이용하여 비교하였다. 결 과 : 대조군과 저산소 조건에서 배양한 실험군에서 VEGF 발현 정도는 차이가 없었다. 결 론 : 아직 국내에서는 유전인자 차원에서의 폐동맥고혈압의 원인규명이나 이에 따른 치료에 대한 연구가 전혀 없는 상태이며, 이 연구에 이어 신생쥐와 성숙쥐와의 차이점 및 나아가서 사람과 쥐의 폐동맥 평활근 세포의 차이점 등을 규명할 예정이며, 이번 연구 결과를 바탕으로 폐동맥 고혈압의 원인기전 규명, 치료 및 예방방법 개발에 기여하고자 한다.

• 한국동물학회지
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• 제39권1호
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• pp.115-121
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• 1996

임신중기에서 발기에 이르는 흰쥐의 태반에서 Placental Lactogen I (PL-I), II 그리고 Pit-1 의 유전자 발현 변화를 Northern blot hybridization으로 조사하였다. 그 결과, 임신시기에 따라 PL-I과 PL-II의 mRNA 양과 크기에 변화가 나타났다. 이들 유전자 발현에 미치는 에스트로겐의 영향을 조사하기 위하여, 임신 14일째 쥐의 난소를 제거하고(OVX), 이후 매일 에스트로겐을 투여한 후 (OVX+E), 임신 18일째 태반을 회수하여 PL-I, II 그리고 Pit-1의 유전자 발현을 Northern blot hybridization으로 조사하였다. OVX 군의 경우, PL-I의 mRNA 크기는 1 kb에서 1.3 kb로 PL-II의 mRNA는 0.6kb에서 1 kb로 변화하였다. OVX+E 군에서는 PL-I과 PL-II의 mRNA가 정상대조군과 같은 상태로 환원하였다. 정상대조군에 비하여 OVX와 OVX+E 군에서 PL-I과 PL-II의 mRNA 크기에는 영향을 미치지 못한 반면, mRNA 양은 난소제거시 감소하였다가, 에스트로겐을 투여하면, 부분적으로 회복되는 경향을 보였다. 이러한 본 실험의결과는 에스트로겐이 PL-I과 PL-II의 RNA splicing이나 polyadenylation 등을 포함한 유전자 발현에 영향을 미치며, Pit-1이 이 과정에 개입하는 것을 시사하는 것이다.

• IMMUNE NETWORK
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• 제4권4호
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• pp.237-243
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• 2004

Background: The normal functions of the cell cycle inhibitor p16INK4a are frequently inactivated in many human cancers. Over 80% of hepatocellular carcinoma (HCC) cases lack a functional p16/Rb pathway. p16/Rb pathway, as well as p53 pathway, is considered as one of key components of tumor suppression. Methods: To study the roles of p16INK4a in HCC, a stable cell line expressing exogenous p16 was generated from SNU-449 hepatocellular carcinoma cells lacking endogenous p16, and suppression subtractive hybridization (SSH) was performed in parallel with the control cells. Results: 1) SSH identifies fibronectin (FN1), crystallin ${\alpha}B$ (CRYAB), Rac1, WASP, RhoGEF, and CCT3 as differentially-expressed genes. 2) Among the selected genes, the up-regulation of FN1 and CRYAB was confirmed by Northern blot, RT-PCR and by proteomic methods. Conclusion: These genes are likely to be associated with the induction of stress fiber and stabilization of cytoskeleton. Further studies are required to clarify the possible role of p16 in the signal transduction pathway.

• Journal of Life Science
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• 제11권1호
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• pp.52-56
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• 2001

The present study intends to characterize the DNA damage-inducible responses in eukaryotic cells. The fission yeast, S. pombe, which displays efficient DNA repair systems, was used in this study as a model system for higher eukaryotes. To study UV-inducible responses in S. pombe, five UV-inducible cDNA clones were isolated from S. pombe by using subtration hybridization method. To investigate the expression of isolated genes, the cellular levels of the transcripts of these genes were determined by Northern blot analysis after UV-irradiation. The transcripts of isolated gene (UV130) increased rapidly and reached maximum accumulation after UV-irradiation. Compared to the message levels of control, the levels of maximal increase were approximately 5 fold to UV-irradiation. In order to investigation whether the increase of UV130 transcripts was a specific results of UV-irradiation, UV130 transcript levels were examined after treating the cells to Methylmethane sulfonate (MMS). The transcripts of UV130 were not induced by treatment of 0.25% MMS. These results implied that the effects of damaging agents are complex and different regulatory pathways exist for the induction of these genes. To characterize the structure of UV130 gene, nucleotide sequences were analyzed. The nucleotide sequence of 1,340 nucleotide excluding poly(A) tail contains one open reading frame, which encodes a protein of 270 amino acids. The predicted amino acid sequences of UV130 do not exhibit any significant similarity to ther known sequences in the database.