• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제32권11호
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• pp.1427-1434
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• 2022

Two novel, halotolerant strains of Martelella soudanensis, NC18^T and NC20, were isolated from deep subsurface sediment, deeply sequenced, and comparatively analyzed with related strains. Based on a phylogenetic analysis using 16S rRNA gene sequences, the two strains grouped with members of the genus Martelella. Here, we sequenced the complete genomes of NC18^T and NC20 to understand the mechanisms of their halotolerance. The genome sizes and G+C content of the strains were 6.1 Mb and 61.8 mol%, respectively. Moreover, NC18^T and NC20 were predicted to contain 5,849 and 5,830 genes, and 5,502 and 5,585 protein-coding genes, respectively. Both strains contain the identically predicted 6 rRNAs and 48 tRNAs. The harboring of halotolerant-associated genes revealed that strains NC18^T and NC20 might tolerate high salinity through the accumulation of potassium ions in a "salt-in" strategy induced by K⁺ uptake protein (kup) and the K⁺ transport system (trkAH and kdpFABC). These two strains also use the ectoine transport system (dctPQM), the glycine betaine transport system (proVWX), and glycine betaine uptake protein (opu) to accumulate "compatible solutes," such as ectoine and glycine betaine, to protect cells from salt stress. This study reveals the halotolerance mechanism of strains NC18^T and NC20 in high salt environments and suggests potential applications for these halotolerant and halophilic strains in environmental biotechnology.

• 대한한방부인과학회지
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• 제22권2호
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• pp.94-118
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• 2009

Purpose: Gleditsiae spina (GS) has been used to treat patients with several diseases such as carbuncle, swelling and parasites. Recently GS is known to have anticancer activity in abdominal solid tumor, but the effects of GS on breast cancers is not clarified. For these reasons, we investigated effects of Gleditsiae spina (GS) on gene expression of human breast cancer cells. Methods: We investigated the effects of GS on proliferation of breast cancer cell line, MDA-MB-231. In addition, the genetic profile for the effect of GS on breast cancer cells was measured using microarray technique, and the functional analysis on these genes was conducted. Results: Total 1,434 genes were up-regulated and 2,483 genes down-regulated in the cells treated with GS. Genes induced or suppressed by GS were all mainly concerned with metabolic process, regulation of biological process and protein binding. The network of total protein interactions was measured using cytoscape program, and some key molecules that can be used for elucidation of therapeutical mechanism of medicine in future were identified. Conclusion: These results suggest possibility of GS as anti-cancer drug for breast cancer, and also suggest that related mechanisms are involved in regulation of intra-cellular metabolism in breast cancer cells.

• 한국수자원학회:학술대회논문집
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• 한국수자원학회 2020년도 학술발표회
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• pp.110-110
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• 2020

최근 낙동강유역에서는 여름철 폭염 및 가뭄의 영향으로 조류대경보가 발령되고 있으며, 급격한 수질환경적 변화가 이루어지고 있다. 본 연구대상유역인 낙동강에서도 가뭄으로 인해 녹조가 발생하여 조류경보가 발령되었다. 남조류의 대발생은 대량 번성 및 사멸에 따라 수체 내 산소 고갈 및 유기물 증가와 같은 문제를 야기하고 있다. 또한 남조류가 분비하는 독성물질 또한 수생태계와 인체에 유해하다. 그리고 인체에는 무해하다고 밝혀졌지만 수돗물 등에서 흙냄새와 같은 좋지 않은 냄새를 유발하는 냄새물인 지오스민, 2-MIB을 분비하여 정수공급체계의 악영향을 미친다. 본 연구대상 지점인 낙동강은 다기능 보 건설로 인해 하천 수심이 증가하고 유속이 느려지면서 정체성 수역 특성을 나타내고 있다. 이는 호소성 수역 특성을 나타내고 있음과 동시에 녹조발생과 같은 수질환경적 변화가 이루어지고 있다는 것을 의미한다. 본 연구에서 시각화 분석을 통해 낙동강 하류 남조류 발생현황을 분석하였으며, 랜덤포레스트를 이용하여 지점별 남조류 발생 주요 영향인자를 도출하였다. 조류경보제 발생 등급은 발령기준으로 관심, 위험, 대발생으로 구분된다. 학습데이터로 관심단계 기준인 남조류세포수 1,000 cell/mL 보다 작게 측정된 데이터들은 관심미만의 데이터로 Normal 등급으로 구분하였다. 구분된 발생등급을 범주형 변수로 설정하여 학습 데이터를 통해 모형을 구축하고 검증 데이터를 이용하여 모형 정확성을 평가하였다. 본 연구를 통해 조류발생 주요 영향인자를 도출하고 변수별 중요도를 평가를 통해 지점별 녹조 발생특성을 비교 분석하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제33권11호
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• pp.1437-1447
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• 2023

A recently bioinformatic analysis of genomic sequences of fungi indicated that fungi are able to produce more secondary metabolites than expected. Despite their potency, many biosynthetic pathways are silent in the absence of specific culture conditions or chemical cues. To access cryptic metabolism, 108 fungal strains isolated from various sites were cultured with or without Streptomyces sp. 13F051 which mainly produces trichostatin analogues, followed by comparison of metabolic profiles using LC-MS. Among the 108 fungal strains, 14 produced secondary metabolites that were not recognized or were scarcely produced in mono-cultivation. Of these two fungal strains, Myrmecridium schulzeri 15F098 and Scleroconidioma sphagnicola 15S058 produced four new compounds (1-4) along with a known compound (5), demonstrating that all four compounds were produced by physical interaction with Streptomyces sp. 13F051. Bioactivity evaluation indicated that compounds 3-5 impede migration of MDA-MB-231 breast cancer cells.

• 한국토양비료학회지
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• 제29권1호
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• pp.20-25
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• 1996

우리나라에서 재배되고 있는 약용작물인 당귀, 황기, 길경, 작약, 더덕, 천궁, 시호 등 약용작물 재배지 토양 254점을 '93년도에 채취하여 토양의 화학성을 분석 검토한 결과는 다음과 같다 1. 약초재배지 토양의 화학적성 질은 평균치로 pH 5.6, O.M 3.0%, 유효태 $P_2O_5$ 405mg/kg. 치환성 K $0.67cmol^+/kg$, 치환성 Ca $6.3cmol^+/kg$, 치환성 mg $1.6cmol^+/kg$이 었다. 2. 조사토양 전체의 pH는 5.1-6.0범위에 많이 분포하였으며 특히 당귀. 길경, 더덕 재배지 토양은 pH 6.0이하가 83-91%나 되어 산성토양으로 나타났다. 3. 유기물의 분포비율은 2.0-4.0% 수준. 유효태 $P_2O_5$,의 분포비율은 500mg/kg이상의 수준에서 많았고 토양의 유기물 및 유효태 $P_2O_5$함량은 길경재배지에서 낮았다. 4. 치환성 양이온의 함량수준별 분포비율은 Ex.K가 $0.2-0.8cmol^+/kg$수준에서 고른 분포를 보인 반면 Ex.Ca와 Ex.MB의 경우는 각각 $2.1-4.0cmol^+/kg$, $0.50-2.00cmol^+/kg$수준에서 높았고. 작물별 토양의 양이온함량은 황기재배지에서 높았고 길경, 더덕재배지에서 낮았다.

• Journal of Chest Surgery
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• 제47권3호
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• pp.233-239
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• 2014

Background: As hypertrophied myocardium predisposes the patient to decreased tolerance to ischemia and increased reperfusion injury, myocardial protection is of utmost importance in patients undergoing aortic valve replacement (AVR) for severe aortic valve stenosis (AS). Methods: Consecutive 314 patients (mean age, $62.5{\pm}10.8$ years; 143 females) with severe AS undergoing isolated AVR were included. Postoperative myocardial injury (PMI) was defined as 1) maximum postoperative creatinine kinase isoenzyme MB or troponin-I levels ${\geq}10$ times of reference, 2) postoperative low cardiac output syndrome or episodes of ventricular arrhythmia, or 3) left ventricular ejection fraction of less than 55% and decrease in left ventricle (LV) ejection fraction of more than 20% of the baseline value. Results: There were 90 patients (28.7%) who developed PMI. There were five cases of early death (1.6%), all of whom had PMI. On multivariable analysis, the use of histidine-tryptophan-ketoglutarate (HTK) solution instead of blood cardioplegia (odds ratio [OR], 3.06; 95% confidence interval [CI], 1.63 to 5.77; p=0.001), greater LV mass (OR, 1.04; 95% CI, 1.01 to 1.07; p=0.007), and increased cardiac ischemic time (OR, 1.13; 95% CI, 1.05 to 1.22; p<0.001) were independent predictors for PMI. Patients who had PMI showed significantly inferior long-term survival than those without PMI (p=0.049). Conclusion: PMI occurred in a considerable proportion of patients undergoing AVR for severe AS and was associated with poor long-term survival. HTK cardioplegia, higher LV mass, and longer cardiac ischemic duration were suggested as predictors of myocardial injury.

• Journal of Chest Surgery
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• 제38권8호
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• pp.551-556
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• 2005

배경: 완전 동맥 무인공 심페 바이패스 관상동맥우회술(OPCAB)에서 하나 혹은 두 개의 동맥 이식편을 사용한 연쇄 문합(Sequential graft)의 결과는 우수한 것으로 보고되고 있다. 하지만 충분하지 않은 이식편의 길이나 관류저하, 이식편의 굴절, 이식편의 부자유스런 경로 등이 문제점이 될 수 있다. 이러한 문제점들을 해결하기 위해 연쇄 문합대신 다중 복합 Y동맥 이식편(Multiple Y composite Graft)을 사용했으며 이방법의 유용성과 임상적 결과를 분석하였다. 대상 및 방법: 2003년 2월부터 2004년 10월까지 다중 복합 Y동맥 이식편을 이용한 완전 동맥 무인공 심폐 바이패스 관상동맥우회술을 시행 받은 71명의 환자를 대상으로 하였으며, 사용한 동맥은 좌, 우내유동맥과 요골동맥이었다. 대부분 좌내유동맥을 inflow 동맥으로 사용했으며, 그 외 좌, 우내유동맥을 동시에 혹은 우내유동맥을 inflow동맥으로 사용하였다. 모든 동맥을 획득한 후 요골동맥은 원위 문합 부위에 맞게 길이를 측정하여 원위부 문합 수에 따라 분절로 나누었다. 그 중 하나를 내유동맥에 Y 문합하고, 다른 요골동맥 분절은 이미 문합한 요골동맥 이식편에 다시 Y문합하는 방법으로 다중 복합 Y동맥 이식편을 완성하였다. 완성된 이식편을 각각의 원위부 문합 부위에 end to side형태의 문합을 시행하였다. 수술 후 총 61명 의 환자에서 multi-slice컴퓨터 단층촬영을 시행하여 이식편의 개통률을 조사했다. 결과: 환자들의 평균나이는 $61.6\pm9.4$세(34$\sim$79세)였고 이 중 57명이 남자였다. 평균 $2.5\pm0.6$개의 동맥이 사용됐으며 $3.7\pm0.7$개의 원위부 문합을 시행하였다. 수술 후 심근경색이나 저관류증과 같은 심각한 합병증이나 사망한 환자는 없었다. 수술 후 평균 CK-MB치는 $17.4\pm29.7\;IU/L$였다. 전체적인 이식편의 개통률은 $99.1\%\;(214/216)$(좌내유동맥 $100\%$, 요골동맥. $98.4\%$, 우내유동맥: $100\%$)를 보였다. 결론: 다중 복합 Y 동맥 이식편을 이용한 완전 동맥 무인공 심폐 바이패스 관상동맥우회술을 기술적인 문제점 없이 시행할 수 있었으며, 우수한 초기 임상 결과와 개통률을 보였다. 저자들은 특히 심장의 둔각 모서리 부위의 우회술시에 기존의 연쇄 문합에 비해 기술적으로 더 용이하며 복잡한 관상동맥우회술이 필요한 환자에게도 도움이 될 것으로 생각한다.

• 한국축산식품학회지
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• 제28권2호
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• pp.138-145
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• 2008

본 연구는 한우에게 옻나무 분말, 규산염 및 크롬메티오닌을 급여하고 도축하여 생산한 쇠고기의 육질을 비교하고자 실시하였다. 26개월령 거세 한우들에게 각각 옻나무 분말 4%, 옻나무 분말 4%+크롬메티오닌 400 ppm, 규산염 1.4%,그리고 규산염 0.14%+크롬메티오닌 400 ppm이 혼합된 사료를 도축전 4개월 동안 급여한 다음 등심(M. longissimus) 부위를 $4{\pm}0.2^{\circ}C$에서 7일 동안 저장하였다. 조지방 함량은 규산염 및 규산염+크롬메티오닌 급여구들에서 높았으며(p<0.05), 보수력 및 연도는 규산염+크롬메티오닌 급여구가 가장 높았다(p<0.05). 지방산 조성은 규산염 및 규산염+크롬메티로닌 급여구들의 다가불포화지방산 함량이 낮았으며(p<0.05), 단가불포화지방산은 규산염+크롬메티오닌 급여구가 가장 낮았다(p<0.05). 저장중 TBARS 및 MetMb은 규산염, 규산염+크롬메티오닌 및 옻나무+크롬메티오닌 급여구들에서 억제되었다. 표면육색은 저장기간 동안 규산염+크롬메티오닌 급여구가 가장 높은 L값, a값, b간, C값 및 총육색을 보였으며, 규산염 및 옻나무+크롬메티오닌 급여구들의 L, a, b, C 및 총육색이 옻나무 급여구보다 높았다(p<0.05). 결론적으로 한우에게 규산염을 급여하면 옻나무 급여보다 지방 함량, 색택 및 산화안정성이 높았지만, 다가불포화지방산은 낮았다. 또한 규산염과 크롬메티오닌을 함께 급여하면 규산염 단독 급여보다 보수력, 연도 및 색택이 높았지만, 단가불포화지방산은 낮았다.

• Journal of Chest Surgery
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• 제40권6호
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• pp.399-406
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• 2007

배경: 개심술 시 불충분한 심근 보호로 인한 허혈과 재관류 손상은 술 후 심실 기능과 예후에 영향을 미친다. 본 저자들은 승모판막 수술에서 HTK 용액과 냉혈 혈성 심정지액이 심근 보호와 임상 결과에 미치는 영향을 전향적으로 비교 분석하였다. 대상 뜻 방법: 승모판막폐쇄부전으로 승모판막수술을 받는 70명의 환자 중 8명의 환자를 제외한 31명에서 HTK 용액을(HTK군), 31명에서 냉혈 혈성 심정지액을(CBC군) 사용하였다. 수술 중과 후에 환자의 혈역학, 심혈관계 약물과 심장박동조율기의 사용, 임상경과 및 합병증을 관찰하였다. 모든 환자에서 최소 6개월 이상 사망률과 이환율을 추적 관찰하였다. 결과: 혈역학적 변수는 평균폐동맥압, 중심정맥압과 폐모세혈관쐐기압이 체외순환으로부터 이탈 후 시기에 HTK군에서 유의하게 낮았던 점을 제외하고는 모든 시기에서 군 간 차이가 없었다. 심근수축제와 심장박동조율기의 사용은 모든 시기에서 군 간 차이가 없었다. 수술 후 1일과 2일째 CK-MB 수치는 HTK군에서 $77{\pm}54,\;41{\pm}23$ (ng/mL)로 CBC군의 $70{\pm}69,\;44{\pm}34$ (ng/mL)와 유의한 차이가 없었다. 6개월 이상의 추적관찰 중 임상경과는 비슷하였다. 결론: 이상의 결과에서 HTK 용액은 냉혈 혈성 심정지액과 비슷한 심근 보호효과를 가짐을 확인할 수 있었다.