• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제45권2호
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• pp.87-94
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• 2007

In this study, we describe Korean isolates of Trichomonas vaginalis infected with double-stranded (ds) RNA virus (TVV). One T. vaginalis isolate infected with TVV IH-2 evidenced weak pathogenicity in the mouse assay coupled with the persistent presence of a dsRNA, thereby indicating a hypovirulence effect of dsRNA in T. vaginalis. Cloning and sequence analysis results revealed that the genomic dsRNA of TVV IH-2 was 4,647 bp in length and evidenced a sequence identity of 80% with the previously-described TVV 1-1 and 1-5, but only a 42% identity with TVV 2-1 and 3 isolates. It harbored 2 overlapping open reading frames of the putative capsid protein and dsRNA-dependent RNA polymerase (RdRp). As previously observed in the TVV isolates 1-1 and 1-5, a conserved ribosomal slip-page heptamer (CCUUUUU) and its surrounding sequence context within the consensus 14-nt overlap implied the gene expression of a capsid protein-RdRp fusion protein, occurring as the result of a potential ribosomal frameshift event. The phylogenetic analysis of RdRp showed that the Korean TVV If-2 isolate formed a compact group with TVV 1-1 and 1-5 isolates, which was divergent from TVV 2-1, 3 and other viral isolates classified as members of the Giardiavirus genus.

• 한국어병학회지
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• 제22권2호
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• pp.137-146
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• 2009

The black rockfish Sebastes schlegelii neutrophil cytosolic factor components p47 phox (phagocyte oxidase) cDNA was cloned. The sequence of the cDNA showed that rockfish p47 phox cDNA consisted of 1,952 bp contained open reading frame encoding predicted polypeptide of 420 amino acids. Additionally analysis of the p47 phox amino acid sequence showed two potential SH3 domains. The functional domains are highly conserved in many animals, though the sequence of the components of the black rockfish showed low homology with that of mammals. The deduced amino acid sequence of the black rockfish p47 phox was similar to those of the carp (60.4%), zebrafish (59,2%), rainbow trout (68.5%), xenopus (55.2%), mouse (54.2%), rabbit (54.5%), rat (53.7%), and chicken (50.9%). The expression of the rockfish p47 phox molecule was induced in peripheral blood leukocytes (PBLs) from 1 to 12 h following LPS stimulation, with a peak at 6 h after the stimulation, and which increased at 1, 3, and 12 h after treated with Poly I:C compared with the control. The rockfish p47 phox gene was expressed in various tissues of healthy fish. The level of p47 phox expression was high in the PBLs, kidney and spleen.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제50권6호
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• pp.753-762
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• 2008

GenBank database로부터 돼지 genomic 서열과 사람의 CFB 유전자의 CDS를 정렬하여 돼지 CFB 유전자의 CDS를 추정하였다. 이를 바탕으로 제작된 primer를 이용하여 RT-PCR을 실시하여 CDS 내부서열을 결정하였으며, 결정된 서열을 바탕으로 primer 제작 및 RACE-PCR을 실시하였다. 돼지 CFB 유전자의 전체 CDS 길이는 2298 bp였으며, 사람 및 마우스와의 비교결과 염기삽입/결실이 확인되었다. CDS 및 아미노산 서열을 사람 및 마우스와 비교한 결과 CDS는 84% 및 80%, 아미노산 서열은 79%, 77%의 상동성을 보였다. 포유류의 CFB에서 일반적으로 나타나는 보체조절단백질(complement control protein, CCP) 영역, Von willebrand factor A(VWFA) 영역, 그리고 serine protease 영역이 확인되었으며, 단백질 기능에 중요하게 작용하는 아미노산 잔기들은 돼지를 포함한 사람, 마우스, 소, 말에서 동일하게 나타났다. 사람, 마우스, 소, 말, 돼지 CFB 유전자의 아미노산 서열에 의한 유전적 거리지수 및 neighbor-joining tree 작성 결과 돼지는 같은 우제목에 속하는 소와 가장 가까운 계통유전학적 유연관계를 나타내었다. 결정된 CDS를 바탕으로 exon 영역을 증폭하기 위한 primer를 제작하였고, cSNP 분석을 위해서 돼지 6품종을 대상으로 direct sequencing을 실시하였다. 그 결과 아미노산 치환을 일으키는 3개(C13T, A1696G, A2015C)의 cSNP가 동정되었다. 동일한 DNA를 사용하여 동정된 3개의 cSNP를 대상으로 Multiplex- ARMS 방법으로 유전자형 분석 결과 direct sequencing 결과와 일치하였다. Multiplex-ARMS 방법의 재현성 확인을 위해 무작위로 2개의 DNA 시료를 선발한 후 direct sequencing과 Multiplex-ARMS 분석을 각각 실시하였으며, 3개의 cSNP에 대한 유전자형이 일치함을 재확인하였다. 따라서 본 연구에서 확인된 3개의 cSNP는 SLA class III 영역의 haplotype 분석을 위한 기초 자료로 사용될 수 있으며, Multiplex- ARMS 기법은 이종장기 개발에 필수적인 SLA 전체 영역 내 유전자들의 유전자형 분석을 위한 효율적인 분석방법이라고 사료된다.

• 생명과학회지
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• 제24권4호
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• pp.343-351
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• 2014

Phosphoinositide 3-kinase (PI3K)는 항산화 제어반응, 심근세포 성장, 및 세포 내 특수반응 뿐만 아니라 세포분화, 생장, 운동, 식균 및 내항작용, 세포 골격유지에 관여하는 등 세포 신호체계에서 핵심 역할을 하는 효소이다. PI3K는 세 그룹으로 나누어지며 type I PI3K는 leukocyte에서 우선적으로 발현되고 G-proteins의 ${\beta}{\gamma}$ subunits에 의해서 활성화 된다. 본 연구에서는 넙치(Paralichthys olivaceus)의 $PI3K{\gamma}$를 암호화하는 cDNA를 클로닝하였다. 넙치의 $PI3K{\gamma}$는 1,341 bp 염기로 구성되는 한 개의 ORF를 가지며 이 단백질은 447 아미노산으로 구성되어있다. $PI3K{\gamma}$는 zebrafish의 $PI3K{\gamma}$와 89.6%, mouse와는 84.7%, Norway rat와는 84%, human의 $PI3K{\gamma}$와는 74.9%가 아미노산 상동성을 나타내었다. $PI3K{\gamma}$유전자의 대장균에서 발현을 위하여 pET-44a(+)-PI3K 재조합 DNA를 구축하여 대장균에서 발현시킨 결과 49 kDa의 재조합 단백질이 과발현 됨을 확인 할 수 있었다. His-tag affinity chromatography를 이용하여 $PI3K{\gamma}$단백질을 순순 분리하였으며 wortmannin을 이용하여 $PI3K{\gamma}$의 활성을 분석하였다.

• 한국수정란이식학회지
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• 제31권2호
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• pp.117-121
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• 2016

Although piglets have been delivered by embryo transfer (ET) with in vitro produced (IVP) embryos and blastocysts, a success rate has still remained lower level. Unlike mouse, human, and bovine, it is difficult to a production of piglets by in vitro fertilization (IVF) because of an inappropriate in vitro culture (IVC) system in pig. Therefore, the present study was conducted to investigate whether minimized exposure time in IVC can improve the pregnancy and delivery rates of piglets. Immediately after IVM, the oocytes were denuded and co-incubated with freshly ejaculated boar semen for 3.5 to 4 hours at $38.5^{\circ}C$ under 5% $CO_2$ in air. To avoid long-term exposure to in vitro state, we emitted IVC step after IVF. After that the presumptive zygotes were transferred into both oviducts of the surrogate on the same day or 1 day after the onset of estrus. Pregnancy was diagnosed on day 28 after ET and then was checked regularly every month by ultrasound examination. The 3 out of 4 surrogates were determined as pregnant (75%) and a total of 5 piglets (2 females and 3 males) were delivered at $118.3{\pm}2.5$ days of pregnancy period. In conclusion, a short-term exposure time may be an important factor in the production of IVP-derived piglets. It can be apply to the in vitro production system of transgenic pig by IVF, cloning, and pronuclear microinjection methods.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제6권2호
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• pp.89-96
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• 2002

성장을 멈추고 있는 원시난포(primordial follicle)에서 난포발달이 개시되어 1차난포(primary follicle)로 발달하는 조절기전은 잘 알려져 있지 않다. 이 초기 난포발달 과정에 관여하는 유전자를 알아내기 위해 suppression subtractive hybridization(SSH)을 사용하였다. 생후 1일과 5일째의 생쥐 난소로부터 얻은 cDNA로 forward와 reverse subtraction을 수행하여 각각 day1과 day5-subtracted cDNA library를 얻었다. 이를 cloning한 결과, 357개 clone의 염기 서열을 BLAST와 RIKEN을 이용해 분석하여 27개의 clone은 novel gene으로 330개의 clone은 데이터 베이스와 일치함을 알았다. 이 중에 기능이 알려진 유전자는 day1에서는 42종, day5에서는 47종이 각각 차이 나게 발현하고 있는 것으로 나타났다. Day1-subtracted cDNA library에서는 GDF8, lats2, septin2, wee1등 4개 유전자를, day5-subtracted cDNA library에서는 HSP84, laminin2, MATER, MTi7, PTP 및 wrn등 6개 유전자를 선택하여 LCM-RT-PCR방법으로 실제로 원시난포와 1차난포에서 차이 나게 발현되고 있는 것을 확인하였다. 본 연구에서 얻은 유전자 발현 양상의 결과는 앞으로 생쥐뿐만 아니라 사람 난소에서 primordial-primary follicle transition에 관여하는 기전을 연구하는데 중요한 정보를 제공할 수 있을 것으로 사료된다.

• Journal of Life Science
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• 제11권1호
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• pp.57-64
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• 2001

The cDNA encoding human NeuAc ${\alpha}$2,3Gal$\beta$ 1,3GalNAc GalNac ${\alpha}$2,6-Sialyltransferase (hST6GalNac IV) was isolated by screening of human fetal liver cDNA library with a DNA probe generated from the cDNA sequence of mouse ST6Gal NAc IV (mkST6GalNAc IV). The cDNA sequence included an open reading frame coding for 302 amino acids, and comparative analysis of this cDNA with mST6GalNAc IV showed that each sequence of the predicted coding region contains 88% and 85% identifies in nucleotide and amino acid levels, respecively. The primary structure of this enzyme suggested a putative domain structure, like that in other glycosyltransferases, consisting of a short N-terminal cytoplamic domain, a transmembrane domain and a large C-terminal active domain. This enzyme expressed in COS-7 cells echibited transferase activity toward NeuAc ${\alpha}$2,3Gal$\beta$ 1,3GalNAc, fetuin and GM1b, although the activity toward the later is very low, no significant activity being detected toward Gal${\beta}$ 1,3Gal NAc or asialofetuin, the other glycoprotein substrates tested. The $^{14}$ C-sialylated residue of fetuin sialylated by this enzyem with CMP-[$^{14}$C]NeuAc was sensitive to treatment with ${\alpha}$2,8-specific sialidase of Vibrio cholerae but resistant to treatment with ${\alpha}$2,3-specific sialidase (NaNase I), and ${\alpha}$2,3- and ${\alpha}$2,8-specific sialidase of Newcastle disease virus. These results clearly indicated that the expressed enzyme is a type of GalNAc ${\alpha}$2,6-sialyltransferase like mST6GalNAc IV, which requires sialic acid residues linked to Gal${\beta}$1,3GalNAc-residues for its activity.

• BMB Reports
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• 제44권2호
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• pp.123-128
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• 2011

Leucine-rich repeat containing protein 10 (LRRC10) is characterized as a cardiac-specific gene, suggesting a role in heart development and disease. A severe cardiac morphogenic defect in zebrafish morphants was recently reported but a contradictory result was found in mice, suggesting a more complicated molecular mechanism exists during mouse embryonic development. To elucidate how LRRC10 is regulated, we analyzed the 5'enhancer region approximately 3 kilo bases (kb) upstream of the Lrrc10 start site using luciferase reporter gene assays. Our characterization of the Lrrc10 promoter indicates it possesses complicated cis-and trans-acting elements. We show that GATA4 and MEF2C could both increase transcriptional activity of Lrrc10 promoter individually but that they do not act synergistically, suggesting that there exists a more complex regulation pattern. Surprisingly, knockout of Gata4 and Mef2c binding sites in the 5’enhancer region (-2,894/-2,889) didn't change the transcriptional activity of the Lrrc10 promoter and the likely GATA4 binding site identified was located in a region only 100 base pair (bp) upstream of the promoter. Our data provides insight into the molecular regulation of Lrrc10 expression, which probably also contributes to its tissue-specific expression.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제32권1호
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• pp.75-81
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• 2017

본 연구에서는 고등어 어육을 고감도로 보다 신속하게 검출하기 위하여 고등어 어육 중 TSSP를 이용해 단클론성 항체를 개발하고 이를 이용하여 간접 효소면역분석법(iELISA)과 western blot의 검출한계를 확인하였다. 먼저 비 열처리와 열처리를 한 고등어 어육 중 존재하는 TSSP를 확인하고, 단백질 추출에 주로 사용되는 버퍼의 종류에 따른 추출법 효율을 확인하기 위하여 전기영동과 단백질 정량을 실시하였다. 그 결과 열처리한 추출물은 비 열처리한 추출물보다 TSSP가 2배 정도 많이 추출되었으며, TSSP로 추측되는 37 kDa 부근에 형성된 밴드의 선명함과 굵기를 육안으로 비교한 결과 carbonate buffer로 추출하였을 때 밴드가 가장 두드러지게 형성되었고, 단백질 정량 결과에서도 carbonate buffer를 이용한 추출물의 단백질 농도가 가장 높은 것을 확인하였다. 이후, 생 고등어 어육을 열처리법으로 추출하여 항원을 준비하고 6주령 BALB/c mouse에 면역한 후 세포융합 및 클로닝을 통해 3A5-1번, 2번, 9번 및 16번 4종의 hybridoma cell을 확보하였다. 이렇게 개발된 항체는 수산물, 축산물, 농산물과의 교차반응성확인을 통하여 고등어 단백질에만 특이성을 가지는 것을 확인하였다. iELISA와 western blot법의 검출한계를 확인한 결과 고등어가 1% 첨가된 수준까지 검출할 수 있으며, 특히 3A5-2와 3A5-9번 항체는 1%에서도 높은 흡광도를 나타내어 민감도가 매우 높은 항체로 확인되었다. 따라서, 개발된 고등어 TSSP 특이항체를 이용한 iELISA법과 western blot법은 가공품에 혼입될 수 있는 식품 알레르겐인 고등어를 보다 신속하고 민감하게 분석할 수 있는 분석 도구로서 활용이 가능할 것으로 판단되며, 개발된 항체는 고감도 바이오센서 개발에 충분히 활용이 가능한 바이오인자로 확인되었다.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제21권1호
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• pp.47-54
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• 2017

Unlike mouse results, cloning efficiency of nuclear transfer from porcine induced pluripotent stem cells (piPSCs) is very low. The present study was performed to investigate the effect of cell cycle inhibitors on the cell cycle synchronization of piPSCs. piPSCs were generated using combination of six human transcriptional factors under stem cell culture condition. To examine the efficiency of cell cycle synchronization, piPSCs were cultured on a matrigel coated plate with stem cell media and they were treated with staurosporine (STA, 20 nM), daidzein (DAI, $100{\mu}M$), roscovitine (ROSC, $10{\mu}M$), or olomoucine (OLO, $200{\mu}M$) for 12 h. Flow Cytometry (FACs) data showed that piPSCs in control were in G1 ($37.5{\pm}0.2%$), S ($34.0{\pm}0.6%$) and G2/M ($28.5{\pm}0.4%$). The proportion of cells at G1 in DAI group was significantly higher than that in control, while STA, ROSC and OLO treatments could not block the cell cycle of piPSCs. Both of viability and apoptosis were affected by STA and ROSC treatment, but there were no significantly differences between control and DAI groups. Real-Time qPCR and FACs results revealed that DAI treatment did not affect the expression of pluripotent gene, Oct4. In case of OLO, it did not affect both of viability and apoptosis, but Oct4 expression was significantly decreased. Our results suggest that DAI could be used for synchronizing piPSCs at G1 stage and has any deleterious effect on survival and pluripotency sustaining of piPSCs.