• 제목/요약/키워드: MDH isozyme

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Genetic Divergence between Two Marine Catfish of Family Ariidae - Arius maculatus and Osteogeneiosus militaris

  • Chaudhari, Aparna;Alam, Afaque
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제17권9호
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    • pp.1188-1191
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    • 2004
  • Two species of marine catfish, Arius maculatus and Osteogeneiosus militaris, belonging to family Ariidae were analysed electrophoretically for genetic variation in 6 enzymes, alcohol dehydrogenase (ADH), malate dehydrogenase (MDH), lactate dehydrogenase (LDH), glucose dehydrogenase (GDH), malic enzyme (ME) and superoxide dismutase (SOD). Eighteen individuals of each species were studied. Two loci MDH and ADH were polymorphic in both. Average heterozygosity in A. maculatus was 1.46, while it was 2.5 in O. militaris. The allele frequencies were used to estimate Nei's genetic distance (D). The D value was calculated to be 0.6879. Two isozyme loci, ME and SOD, were found to be the most reliable species specific markers. No tissue specific loci were observed for the enzymes studied, the bands being identical in each case. The genetic distance observed between O. militaris and A. maculatus in this study suggests that they would be more appropriately classified as species of the same genus rather than being assigned separate genera.

왕대속 3종의 지역개체군간 동위효소변이 (Isozymic Variation of Local Populations in the 3 Species of Phyllostachys)

  • 김창호;하미영;이호준
    • The Korean Journal of Ecology
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    • 제21권3호
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    • pp.301-307
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    • 1998
  • Intraspecific and interspecific isozyme variations and their relationship of 16 local populations in 3 species of Phyllostachys, that is, P. bambusoides, P. nigra var. henonis and P. pubescens were investigated by multi-variate analysis. Leaf isozymes of Phyllostachys such as 6-PGD (6-phosphogluconate dehydrogenase), MDH (malate dehydrogenase), PGI (phosphoglucoisomerase), PRX (peroxidase), PGM (phosphoglutamase), IDH (isocitrate dehydrogenase) showed electrophoretic variations in the number of zymotypes (7, 6, 6, 9, 3 and 5, respectively). In the cluster analysis on the isozymic characteristics, 16 populations were classified into 3 species at the euclid genetic distance of 2.041. P. nigra var. henonis and P. bambusoides were clustered first at 2.813 and then P. pubescens at 3.001. So far, 3 local types of intraspecific ariation were found in P. nigra var. henonis and P. bambusoides.

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일본 해역에 서식하고 있는 도다리, Pleuronichthys cornutus, 2형간의 유전적 분기 (Genetic Divergence of Two Types of Finespotted Flounder, Pleuronichthys cornutus, Distributed in the Japan Sea Area)

  • 박중연;목도명박;강용주
    • 한국수산과학회지
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    • 제27권3호
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    • pp.306-313
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    • 1994
  • 일본에서 상업적으로 중요한 어종 중의 하나인 도다리 2형간 유전적 분기의 정도를 측정하기 위하여 전분 gel 전기영동법에 의한 isozyme분석을 행하였다. 도다리 2형간에 있어서 14종의 효소를 지배하는 22유전자좌가 검출되었으며 2형간에 있어서 공통의 대림유전자를 가지고 있지 않은 완전분기는 3유전자좌(Acp, Idh-2 및 Mdh-2)에서 관찰되었다. 2형간에 있어서 측정된 Nei의 유전적거리는 0.46592이었으며 2형간에 있어서 유전적 변이성의 차이를 나타내는 평균 이형 접합체율의 기대치는 A type에서 0.120, B type에서는 0.095로 나타났다. 이상의 결과로부터 2형간에 있어서 유전적으로 상호 분기되어 있었으며 그들의 분기 년도는 대략 $2.3{\times}10^6$년 전으로 추정된다.

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Isozyme electrophoresis patterns of the liver fluke, Clonorchis sinensis from Kimhae, Korea and from Shenyang, China

  • Park, Gab-Man;Yong, Tai-Woon;Im, Kyung-Il;Lee, Kyu-Je
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제38권1호
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    • pp.45-48
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    • 2000
  • An enzyme analysis of the liver fluke, Clonorchis sinensis from Kimhae, Korea and from Shenyang, China was conducted using a horizontal. starch gel electrophoresis in order to elucidate their genetic relationships. A total of eight enzymes was employed from two different kinds of buffer systems. Two loci from each enzyme of aconitase and esterase (${\alpha}-Na{\;}and{\;}{\beta}-Na$) : and only one locus each from six enzymes, gluucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD), ${\alpha}-glycerophosphate$ dehydrogenase (GPD), 3-hydroxybutyrate dehydrogenase (HBDH), malate dehydrogenase (MDH), phosphoglucose isomerase (PGI), and phosphoglucomutase (PGM) were detected. Most of loci in two populations of C. sinensis showed homozygous monomorphic banding patterns and one of them, GPD was specific as genetic markers between two different populations. However, esterase (${\alpha}-Na$), GPD, HBDH and PGI loci showed polymorphic banding patterns. Two populations of C. sinensis were more closely clustered within the range of genetic identity value of 0.998-1.0. In summarizing the above results, two populations of C. sinensis employed in this study showed mostly monomorphic enzyme protein banding patterns, and genetic differences specific between two populations.

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한국산 논우렁이과 ( Family Viviparidae ) 2종에서의 동위효소 변이 (Isozyme Variability in Two Species of Freshwater Viviparid Snails in Korea : Cipangopaludina chinensis malleata and C. Japonica)

  • 정평림;정영헌;박준우;정기헌
    • 한국패류학회지
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    • 제14권1호
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    • pp.33-40
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    • 1998
  • A horizontal starch gel electrophoresis for enzyme proteins extracted from 2 species of Korean viviparid snails; Cipangopaludina chinensis malleata and C. japonica was carried out in order to elucidate their genetic relationships. A total of 10 enzymes were employed in three different kinds of buffer systems. Two loci from each enzyme of alcohol dehydrogenase, esterase, glucose phosphate isomerase, isocitrate dehydrogenase, iditol dehydrogenase, malate dehydrogenase and peptidase(VL); and only one locus dach from two enzymes, glycerlo-3-phosphate dehydrogenase and phosphoglucomutase were detected; but, four loci from peptidase(LGG) were observed. Most of loci in two viviparid species showed homozygous monomorphic banding patterns and some of them were specific as genetic markers between two different species. However, EST-1, MDH-1, PEP(VL)-1loci showed polymorphic banding patterns. Foru populations of C. chinensis malleata were more closely clustered in a dendrogram within the range of genetic identity values of 0.928-1.00, and these clusters were lineated with C. japonica at the value of 0.355. In summarizing the above results, two viviparid snail species dmployed in this study mostly showed monomorphic enzyme protein banding patterns, and genetic differences specific between two species.

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만손열두조충에서 젖산탈수소효소와 말산탈수소효소의 분포와 특징 (Localization and characteristics of lactate and palate dehydrogenase in the sparganum and adult worm of Spirometra erinacei)

  • 곽기훈;전은우;김창환
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제34권1호
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    • pp.59-68
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    • 1996
  • 만손열두조충의 스파르가눔(흰쥐에서 적출한 r-스파르가눔, 뱀에서 적출한 s-스파르가눔)과 성충을 재료로 하여 젖산탈수소효소와 말산탈수소효소의 조직내 분포 및 동위효소의 특징을 효소조직화학적 방법과 전기영동뎁으로 조사하였다. LDH와 WH는 외피하근층에서 강한 활성이 나타났으며, 실질조직(parenchyma)에서는 약하게 나타났다. 그러나 nH는 스파르가눔의 외피조직 에서도 활성이 나타났으나 성충의 외피조직에는 나타나지 않았다. LDH의 동위효소 유형은 5-스파르가눔, s-스파르가눔과 성충에서 각각 2개, 4개, 2개가 분리되었고, 45 kDa의 분회이 공통적으로 주분획이었으며 sinH의 동위효소는 5-스파르가눔, r-스파르가눔과 성충에서 각각 2개, 3개 4개의 분획이 분리되었고, IEF에 의해 성충에 존재하는 4개의 tmH 동위효소 분획의 등전점(Pl)은 각각 6.0, 6.5, 6.7, 7.1이었으며, 이 중 6.0이 주분획이었다. 또 최적 pH는 7이나 활성 범위가 pH 6 ~8이었고. 최적온도는 $40^{\circ}C$였으며, $50^{\circ}C$ 이상에서는 활성이 급격히 감소하였다 mH의 최적 활성도는 s-스파르가눔, r-스파르가눔과 성충에서 각각 19.4, 24.5, 108.0이었다. 위의 결과로 보아, 외피하근층으로 흡수된 양분은 충체 중앙으로 이동하면서 산화분해되며 유충에 비해 성충에서 물질 대사가 활발함을 알 수 있고, 또한 만손열두조충의 스파르가눔과 성충이 숙주와 기생 장소를 달리하지만 기생 환경에 따라 젖산탈수소효소와 말산탈수소효소의 동위효소들이 활성을 달리하므로써 숙주 환경에 적응한다는 사실을 알 수 있다.

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Genetic Studies of Oenothera odorata Populations in Korea Based on Isozyme Analysis

  • Huh, Hong-Wook
    • Journal of Plant Biology
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    • 제39권3호
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    • pp.223-229
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    • 1996
  • The genetic variation in Korean evening primorse (Oeothera odorata L.) populations was examiend to estimate the level of allozyme variation within populatons using starch gel electrophoresis. 7 of 13 loci (Adh, Est-1, Est-2, Mdh-2, Pgd-2, Pgm-1, and Idh) revealed (Ps=43.2%) were polymorphic. The mean number of alleles per locus (A) and polymorphic locus (Ap) for populations were 1.64 and 2.46, respectively. The effective number of alleles (Aep) within populations relatively was low ranging from 1.08 to 1.22 with a mean of 1.14. Within populations, the mean number of allele per polymorphic loci (Ap) was 2.46, the mean number of alleles per locus (A) was 1.64, and the mean genetic diversity was 0.093. About 2.7% of the total allozyme diversity resided among populations (Mean GST=0.0274). FIS, a measure of the deviation from random mating within 13 populations, was relative low (mean FIS=0.03636). The indirect estimate of gene flow, based on the mean GST, was high (Nm=8.88). Estimates of gene flow were consistent with low levels of genetic differentiation among populations.

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갈겨니(Zacco temmincki)의 진화에 관한 연구 IV. 유전적 변이, 형태비교 및 인공교배 (Evolutionary Study on the Dark Chub (Zacco temmincki) IV. Genetic Variation, Morphology and Artificial Hybridization)

  • 양서영;민미숙
    • 한국동물학회지
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    • 제30권4호
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    • pp.417-431
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    • 1987
  • Isozyme analysis, morphometric comparison, and artificial hybridization test wereperformed to elucidate the patterns of genic variation, morphological differentiation, genetic incompatibility, and a probable path in speciation between two MDH allelotypes (MM type and MS type) of the Dark Chub Zacco temmincki, a fresh water fish inhabiting in Korean waters. The degree of genic variation of MS type(HD=.023, HG=.021) was twofold higher than that of MM type (HD=.013, HG=.014) but both allelotypes were far less than the average genic variation of fresh water Bish in general. The average genetic similarities among 7 populations of MM type and 6 Populations of MS type were S=.947 and S=.966 respectively, whereas the value between two allelotypes was S=.853. Presumed divergent time of two allelotypes was estimated to be about 700 thousand years ago. Discriminant function analysis based on 18 morphometric characters of 302 specimens representing 12 populations revealed no morphological difference between two allelotypes. Artificial hybridization test indicates that there is an obvious genetic incogpatibility between two allelotypes and therefore it is assumed that isolating mechanism is completed.

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오존 노출에 의한 층층나무의 유전특성 변화 (Genetic Changes of Cornus controversa with Ozone Exposure)

  • 장석성;이석우;이재천;한심희;김홍은
    • 한국농림기상학회지
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    • 제5권4호
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    • pp.226-232
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    • 2003
  • 도심지 주요 대기 오염원 가운데 하나인 오존이 층층나무의 유전구조에 미치는 영향을 조사하기 위하여 오존 처리에 대해서 생장이 건강한 내성 그룹과 피해가 심한 감수성 그룹을 선발한 후 동위효소 분석에 의한 유전구조를 비교하였다. 두 그룹간 유전구조의 차이는 5개 다형적 유전자좌에서 관측된 대립유전자 빈도 및 유전자정 빈도의 비교에 의해서 이루어졌다. 분석 결과 3개 유전자좌(Lap-2, Mdh-1, Skdh-1)에서 두 그룹간에 통계적으로 유의한 차이가 관측되었다. 내성그룹의 경우 유전적 다수도, 유전적 다양도, 이형접합도 등 유전적 다양성을 추정하기 위한 모든 통계치에서 감수성 그룹에 비해 높은 값을 나타냈다. 본 연구 결과는 유전적으로 다양한 개체 또는 집단이 그렇지 않은 개체나 집단에 비해서 환경 스트레스에 대해 저항성이 크다는 일반적인 가설에 잘 부합하는 것으로 나타났다.

양배추 protoclone의 변이 (Protoclonal variation in cabbage (Brassica oleracea ssp. capitata))

  • 이연희;조현석;김호일;나종현;이인원
    • 식물조직배양학회지
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    • 제24권3호
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    • pp.175-181
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    • 1997
  • 양배추 F$_1$ 종자 그린 챌린저 배축으로부터 분리된 원형질체로부터 재분화된 protoclone들에 대한 형태적 특성, 배수성, 동위효소, RAPD 분석으로 변이 양상을 살펴보았다. 형태적 특성은 초자, 엽형, 엽색, 엽결각, savoy, wave등을 조사한 결과 대부분이 형태적으로 원식물체와 같았으나 3개체는 잎의 결각이 뚜렷하고 1개체는 savoy와 wave가 심하게 나타났다. Flow cytometry system으로 종자에서 정상적으로 발아한 배축, 자엽과 잎의 배수성을 측정한 결과 배측과 자엽에서는 2배체와 4배체 세포가 혼합되어 있었으나 잎에서는 일정하게 정상적인 2배체로 측정되었다. 잎을 재료로 하여 125개체 protoclone들의 배수성을 본 결과 2배체 91개체(72.8%), 4배체 32개체(25.6%), 혼합배수체 2개체(1.6%)로 나타났다. 또한 4배체를 나타내는 R$_{0}$ protoclone 개체를 자가수분시켜 얻은 종자를 발아시켜 배축, 자엽과 잎의 배수성을 측정한 결과 잎에서 4배체, 배축과 자엽에서는 4배체, 8배체 세포가 혼합되어 있었다. PGM과 MDH 동위효소 분석 결과 R$_{0}$ 정상개체 그리고 변이를 나타낸 개체, 배수성이 다른 개체들간의 밴드양상은 같았으며 15종류의 random primer를 사용한 RAPD에서도 차이는 없었다.없었다.

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