• 식물분류학회지
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• 제47권1호
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• pp.6-10
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• 2017

Microsatellite markers were isolated for Daphne kiusiana var. kiusiana (Thymelaeaceae), an evergreen broad-leaved shrub endemic to Korea and Japan. Because its populations in Jeju Island are morphologically controversial, and consistently threatened by anthropogenic pressures, taxonomic delimitation and conservation effort are required at the genetic level. We developed 21 polymorphic microsatellite loci from Next Generation Sequencing data. The primer set included di-, tri-, and tetra-nucleotide repeats. Variability in the markers was tested for 80 individuals of D. kiusiana from three natural populations in Jeju Island and Japan. Among the 21 loci, three were unavailable for population JKJU of Japan. The Neighbor-Joining tree based on microsatellite markers described here classified the three populations into two groups according to geographical or morphological traits. These will be a powerful genetics tool for determining the taxonomic boundary and establishing suitable conservation strategies for D. kiusiana in Jeju Island.

• 식물분류학회지
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• 제49권4호
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• pp.275-281
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• 2019

One key step in the plant restoration process is the collection of seeds from the field. For the selection of source populations of target plant species for translocation purposes (reintroduction or reinforcements), several approaches are possible. A practical method involves the use of data from reciprocal transplant studies. If no direct data are available, knowledge of population genetics and the phylogeography of the target species can serve as an alternative. In this short review, we briefly propose guidelines for those collecting seeds for plant species restoration based on population genetics theory, focusing on two main questions: Where does the plant material come from and how are sources designated, and how are seeds efficiently collected from local populations? While genetic data on a larger scale (phylogeography and population genetics) are needed to form a reply to the first question, similar data on a smaller scale (fine-scale genetic structures within populations) are necessary to shed light on the second issue.

• Proceedings of the National Institute of Ecology of the Republic of Korea
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• 제3권3호
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• pp.154-164
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• 2022

Understanding temporal variations in wildlife populations is a prerequisite for conservation planning of wide-ranging species such as tigers (Panthera tigris). We determined the temporal variation in abundance, population growth, and sex ratios at different age and sex stages for a tiger population in Ranthambhore Tiger Reserve, India from November 2007 to February 2011 using motion-sensing cameras. We identified 19 male and 21 female tigers from stripe patterns during 16,110 trap nights within an area covering 233 km². The annual abundance of the population varied from 34.9 (mean)±3.8 (SE) to 23.9±1.5, with a declining trend in the mean annual change of abundance (-12%). The density of adult females remained stable across the study duration, but the densities of adult males and non-breeding tigers fluctuated. The sex ratio was female-biased (0.58 males/female) for breeding tigers and male-biased (1.74 males/female) for non-breeding tigers. Our results reinforce the importance of long-term studies for monitoring the naturally occurring processes in populations to develop population indicators and identify reliable baseline information for conservation and management planning of populations.

• 한국산림과학회지
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• 제90권4호
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• pp.558-564
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• 2001

굴참나무 동아의 형태적 변이를 연구하기 위하여 위도, 경도, 해발고 및 지리적 특성을 고려하여 16개 천연집단을 선발하였다. 각 집단별로 30개체를 대상으로 개체목당 수관 1/3 하단부에서 정아와 측아를 30개씩 고르게 채집하여 정아와 측아의 길이 및 폭에 대한 변이를 조사한 결과는 다음과 같다. 1. 정아길이, 정아폭, 측아길이 및 측아폭은 각각 6.9~11.3cm, 3.0~3.7cm, 6.1~8.9cm 및 2.5~3.1cm로 나타났으며, 모든 특성에서 약 20% 내외의 변이폭을 보였다. 2. 동아특성에 대한 변이는 집단간 및 집단내의 개체간에 고도의 유의적인 차이를 보였으며 특히, 분산기여도는 집단간보다 집단내의 개체간에 큰 것으로 나타났다. 3. 상관분석한 결과 정아길이는 측아걸이 및 폭과, 측아폭은 정아폭 및 측아길이와 정의 상관을 나타내었으며, 또한 지리적 변이에 있어 위도는 정아폭과, 경도는 정아길이 및 측아길이와 정의 상관을 나타내었다. 4. 군집분석한 결과는 거리지수 3.4에서 2개의 그룹 즉, I그룹(Pop. 8)과 II그룹(Pop. 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16)으로 나뉘었으며, 거리지수 1.5에서는 II그룹이 다시 Pop. 1, 2, 7, 9, 및 11의 군집(II-1그룹)과 Pop. 3, 4, 5, 6, 10, 12, 13, 14, 15 및 16의 군집(II-2그룹)으로 나뉘어 거리지수 1.2 이상에서 총 III그룹으로 분리되었다.

• 한국산림과학회지
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• 제66권1호
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• pp.82-94
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• 1984

집단간(集團間), 집단내(集團內) 개체목간(個體木間)에 보이는 기공밀도(氣孔密度)와 기공(氣孔)길이의 차이(差異)를 밟히기 위하여 그 변이(變異)를 4가지 참나무 수종(樹種)에서 조사(調査)하였다. 전국(全國)에 분포(分布)된 참나무 천연집단(天然集團)에서 신갈나무 9개집단(個集團), 졸참나무, 굴참나무 각각 4개집단(個集團), 상수리나무 3개집단(個集團)을 조사하였다. 집단별(集團別) 20주(株)의 개체목(個體木) 각각(各各)에서 12개(個)의 잎을 채취(採取)하여 collodion replica의 현미경(顯微鏡) 검경(檢鏡)에 의(依)해 각(各) 채취엽(採取葉)에서 기공(氣孔)길이는 20반복(反復), 기공밀도(氣孔密度)는 10반복(反復)을 측정(測定)하였다. 조사(調査)된 모든 수종(樹種)에서 평균(平均) 기공밀도(氣孔密度)는 $600{\sim}1,000/mm^2$, 길이는 $19{\sim}26{\mu}m$에 분포(分布)하고 있었다. 기공밀도(氣孔密度)와 길이는 모든 수종(樹種)에서 집단간(集團間), 집단내(集團內) 개체목간(個體木間)에 1% 또는 5% 수준(水準)에서 통계학적(統計學的)으로 유의적(有意的)인 차이(差異)를 보였다. 신갈나무는 다른 수종(樹種)에 비(比)해서 특히 집단간(集團間)에 심한 차이(差異)를 보였고 굴참나무는 그 반대(反對)였다. 기공밀도(氣孔密度)와 길이의 집단내(集團內) 개체목간(個體木間) 변이계수(變異係數)는 모든 집단(集團)에서 각각(各各) 3.7~12%와 1~5%의 작은 값을 보였다. 신갈나무의 평균기공밀도(平均氣孔密度)는 조사(調査)된 임분(林分)의 생육기(生育期) 일평균온도합계(日平均溫度合計) 및 습도합계(濕度合計)와 중상관계수(重相關係數), $R_{df{\cdot}2.6}=0.868^*$과 $Y=0.041X_1(G.M.T.S.)+0.489X_2(G.M.H.S.)+22.37$의 중회귀식(重回歸式)을 보이며 통계적(統計的)으로 유의적(有意的)인 상관(相關)을 보였다. 그러나 기공밀도(氣孔密度)의 경우(境遇)와는 달리 평균(平均) 기공(氣孔)길이는 상기(上記) 기후인자(氣候因子)들과 상관(相關)을 보이지 않았다. 엽측정치(葉測定値) 또는 개체목(個體木)의 평균치(平均値)를 단위(單位)로 하는 빈도분포도(頻度分布圖)는 일부 집단(集團)에서 정규분포곡선(正規分布曲線)을 보이지 않았다. 그러나 분산분석(分散分析)의 결과(結果)와 같이 그 곡선(曲線)은 집단간(集團間) 차이(差異)를 정확(正確)하게 나타낼 수 있었다.

• 한국공작기계학회논문집
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• 제12권3호
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• pp.82-88
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• 2003

SGA(Single Genetic Algorithm) is a heuristic global optimization method based on the natural characteristics and uses many populations and stochastic rules. Therefore SGA needs many function evaluations and takes much time for convergence. In order to solve the demerits of SGA, ${\mu}GA$(Micro-Genetic Algorithm) has recently been developed. In this study, ${\mu}GA$ which have small populations and fast convergence rate, was applied to structural optimization with discrete or integer variables such as 3, 10 and 25 bar trusses. The optimized results of ${\mu}GA$ were compared with those of SGA. Solutions of ${\mu}GA$ for structural optimization were very similar or superior to those of SGA, and faster convergence rate was obtained. From the results of examples, it is found that ${\mu}GA$ is a suitable and very efficient optimization algorithm for structural design.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제15권3호
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• pp.672-677
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• 2005

The standard reference collection of strains for E. coli, the ECOR collection, was analyzed by a genome-based typing method. Seventy-one ECOR strains were subjected to repetitive extragenic palindromic PCR genome fingerprinting with BOX primers (BOX-PCR). Using a similarity value of 0.8 or more after cluster analysis of BOX-PCR fingerprinting patterns to define the same genotypes, we identified 28 genotypes in the ECOR collection. Shannon's entropy-based diversity index was 3.07, and the incident-based coverage estimator indicated potentially 420 genotypes among E. coli populations. Chi-square test of goodness-of-fit showed statistically significant association between the genotypes defined by BOX-PCR fingerprinting and the groups previously defined by multi-locus enzyme electrophoresis. This study suggests that the diversification of E. coli strains in natural populations is actively ongoing, and rep-PCR fingerprinting is a convenient and reliable method to type E. coli strains for the purposes ranging from ecology to quarantine.ine.

• 한국공작기계학회:학술대회논문집
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• 한국공작기계학회 2003년도 춘계학술대회 논문집
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• pp.9-14
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• 2003

SGA (Single Genetic Algorithm) is a heuristic global optimization method based on the natural characteristics and uses many populations and stochastic rules. Therefore SGA needs many function evaluations and takes much time for convergence. In order to solve the demerits of SGA, $\mu$GA(Micro-Genetic Algorithm) has recently been developed. In this study, $\mu$GA which have small populations and fast convergence rate, was applied to structural optimization with discrete or integer variables such as 3, 10 and 25 bar trusses. The optimized results of $\mu$GA were compared with those of SGA. Solutions of $\mu$GA for structural optimization were very similar or superior to those of SGA, and faster convergence rate was obtained. From the results of examples, it is found that $\mu$GA is a suitable and very efficient optimization algorithm for structural design.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제57권6호
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• pp.627-633
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• 2019

The study of coprolites has been a theme of archaeology in the American Southwest. A feature of archaeoparasitology on the Colorado Plateau is the ubiquity of pinworm infection. As a crowd parasite, this ubiquity signals varying concentrations of populations. Our recent analysis of coprolite deposits from 2 sites revealed the highest prevalence of infection ever recorded for the region. For Salmon Ruins, the deposits date from AD 1140 to 1280. For Aztec Ruins, the samples can be dated by artifact association between AD 1182-1253. Both sites can be placed in the Ancestral Pueblo III occupation (AD 1100-1300), which included a period of cultural stress associated with warfare. Although neither of these sites show evidence of warfare, they are typical of large, defensible towns that survived this time of threat by virtue of large populations in stonewalled villages with easily accessible water. We hypothesize that the concentration of large numbers of people promoted pinworm infection and, therefore, explains the phenomenal levels of infection at these sites.

• 식물분류학회지
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• 제43권4호
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• pp.245-251
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• 2013

작약은 원예 및 전통한약으로 중요한 자연자원이다. 경주국립공원 일대에서 발견된 야생 작약 집단에 대한 보전 및 활용 방안 마련을 위해 마이크로새틀라이트 마커를 활용한 유전적 다양성 분석을 수행하였다. 경주국립공원 일대 3개 집단과 중국 연변 1개 집단 등 4개 집단을 대상으로 유전적 다양성 분석을 수행한 결과, 5개의 마이크로새틀라이트 마커로부터 61개의 대립유전자를 확인하였으며, 평균 이형접합성($H_o$)은 0.452로 나타났다. 집단 간의 유전적 분화는 $F_{ST}$=0.116로 볼 때 비교적 낮은 수준인 것으로 나타났으며, 계층적 AMOVA 분석 결과 유전적 변이가 집단 간보다는 집단 내 개체사이에 분포하는 것으로 확인되었다. 그러나 $F_{ST}$값 대신 대립유전자의 크기를 고려한 $R_{ST}$ 값을 사용한 AMOVA 분석 결과에서는 중국 집단과 국내 집단 사이에 두드러진 차이가 나타났다. 이러한 양상은 STRUCTURE 분석에서도 확인되었다. 한편, 경주국립공원 일대 3개 집단 사이에는 지속적인 유전자 흐름이 일어나고 있는 것으로 확인되었으며, 작은 집단 크기와 성숙한 개체가 적은 것으로 볼 때, 추가적인 보호 및 장기 모니터링이 필요할 것으로 판단된다.