• 생명과학회지
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• 제19권10호
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• pp.1463-1467
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• 2009

Telomeres, comprised of tandem repeats of TTAGGG sequences, are special nucleoprotein structures that protect and stabilize chromosome ends. These structures form the crux of the telomere concept of aging, senescence and genomic instability. The classic terminal restriction fragment (TRF) analysis to quantify the amount of telomeric DNA is disadvantageous in species containing ultra long telomeres like in mice (100Kb). In this study, we used a more sensitive quantitative fluorescence in situ hybridization (Q FISH) technique to quantify telomeric DNA, and used it as a biological aging marker in mice. 12 litters each of Senescence-Resistant (SAMR1) and -Prone (SAMP1) known as senescence accelerated mouse strains were purchased from Central Lab, Animal Inc. We quantified the amount of telomeric DNA using telomere specific DNA probes on the two strains of male mice at 8 weeks, 18 weeks and 26 weeks of age. The amount of telomeric DNA correlated with aging and age associated changes in body and organ weight between SAMR1 and SAMP1 strains of mice. These data suggest the usefulness of the amount of telomeric DNA as a biological aging marker in human aging studies.

• 한국축산식품학회지
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• 제27권2호
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• pp.209-215
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• 2007

본 연구는 mt DNA 12S rRNA 유전자의 PCR-RFLP 분석기법을 이용하여 다양한 식육자원 및 각종 가공 육제품의 원료육에 대한 정확하고 재현성 높은 축종 및 육종 감별기술을 개발하기 위하여 수행되었다. 국내에서 유통되고 있는 9종류 축종(소, 돼지, 양, 염소, 말, 사슴, 닭, 오리 및 칠면조)의 육류로부터 12S rRNA유전자의 특정 염기서열을 포함하는 primer를 설계 제작하여 PCR-RFLP 분석을 실시하였다. 각 공시축의 근육조직으로부터 genomic DNA를 추출하고 PCR 증폭 반응을 수행한 후 얻어진 PCR 증폭산물(약 455 bp)을 Tsp5091와 MboI 제한효소로 각각 절단한 결과 Tsp5091 제한효소는 포유류 6종간에서 그리고 MboI 제한효소는 가금류 3종간에서 명확한 차이를 보이는 종 특이적인 PCR-RFLP profile을 검출하였다. 따라서 본 연구에서 개발한 12S rRNA 유전자의 종 특이적 DNA 분자표지는 각종 원료육 및 가공 육제품의 육종 및 축종 판별에 매우 유용한 동물 종 감별 DNA marker로 이용될 수 있을 것이다.

• 대한의생명과학회지
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• 제3권1호
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• pp.29-35
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• 1997

본 연구에서는 한국인 만성신부전증 환자에서 심혈관계 질환의 조기진단을 위한 생화학적 표지 자로서 homocysteine의 임상적 유용성을 검토하기 위하여, 만성신부전증 환자와 건강인에서 HPLC/FLD (high performance liquid chromatography/fluorescence detector)를 이 용하여 혈장 homocysteine 농도를 측정하고 그 결과를 비교하였다. 본 실험방법의 회수율은 98.6$\pm$5.8%를 나타내었으며, 0.2 nmol/L 보다 낮은 농도까지 측정이 가능하였고, 2~50 nmol/ml까지 직선성이 성립하였다 (correlation coefficient =0.9997). 한국인 중 건강한 정상인 (20명)과 만성신부전증 환자 (90명)에서 혈장 homocysteine은 각각 6.81$\pm$1.54 nmol/ml과 27.28$\pm$14.94 nmol/ml이었으며 , 환자군에서는 정상인군에 비하여 약 4배정도 높은 수치를 나타내었다 (p<0.05).본 실험의 결과로 볼 때 HPLC/FLD를 이용한 homocysteine 측정은 예민도와 재현성이 높아 routine 실험실 방법으로 유용성이 높을 것으로 생각되며, 또한 혈장 homocysteine의 측정은 만성신부전증 환자의 주요한 사망원인이 되는 폐쇄성 동맥질 환을 조기에 진단하거나, 혹은 homocysteine 농도를 저하시키는 치료를 실시 한 후 치료효과를 판단하기 위한 생화학적 marker로 활용될 수 있을 것으로 기대된다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제51권4호
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• pp.283-288
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• 2009

본 연구는 비육돈 268두를 대상으로 13번 염색체 중 POU1F1 intron 3영역의 유전자 Single Nucleotide Polymorphism(SNP)은 Msp I 제한효소에 의해서 구분된다. 직접 제작한 Primer로 POU1F1 유전자 중 intron 3영역을 증폭할 수 있도록 제작하였고, 823bp의 증폭산물을 기대할 수 있었다. 그 SNP 유전자형을 3개 군으로 분류하여 빈도 추정과 함께 육질관련 형질과의 연관성을 분석한 결과는 다음과 같다. POU1F1 SNP의 DD 유전자형은 84.33%로 가장 높은 출현율을 보인 반면에 CC 유전자형은 0.75%로 매우 낮게 나타났다. 대립유전자 D 빈도는 0.918로 매우 높게 출현하였으나, C 빈도는 0.082로 매우 낮게 출현하였다. Hardy-Weinberg 법칙에 따른 적합도 검정에서는 유의성 없이(p>0.05) 유전적 평형을 이루고 있는 집단임을 알 수 있었다. CD와 DD 유전자형 집단에서 등지방두께, 도체중, Hunter a 및 b값, 그리고 pH에서는 모두 유의한 차이를 보이지 않았으나, Hunter $L^*$값은 CD(37.26) 보다 DD(40.15) 유전자형 개체군에서 짙게 나타났고(p<0.05), 육색도판에 의한 육색은 DD(3.91) 보다 CD(5.09) 유전자형 개체에서 짙게 나타났다((p<0.001). 따라서 이러한 POU1F1 유전자의 SNP 유전자형은 돼지의 성장이나 도체관련 형질과의 연관성을 더욱 깊이 있게 탐색하여 명확한 구명으로 우량 돈육 생산을 위한 DNA marker로 활용되어야 할 것으로 사료된다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제50권4호
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• pp.445-456
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• 2008

텔로미어란 염색체 말단부에 TTAGGG의 반복 염기서열과 특정 단백질로 구성되어 있는 것으로 핵 내 염색체의 안정성에 작용을 하며 세포의 노화, 사멸 및 암의 발생과 관련이 있다. 텔로머레이스는 텔로미어의 길이를 일정하게 유지하기 위한 직접적 효소로서 telomeric DNA 합성에 관여하는 ribonucleoprotein이다. 본 연구에서는 한우와 Holstein종 136두를 대상으로 백혈구 세포를 이용하여 연령 별, 품종 별, 성 별 텔로미어 함량을 분석하였다. 또한 동일 연령에서 혈액, 간, 뇌, 심장, 신장 및 생식선 조직들의 텔로미어 함량과 텔로머레이스 활성도도 비교 분석하였다. Telomeric DNA의 양적분석은 양적형광접합보인법(Q-FISH)을 이용하였고, 텔로머레이스 활성도의 분석은 TRAP방법을 이용하였다. 분석 결과, 소의 백혈구 세포들에 있어 개체의 연령이 증가함에 따라 텔로미어의 함유율이 점진적이며 유의적으로 감소되는 양상을 보였고, 한우가 Holstein에 비해 텔로미어 함유율이 높게 나타나 품종 간 유의적 차이가 있었으며, 성 간에도 수컷이 암컷에 비해 유의적으로 높은 텔로미어 함유율을 나타내었다. 반면 동일 연령의 간, 심장, 신장, 폐, 혈액 세포내 텔로미어의 함유율은 차이가 없는 것으로 나타났다. 텔로머레이스 활성도는 태아의 모든 조직에서 비교적 강한 활성을 보였지만, 성 성숙이 된 18개월령에서는 생식선 조직을 제외한 나머지 조직에서 텔로머레이스 활성도는 현저하게 떨어져 조직별 세포의 증식성 특이성과 텔로머레이스 활성도간에는 밀접한 연관성이 있는 것으로 나타났다. 이상의 결과로서 세포내 텔로미어 양적 분포 양상 및 텔로머레이스 활성도를 이용하여 개체의 연령 지표 또는 생리적 표지의 개발 가능성을 제시하고 자 한다.

• 화훼연구
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• 제16권1호
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• pp.28-35
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• 2008

Hedera helix 11계통, Hedera rhombea 3계통, Fatshedera lizei 1계통, 그리고 Fatsia japonica 1계통을 수집하였다. RAPD primer 10개를 이용하여 수집된 3속의 재료들의 유전적 다양성을 측정하였다. 3속을 재료로 사용하여 밴드간 96.9%의 높은 다형성을 보였다. 총 97개의 RAPD 밴드를 이진화하여 UPGMA 방법을 이용하여 계통도를 작성하였다. Hedera helix 계통들은 모두 1개의 그룹에 속하였으며 8계통의 유전적 거리는 극도로 적었으며 나머지 3계통 역시 유전적으로 가까웠다. 하지만 형태적으로는 높은 다형성을 보였다. 따라서 수집된 유전자원을 이용한 돌연변이체 개발이 가능성이 있는 방법으로 제시되었다. Fatsia japonica는 유전적으로 관계성이 적어 다른 종들과 평균 0.63의 유전적 거리를 보였다. Hedera helix와 Fatsia japonica 속간 교배를 통하여 개발된 Fatshedera lizei는 Hedera rhombea 계통들과 함께 계통도에서 위치하였다.

• Reproductive and Developmental Biology
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• 제35권1호
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• pp.77-83
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• 2011

One-step dilution and direct transfer would be a practical technique for the field application of frozen embryo. This study was to examine whether Jeju Black Cattle (JBC, Korean Cattle) can be successfully cloned from vitrified and one-tep diluted somatic cell nuclear transfer (SCNT) blastocyst after direct transfer. For vitrification, JBC-SCNT blastocysts were serially exposed in glycerol (G) and ethylene glycol (EG) mixtures [10%, (v/v) G for 5 min., 10% G plus 20% EG (v/v) for 5 min., and 25% G plus 25% EG (v/v) for 30 sec.] which is diluted in 10% FBS added D-PBS. And then SCNT blastocysts were loaded in 0.25 ml mini straw, placed in cold nitrogen vapor for 3 min. and then plunged into $LN_2$. One-step dilution in straw was done in $25^{\circ}C$ water for 1 min, by placing vertically in the state of plugged-end up and down for 0.5 min, respectively. When in vitro developmental capacity of vitrified SCNT blastocyst was examined at 48 h after one-step dilution, hatched rate (56.4%) was slightly lower than that of control group (62.5%). In field trial, when the vitrified-thawed SCNT blastocysts were transferred into uterus of synchronized 5 recipients, a cloned female JBC was delivered by natural birth on day 299 and healthy at present. In addition, when the short tandem repeat marker analysis of the cloned JBC was evaluated, microsatellite loci of 11 numbers was perfectly matched genotype with donor cell (BK94-14). This study suggested that our developed vitrification and one-step dilution technique can be applied effectively on field trial for cloned animal production, which is even no longer in existence.

• 대한세포병리학회지
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• 제8권1호
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• pp.11-19
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• 1997

Clinical lymphadenopathies are subjected to fine needle aspiration cytology(FNAC) for diagnosing not only benign lesions but also malignant ones, as the first diagnostic procedure. While the diagnostic reliability in metastatic carcinoma is high, it is difficult to differentiate malignant lymphoma from reactive conditions. We evaluated the diagnostic reliability of FNAC in lymphadenopathy, and discuss the diagnostic limitation and its place in clinical practice in this study, Over 8 years from January 1988, FNAC of 1,216 lymphadenopathies were analyzed and among them 170 cases were compared with histopathology. The results are as follows. 1. Of ail the cases, 890 cases(73.2%) were diagnosed cytologically as benign, 312 cases(25.7%) as malignant, and 14 cases(1.1%) as unsatisfactory material. Reactive hyperplasia was diagnosed in 585 cases(65.7%) of the benign lesions, and among the malignant diseases, metastatic carcinoma was diagnosed in 248 cases(79.5%), and malignant lymphoma in 62 cases(19.9%). 2. The overall diagnostic accuracy was 89.2%, and no false positive case and 9 false negative results were observed among 170 cases which were proven by histopathology. Six cases of sampling error of false negative diagnoses included 3 of metastatic carcinomas and 3 of malignant lymphomas. The causes were difference between aspiration and biopsy site, poor fixation, or scanty cellularity with bloody smear. All 3 cases of misinterpretation error were malignant lympliomas, one of mixed type on biopsy which was diagnosed as reactive hyperplasia cytologically. In summary, FNAC technique is thought to be useful in the initial diagnosis of lymphadenopathies as well as in the follow-up of patients with known malignancy. Although the results of malignant lymphoma was less accurate than other malignant lesions, the application of strict cytologic criteria or lymphoid marker studies of aspiration material will reduce the false negative rate.

• 한국환경보건학회지
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• 제36권1호
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• pp.44-51
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• 2010

This study aimed to develop analytical method for 8-isoprostanes as biomarkers for oxidative stress with LC/MS/MS technique and to apply the method for human urine samples. Analyzed compounds for urinary oxidative stress markers were 7 stereo-isomers of prostaglandins and the internal standard (iso-$PGF_{2{\alpha}}-d_4$) was used to adjust the recovery rate. The method for determining urinary iso-$PGF_{2{\alpha}}$ consisted of solid phase extraction and LC/MS/MS detection. Separation of isomers of prostaglandins completed by porous graphitic carbon column and buffer solution. Detection limits for urinary markers of oxidative stress, iso-$PGF_{2{\alpha}}$ with LC/MS/MS were 0.01 ng/ml by S/N ratio 3 and 0.028 ng/ml by calculated as to FDA method. The recovery (92.8~101.9%) and precision (8.8~20.7%) of analysis were feasible for detecting iso-$PGF_{2{\alpha}}$ in real human urine samples. We detected 4 isomers of prostaglandins in human urine samples. Mean (standard deviation) of urinary iso-$PGF_{2{\alpha}}$ concentration were 0.231 (0.117) ng/mg creatinine for smoking group and 0.154 (0.082) ng/mg creatinine for non-smoking group.

• 대한세포병리학회지
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• 제9권1호
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• pp.15-20
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• 1998

Mutant form of the p53 gene product is abnormally accumulated in the nuclei of the tumor cells due to prolonged half life, and readily detected by immunohistochemical methods. To determine the positivity rate of p53 in body cavity fluid according the primary site and histological types of tumors and the utility of p53 immunostaining as an adjunct in the diagnosis of malignancy, we reviewed 69 effusions, including pleural effusion, ascitic fluid, and pericardial fluid, that were diagnosed as overt malignancy and 21 effusions of suspicious malignancy, immunohistochemistry was performed on paraffin-embedded cell blocks using a monoclonal antibody to p53 supressor gene product(Clone DO7) and a standard avidin-biotin complex technique with a citrate buffer antigen retrieval solution. The results were as follows; of the 46 pleural effusions with overt malignancy, 22 were immunopositive for p53 protein; of the 21 ascitic fluids with overt malignancy, 5 were positive for p53. Positivity rates according to the primary sites of tumors were 18 of 34(52.9%), 8 of 21(38.1%), 1 of 9(11.1%) cases of the tumors of the lung, GI tract, and ovary, respectively. According to the histologic types of lung cancer, 11 cases(61.6%) were positive out of 18 adenocarcinomas, 2 of 5 large cell undifferentiated carcinomas, and 1 of 2 small cell undifferentiated carcinomas. Of 21 cases of suspicious malignancy, 6 were positive for p53 and all of them(6/6) were confirmed as adenocarcinoma of the lung or GI tract. These findings indicate that p53 immunostaining using paraffin embedded cell block is useful diagnostic and prognostic marker in body fluid cytology although negative immunostaining does not exclude malignancy.