• 제목/요약/키워드: MPI

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분리녹두단백질의 화학적 조성에 관한 연구 (Chemical Properties of Mungbean Protein Isolates)

  • 계인숙;전영수;최홍식
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제18권4호
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    • pp.423-429
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    • 1989
  • 선화녹두(sunhwa-nogdu ; SH)와 재래종 녹두(conventional variety ; C) 2품종의 분리녹두단백(mungbean protein isolate : MPI)을 제조하여, 이들의 아미노산 조성 그리고 용해도에 의한 단백질의 분획 및 분획된 단백질의 전기영동 패턴을 연구하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 즉, MPI의 아미노산조성을 보면 MPI-SH, MPI-C 둘 다 glutamic acid, aspartic acid의 함량이 높게 나타났으며, 함황아미노산의 함량은 낮게 나타났다. 한편 MPI의 아미노산조성은 원시료인 MBF와 거의 유사함을 나타내었고, 두 품종간에도 큰 차이가 없었다. 그리고 MPI를 용해도에 의하여 분별정량 했을 때 $87.6{\sim}92.9%$가 수용성 성분이었으며, prolamin, glutelin, residue는 MPI-C에서 0.25, 1.13, 10.74%로 MPI-SH의 0.25, 0.91, 5.63%에 비해 각각 높게 나타났다. 또한, 전분획의 전기영동 패턴을 살펴본 결과 $6{\sim}10$개의 band를 나타내며 $43,000{\sim}68,000\;dalton$ 범위의 분자량에 집중하는 경향을 나타내었다.

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Myrinet 상에서 VMMC를 기반으로 하는 효율적인 MPI 구현 (An Efficient Implementation of MPI over VMMC for Myrinet)

  • 김호중;맹승렬
    • 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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    • 제7권5호
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    • pp.539-547
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    • 2001
  • 클러스터 시스템의 성능을 향상시키기 위해서는 Myrinet과 같은 고성능 통신망 인터페이스가 필수적이다. 그러나 Myrinet에서 동작하는 저수준 통신 계층들은 각기 고유한 통신 방식을 사용하므로 호환성이 떨어진다. 따라서 MPI와 같은 통신 프로그래밍 표준을 효율적으로 구현하여 응용프로그램 수준에서 고성능과 호환성을 동시에 제공하여야 한다. 본 논문에서는 VMMC 통신 계층을 기반으로 MPI를 구현하였다. VMMC의 직접 저장 방식은 MPI의 Send/Recv 방식을 지원하기에 적합하지 않지만 본 논문에서는 두 가지 통신 방식을 변화하기 위한 송수신 큐 구조를 설계하고 늦은 위치 갱신, 선택적 무복사 전송 등의 최적화 기법을 적용함으로써 높은 전송성능을 얻는다. MPI-VMMC의 최대 전송 대역폭은 90.7Mbytes/sec이며 이는 VMMC 통신 계층의 최대 전송 성능의 95%에 달한다.

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분리 녹두 단백질과 이를 화학적으로 수식화한 단백질간의 식품학적 기능성 비교 (A Comparison Study on Functional Properties of Mungbean Protein and Chemically Modified Mungbean Protein)

  • 손경희;민성희;박현경;박진
    • 한국식품조리과학회지
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    • 제7권3호
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    • pp.53-59
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    • 1991
  • This study was carried out in order to investigate the change of protein functionalities such as foaming and emulsifying properties by succinylation of protein isolates. Succinylated and unsuccinylated munghean protein isolates were tested for finding out the effects of pH, heat treatment and sodium chloride concentration on the solubility, emulsion capacity, emulsion stability, foaming capacity, and foam stability. The results are summarized as follows: 1. Succinylation enhanced the solubility of MPI except at pH 4.5. When heated, succinylation greatly increased the solubility of succinylated MPI above $60^{\circ}C$. With the addition of NaCl, succinylation increased the solubility of MPI at acidic condition. 2. Emulsion capacity of succinylated MPI showed the lowest value at pH 7 and higher values at acidic and alkaine condition. when succinylated MPI was heated, emulsion capacity showed the highest at $80^{\circ}C$. With NaCl was added, emulsion capacity of succinylated MPI lincreased at pH 7, 9 or 11 decreased at pH 3 except addition of 1.0M NaCl. 3. Emulsion stability of MPI and succinylated MPI showed the highest at pH 4.5. Succinylation enhanced the emulsion stability of MPI at acidic condition. 4. The foaming capacity of MPI was increased at pH 3, 7 or 9 by succinylation. 5. When heated, foam stability of MPI and succinylated MPI showed the highest at pH 4.5 and at pH 11, respectively. When heated, both proteins showed the highest stability at $100^{\circ}C$.

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분산 메모리 시스템에서 압력방정식의 해법을 위한 MPI와 Hybrid 병렬 기법의 비교 (Comparison of Message Passing Interface and Hybrid Programming Models to Solve Pressure Equation in Distributed Memory System)

  • 전병진;최형권
    • 대한기계학회논문집B
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    • 제39권2호
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    • pp.191-197
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    • 2015
  • 본 연구에서는 분산 메모리시스템에서의 압력 방정식의 병렬해법을 위하여 MPI(Message Passing Interface)와 하이브리드 병렬기법을 사용하였다. 두 모델은 영역분할 기법을 활용하며, 하이브리드 기법은 성능이 양호한 두 가지 영역분할에 대해 수행하였다. 두 병렬기법의 성능을 비교하기 위해서 다양한 문제 크기에 대해 최대 96개의 쓰레드를 사용하여 속도향상을 측정하였다. 병렬 성능은 캐쉬 메모리에 따른 문제의 크기 및 MPI 통신, OpenMP 지시어의 부하에 대해 영향을 받음을 확인하였다. 문제의 크기가 작은 경우에는 쓰레드가 증가할수록 MPI 통신 및 OpenMP 지시어 부하에 대한 비율이 상대적으로 크기 때문에 병렬 성능이 좋지 않으며, MPI 통신 부하보다는 OpenMP 지시어 부하가 상대적으로 크므로 MPI 병렬 기법의 병렬 성능이 더 우수하다. 문제의 크기가 큰 경우에는 캐쉬 메모리의 활용도가 높고 MPI 통신 및 OpenMP 지시어 부하에 대한 비율이 낮아 병렬 성능이 좋으며, OpenMP 지시어보다 MPI 통신에 의한 부하가 더 지배적이어서 하이브리드 병렬 성능이 MPI 병렬 성능보다 더 양호하다.

MPI와 OpenMP기반 하이브리드 모델을 이용한 항공 레이저 스캐닝 자료의 병렬 처리 (Parallel Processing of Airborne Laser Scanning Data Using a Hybrid Model Based on MPI and OpenMP)

  • 한수희;박일석;허준
    • 한국측량학회지
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    • 제30권2호
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    • pp.135-142
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    • 2012
  • 본 연구에서는 대용량 항공 레이저 스캐닝 자료로부터 DSM(Digital Surface Model) 및 DTM(Digital Terrain Model)을 효율적으로 생성하기 위하여 다중 코어 피씨클러스터(PC-Cluster)에 기반한 병렬처리방식을 제안하였다. 이를 위하여 MPI(message passing interface)만을 사용하는 기존 MPI 모델을 변형하여 MPI와 OpenMP를 병용한 하이브리드(hybrid) 모델을 제작하였으며 다중 코어 피씨클러스터에서 그 성능을 평가하였다. 결과적으로, 하이브리드 모델과 기존 모델을 비교하였을 때 DSM을 생성하기 위한 보간에서는 다소 불리하지만 MPI 호출을 줄임으로써 전반적인 성능을 향상시킬 수 있었다. 아울러, 불규칙한 항공 레이저 스캐닝 자료의 분포로부터 발생하는 코어간 부하 불일치를 OpenMP의scheduling 기능을 통해 조절함으로써 하이브리드 모델의 성능을 향상시킬 수 있었다.

동기 병렬연산을 위한 응용수준의 결함 내성 연산시스템 (An Application-Level Fault Tolerant System For Synchronous Parallel Computation)

  • 박필성
    • 인터넷정보학회논문지
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    • 제9권5호
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    • pp.185-193
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    • 2008
  • 대규모 병렬 시스템의 MTBF(moon time between failures)는 아주 짧아 겨우 수 시간 단위에 불과하여 장시간의 연산 도중 연산 실패로 끝나 소중한 계산 시간이 낭비되는 경우가 많다. 그러나 현재의 MPI(Message Passing Interface) 표준은 이에 대한 대안을 제시하지 않고 있다. 본 논문에서는, 비표준의 결함 내성 MPI 라이브러리가 아닌 MPI 표준 함수들만을 사용하여, 일반적인 동기 병렬 연산에 적용할 수 있는 응용 수준의 결함 내성 연산 시스템을 제안한다.

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MPI 집합통신 성능 향상 연구 동향 (Research Trends for Improving MPI Collective Communication Performance)

  • 안후영;박유미;김선영;한우종
    • 전자통신동향분석
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    • 제37권6호
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    • pp.43-53
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    • 2022
  • Message Passing Interface (MPI) collective communication has been applied to various science and engineering area such as physics, chemistry, biology, and astronomy. The parallel computing performance of the data-intensive workload in the above research fields depends on the collective communication performance. To overcome this limitation, MPI collective communication technology has been extensively researched over the last several decades to improve communication performance. In this paper, we provide a comprehensive survey of the state-of-the-art research performed on the MPI collective communication and examine the trends of recently developed technologies. We also discuss future research directions for providing high performance and scalability to large-scale MPI applications.

가상버스 네트워크를 위한 MPI/VBus (MPI/Vbus for Virtual Bus Network)

  • 최현진;김봉완;박규호
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2001년도 가을 학술발표논문집 Vol.28 No.2 (3)
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    • pp.883-885
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    • 2001
  • Wave Pipelining(WP) 기법을 적용한 가상버스(Virtual Bus) 네트워크 구조는 병렬 컴퓨팅에서 중요한 메시지의 긴급성을 효과적으로 지원한다. 우리는 효율적인 통신을 지원하는 가상버스에 적합하도록 MPI를 설계, 구현(MPI/VBus)하였다. 또한, MPI/Vbus와 디바이스 드라이버가 메시지 큐들을 커털 영역에서 공유하도록 설계함으로써 사용자 레벨 통신(User Level Communication)을 쉽게 구현할 수 있도록 했다.

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사용자 수준의 통신을 이용한 MPI의 성능 향상 (Enhanced performance of MPI using user-level communication)

  • 홍석래;최경희;정기현;문경덕
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2000년도 가을 학술발표논문집 Vol.27 No.2 (3)
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    • pp.70-72
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    • 2000
  • MPI는 분산 환경에서 동작하는 병렬 프로그램을 작성하기 위한 표준을 제안하고 있다. 기존의 MPICH는 운영체제가 제공하는 통신 메커니즘 위에 MPI 고유의 통신 메커니즘을 구현하고 있다. 운영체제를 경유하는 통신 메커니즘은 자료 송수신이 많은 분산 프로그램의 성능에 상당한 오버헤드로 작용된다. 이에 본 연구에서는 운영체제를 경유하지 않고도 분산 시스템간의 통신이 가능하도록 사용자 수준의 통신 메커니즘을 제공하는 VIA에 기반을 둔 MPI를 제안한다.

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이기종 클러스터 시스템에서 Cilk와 MPI 특성 비교 (Comparing Cilk and MPI on a heterogeneous cluster system)

  • 이규호;김준성
    • 전자공학회논문지CI
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    • 제44권4호통권316호
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    • pp.21-27
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    • 2007
  • 최근 수년간의 급속한 기술의 발전과 대량생산 체제의 영향으로 개인용 컴퓨터와 간단한 네트워크 장비를 이용한 클러스터 시스템 구현이 용이해졌으나 개인용 컴퓨터의 교체 주기가 짧아짐에 따라 시스템 구성을 자유롭게 할 수 있는 클러스터 시스템의 이기종화를 초래하였다. 이기종 클러스터 시스템을 이용하여 구축된 병렬처리 시스템의 경우 그 성능을 효율적으로 사용하기 위해서는 각 노드의 성능을 고려한 작업 관리가 필요하다. 본 연구에서는 이기종 클러스터 시스템에서 MPI와 Cilk 병렬처리 시스템의 특성을 성능측면에서의 speedup과 활용도측면에서의 프로그램 코드의 복잡도를 정량적으로 살펴보았다. 실험에 따르면 작은 데이터를 이용하는 경우 Cilk가, 큰 데이터를 이용하거나 정규화된 데이터 교환 형태를 갖는 경우 MPI가 더 좋은 성능을 보였으며 코드 복잡도의 경우 Cilk가 간결한 프로그래밍 스타일을 제공함을 보였다.