• Title/Summary/Keyword: Natural populations

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기중성 남세균, Wilmottia murrayi (Oscillatoriales, Cyanobacteria)의 국내 미기록속 및 미기록종에 대한 연구 (A study of newly recorded genus and species for aerial cyanobacteria Wilmottia murrayi(Oscillatoriales, Cyanobacteria) in Korea)

  • 이남주;서요셉;기장서;이옥민
    • 환경생물
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    • 제37권3호
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    • pp.260-267
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    • 2019
  • 국내 금강수계의 하구역에 위치한 하제항 암벽으로부터 기중성 남세균이 채집되어, 단조류 배양되었다. 2개의 남세균 배양주로부터 형태적 형질과 TEM에 의한 세포 미세구조 특징을 관찰하였다. 또한 16S rDNA 염기서열을 규명하여 BLAST 검색, 염기서열 유사도, 유전거리 및 계통분석을 실시하였다. 국내 배양주는 Wilmottia murrayi와 계통학적으로 동일한 clade를 형성하였고, 99% 이상의 유사도를 나타냈다. TEM을 통한 세포 미세구조는 틸라코이드가 여러겹으로 세포막 주변에 분포하는 특징을 나타냄으로써 Coleofasciculaceae과의 특징과 일치하였다. 이상의 결과를 통해 W. murrayi를 국내 미기록속 및 미기록종으로 보고하였다.

SSR을 이용한 꽃치자와 열매치자의 유전적 관계 (Genetic Relationships between Gardenia jasminoides var. radicans and G. jasminoides for. grandiflora Using ISSR Markers)

  • 허만규
    • 생명과학회지
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    • 제17권1호
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    • pp.24-30
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    • 2007
  • 꽃치자(Gardenia jasminoides var. radicans)와 열매치자(C. jasminoides for. grandiflora)는 Gardenia속으로는 우리나라에 두 분류군밖에 없으며 열매치자는 약용, 식용, 꽃치자는 방향제로 쓰인다. 그런데 꽃이 지고 나면 형태적으로 구분이 거의 되지 않는다 ISSR분석으로 이들 종의 유전적 다양도와 집단구조를 실시하였다. 88개의 DNA 분절에서 한 분류군에만 나타나는 특이밴드가 탐지되었다. 한국의 세 야생 집단은 분리되어 있고 패치 분포를 보이지만 재배종에 비해 높은 유전적 다양성을 유지하친 있었다. 열매치자가 꽃치자보다 유전적 다양성이 높았으며 ISSR 마커로 이들 분류군이 잘 분리되었다. 또한 야생 집단이 재배 집단보다 다양성이 약간 높으나 유의성은 없었다. 이는 재배화과정에서 유전적 다양성의 일부 상실이 있었으나 인위적인 채취와 식재로 야생 집단과 재배 집단의 유전적 교류가 존재하였음을 시사한다.

Conservation Biology of Endangered Plant Species in the National Parks of Korea with Special Reference to Iris dichotoma Pall. (Iridaceae)

  • So, Soonku;Myeong, Hyeon-Ho;Kim, Tae Geun;Oh, Jang-Geun;Kim, Ji-young;Choi, Dae-hoon;Yun, Ju-Ung;Kim, Byung-Bu
    • 한국자원식물학회:학술대회논문집
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    • 한국자원식물학회 2019년도 추계학술대회
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    • pp.32-32
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    • 2019
  • The aim of this study was to provide basic guidelines for conservation and management of endangered plants in the national parks of Korea. Iris dichotoma Pall. (Iridaceae), which is a popular garden plant, is considered a second-class endangered species by Korean government and it is listed as a EN (Endangered) species in Red Data Book of Korea. We analyzed ecological conditions of I. dichotoma habitats based on vegetation properties and soil characteristics. This species which is known to inhabit in grassland adjacent to the ocean of lowlands slope and its population was located at an elevation of 8 m to 11 m. In the study sites, the mean of soil organic matter, total nitrogen and soil pH were 6.16%, 0.234% and 5.39 respectively. Additionally, the genetic variation and structure of three populations were assessed using ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) markers. The genetic diversity of I. dichotoma (P = 59.46%, H = 0.206, S = 0.310) at the species level was relatively high. Analysis of molecular variance (AMOVA) showed 82.1% of the total genetic diversity was occurred in within populations and 17.9% variation among populations. Lastly, we developed predicted distribution model based on climate and topographic factors by applying SDMs (Species Distribution Models). Consequently, current status of I. dichotoma habitats is limited with natural factors such as the increase of the coverage rate of the herbs due to ecological succession. Therefore, it is essential to establish in situ and ex situ conservation strategies for protecting natural habitats and to require exploring potential and alternative habitats for reintroduction.

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Identifying Copy Number Variants under Selection in Geographically Structured Populations Based on F-statistics

  • Song, Hae-Hiang;Hu, Hae-Jin;Seok, In-Hae;Chung, Yeun-Jun
    • Genomics & Informatics
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    • 제10권2호
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    • pp.81-87
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    • 2012
  • Large-scale copy number variants (CNVs) in the human provide the raw material for delineating population differences, as natural selection may have affected at least some of the CNVs thus far discovered. Although the examination of relatively large numbers of specific ethnic groups has recently started in regard to inter-ethnic group differences in CNVs, identifying and understanding particular instances of natural selection have not been performed. The traditional $F_{ST}$ measure, obtained from differences in allele frequencies between populations, has been used to identify CNVs loci subject to geographically varying selection. Here, we review advances and the application of multinomial-Dirichlet likelihood methods of inference for identifying genome regions that have been subject to natural selection with the $F_{ST}$ estimates. The contents of presentation are not new; however, this review clarifies how the application of the methods to CNV data, which remains largely unexplored, is possible. A hierarchical Bayesian method, which is implemented via Markov Chain Monte Carlo, estimates locus-specific $F_{ST}$ and can identify outlying CNVs loci with large values of FST. By applying this Bayesian method to the publicly available CNV data, we identified the CNV loci that show signals of natural selection, which may elucidate the genetic basis of human disease and diversity.

Deosophila melanogadter의 ADH Polymorphism 과 두 유전자 사이의 적응성에 관한 비교 연구 (Comparative Studies on Polymorphism and Fithess between Two ADH Alleles in Drosophila melanogaster)

  • 최영헌;유미애;이원호
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제33권3호
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    • pp.141-147
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    • 1994
  • Deosophila melanogadter 자연집단재 alcohol dehydrogenase(ADH) allele 의 polymorphism 및 두 ADH allele 유전자형간의 적응도와 ethanol 의 상관 관계를 조사하였다. D. meanogaster의 자연집단내 ADH는 polymorphic 하였으며, FF,FS그리고 SS형의 유전자 빈도는 47.66,42.18 및 10.16%로 나타나 F 유전자의빈도가 S 유전자에 비하여 높게 분포하였다. 산란력과 우화율에서는 FF 유전자형이 SS 유전자형에 비하여 모두 약간 높게 나타났다. 자연집단에서 유래된 인공 소집단에서는 세대의 흐름에 따라 {{{{ { Adh}^{F } }}}} 유 전자형의 빈도증가와 상대적 {{{{ { Adh}^{S }}}}} 유전자형의 감소를 보였고, etha-nol은 ADH locu 상의 selective factor로서 작용함을 시사하여 주었다.

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보호종인 히어리의 자생지내외 보전과 지역사회 협력 모델 개발 - III. 몇 개의 히어리 자연집단과 벌채집단 간 개체군 비교 (Conservation of an Endangered Corylopsis coreana Uyeki in and ex situ and Development of Cooperative Model within Local Community - III. Populational Comparison Between Natural Groups and Deforestation Groups of Corylopsis coreana UYEKI)

  • 임동옥;황인천;정흥락
    • 한국환경생태학회지
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    • 제20권2호
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    • pp.227-234
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    • 2006
  • 히어리의 자연집단과 벌채집단간의 비교는 전라남도 순천시 승주읍 접치재, 월등면, 황전면, 경상남도 진주시 명석면, 경기도 포천시 백운산 5곳의 벌채지와 주변 자연림에 분포하는 히어리군락을 대상으로 비교하였다. $100m^2$당 맹아수와 개체당 평균 맹아수는 벌채 집단에서 자연집단의 것보다 더 높게 나타났다. 반면 맹아수별 수고와 직경은 자연집단에서 더 높게 나타났다. 종조성과 식생상관성은 없으며 벌채집단과 자연집단 모두에서 큰차이 없이 생육하였다. 개괄지인 벌채집단에서 근맹아 뿐만 아니라 실생묘로도 번식하였다. 이처럼 히어리는 환경적응력이 커서 인간이 훼손시킨 벌채집단에서 근맹아와 실생묘로 번식함으로써 종 자체의 소멸은 없고, 오히려 일시적인 교란이후에 개체군 확장을 보였다.

Taxonomical Study of Chrysosplenium L. (Saxifragaceae) in Korea Based on Chemical Composition

  • Kim, Hyun-Jun;Jeong, Hea-Seok;Kang, Shin-Ho
    • 한국자원식물학회지
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    • 제26권6호
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    • pp.718-725
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    • 2013
  • Components extracted from 7 species and 18 populations of Chrysosplenium in Korea were compared and analyzed using GC-MS analysis. 57 components (${\geq}80%$ quality) were identified, of which neophytadiene, palmitic acid and phytol were found at all the taxa. Percentage composition of isolated extracts showed a clear difference in components type and GC-MS profile. On the basis of that result, data matrix was made and cluster analysis using UPGMA was conducted. From the result of cluster analysis, two groups were recombined; one with alternate leaves comprised C. japonicum in Ser. Alternifolia and C. flagelliferum in Ser. Flagellifera and the other with opposite leaves gradationally comprised C. psuedofauriei in Ser. Sinica, C. ramosum in Ser. Oppositifolia and C. sphaerospermum, C. valdepilosum, C. flaviflorum in Ser. Pilosa. These chemotaxonomic results agreed in general with those of existing studies on external morphology and molecular. In conclusion, chemical composition can be an useful characters in understanding the relation analysis among interspecific and intraspecific complex with the help of cluster analysis of 7 species and 18 populations of Chrysosplenium in Korea.

Genetics of Self-fertility and Selection of Self-Fertile Lines in Rye (Secale cereale L.)

  • Heo, Hwa-Young;Hong, Byung-Hee;Seong, Rak-Chun;Ha, Yong-Woong
    • 한국작물학회지
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    • 제45권5호
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    • pp.343-346
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    • 2000
  • Rye breeding using F$_1$ hybrid began about 30 years ago, when cytoplasmically inherited forms of male sterility (CMS) and corresponding nuclear restorers were detected. It is very important to produce inbred lines for making hybrid lines because of strong self-incompatibility in rye. Among the 456 rye germplasms used in hybrid breeding scheme, 24 lines (5.3%) had the above 60% of self-fertility, and six lines of them were selected for their good agronomic characteristics and were used for subsequent inbreeding program. The average self-fertility of selected six lines was 78.4%, ranging from 72.2 to 99.5%. Genetic analysis for the self-fertility using $F_2$ populations showed that the segregation of self-fertile and sterile plants in F$_2$populations could be fit into 3 to 1 ratio suggesting self-fertility in rye be controlled by one major gene. The four different self-fertile lines, PI237923, 5C11, 5G5 and Florida black, had the same self-fertility gene because their F$_2$ plants showed almost the same self-fertility as their parents and showed no genetic segregation.

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Effect of Gardening as a physical activity on the improvement of Blood lipoprotein profile in an urban population in Republic of Korea: A pilot study

  • Jang, TaeSu;Lee, Ae-Kyung;Park, EunJi;Kim, Jae Kyung
    • International journal of advanced smart convergence
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    • 제11권3호
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    • pp.170-178
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    • 2022
  • Purpose: Gardening has been reported to have positive emotional and physical effects in older adults. However, limited studies have assessed this relationship in Korea. Therefore, in this pilot study of densely populated urban dwellers, we aimed to investigate whether temporary but repeated experiences of the natural environment could positively change metabolism-related blood indicators. Methods: This study used pre- and post-interventional designs to investigate the effects of 16 weeks of gardening on lipid profiles in an urban adult population and investigate their relationships. This study was conducted 30 times at the H Botanical Garden in Yongin City from August 16, 2021 to November 30, 2021 (16 weeks, twice a week, 3 hours each time). Before and after the gardening program, a clinical pathologist collected blood samples from the participants. Results: High-density lipoprotein levels increased, low-density lipoprotein levels decreased, and total cholesterol levels decreased after the gardening activity. Conclusions: Our findings suggest that gardening has potential for clinical application as it has good control over the lipid profile through physical activity. These findings can be used as basic data for studying the relationship between urban populations and their living environment and for various studies in the future as experiencing the natural environment provides many health benefits.

소백산 초오속 초오아속(미나리아재비과) 식물의 잡종형성 (Hybridization in Aconitum subgenus Aconitum at Mt. Sobaek in Korea)

  • 임채은;박종욱
    • 식물분류학회지
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    • 제31권4호
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    • pp.343-358
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    • 2001
  • 본 연구에서는 소백산 초오아속 개체군들과 이들의 부모종으로 추정되는 분류군들을 대상으로 소화경에 분포하는 털의 종류와 분포양상, 잎의 형태 및 결각 상태 등 주요 식별형질에 대한 비교형태학적 연구 및 수리분류학적 분석을 수행하여, 소백산 본 아속 개체군들의 형태 변이 양상 및 기원을 밝히고자 하였다. 소백산에 분포하는 본 아속 식물은 소화경에 분포하는 털의 종류 및 분포양상에 따라 크게 (1) 소화경이 완전히 무모인 개체, (2) 소화경 상부에만 유두상 돌기가 있는 굽은 털이 소수 분포하는 개체, (3) 소화경 상부로부터 중앙부까지 유두상 돌기가 없는 굽은 털이 다수 분포하는 개체, (4) 소화경 상부에만 굽은 털과 함께 표면이 평활한 선형의 개출모가 소수 혼생하는 개체, 그리고 (5) 소화경 상부로부터 중앙부까지 굽은 털과 함께 표면이 평활한 선형의 개출모가 다수 혼생하는 개체 등의 5가지 형태유형으로 구분되었으며, 이러한 5가지 형태유형을 가진 개체들은 소백산 대부분의 지역개체군에서 다양한 비율을 가지면서 모두 나타난다. 상기 비교형태학적 연구 결과와 주요 식별 형질의 주성분 분석 결과를 종합할 때, 소백산에 분포하는 본아속 재체군의 개체들은 과거, (1) 암술 및 소화경이 무모인 A. kusnezoffii, (2) 소화경에 유두상 돌기가 있는 굽은 털을 가진 A. japonicum subsp. napiforme, 그리고 (3) 소화경에 선형의 개출모를 가지는 A. jaluense subsp. jaluense 등 최소한 세 분류군간의 다원 잡종형성에 의해 유래된 것으로 판단되며, 이들 개체 사이에 반복적으로 유전자 침투(introgression)가 일어난 것으로 추정된다.

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