• 공업화학
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• 제22권5호
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• pp.545-550
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• 2011

바이오 분자의 고정 링커로 전기전도도가 높은 방향족 공액구조의 4-(2-(4-(acetylthio)phenyl)ethynyl)benzoic acid (APBA) 분자를 합성한 후, APBA 자기조립 단분자막을 제작하였다. 제작한 APBA 자기조립 단분자막의 구조를 분석하였고, 페로센으로 고정화시킨 APBA의 자기조립 단분자막의 전기화학적 특성을 조사하였다. 부탄티올 단분자막에 APBA를 삽입시켜 혼합 단분자막을 제조하여 XPS로 금 기판에 대한 혼합 단분자막의 수직 배향성을 조사하였다. 또한, APBA 혼합 시간에 따른 APBA와 부탄티올(BT) 혼합 단분자막에 페로센을 고정화하여 전기화학적 산화 환원 특성을 조사하였다. 혼합 단분자막의 전기화학적 활성은 혼합 시간의 증가에 따라 증가하였고, 부탄티올 단분자막 기판을 APBA 용액에 36 h 침지시켰을 때 가장 높은 페로센 분자의 산화 환원 전류값을 얻었다.

• Molecules and Cells
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• 제45권12호
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• pp.911-922
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• 2022

A structural protein of SARS-CoV-2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2), nucleocapsid (N) protein is phosphorylated by glycogen synthase kinase (GSK)-3 on the serine/arginine (SR) rich motif located in disordered regions. Although phosphorylation by GSK-3β constitutes a critical event for viral replication, the molecular mechanism underlying N phosphorylation is not well understood. In this study, we found the putative alpha-helix L/FxxxL/AxxRL motif known as the GSK-3 interacting domain (GID), found in many endogenous GSK-3β binding proteins, such as Axins, FRATs, WWOX, and GSKIP. Indeed, N interacts with GSK-3β similarly to Axin, and Leu to Glu substitution of the GID abolished the interaction, with loss of N phosphorylation. The N phosphorylation is also required for its structural loading in a virus-like particle (VLP). Compared to other coronaviruses, N of Sarbecovirus lineage including bat RaTG13 harbors a CDK1-primed phosphorylation site and Gly-rich linker for enhanced phosphorylation by GSK-3β. Furthermore, we found that the S202R mutant found in Delta and R203K/G204R mutant found in the Omicron variant allow increased abundance and hyper-phosphorylation of N. Our observations suggest that GID and mutations for increased phosphorylation in N may have contributed to the evolution of variants.

• 대한의생명과학회지
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• 제12권2호
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• pp.73-79
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• 2006

Nebulin is a giant ($600{\sim}900$ kDa), modular sarcomeric protein proposed to regulate the assembly, and to specify the precise lengths of actin filamints in vertebrate skeletal muscles. Recently, There is an evidence that the nebulin also expressed in non muscle tissue, brain and liver. We identified a new isoform of nebulin from adult brain library by PCR screening. It contains two simple-repeats exon 165, 166 and linker-repeats exon $154{\sim}161$ except exon 159. The nebulin modules M160 to M170 (exon 150 to exon 161) has been shown to bind desmin. In mature striated muscle, desmin intermediate filaments surround Z-discs and link individual myofibrils laterally at their Z-discs and to other intracellular structures, including the costameres and the intercalated discs of the sarcolemma, sarcoplasmic reticulum, mitochondria, T-tubules, and nuclei. Therefore, it is an interesting possibility that the differential splice pathways within the linker region of nebulin modify the affinity of nebulin's interaction with desmin. The specific interactions of nebulin and desmin were confirmed in vivo by yeast two hybrid experiments. To verify in the cellular level the interaction between nebulin isoform and desmin, we transfected COS-7 cell with EGFP-tagged nebulin and DsRed-tagged desmin. Based on evidence showing that despite exon 159 was deleted, the new isoform of nebulin was interact with desmin. This suggest that nebulin in brain may interact with another intermediate filament. The conservation of these ligand-binding capacity in brain and skeletal nebulins suggest that nebulins may have conserved roles in brain and skeletal muscle.

• 생명과학회지
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• 제27권6호
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• pp.673-679
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• 2017

미세소관을 따라 이동하는 모터단백질들은 세포내 물질수송에 필수적인 역할을 한다. Kinesin 1은 세포내에서 미세소관을 따라 움직이는 모터단백질로서 다양한 소포, mRNA, 그리고 단백질의 세포내 수송에 관여한다. Kinesin 1은 2개의 장쇄단위체(KHCs, 또는 KIF5s)와 2개의 경쇄단위체(KLCs)로 구성되어 있다. KIF5s는 N-말단에 모터도메인을 가지고 있고 C-말단의 운반체 결합도메인을 통해 다양한 운반체와 결합한다. 본 연구에서 KIF5B와 결합하는 단백질을 분리하기 위하여 효모 two-hybrid 탐색을 수행한 결과 미세소관의 plus end 결합단백질인 cytoplasmic linker protein 170 (CLIP-170)을 분리하였다. CLIP-170의 coiled-coil 도메인은 KIF5B의 운반체 결합도메인과 결합하였다. 또한 CLIP-170은 KIF5A와 KIF5C와도 결합하였다. 그리고 glutathione S-transferase (GST) pull-down을 통해 KIF5s와 CLIP-170이 단백질수준에서 결합함을 확인하였다. 생쥐 뇌파쇄액을 KIF5B 항체로 면역침강한 결과 CLIP-170이 같이 침강함을 확인하였다. 이러한 결과들은 kinesin 1이 세포내에서 CLIP-170을 운반함을 시사한다.

• 미생물학회지
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• 제31권4호
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• pp.279-285
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• 1993

p53 유전자의 변화는 인간의 여러 암에서 가장 흔하게 발견되며 종양세포내에서는 이러한 변형된 p53 단백질의 양의 증가가 초래된다. 세포내에 축적된 p53 단백질의 발견은 인간의 암증세를 판단할 유용한 기중이 되기도 한다. 본 연구에서는 이러한 면역조직화학 검사에 쓰일 수 있는 폴리클로날 항체를 만들기 위햐여 사람의 p53 유전자를 glutathione S-transferase 와의 융합 단백질의 형태로서 대장균내에서 발현시켰다. p53 의 아미노산 1-158번을 코딩하고 있는 NeoI fragment 와 아미노산 159-393 번을 코딩하는 NocI-BamHI fragment 를 BamHI linker 를 이용하여 in frame 으로 pGEX-2T 의 BamHI 자리에 삽입하여 재조합 플라스미드 pGTNS 와 pGTNL 을 각각 만들었다. 또 PCR 에 의한 증폭에 의햐여 아미노산 38-145번을 코딩하는 유전자 부위를 증폭하였으며 BamHI 과 PvuII 로 절단하여 pGEX-2T의 BamHI 과 SmaI 자리에 삽입함으로써 pGTBP 를 제조하였다. 이들 재조합 균주들을 IPTG 로 4시간 induction 한 후 세포 추출물로부터 glutathione Sepharose bead 를 이용하여 융합단백질을 분리하였다. Bead 에 결합된 단백질은 10% SDS-polyacrylamide gel 에서 전기영동하였으며, 각각의 분자량은 54 kDa, 53 kDa 와 40 kDa 였다. 이러한 방법으로 1리터 배양으로부터 약 1mg 의 단백질을 정제하였다.

• Elastomers and Composites
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• 제44권1호
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• pp.76-83
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• 2009

본 연구는 비닐작용기의 위치가 다른 실리콘 프리폴리머와 수소작용기의 위치가 다른 가교제, 그리고 이들의 혼합사용이 제조된 치과용 폴리비닐실록산 고무인상재의 물성에 미치는 영향을 연구하였다. 한 종류의 중점도 프리폴리머를 사용한 실험군은 인장강도, 파단신율, 압축시 변형률이 다른 특성의 프리폴리머들을 혼합사용한 경우보다 낮은 값을 보였다. 측부와 말단에 수소작용기가 있는 CR210 가교제를 사용한 실험군은 측부에만 수소작용기가 있는 CR101 가교제를 사용한 실험군에 비해 압축시 변형률과 파단신율이 더 높았다. 측쇄에도 비닐기를 갖는 높은 비닐함량의 프리폴리머를 사용한 경우는 더 높은 인장강도를 보였지만, 경화 속도가 늦어서 임상 사용에 적합한 작업성을 갖는 치과용 인상재를 만들기 위해서는 이 성분이 경화시간에 미치는 영향과 이를 조절할 수 있는 방안에 대한 지속적인 연구가 필요하다고 생각한다.

• 대한의생명과학회지
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• 제10권1호
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• pp.23-29
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• 2004

Nebulin is a (Mr 600∼900 kDa) large actin-binding protein specific to skeletal muscle and thought to act as a molecular template that regulates the length of thin filaments. Cardiac muscles of higher vertebrates have been shown earlier to lack nebulin. Recently, full-length nebulin mRNA transcripts have been detected in heart muscle, but at lower levels than in skeletal muscle. Nebulin expression also was detected in the kidney, eye, and otic canal, suggesting that nebulin isoforms may also be expressed in these organs. We have searched for nebulin isoforms in brain of human using PCR and Northern blot. Here, we provide evidence that nebulin mRNA transcripts are expressed in brain. Seven nebulin isoforms (B, C, D, E, F, G and H form) are obtained in human skeletal muscle and four isoforms (B, C, G and H form) in human brain cDNA library. We cloned the 1.3 kb of nebulin fragment from human adult brain library by PCR. The identity of the PCR product was confirmed by sequence analysis. The partial brain nebulin sequence was 99% identical to the skeletal muscle cDNA as determined by Blast alignment. It contains two simple-repeats HR1, HR2 and linker-repeats exon l35∼143 except exon 140. It was different from skeletal muscle B form, which contain HR1 and HR8. These data suggest that nebulin isoform diversity occurs even more extensively than previously known, likely contributing to the distinct thin filament architecture of different striated muscles.

• Toxicological Research
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• 제17권
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• pp.109-115
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• 2001

Abrus agglutinin was purified from the kernels of Abrus precatorius by Sepharose 4B affinity column chromatography followed by Sephadex G-100 gel filtration column chromatography. About 1.25 g of abrus agglutinin was obtained from 1 kg of the kernels. The LD$_{50}$ of abrus agglutinin is 5 mg/kg of body weight, which is less toxic than that of abrin, 20$\mu\textrm{g}$/kg body weight. The amino acid sequence of abrus agglutinin was determined by protein sequencing techniques and deduced from the nucleotide sequence of a cDNA clone encoding full length of abrus agglutinin. There are 258 residues, 2 residues and 267 residues in the A-chain, the linker peptide and the B-chain of abrus agglutinin, respectively. Abrus agglutinin had high homology to abrin-a (77.8%). The 13 amino acid residues involved in catalytic function, which are highly conserved among abrin and ricin, were also conserved within abrus agglutinin. The protein synthesis inhibitory activity of abrus agglutinin ($IC_{50}$/ = 3.5 nM) was weaker than that of abrin-a (0.05 nM). By molecular modeling followed by site-directed mutagenesis showed that Pro199 of abrus agglutinin A-chain located in amphipathic helix H and corresponding to Asn200 of abrin A-chain, can induce bending of helix H. This bending would presumably affect the binding of abrus agglutinin A-chain to its target sequence GpApGpAp, in the tetraloop structure of 285 r-RNA subunit and this could be one of major factors contributing to the relatively weak protein synthesis inhibitory activity and toxicity of abrus agglutinin.n.

• 대한화학회지
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• 제22권5호
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• pp.304-310
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• 1978

혈장내의 중요한 성분인 몇가지 염들이 poly(2-hydroxyethyl methacrylate) 격막을 통과하는 상대투과계수($U_{re}$), 분배계수($K_D$), 확산계수($D_m$)등을 측정하였다. 이 격막을 제조할 때 cross-linker로서 사용된 tetraethylene glycol dimethacrylate(TEGDMA)의 함량은 중량비로 2.8%였다. 이 염들의 확산계수는 그 분자량이 증가함에 따라서 지수함수적으로 감소하였으며, 그 분자의 원통반지름(a)에 대해서는 요소를 제외하고는 직선적으로 감소하였다. 이와 같은 사실을 sieve pore filow 모델로서 설명하였다. 여러 온도에서 요소의 $U_{re}$와 $D_m$은 글리신, ${\beta}$-알라닌, D-글루코오스, 사카로스 및 말레산과 같은 다른 염들의 값보다 더 컸다. 이와 같은 결과는 이 poly(HEMA) 격막이 혈투석 응용에 적합하다는 사실을 보여 주었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제9권3호
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• pp.376-380
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• 1999

Constructs, encoding a single-chain variable fragment of a catalytic antibody 4f4f (scFv-4f4f) with glycosidase activity, were made by combining the coding sequences for the heavy and light chain variable domains with a sequence encoding a linker (GGGGS). Using three different plasmid systems, single-chain antibodies were expressed separately in Escherichia coli, demonstrating significant differences in the expression level and amounts in soluble form of the recombinant protein. The protein expression from pET3a-scFv-4f4f was up to 20% of the total soluble proteins and, more importantly, the proteins were mostly found in a soluble form. An SDS-PAGE analysis of the purified single-chain proteins, yielding higher than 5mg from a 1-1 culture, showed a single band corresponding to its molecular weight of 29,100. A preliminary study shows that the expressed scFv-4f4f is catalytically active. The catalytic parameters for the hydrolysis of p-nitrophenyl-$\beta$-D-glucopyranoside by scFv-4f4f are being investigated.