• 제목/요약/키워드: MIB-1

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Whole Genome Sequencing and Gene Prediction of Cynodon transvaalensis

  • Sol Ji Lee;Chang soo Kim
    • 한국작물학회:학술대회논문집
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    • 한국작물학회 2022년도 추계학술대회
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    • pp.237-237
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    • 2022
  • Cynodon transvaalensis belongs to the warm-season grasses and is one of the economically and ecologically important crops. Cynodon species with high heterozygosity are difficult to assemble, so genome research has not been actively conducted. In this study, hybrid assembly was performed by sequencing with Illumina and PacBio. As a result of the assembly, the number of scaffolds and the length of N50 were 1,392, 928 kb, respectively. The completeness of the assembly was confirmed by BSUCO at 98.3%. In addition, as a result of estimating the size of the assembled genome by K-mer analysis (k=25), it was approximately ~413 Mb. A total of 37,060 cds sequences were annotated in the assembled genome, and their functions were identified through blast. After that, we try to complete the assembled genome into a pseudochromosome-level genome through Hi-C technology. These results will not only help to understand the complex genome composition of african bermudagrass, but also provide a resource for genomic and evolutionary studies of grass and other plant species.

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WasmEdge와 다양한 런타임 및 프레임워크에서의 성능 비교 연구 (A Study on Performance Compare WasmEdge to different Runtimes, Frameworks)

  • 홍석민;이소영;신용태
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2024년도 춘계학술발표대회
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    • pp.95-98
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    • 2024
  • 현대 소프트웨어는 다양한 서비스 구조가 사용되고 있다. 이러한 환경에서는 각 서비스의 요구사항을 충족시킬 수 있는 기술들이 필요하며, Wasm(WebAssembly)은 많은 서비스에서 요구하는 조건을 만족시킬 수 있는 장점을 가지고 있다. 이에 본 논문에서는 WasmEdge와 다양한 런타임 환경의 성능을 비교하기 위해 로직 실행 시간, HTTP 부하 테스트, 컨테이너 이미지 크기의 세 가지 지표를 분석한다. 결과는 로직 실행 시간에서 Wasm이 1.81초로 가장 빨랐고, 컨테이너 이미지 크기 역시 9.54MB로 가장 작았다. 마지막으로 HTTP 부하 테스트에서는 가장 빠른 트래픽 처리를 보여준 Spring Boot의 평균 초당 15076개보다 WasmEdge가 9239개로 트래픽 처리가 느렸지만, 로직 실행 속도와 컨테이너 이미지 크기가 작기 때문에 충분히 서버리스 컴퓨팅, 마이크로 서버, 엣지 컴퓨팅 분야에서 요구하는 조건을 만족시킬 수 있다.

Oligosaccharide-Linked Acyl Carrier Protein, a Novel Transmethylase Inhibitor, from Porcine Liver Inhibits Cell Growth

  • Seo, Dong-Wan;Kim, Yong-Kee;Cho, Eun-Jung;Han, Jeung-Whan;Lee, Hoi-Young;Hong, Sungyoul;Lee, Hyang-Woo
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제25권4호
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    • pp.463-468
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    • 2002
  • We have previously reported on the identification of the endogenous transmethylation inhibitor oligosaccharide-linked acyl carrier protein (O-ACP), In this study, the role of the transmethylation reaction on cell cycle progression was evaluated using various transmethylase inhibitors, including O-ACP. O-ACP significantly inhibited the growth of various cancer cell lines, including NIH3T3, ras-transformed NIH3T3, MDA-MB-231, HT-1376, and AGS. In addition, exposure of ras-transformed NIH3T3 to O-ACP caused cell cycle arrest at the $G_0/G_1$ phase, which led to a decrease in cells at the S phase, as determined by flow cytometry. In contrast, transmethylase inhibitors did not affect the expression of $p21^{WAF1/Cip1}$, a well known inhibitor of cyclin dependent kinase, indicating that the cell cycle arrest by transmethylase inhibitors might be mediated by a $p21^{WAF1/Cip1}$-independent mechanism. Therefore, O-ACP, a novel transmethylase inhibitor, could be a useful tool for elucidating the novel role of methylation in cell proliferation and cell cycle progression.

두경부암 환자로부터 분리된 Streptococcus sp. strain NM의 유전체분석 (Draft genome sequence of Streptococcus sp. strain NM isolated from head and neck cancer patients)

  • 김영석;도경탁;박수제
    • 미생물학회지
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    • 제55권1호
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    • pp.61-63
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    • 2019
  • Firmicutes에 속하는 Streptococcus sp. strain NM을 두경부암 환자로부터 분리하였다. 본 연구에서는 약1.90 Mb의 크기와 39.3%의 평균 G+C 함량을 가진 NM 균주의 비완전한 유전체를 보고한다. 유전체는 1,845개의 코딩서열, 12개의 리보솜 RNA 및 58개의 전사 RNA유전자를 포함하였다. 본 유전체로 부터, 항생제내성, 용혈 및 방어시스템과 관련된 유전자들이 확인되었다.

에스트로겐 수용체를 통한 카드뮴 독성 및 항산화제에 의한 독성경감에 관한 연구 (Study on the Estrogen Receptor Mediated Toxicity of Cadmium and Protective Effects of Antioxidant)

  • 김태성;강태석;강호일;문현주;강일현;이영주;최은희;홍진태;한순영;홍진환
    • 한국환경성돌연변이발암원학회지
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    • 제26권1호
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    • pp.12-19
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    • 2006
  • Cadmium, a human carcinogen, can induce toxicity in various cell lines and organs. Despite extensive research, the mechanisms of cadmium-induced cell toxicity and estrogenic potential in human are not clear. This study was performed to investigate cadmium-induced toxicity on human breast cancer cells: MCF-7 cells, an estrogen receptor (ER) positive breast cancer cells, and MDA-MB-231 cells, an ER negative breast cancer cells. MCF-7 cells was proved to be more sensitive than the other cell lines (IC50 = $50\;{\mu}M$ at MCF-7 cells and $120{\mu}M$ at MDA-MB-231). The expression of JNK and AP-1 transcription factors such as c-Jun and c-Fos dependent transcription were increased by cadmium treatment. Inhibition of ER activation by ER antagonist (tamoxifen or ICI 182,780) significantly recovered the viablity and inhibited apoptotic cell death. This suggested that cadmium-induced cell death in ER (+) cells was mediated by JNK/AP-1 pathway and this pathway was more stimulated by ER activated by cadmium. Co-treatment of antioxidants such as selenium (Se), butylated hydroxyanisole (BHA), glutathione (GSH), or N-acetyl-L-cysteine (NAC) recovered the cadmium-induced cell death in MCF-7 cells. Cadmium-induced lipid peroxidation was decreased by GSH, NAC, or BHA in MCF-7 cells. The expression of SOD protein was decreased by cadmium ($100{\mu}M$) but recovered by GSH, NAC, BHA, or Se. Our data showed that the cadmium-induced cell toxicity in human breast cancer cells could be protected by the antioxidants (Se, BHA, NAC, GSH, or NAC) and ER antagonist (tamoxifen or ICI 182,780). Therefore, toxicity of cadmium in breast cancer were mediated by oxidative stress and $ER{\alpha}$.

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무인차량용 단거리 라이다 시스템을 위한 멀티채널 트랜스임피던스 증폭기 어레이 (Multi-channel Transimpedance Amplifier Arrays in Short-Range LADAR Systems for Unmanned Vehicles)

  • 장영민;김성훈;조상복;박성민
    • 전자공학회논문지
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    • 제50권12호
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    • pp.40-48
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    • 2013
  • 본 논문에서는 0.18um CMOS(1P6M) 공정을 이용하여 무인차량용 단거리 라이다 시스템을 위한 멀티채널 트랜스임피던스 증폭기(TIA) 어레이 회로를 구현하였다. 트랜스임피던스 증폭기 어레이 구조는 전압모드 $4{\times}4$ 채널 Inverter TIA 어레이와 전류모드 $4{\times}4$ 채널 Common-Gate(CG) TIA 어레이 두 가지를 설계했으며, 전체적으로 $4{\times}8$의 32-채널을 갖도록 설계하였다. 먼저, Inverter TIA는 피드백 저항을 가진 Inverter 입력구조와 CML 출력버퍼단으로 구성되어 있으며, 저잡음 및 저전력 특성뿐 아니라, virtual ground를 갖도록 설계함으로써 DC 전류조절이 가능하여 이득과 출력 임피던스 컨트롤이 가능하도록 하였다. 또한, CG-TIA는 on-chip bandgap reference로부터 bias 전압을 이용하고, 소스팔로워 출력버퍼를 사용하여 고주파수 이득을 높였으며, 기본적인 구조 상 CG-TIA는 채널당 칩 면적이 Inverter TIA에 비해 1.26배 작게 설계되었다. 포스트 레이아웃 시뮬레이션 결과, 제안한 Inverter TIA 어레이는 각 채널당 57.5-dB${\Omega}$ 트랜스임피던스 이득, 340-MHz 대역폭, 3.7-pA/sqrt(Hz) 평균 잡음전류 스펙트럼 밀도, 및 2.84-mW (16채널 45.4-mW) 전력소모를 가졌다. CG-TIA 어레이는 채널당 54.5-dB${\Omega}$ 트랜스임피던스 이득, 360-MHz 대역폭, 9.17-pA/sqrt(Hz) 평균 잡음전류 스펙트럼 밀도, 4.24-mW (16채널 67.8-mW) 전력소모를 가졌다. 단, 펄스 시뮬레이션 결과, CG-TIA 어레이가 200-500-Mb/s 동작속도에서 훨씬 깨끗하게 구분 가능한 출력펄스를 보였다.

뇌정위 방사선수술을 위한 컴퓨터 치료계획시스템의 개발 (Development of a Stereotactic Radiosurgery Planning System)

  • 조병철;오도훈;배훈식
    • 한국의학물리학회지:의학물리
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    • 제8권1호
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    • pp.17-24
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    • 1997
  • 선형가속기를 이용한 뇌정위 방사선수술을 시행하기 위하여 PC에서 실행 가능한 치료 계획시스템을 개발하였다. 128 MB RAM 용량의 Pentium Pro 200 MHz의 PC에서 Windows 95를 기반으로 하였으며, Research Systems사의 프로그램 제작 툴인 IDL을 이용하여 프로그래밍 하였다. Brown-Robert-Wells(BRW) 정위틀을 두개골에 고정한 후 전산화단층촬영을 시행하여 얻은 영상데이터를 광자기디스크를 이용하여 PC에서 입력받을 수 있도록 인터페이스를 구축하였다. 영상데이터를 입력시킨 후 각 단면영상에서의 정위틀의 위치를 자동으로 인식하고 정위좌표계를 설정하여 단변영상의 좌표, 기울어짐, 축소율 등을 정확히 계산하여 보정할 수 있다. 좌표계의 설정이 이루어지면 각 단면에서 표적 및 방사선 민감 조직들의 외곽선을 입력, 수정한다. 외곽선의 입력이 종료되면 표적의 중심이 결정되고 방사선 수술을 위한 빔의 설계한다. 빔 설계의 효율성을 위하여 Beam's eye view(BEV) 및 Room's eye view(REV)를 동시에 확인할 수 있도록 개발하였다. 빔의 설계가 끝나면 3 차원적인 선량계산을 시행한다 .5개의 arc로 설계하였을 때 선량계산에 소요되는 시간은 약 1-2 분이었다. 선량분포는 각 단면영상에서 확인할 수 있으며 표적 및 주변 방사선 민감 조직들의 Dose-Volume Histogram(DVH)을 평가하여 선량분포 및 치료계획의 합리성을 정량적으로 분석할 수 있도록 구현하였다. 기본적인 기능을 지원하는 PC 기반의 뇌정위 방사선수술을 위한 치료계획시스템으로 앞으로 임상적용이 가능할 것으로 생각된다.

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복분자(覆盆子)의 토끼 음경해면체 평활근 이완효과 (Relaxation Effects of Rubus coreanus in Isolated Rabbit Corpus Cavernosum Smooth Muscle)

  • 박선영;이평재;신선미;김호현
    • 동의생리병리학회지
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    • 제27권4호
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    • pp.400-408
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    • 2013
  • This study aimed to investigate the relaxation effects and its underlying mechanisms of Rubus coreanus(RC) extract in contracted rabbit corpus cavernous tissues by phenylephrine(PE) $1{\mu}M$. In order to define the relaxation effects of RC, rabbit corpus cavernous tissues were prepared in $2{\times}2{\times}6mm$ sized strip. The dose-dependent relaxation responses of RC at 0.01-3.0 $mg/m{\ell}$ in contracted strips induced by PE were measured and also observed after endothelial denudation. To analyze the underlying mechanisms of RC-induced relaxation, indomethacin(IM), tetraethylammonium chloride(TEA), $N{\omega}$-nitro-L-arginine (L-NNA), methylene blue(MB) were treated before RC extract infused into precontracted strips induced by PE. To study the effect of RC extract on influx of extracellular $Ca^{2+}$ in corpus cavernous strips, calcium chloride(Ca) 1 mM infused into precontracted strips induced by PE after pretreatment of RC extract in $Ca^{2+}$-free krebs-ringer solution. To investigate cytotoxic activity and nitric oxide(NO) concentration of RC extract on human umbilical vein endothelial cell(HUVEC), cell viability on HUVEC was measured by MTT assay, and NO concentration was measured by Griess reagent system. The cavernous strips were significantly relaxed by RC extract at 1.0 $mg/m{\ell}$, 3.0 $mg/m{\ell}$ and the relaxation responses to RC were inhibited significantly by endothelial disruption. The pretreatment of IM, TEA didn't affect RC extract-induced endothelium-dependent relaxation, but the pretreatment of L-NNA, MB reduced RC extract-induced endothelium-dependent relaxation. When $Ca^{2+}$ was supplied the cavernous strips which were precontracted by PE in a $Ca^{2+}$-free krebs-ringer solution, contraction of strips was increased, but pretreatment of RC inhibited contractile response to $Ca^{2+}$. When RC extract was applicated on HUVEC, NO concentration was increased. Our findings show that RC extract exerts a relaxing effect on corpus cavernosum in part by suppressing influx of extracellular $Ca^{2+}$ through activating the NO-cGMP system.

한반도주위 해양에서 의 해면 열수지와 응력의 계절변화 (Seasonal Variation of Surface heat budget and Wind Stress Over the Seas Around the Korean Peninsula)

  • 강인식;김맹기
    • 한국해양학회지
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    • 제29권4호
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    • pp.325-337
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    • 1994
  • 한반도 주변해역에서 의 해면 열속과 응력의 분포를 김과 강(1994)의 지표층 flux 모델을 사용하여 구하였고 이들의 계절변화를 조사하였다. 모델의 입력자료는 유럽중 기기상예보소 (ECMWF)의 1000mb 온도, 비습, 지오포텐샬고도와 미국기상청(NMC)의 해 수면온도 자료를 사용하였다. 자료의 공간해상도는 위도, 경도 2도이며 기간은 1984년 부터 87년까지의 3년이다. 한편, 해면의 단파복사량은 미국항공우주국 (NASA)의 인공 위성 자료를 사용하였고 잔파복사량은 경험식을 사용하여 구하였다. 모든 열속을 합한 순열속을 한반도 주변해역에서 보면, 1월과 10월에 각각 200∼400 Wm/SUP -2/와 100 Wm/SUP -2/로 해양이 냉각되고 4월과 7월에는 약 100 Wm/SUP -2/로 가열되고 있음을 알 수 있다. 한편, 연평균 순열속은 황해 북부를 제외한 전해역에서 음의 값이 나타나 고 있다. 가장 큰 냉각이 일어나는 해역은 쿠로시오 해역으로 이 지역의 연평균 값은 약 120 Wm/SUP -2/이다. 동해에서는 북부와 남부해역에서 60∼80 Wm/SUP -2/의 냉각이 일어나며 중부해역에서는 비교적 적은 30 Wm/SUP -2/ 정도의 냉각이 일어나고 있다. 한편, 1월의 응력 크기는 다른 달에 대하여 3∼5배 정도 크게 나타나고 이에 따라 연 평균응력의 분포는 1월의 형태와 유사하다. 연평균 응력컬은 동지나해와 남해에서 음 의 값이 나타나지만 황해 북부에서는 양의 값을 보인다. 동해의 응력컬은 북부와 남동 해역에서 양의 값이 그리고 북서해역에서는 음의 값이 나타나고 있다.

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셀레늄 급여원에 따른 쇠고기의 육색 안정성 비교 연구

  • 박범영;성필남;김동훈;하경희;이성훈;이종문;안종남;김완영
    • 한국축산식품학회:학술대회논문집
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    • 한국축산식품학회 2005년도 제36차 추계 학술발표대회
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    • pp.267-270
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    • 2005
  • 유기셀레늄급원을 달리하여 쇠고기 육색 안정성에 미치는 영향을 분석한 결과는 다음과 같다. Myoglobin의 함량은 대조구와 시험구에서 각각 6.39%, 14.18%로 대조구가 시험구에 비하여 낮은 결과를 보였으며, Oxy-Myoglobin의 함량은 반대로 대조구 89.07%, 시험구 83.47%로 시험구가 대조구에 비하여 낮은 결과를 보였다(p<0.05). 그러나 Met-myoglobin 함량은 대조구가 4.56%이였고 시험구가 2.35%로 대조구가 높은 결과를 보였다. 보다 정확한 결과를 평가하기 위해서는 시료를 Met화 시킨 후 측정해 볼 필요성이 대두되어 도축후 $4^{\circ}C$에서 14일 및 21일간 숙성한 시료를 $20^{\circ}C$에서 48시간 산화시킨 후 측정 육색소 화학적 조성을 비교한 결과, 육색소 화학적 조성을 비교한 결과로 Myoglobin 함량은 저장 14일차와 21일차에서 유의적인 차이를 보이지 않았으나, Oxy- myoglobin은 저장 14일차와 21일차 모두 유기셀레늄 강화 버섯 폐배지 급여구가 대조구와 무기셀레늄 급여구에 비하여 높은 결과를 보였다. Met-myoglobin함량에 있어서는 대조구와 무기셀레늄구가 유기 셀레늄구와 유기셀레늄강화 버섯 폐배지 급여구에 비하여 높은 결과를 보였다(p<0.05). 유기셀레늄 강화 버섯 폐배지 급여구가 대조구나 유기셀레늄구에 비하여 Oxy-myoglobin production이 유의적으로 높았으며, Met-myoglobin Activity는 유기 셀레늄 급여구가 가장 높았으며, 그 다음으로는 유기셀레늄강화 버섯폐배지 급여구가 높았다(p<0.05). 이러한 결과는 소매상품 으로 제조 판매시 Oxy-Mb이 Met-Mb으로의 전환을 억제하여 이상적인 육색을 장시간 유지할 수있을 것으로 판단된다.조직감과 염도에서 매우 좋게 평가되었다. 이러한 결과는 제조 가능한 식염첨가최저수준은 0.5%이상임을 보여주었다. 따라서 로인 햄의 제조에 필요로 되는 식염의 첨가량은 0.5${\sim}$1.5% 범위로 평가된다. 차후의 연구로는 저염 로인 햄의 경우 품질의 저하를 보완할 수 있는 기능성 첨가물이나 가공기법이 필요할 것으로 보인다.97.22로 가장 낮았고, 기타 처리구는 1.19${\sim}$1.59의 처리를 보이고 있는데 비하여, 대조구(100) 대비 증체율에서는 생봉독 처리 2구에서 103.30으로 3.30%가 높았다.양성이 무엇보다 중요하다. 특히 지역자원 활용 소스 중심의 문화관린 산업의 seeds 발굴과 향토상품의 상품화와 네트워크 조직망 구축을 위한 지역중심의 복합 생활문화 공간이 필요할 것이며, 이를 촉진키 위한 mentor academy시스템 접근을 통해 점점 고령화되어 가고 있는 재래시장에 대해 차별적 특성이 반영된 종합적이고 체계적 접근 방법연구가 필요하다./TEX> 자체기술개발, 선진기술 도입, 산업간 및 산업내 기술확산, 국제기술협력 ${\rightarrow}$ 기술혁신의 촉진 ${\rightarrow}$ 총요소생산성과 기업경쟁력(자원 및 역량, 프로세스 경쟁력, 품질경쟁력, 시장경쟁력, 고객성과, 시장성과, 재무성과)의 제고 ${\rightarrow}$ 가격경쟁력(임금, 금리, 물류비용, 환율 등)과 비(非)가격경쟁력(디자인, 에프터서비스, 품질, 운송 등)의 제고 ${\rightarrow}$ 국가경쟁력의 제고 ${\rightarrow}$ 국제수지 흑자 ${\rightarrow}$ 성장 ${\rightarrow}$ 물가 및

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