• 제목/요약/키워드: Microdeletion

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The first Korean case of 2p15p16.1 microdeletion syndrome, characterized by facial dysmorphism, developmental delay, and congenital hypothyroidism

  • Jin Young Cho;Tae Kwan Lee;Yoo Mi Kim;Han Hyuk Lim
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제19권2호
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    • pp.105-110
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    • 2022
  • The microdeletion syndrome of chromosome 2p15p16.1 (MIM: 612513) is an extremely rare contiguous gene deletion syndrome. Microdeletions of varying sizes in the 2p15-16.1 region are associated with developmental delay, intellectual disability, autism spectrum disorder, hypotonia, and craniofacial dysmorphism. Previous studies have identified two critical regions: the proximal 2p15 and distal 2p16.1 regions. BCL11A, PAPOLG, and REL genes play crucial roles in patients with 2p16.1 microdeletion. To our knowledge, only 39 patients have been reported as having 2p15p16.1 microdeletion syndrome. Here, we present another patient with 2p15p16.1 microdeletion syndrome. A nine-month-old boy was referred to our clinic for the psychomotor delay, facial dysmorphism, and congenital hypothyroidism. During his follow-up visits, he was diagnosed with global developmental delay, intellectual disability, abnormal behavior, hypotonia, microcephaly, and abnormal electroencephalography. Using a chromosomal microarray for genetic analysis, a novel, de novo, 622 kb microdeletion of 2p16.1 was identified as one of the critical regions of the 2p15p16.1 microdeletion syndrome. This is the first case of its kind in Korea. We have discussed our case and literature reviews to clarify the relationship between the genes involved and clinical phenotypes in 2p15p16.1 microdeletion syndrome.

1q21.1 microdeletion identified by chromosomal microarray in a newborn with upper airway obstruction

  • Kim, Yoon Hwa;Yang, Ju Seok;Lee, Young Joo;Bae, Mi Hye;Park, Kyung Hee;Lee, Dong Hyung;Shin, Kyung-Hwa;Kim, Seung Chul
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제15권1호
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    • pp.34-37
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    • 2018
  • A 1q21.1 microdeletion is an extremely rare chromosomal abnormality that results in phenotypic diversity and incomplete penetrance. Patients with a 1q21.1 microdeletion exhibit neurological-psychiatric problems, microcephaly, epilepsy, facial dysmorphism, cataract, and thrombocytopenia absent radius syndrome. We reported a neonate with confirmed intrauterine growth restriction (IUGR), micrognathia, glossoptosis, upper airway obstruction, facial dysmorphism, and eye abnormality at birth as well as developmental delay at the age of 1 year. These clinical manifestations, except for the IUGR and upper airway obstruction, in the neonate indicated a 1q21.1 microdeletion. Here, we report a rare case of a 1q21.1 microdeletion obtained via paternal inheritance in a newborn with upper airway obstruction caused by glossoptosis and tracheal stenosis.

남성 불임 환자에서 Y 염색체 미세 결손이 체외 수정 결과에 미치는 영향 (Effects of Y Chromosome Microdeletion on the Outcome of in vitro Fertilization)

  • 최노미;양광문;강인수;서주태;송인옥;박찬우;이형송;이현주;안가영;한호섭;이희정;김나영;유승연
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제34권1호
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    • pp.41-48
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    • 2007
  • 목 적: 무정자증이나 심한 희소정자증이 있는 남성 불임 환자에서 Y 염색체 미세 결손을 동반하는 경우 체외 수정 및 세포질내 정자 주입술과 배아 이식의 결과에 미치는 영향을 알아보고자 하였다. 연구방법: 후향적 실험군 -대조군 연구로, Y 염색체 미세 결손이 동반된 무정자증이나 심한 희소정자증이 있는 남성 불임 부부 14 쌍을 실험군으로 하였고 대조군으로는 남성 배우자가 무정자증이나 심한 희소정자증이 있지만 Y 염색체는 정상인 12 쌍의 불임 부부를 대상으로 하였으며, 이 두 군을 다시 정자 채취 방법에 따라 사정된 정자를 이용한 군과 고환 내 정자 추출술을 통해 정자를 채취한 군으로 분류하였다. 연구 결과로는 수정률, 등급이 우수한 배아 수, 착상률, 융모막성 성선자극호르몬 양성률, 초기 임신 소실률, 출생률을 비교하였다. 결 과: 등급이 우수한 배아 수, 착상률, 융모막성 성선자극호르몬 양성률, 초기 임신 소실률, 출생률은 Y 염색체 미세 결손이 있는 군과 정상 Y 염색체를 갖는 군 간에 차이가 없었으나, 수정률은 Y 염색체 미세 결손이 있는 불임 부부 (61.1%) 에서 정상 Y 염색체를 갖는 불임 부부 (79.8%, p=0.003) 보다 낮았다. 정자 채취의 방법에 따라 비교하였을 때, 고환 내 정자 추출술을 통해 정자를 채취한 경우 실험군 (52.9%) 에서 대조군 (79.5%, p=0.008) 보다 유의하게 수정률이 낮게 나타났으나 사정된 정자를 이용한 경우에는 실험군에서 대조군 보다 수정률이 더 낮은 경향을 보였으나 유의한 차이는 없었고, 나머지 결과들은 두 군 간에 차이가 없었다. 결 론: Y 염색체 미세 결손이 동반된 무정자증이나 심한 희소정자증이 있는 불임 부부에서 고환 내 정자 추출술을 통해 정자를 채취할 경우 체외 수정 및 세포질내 정자 주입술 결과 정상 Y 염색체를 갖는 불임 부부에서 보다 수정률이 더 낮게 나타났으나, 사정된 정자를 이용하는 경우나 고환 내 정자 추출술을 통해 정자를 채취하여 수정이 된 후에는 Y 염색체의 미세 결손이 체외 수정 및 세포질내 정자 주입술과 배아 이식의 결과에 영향을 주지 않는 것으로 보인다. 그러나 향후 대규모의 전향적 연구가 더 필요할 것으로 사료된다.

프래더 윌리 증후군의 유전학적 발병 기전에 따른 표현형 및 성장 호르몬 치료 효과에 관한 연구 (Phenotype-genotype correlations and the efficacy of growth hormone treatment in Korean children with Prader-Willi syndrome)

  • 배근욱;고정민;유한욱
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제51권3호
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    • pp.315-322
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    • 2008
  • 목 적 : PWS의 두 가지 대표적 유전형인 미세결실형과 mUPD (15)형에서, 유전형에 따른 표현형의 차이와 성장 호르몬 투여 효과의 차이를 비교해 보고자 하였다. 방 법 : 1990년 1월부터 2007년 1월까지 서울아산병원에서 15번 염색체의 미세 결실에 대한 FISH 검사 및 메틸화-특이 PCR 검사를 통해 PWS로 확진된 53명의 환자를 대상으로 하였다. 출생시 부모의 연령, 출생 체중, PWS의 주요 표현형인 신생아 시기의 저긴장증, 수유 문제, 남아의 경우 잠복 고환, 발달 지연 및 정신 지체, 저신장, 저색소증, 사시, 척추측만증 등의 유무, 성장 호르몬 치료 전과 치료 후의 신장, 체중, 체질량 지수의 변화를 조사하였고 미세결실형 군과 mUPD(15)형 군으로 나누어 유전형에 따른 차이를 분석하였다. 결 과 : 유전학적 검사상 53명의 대상 환아 모두 미세결실형 또는 mUPD(15)형으로 진단되었으며, 미세결실형은 39명, mUPD (15)형은 14명이었다. 평균 진단 연령은 $4.51{\pm}5.19$세였다. 출생 당시 부모의 연령은 mUPD(15)형 군에서 유의하게 높았으며(P=0.0001), 저색소증(P=0.0001)과 신생아기의 수유 부전(P=0.049)은 미세결실형에서 유의하게 많았으나, 그 외의 조사된 표현형에서는 두 군 간에 통계적으로 의미 있는 차이는 없었다. 성장 호르몬은 20명의 환아[미세결실형 14명, mUPD(15)형 6명]에게 평균 $27.9{\pm}11.9$개월 동안 투여되었다. 두 유전형 간에 성장 호르몬 치료 전 및 치료 후의 신장 SDS, 체중 SDS, 체질량지수, IGF-1, IGFBP3, 신장 증가 속도, 체중 증가 속도의 값에는 의미 있는 차이가 없었다. 결 론 : PWS의 주요한 두 유전형의 비교에서, 부모의 연령은 mUPD(15)형에서 의미 있게 높았으며 신생아기 수유 부전과 저색소증은 결실형에서 의미 있게 많았다. 성장 호르몬의 치료 효과에서는 두 유전형 간에 의미 있는 반응의 차이는 없었다. 향후 두 유전자형과 다른 표현형들(예를 들면 행동, 발달, 지능 등) 과의 연관성에 관한 전향적 연구가 더 필요할 것으로 생각된다.

The first Korean case of a newborn with 3p26 microdeletion and 5q35 microduplication inherited from paternal balanced translocation

  • Jang, Jin A;Sohn, Young Bae;Lee, Jang Hoon;Park, Moon Sung
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제18권1호
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    • pp.48-54
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    • 2021
  • Genetic imbalances are a major cause of congenital and developmental abnormalities. We report the first case of a 3p26 microdeletion and 5q35.2q35.3 microduplication in a newborn with multiple congenital anomalies evaluated using chromosomal microarray analysis (CMA) and fluorescence in situ hybridization (FISH). The patient was born at 30 weeks and 2 days of gestation with a body weight of 890 g. He had symmetric intrauterine growth restriction, microcephaly, facial dysmorphism (hypertelorism, blepharophimosis, mild low-set ears, high-arched palate, and micrognathia), and right thumb polydactyly. Echocardiography revealed an atrial septal defect and patent ductus arteriosus. Furthermore, CMA revealed a concurrent microdeletion in 3p26 and a microduplication in 5q35.2q35.3. FISH analysis showed that these genetic changes resulted from a translocation mutation between chromosomes 3 and 5. The patient's mother had mild intellectual disability, short stature, and facial dysmorphism, while his father had a normal phenotype. However, parental FISH analysis revealed that the asymptomatic father carried a balanced translocation of chromosomes 3p26 and 5q35. CMA and FISH tests are useful for diagnosing neonates with multiple congenital abnormalities. Further parental genetic investigation and proper genetic counseling are necessary in cases of chromosomal abnormalities inherited from parental balanced translocations.

The Effect of Jazf1 Overexpression in Zebrafish Cardiac Development

  • Shin, Mi-Jung;Yuh, Hyung-Soo;Seo, Byoung-Boo;Park, Hum-Dai;Yoon, Du-Hak;Ryoo, Zae-Young
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제35권4호
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    • pp.457-461
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    • 2011
  • JAZF1 (Juxtaposed with Another Zinc Finger gene 1) transcription factor are Zn-finger proteins that bind to the nuclear orphan receptor TAK/TR4 (Nakajima et al., 2004). The nuclear orphan receptor TAK1/TR4 functions as a positive as well as a negative regulator of transcription. It was recently reported that congenital cardiovascular malformations are significantly more frequent in Neurofibromatosis 1 (NF1) patients with microdeletion syndrome than in those with classical NF1. JAZF1 was expressed in adult heart of patients with microdeletion syndrome. JAZF1 is highly conserved among various species include zebrafish. We hypothesized that the expression of zebrafish Jazf1 may lead to severe forms of congenital heart disease that allow the survival of newborns and adults. In this study, we created Jazf1 transgenic zebrafish which over-express zebrafish Jazf1 cDNA under control of the CMV promoter. Our results suggested that Jazf1 expression may play an important role in zebrafish cardiac development.

A DiGeorge Syndrome with both Basal Ganglia Calcification with 22q11.2 Deletion

  • Kim, Young Han;Choi, Joong Wan;Ryu, Hye Won;Bae, Eun Ju;Oh, Phil Soo;Lee, Hong Jin
    • 대한유전성대사질환학회지
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    • 제14권2호
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    • pp.163-167
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    • 2014
  • DiGeorge syndrome is a disorder caused by microdeletion in chromosome 22q11.2 with various abnormalities including cardiac anomaly, facial dysmorphism, thymic and parathyroid hypoplasia, cleft palate and immune dysfunction. The frequency of hypocalcemia caused by hypoparathyroidism is known to be approximately 60% of DiGeorge syndrome. It is known that the disorder mostly occurs in the neonatal period and the symptoms are improved afterwards. Herein we report a case of DiGeorge syndrome only accompanied by hypocalcemia caused by hypoparathyroidism without other abnormalities. She was first diagnosed only at the age of 22 with basal ganglia calcification that had been discovered in brain CT (Computed tomography).

Y 염색체 미세결실과 정자형성장애의 연관성에 대한 연구 (Relationship between Microdeletions on the Y Chromosome and Defect of Spermatogenesis)

  • 이형송;최혜원;박용석;궁미경;강인수;윤종민;이유식;서주태;전진현
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제29권4호
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    • pp.303-310
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    • 2002
  • Objective s: To estimate the frequency of Y chromosome microdeletions in the Korean population of infertile men and to evaluate the relationship between microdeletion on the Y chromosome and clinical phenotypes of infertile men with idiopathic azoospermia and oligozoospermia. Materials and Methods: Genomic DNA was extracted from blood samples collected from 330 infertile men attending the Infertility Clinic at Samsung Cheil Hospital, Korea. Six sequence tagged sites (STSs) spanning the azoospermia factor (AZF) regions of the Y chromosome were amplified by polymerase chain reactions (PCRs). Results: Microdeletions on Y chromosome were detected in 35 (10.6%) of the 330 infertile men. Most of the microdeletions (91.4%) involved AZFb or AZFc. The high incidence of microdeletions were found in AZFc region (57.1%), but the low in AZFa (8.6%) and AZFb (5.7%). Larger microdeletions involving two or three AZF regions were detected in 28.6% of cases. All patients (6 patients) with deletion of AZFa region showed no germ cell phenotypes, Sertoli cell only syndrome or Leydig cell hyperplasia in histopathologic examinations. Conclusion: Microdeletions on the Y chromosome, especially, at AZFc/DAZ regions may be the major cause of azoospermia and severe oligozoospermia. We suggest that idiopathic infertile men have genetic counselling and microdeletion analysis on the Y chromosome before IVF-ET and ART program.

47,XXY와 46,XY 핵형을 가진 한국인 불임남성의 Y 염색체의 미세결실에 대한 비교 분석 (Comparative analysis of Y chromosomal microdeletions in Korean infertile men of 47,XXY and 46,XY karyotypes)

  • 허재원;김우영;김대수;하홍석;이자랑;최욱환;남기만;배화정;최진;김희수
    • 생명과학회지
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    • 제17권6호통권86호
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    • pp.741-747
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    • 2007
  • 무정자증 환자의 경우, 정확히 알려지지 않은 유전적인 요인들이 남성불임과 연관되어 있다. 그들 중 클라인펠트 증후군(KS)과 정상 핵형의 남성에게서 발견되는 Y염색체상의 미세결실 증상(YMNK)은 남성 불임의 가장 빈번한 원인이라고 할 수 있다. 본 연구는 한국인 집단에서 남성불임으로 고통 받고 있는 YMNK (66 개체)와 KS(30 개체) 환자들을 비교 분석 하였다. Y염색체 상의 AZFa,b,c 영역의 미세결실을 분석하기 위해 19개의 STS 프라이머를 이용해 PCR분석을 하였다. 실험 결과 YMNK의 34.9%와 KS의 73.4%가 미세결실을 포함하고 있었다. 이점으로 미루어보아 YMNK환자보다 KS환자의 경우가 Y염색체의 불안정성이 더욱 높은 것으로 사료된다. 결론적으로 미세결실을 포함하는 제놈의 불안정성은 정상적인 정자형성 과정을 방해하여 남성불임을 초래할 수 있을 것이다.