Kim, Sung-Hyun;Lee, Jae-Rin;Shin, Yong-Uk;An, Gyn-Heung;Kim, Seong-Ryong
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.9
no.4
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pp.475-481
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1999
The study of lignin, a major component of secondary cell wall, has been partly focused on its removal from the woody part in the kraft pulping industry. Cinnamyl alcohol dehydrogenase (CAD; EC 1.1.l95) catalyzes the synthesis of cinnamyl alcohols from corresponding cinnamaldehydes. A cDNA clone, MdCADl, encoding putative CAD from apples (Malus domestica Borkh. cv Fuji) was characterized in this study. The clone contains an open reading frame of 325 amino acid residues, which shows a greater than 80% identity with Eucalyptus CADl. MdCADl mRNA was detectable in vegetative tissues and was strongly expressed in the fruit. The expression pattern of MdCADl mRNA in the fruit peel after light exposure was also examined. The mRNA was rapidly increased until 1 day after light exposure and remained stable thereafter, suggesting that MdCADl is light inducible. The inducibility of the MdCADl gene was examined using several environmental stresses. Mechanical wounding of leaves increased the MdCADl mRNA level and the induction was further increased by salicylic acid. Southern blot hybridization showed that there is either one or a few copies of CAD genes in apples. To our knowledge, it is believed that MdCADl is the first CAD clone expressed predominantly in fruit.
Proceedings of the Korean Biophysical Society Conference
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2003.06a
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pp.70-70
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2003
Active sites and substrate bindings of 1-aminoxyclopropane-1-carboxylate oxidase (MD-ACO1) catalyzing the oxidative conversion of ACC to ethylene have been determined based on site-directed mutagenesis and comparative modeling methods. Molecular modeling based on the crystal structure of Isopenicillin N synthase (IPNS) provided MD-ACO1 structure. MD-ACO1 protein folds into a compact jelly roll shape, consisting of 9 ${\alpha}$-helices, 10 ${\beta}$-strands and several long loops. The MD-ACO1/ACC/Fe(II)/Ascorbate complex conformation was determined from automated docking program, AUTODOCK. The MD-ACO1/Fell complex model was consistent with well known binding motif information (HIS177-ASP179-HIS234). The cosubstrate, ascorbate is placed between iron binding pocket and Arg244 of MD-ACO1 enzyme, supporting the critical role of Arg244 for generating reaction product. These findings are strongly supported by previous biochemical data as well as site-directed mutagenesis data. The structure of enzyme/substrate suggests the structural mechanism for the biochemical role as well as substrate specificity of MD-ACO1 enzyme.
International journal of advanced smart convergence
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v.7
no.3
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pp.146-154
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2018
In this study we investigated antioxidant and anti-inflammatory activities of Malus Domestica (apple), Pyrus Communis L. (pear), Daucus carota L. (carrot), Brassica oleracea var. (broccoli), Brassica oleracea var. capitata (cabbage) and Raphanus sativus L. (radish), that were obtained from local market. As these are common fruits and vegetables that are widely consumed, we aimed to investigate their beneficial properties especially the antioxidant and anti-inflammatory. The samples were processed by an indirect heating method and their properties were compared to their raw forms. Based on DPPH and ABTS assay, processed samples showed better antioxidant activity compared to raw samples, and processed pear sample had the best antioxidant activity. The anti-inflammatory activities of the samples were also investigated in LPS-treated RAW 264.7 cells. The mRNA expressions of pro-inflammatory mediators and cytokines (iNOS, COX-2, $TNF-{\alpha}$, $IL-1{\beta}$ and IL-6) were assessed by RT-PCR. Processed samples exhibited better inhibition of iNOS, compared to the raw forms. Processed broccoli and cabbage samples exhibited outstanding anti-inflammatory effects. The samples did not exhibit cytotoxicity against RAW 264.7 cells up to 1mg/ mL as shown in the cell viability assay. Taken together, processed broccoli and cabbage samples exhibited the strongest anti-inflammatory properties.
Berries of Korean mistletoe (Viscum album var. coloratum [Kom.] Ohwi) contained one seed, which have, in general, one or two embryos but very rarely three embryos. Mucilaginous substances in berries may help them adhere to the branches of host trees. It was observed that seeds need more than one and half years to develop into normal and healthy seedlings from the time of inoculation. Many factors such as adhesion of berry, thickness of host branch, orientation of haustorial root, etc. influenced the successful development of mistletoe plants. Through the application of six-year observation results on the germination of seeds and growth of seedlings, about 80% of germination rate for mistletoe seeds and 61% of survival ratio for germinated seeds, which is more than 23 times higher in natural conditions, were obtained after inoculation of seeds on the one-year-old branches of Malus pumila var. dulcissima and Quercus mongolica trees. The technological aspects of the success can be applied to other host plants and provide a critical clue to an artificial propagation system, for this medicinally valuable genus. This is the first successful report on artificial inoculation and plant development of Korean mistletoe.
This study was conducted to investigate the influence of various calcium salts on the accumulation of calcium in apple fruits when sprayed on whole tree. Differences in the total calcium contents of fruits were found between calcium sources and cultivars. In 'Tsugaru' , calcium nitrate, calcium chloride, and calcium carbonate were all effective but only calcium chloride and calcium carbonate appeared to be effective in 'Fuji' . Major parts of the applied calcium were accumulated in the feel and outer flesh. Ethylene evolution of fruit was retarded during storage with the increase of total calcium content in 'Fuji' fruit treated calcium acetate.
The most effective cytokinin source for adventitious shoot regeneration of in vitro grown leaves from 'Gala' apple was BA with the concentration of 4.0 mg/L, while auxin source was IAA, IBA and NAA with the concentration of 0.1 mg/L, respectively. As the result of combinational treatment of BA and NAA, 6.0 or 8.0 mg/L BA with 0.5 mg/L NAA was effective for adventitious shoot regeneration from leaf tissues of 'Gala', 0.1 mg/L NAA + 8.0 mg/L BA and 1.0mg/L NAA + 8.0 mg/L BA for internode, and 0.1 mg/L NAA + 4.0 mg/L BA for petiole.
Alaniz, Sandra;Cuozzo, Vanessa;Martinez, Valentina;Stadnik, Marciel J.;Mondino, Pedro
The Plant Pathology Journal
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v.35
no.2
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pp.100-111
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2019
Glomerella leaf spot (GLS) caused by Colletotrichum spp. is a destructive disease of apple restricted to a few regions worldwide. The distribution and evolution of GLS symptoms were observed for two years in Uruguay. The recurrent ascopore production on leaves and the widespread randomized distribution of symptoms throughout trees and orchard, suggest that ascospores play an important role in the disease dispersion. The ability of ascospores to produce typical GLS symptom was demonstrated by artificial inoculation. Colletotrichum strains causing GLS did not result in rot development, despite remaining alive in fruit lesions. Based on phylogenetic analysis of actin, ${\beta}$-tubulin and glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gene regions of 46 isolates, 25 from fruits and 21 from leaves, C. karstii was identified for the first time causing GLS in Uruguay and C. fructicola was found to be the most frequent (89%) and aggressive species. The higher aggressiveness of C. fructicola and its ability on to produce abundant fertile perithecia could help to explain the predominance of this species in the field.
Kim, Hyun Hee;Mizuno, Kazuharu;Lee, Ho Sang;Koo, Jae Gyun;Kong, Woo Seok
Journal of Environmental Science International
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v.30
no.1
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pp.29-43
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2021
This study analyzed the status of climate-change indicator plants native to the main islands of the Korean peninsula, while elucidating their distribution characteristics. Information on flora from over 129 island locations, comprising more than 100 species of native plants, was collected, compiled into a database, and utilized as raw data. The distribution of 193 climate-change indicator plants was confirmed. The distribution area of broadleaf evergreen trees and ferns, including Mallotus japonicus and Cyrtomium falcatum, was relatively wide. In contrast, the distribution of common northern plants such as Corydalis turtschaninovii and Malus baccata was limited. If global warming persists, northern plant distribution is expected to decrease rapidly in the Korean Peninsula island region, while the northern limit line of the southern plants is expected to migrate further northward. During this process, it is likely that the plant congregation structure and species diversity within the island region will change dynamically. In this study, comparative analyses between species and regions were conducted by assessing the relative frequency of their occurrence, and six types of botanical geographic distribution patterns were noted.
Gwang-Jae Lim;Kallol Das;Hyeong-Jin Noh;Seong-Keun Lim;Young-Je Cho;Seung-Yeol Lee;Hee-Young Jung;Seong Hwan Kim
The Korean Journal of Mycology
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v.51
no.2
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pp.111-120
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2023
Three fungal strains designated as KNUF-23-MG32, KNUF-23-YC8, and KNUF-23-MJ82 were isolated from the abnormal symptomatic apple trees during screening fungal pathogens collected in Jeollanam-do and Gyeongsangbuk-do, Korea. These fungal strains were found to have similar cultural and morphological characteristics close to the genus Botryosphaeria. Morphological characteristics were matched with B. kuwatsukai CBS 135219 but different with B. dothidea KACC 45481 and B. sinensis HMAS 246714T. Pathogenicity tests of strain KNUF-23-MG32 showed that this strain causes rot in Fuji apples. Molecular phylogenetic analysis based on the sequences of the internal transcribed spacer (ITS) regions, translation elongation factor 1-alpha (TEF1α), and partial β-tubulin (TUB2) showed that these strains are B. kuwatsukai. To the best of our knowledge, this is the first report of an apple ring rot fungus Botryosphaeria kuwatsukai in Korea.
Diane Avalos-Ruiz;Gwang-Jae Lim;Seong-Keun Lim;Leonid N. Ten;In-Kyu Kang;Seung-Yeol Lee;Hee-Young Jung
The Korean Journal of Mycology
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v.50
no.4
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pp.255-262
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2022
In this study, the fungal strain KNUF-21-F39 was isolated from a declined apple tree (Malus domestica) in the Chungcheongbuk province in Korea. The strain KNUF-21-F39 presented a slow growth rate and a variety of macroconidia shapes and sizes ranging from ovoid to fusoid and 1- to 5-septate, primarily showing 3- and 4-septate, with "S" -shaped macroconidia rarely observed. The strain was identified based on morphological characteristics along with phylogenetic analysis performed using the internal transcribed spacer region (ITS) and partial sequences of translation elongation factor 1-α (tef1), RNA polymerase largest subunit (rpb1), and calmodulin (cal) genes. The fungal strain KNUF-21-F39 was identified as Fusarium diversisporum, which has not been previously reported in Korea. The ice nucleation activity (INA) of the strain was also evaluated, identifying the strain as positive for INA. This is the first report characterizing F. diversisporum as an IN-active fungal species.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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