• 제목/요약/키워드: Multiplex

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Multiplex PCR을 이용한 장출혈성 대장균 O157:H7의 검출 (Detection of Enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 Strains Using Multiplex Polymerase Chain Reaction)

  • 엄용빈;김종배
    • 대한의생명과학회지
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    • 제4권1호
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    • pp.43-56
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    • 1998
  • 최근 전세계적으로 문제가 되고 있는 장출형성 대장균 O157:H7을 분리배양 및 동정 없이 바로 시료를 분석하여 신속하게 검출하기 위한 다중 중합효소 연쇄반응 (multiplex PCR) 기법을 확립하고, 이 기법을 이용하여 국내 분리 균주 중에서 SLT-I.II, eaeA, 60-MDa plasmid gene을 가지고 있는 대장균을 유전자 수준에서 검출하고자 하였다. 장출혈성 대장균 O157:H7이 가진 SLT-I.II, 60-MDa plasmid 유전자들에 대한 특이 oligonucleotide primers (MK1'-MK2', NAE19-NAE20, MFSIF-MFSIR)를 함께 동시에 반응 완충액에 넣어 다중 중합효소 연쇄반응을 시행한 결과 317bp (eaeA), 228bp (SLT-I.II), 167bp (60-MDa plasmid)의 PCR 증폭 DNA생성물을 표준균주 (E. coli ATCC 35150)에서는 확인할 수 있었지만, 기타 다른 병원성 장내세균 13세균 13균주에서는 band를 확인할 수 없었다. 한편 다중 중합효소 연쇄반응의 template DNA 추출 방법에 따른 PCR 결과를 비교하였다. 각각의 DNA 추출 방법 중 boiling lysis 방법이 신속하고 간편하여 장출혈성 대장균 O157:H7에 의한 식중독의 임상진단에 다중 중합효소 연쇄반응 (multiplex PCR) 적용하는 데에는 boiling lysis법을 이용하는 것이 가장 적합한 방법으로 확인되었다.

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Multiplex PCR 기법을 이용한 보통사마귀 내 인유두종바이러스 검출 및 분류 (Detection and Typing of Human Papillomavirus in Cutaneous Common Warts by Multiplex Polymerase Chain Reaction)

  • 최순용;임종호;김은정;김혜성;김범준;강훈;박영민
    • 생명과학회지
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    • 제21권7호
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    • pp.947-952
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    • 2011
  • 현재까지 다수의 역학연구를 통해 피부에 발생한 보통사마귀에서 제 1, 2, 3, 4, 7, 10, 27, 57 및 65형의 인유두종바이러스가 검출되었다. 그러나 기존의 중합효소연쇄반응(conventional polymerase chain reaction, PCR)을 이용하는 경우 절차가 복잡하여 시간이 오래 걸리는 단점이 있었다. 이번 연구를 통해 저자들은 보통사마귀에서 가장 흔히 검출되는 6가지 유전자형의 인유두종바이러스를 한번에 확인 가능한 간편한 muliplex PCR의 개발을 목표로 하였다. 인유두종바이러스의 염기서열분석을 통해, L1에서 E6, 그리고 E2에서 L2 사이의 유전자간영역(intergenic region)으로 부터 6쌍의 primer를 고안하였으며, L1 유전자서열 분석을 통해 multiplex PCR의 특이성을 확인하였다. 총 129개의 조직표본 중 109개에서 제 1, 2, 3, 4, 27, 57형의 인유두종바이러스를 확인하였다. 이번 연구의 primer를 이용한 인유두종바이러스 검출의 민감도와 특이도는 각각 85%와 99.5%였다. 이러한 primer 세트로 인유두종바이러스가 검출되지 않은 20개의 조직표본의 경우, 또 다른 HPV primer를 사용한 추가적인 multiplex PCR을 시행하여 7개 표본에서 제 7형 및 65형의 인유두종바이러스가 검출되었다. 이상의 결과는 본 연구를 통해 새롭게 고안된 multiplex PCR 기법을 통해 보통사마귀에서의 인유두종바이러스를 보다 정확하고 빠르게 검출할 수 있다는 것을 보여 준다.

멀티플렉스 영화관의 선택속성이 만족도, 충성도에 미치는 영향: 질적/양적 방법의 혼합 (Effects of Selection Attributes on Satisfaction and Loyalty of Multiplex Cinemas: Combining Quantitative and Qualitative Methods)

  • 조은정;남채은;차하영;신정현;한영위
    • 한국프랜차이즈경영연구
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    • 제10권2호
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    • pp.49-58
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    • 2019
  • Purpose - As the growth potential of the cultural contents industry steadily grows, the cinemas industry is growing fast especially due to popularity and commerciality. The recent in the cinemas industry is evolving on multiplex cinemas that combine cultural facilities such as theaters, restaurants, and shopping centers. Due to the rapid growth of multiplex cinemas, many researchers have studied the characteristics of visiting customers in Korea. Among them, selection attribute of multiplex cinemas, including the service quality and physical environment, is important because it may examines the cause of customer 's behavior. Thus, this research focuses on the effects of the selection attributes of the multiplex cinemas on customer satisfaction and their loyalty. This research suggests the guidelines for how cinemas should manage their customers and build their customers satisfaction and loyalty that improve business performance. Research design, data, and methodology - This study tests the structural relationship between selection attributes of multiplex cinemas, customer satisfaction, and loyalty. selection attributes of multiplex cinemas divide into five sub-dimensions such as movies facility quality, services, cleanliness, accessibility, and snack bars quality. In order to examine the purposes of this research, research model and hypotheses were developed. All constructs were measured with multiple items developed and tested in the previous studies. The data were collected from 100 students in their 10-20s and were analyzed using SPSS 22.0, SmartPLS 3.0 and fsQCA program. Result - The findings of this research are as follows. First, all selection attributes except cleanliness have significant positive impacts on customer satisfaction and loyalty. Second, customer satisfaction has significant positive impact on loyalty. Third, as a result of fsQCA, high satisfaction and high accessibility were the necessary conditions on loyalty. Fourth, the necessary conditions for male and female groups were different. Conclusions - The implications of this study are as follows. Overall, multiplex cinemas should manage selection attributes basically regardless of the type of theater. Especially, cleanliness was not significant, but the customer probably consider it an essential and basic factors. Also, they are able to manage the selection attributes differently depending on the type of gender. For the male customers, it is effective that centralized strategy and for female customers, it is effective that emphasized the multiplex cinemas image.

북방전복 (Haliotis discus hannai)의 선발육종 연구를 위한 microsatellite multiplex PCR법 개발 (Microsatellite multiplex PCR method for selective breeding studies in Pacific abalone (Haliotis discus hannai))

  • 박철지;남원식;이명석;강지윤;김경길
    • 한국패류학회지
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    • 제30권4호
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    • pp.383-390
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    • 2014
  • 북방전복 선발육종에 필요한 친자확인 및 가계분석을 효율적으로 실험하기 위하여 microsatellite multiplex PCR 기술을 개발하였다. 개발한 mutiplex PCR 기술은 6개 microsatellite locus Hdh145, Hdh512, Hdh1321, Awb017, Awb083 및 Awb098을 한번의 PCR 증폭으로 다중분석이 가능하다. 이 기술은 높은 친자확인 성공률과 가계분석에 있어서도 모두 멘델의 분리법칙을 따르고 있다. 더욱이 대량의 시료처리를 필요로 하는 경우에 있어서도 시간절약 및 비용 절감뿐만 아니라 샘플 처리과정의 간소화가 가능하여 handling errors를 줄일 수 있다. 따라서 본 연구에서 개발된 multiplex PCR은 친자확인, 가계분석, 집단유전학 및 계통분류학 분석에 유용하게 사용할 수 있을 것이라 생각된다.

식품검사에서 Lis-mix multiplex PCR 방법의 응용 및 Listeria ivanovii 특이적 검출 (Application of Multiplex PCR Using Lis-mix Primers in Food test and Specific Detection of Listeria ivanovii)

  • 한기호;이칠우;양옥순;이영순;임윤규;윤병수
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제16권4호
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    • pp.251-257
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    • 2001
  • Listeria monocytogenes와 L. ivanovii는 인간과 동물에 대한 식품 유래성 병원성 세균이다. Listeria 속에는 이들 병원균 외에 비병원성세균인 L. innocua, L, welshimeri, L. seeligeri, L.grayi 등 이 포함되어 있기에, 식품검사에서 배양법을 사용하는 종래의 Listeria의 검출방법은 시간과 많은 실험을 필요로 한다. 이런 이유 등으로 Literia의 종동정과 검출을 위한 신속한 검출법으로 Lis-mix multiplex PCR검출법 (Bubert et al., 1999)이 개발되었다. 본 연구에서는 식품검사에 활용하기 위한 실용적인 Lis-mix multiplex PCR 방법을 개발하고, 아울러 새로운 Siw-mixIII PCR 검출법을 개발하였다. 이 방법을 사용하여 식품에서 분리된 총 69개의 Listeria 균주를 성공적으로 종동정할 수 있었으며, Siw-mixIII multiplex PCR방법을 사용하여 L. ivanovii, L.welshimeri, L.seeligeri를 한번의 PCR로 검출 및 종동정을 할 수 있었다.

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장구균의 vancomycin 내성 유전자와 종 특이유전자의 검출을 위한 Multiplex polymerase chain reaction 개발 (Development of multiplex polymerase chain reaction for the detection of vancomycin resistant genotypes and Enterococcus Sp.-specific genes)

  • 조윤상;이희수;김종만;안종삼;류판동;박용호;유한상;이문한
    • 대한수의학회지
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    • 제43권1호
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    • pp.103-112
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    • 2003
  • A multiplex PCR assay, which allows simultaneous detection of vancomycin resistant genotypes and Enterococcus species-specific genes, was developed. Vancomycin resistant enterococci (VRE) from chickens and humans could be detected for vanA, vanB, vanC-1, vanC-2, $ddl_{E.faecium}$ and $ddl_{E.faecalis}$ by multiplex PCR. Eight isolates of VRE from humans (n=11) had $ddl_{E.faecium}$ and vanA, and 3 isolates of the VRE had $ddl_{E.faecium}$ and vanB. One isolate of VRE from chickens (n=6) had $ddl_{E.faecium}$ and vanA, and 5 isolates of the VRE had only vanA. E. faecium, E. faecalis, E. gallinarum and E. casseliflavus were also confirmed for the species-specific gene by multiplex PCR. This multiplex PCR could detect E. faecium, E. faecalis, E. gallinarum, E. casseliflavus, vanA, vanB, vanC-1 and vanC-2, simultaneously. The PCR assay established in the present study can be an alternative to time-consuming biochemical tests and antibiotic susceptibility tests of Enterococcus spp.

Application of Multiplex Nested Methylated Specific PCR in Early Diagnosis of Epithelial Ovarian Cancer

  • Wang, Bi;Yu, Lei;Yang, Guo-Zhen;Luo, Xin;Huang, Lin
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제16권7호
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    • pp.3003-3007
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    • 2015
  • Objective: To explore the application of multiplex nested methylated specific polymerase chain reaction (PCR) in the early diagnosis of epithelial ovarian carcinoma (EOC). Materials and Methods: Serum and fresh tissue samples were collected from 114 EOC patients. RUNX3, TFPI2 and OPCML served as target genes. Methylation levels of tissues were assessed by multiplex nested methylated specific PCR, the results being compared with those for carcinoma antigen 125 (CA125). Results: The serum free deoxyribose nucleic acid (DNA) methylation spectrum of EOC patients was completely contained in the DNA spectrum of cancer tissues, providing an accurate reflection of tumor DNA methylation conditions. Serum levels of CA125 and free DNA methylation in the EOC group were evidently higher than those in benign lesion and control groups (p<0.05). Patients with early EOC had markedly lower serum CA125 than those with advanced EOC (p<0.05), but there was no significant difference in free DNA methylation (p>0.05). The sensitivity, specificity and positive predicative value (PPV) of multiplex nested methylated specific PCR were significantly higher for detection of all patients and those with early EOC than those for CA125 (p<0.05). In the detection of patients with advanced EOC, the PPV of CA125 detection was obviously lower than that of multiplex nested methylated specific PCR (p>0.05), but there was no significant difference in sensitivity (p>0.05). Conclusions: Serum free DNA methylation can be used as a biological marker for EOC and multiplex nested methylated specific PCR should be considered for early diagnosis since it can accurately determine tumor methylation conditions.

Multiplex PCR for Simultaneous Detection of Aminoglycoside Resistance Genes in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae

  • Kim, Hyun Chul;Jang, Ji-Hyun;Kim, Hyogyeong;Kim, Young-Jin;Lee, Kyoung-Ryul;Kim, Yun-Tae
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.155-165
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    • 2012
  • The purpose of this study was to develop a multiplex PCR for the detection of aac(6')-Ib, aph(3')-Ia, and ant(2")-Ia; the genes that encode the most clinically relevant aminoglycoside modifying enzymes (AMEs) in Gram-negative bacteria. Clinical isolates of 80 E. coli and 23 K. pneumoniae from tertiary university hospital were tested by multiplex PCR. The most prevalent AME gene was aac(6')-Ib which was found in 22.3% of the isolates. Of the total 80 E. coli isolates, 1 isolate was found to contain both aph(3')-Ia and ant(2")-Ia simultaneouly. Of the total 23 K. pneumoniae isolates, 2 isolates were found to contain both aac(6')-Ib and aph(3')-Ia, and 1 isolate was found to contain both aac(6')-Ib and ant(2")-Ia simultaneously. Annual (2005~2009) analysis of isolates that contain the AME genes were of no correlation. The sensitivity and specificity of multiplex PCR in detecting AME genes was 94.4% (34 of 36 cases) and 100%, respectively. We suggest the multiplex PCR method we developed could be highly sensitive and specific in detecting the AME genes of E. coli and K. pneumoniae. This study could be the first published investigation in which the multiplex PCR method detects aac(6')-Ib, aph(3')-Ia, and ant(2")-Ia genes.

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Development of a multiplex PCR method for identification of four genetically modified maize lines and its application in living modified organism identification

  • Park, Jin Ho;Seol, Min-A;Eum, Soon-Jae;Kim, Il Ryong;Lim, Hye Song;Lee, Jung Ro;Choi, Wonkyun
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제47권4호
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    • pp.309-315
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    • 2020
  • Advances in biotechnology have led to progress in crop genetic engineering to improve agricultural productivity. The use of genetically modified (GM) crops has increased, as have consumers' and regulators' concerns about the safety of GM crops to human health, and ecological biodiversity. As such, the identification of GM crops is a critical issue for developers and distributors, and their labeling is mandatory. Multiplex polymerase chain reaction (PCR) has been developed and its use validated for the detection and identification of GM crops in quarantine. Herein, we established a simultaneous detection method to identify four GM maize events. Event-specific primers were designed between the junction region of transgene and genome of four GM maize lines, namely 5307, DAS-40278-9, MON87460, and MON87427. To verify the efficiency and accuracy of the multiplex PCR we used specificity analysis, limit of detection evaluation, and mixed certified reference materials identification. The multiplex PCR method was applied to analyze 29 living, modified maize volunteers collected in South Korea in 2018 and 2019. We performed multiplex PCR analysis to identify events and confirmed the result by simplex PCR using each event-specific primer. As a result, rather than detecting each event individually, the simultaneous detection PCR method enabled the rapid analysis of 29 GM maize volunteers. Thus, the novel multiplex PCR method is applicable for living modified organism volunteer identification.

Multiplex real-time PCR을 이용한 송아지 설사병 원인 주요 병원체의 동시검출 (Simultaneous Detection of Major Pathogens Causing Bovine Diarrhea by Multiplex Real-time PCR Panel)

  • 김원일;조용일;강석진;허태영;정영훈;김남수
    • 한국임상수의학회지
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    • 제29권5호
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    • pp.377-383
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    • 2012
  • 송아지 설사병은 국내 축산산업에 큰 피해를 주는 중요한 질병이다. 다양한 감염성 원인체들이 송아지 설사병에 관련될 수가 있기 때문에 효과적인 치료를 위해서는 신속한 감별진단이 필수적이다. 따라서 소설사병 바이러스(BVDV), 소 코로나바이러스(BCoV), A형 소 로타바이러스(BRV), 살모넬라, $K99^+$ 대장균, Cryptosporidium parvum등의 6개의 주요 병원체들을 동시에 검출하는 두 개의 multiplex real-time PCR으로 구성된 PCR 패널을 개발하여 국내 농가에서 전북대학교 동물질병진단센터로 접수된 97개의 설사 분변을 검사하였다. 또한 현미경 검사법을 이용하여 97개의 분변에서 Coccidium 충란을 검사하였다. 개발된 multiplex PCR의 민감도는 BVDV, BCoV와 BRV의 경우는 0.1 $TCID_{50}$, $K99^+$ 대장균은 5 CFU, Salmonella는 0.5 CFU, Cryptosporidium는 50 oocysts로 측정되었다. 또한 multiplex PCR의 증폭효율은 병원체에 따라0.97에서 0.99였다. 국내에서 접수된97개의 분변 중 36개의 분변은 multiplex PCR에 의해 최소 하나의 병원체에 대해 양성으로 판정되었고, 6개의 샘플은 2개의 병원체에 동시에 양성반응을 보였다. 또한 1달 이상 연령의 송아지 분변48개에서는 Coccidium 충란이 발견되었다. 결과적으로, 새로이 개발된 multiplex real-time PCR은 BVDV, BCoV, BRV, $K99^+$ 대장균, Salmonella와 Cryptosporidium과 관련된 송아지 설사병을 신속하고 정확하게 진단할 수 있는 유용한 검사법이 될 수 있을 것으로 기대되며 향후 Coccidium까지 검출할 수 있는 동시 진단법이 개발될 필요가 있을 것으로 생각된다.