• BMB Reports
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• 제32권4호
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• pp.414-418
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• 1999

A novel gene for malonyl-CoA decarboxylase was discovered in the mat operon, which encodes a set of genes involved in the malonate metabolism of Rhizobium trifolii (An and Kim, 1998). The subunit mass determined by SDS-PAGE was 53 kDa, which correspond to the deduced mass from the sequence data. The molecular mass of the native enzyme determined by field flow fractionation was 208 kDa, indicating that R. trifolii malonyl-CoA decarboxylase is homotetrameric. R. trifolii malonyl-CoA decarboxylase converted malonyl-CoA to acetyl-CoA with a specific activity of 100 unit/mg protein. Methylmalonyl-CoA was decarboxylated with a specific activity of 0.1 unit/mg protein. p-Chloromercuribenzoate inhibited this enzyme activity, suggesting that thiol group(s) is(are) essential for this enzyme catalysis. Database analysis showed that malonyl-CoA decarboxylase from R. trifolii shared 32.7% and 28.1% identity in amino acid sequence with those from goose and human, respectively, and it would be located in the cytoplasm. However, there is no sequence homology between this enzyme and that from Saccharopolyspora erythreus, suggesting that malonyl-CoA decarboxylases from human, goose, and R. trifolii are in the same class, whereas that from S. erythreus is in a different class or even a different enzyme, methylmalonyl-CoA decarboxylase. According to the homology analysis, Cys-214 among three cysteine residues in the enzyme was found in the homologous region, suggesting that the cysteine was located at or near the active site and plays a critical role in catalysis.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제19권10호
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• pp.1399-1403
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• 2006

A total of 80 cows, including 40 top mastitis resistant and 40 top mastitis susceptible animals as Group I and Group II, were selected from a population of 520 cows based on clinical mastitis occurrence. PCR-SSCP analysis on four fragments within the 5'region and two fragments of Exons 4,15 of bovine lactoferrin (bLF) revealed that four fragments-P1,P4,E4,E15-had polymorphisms which totally included six base mutations, and only two of them had significant differences in allele frequencies between resistant and susceptible groups, P1 (53.7% vs. 70.0%, p<0.05) and P4 (55.0% vs. 68.8%, p<0.05). Further study on these two promising markers combined with the milk performance traits of cows demonstrated that their selection would result in higher fat percentage (p<0.05), lower Somatic Cell Score (SCS) (p<0.05) and Clinical Mastitis Residuals (CMR) (p<0.01) indicating higher mastitis resistance and lower milk yield (p<0.05). The putative transcription factor binding sites in the 5'region were also studied by using MatInspector 7.2.2 software, and two signal pathways regulating the expression of bLF including the NF-${\kappa}B$ pathway and nuclear hormone receptor pathway were predicted.

• 한국자원식물학회:학술대회논문집
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• 한국자원식물학회 2019년도 춘계학술대회
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• pp.71-71
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• 2019

The genus Cenchrus (Poaceae), containing ca. 23 species, is distributed throughout Australia, Africa, Indian sub-continent, and America. In Korea, Cenchrus longispinus (Hack.) Fernald, especially introduced to Daecheong Island in 1999, is one of the most hazardous invasive plant which causes serious environmental threats, biodiversity damages and physically negative impact on humans and animals. Based on the next-generation sequencing (NGS) technology, we characterized the chloroplast (cp) genome sequences of C. longispinus which contains a large single copy (LSC; 80,223 bp), a small single copy (SSC; 12,449 bp), separated by a pair of inverted repeats (IRs; 22,236 bp). Additionally, we analyzed the cp genome sequences of Cenchrus echinatus L. which contains a large single copy (LSC; 80,220 bp), a small single copy (SSC; 12,439 bp), separated by a pair of inverted repeats (IRs; 22,236 bp). These cp genomes consist of 75 unique genes, 4 rRNA coding genes, 33 tRNA coding genes and 21 duplicated in the IR regions, of which the gene content and organization are similar to the other Poaceae cp genomes. We selected 40 potential regions in cp genomes of two Cenchrus species and one Korean Pennisetum species to develop new single nucleotide polymorphism (SNP) markers for identifying C. longispinus based on amplification-refractory mutation system (ARMS) technique. The markers, inferred from SNP in matK and ndhF genes, show effectiveness to recognize C. longispinus from C. echinatus and Korean native species Pennisetum alopecuroides (L.) Spreng.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제34권9호
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• pp.1877-1889
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• 2024

Rhamnolipid (RL) is renowned for its efficacy in bioremediating several types of organic and metal contaminants. Nevertheless, there has been a scarcity of studies specifically examining the relationship between this substance and metals, especially in terms of their impact on RL formation and the underlying interaction processes. This study addresses this gap by investigating the RL mechanism in Cr (VI) remediation and evaluating its effect on RL production in Pseudomonas aeruginosa RW9. In this study, P. aeruginosa RW9 was grown in the presence of 10 mg l^-1 Cr (VI). We monitored RL yield, congeners distribution, and their ratios, as well as the transcriptional expression of the RL-encoded genes: rhlA, rhlB, and rhlC. Our results revealed that RL effectively reduced Cr (VI) to Cr (III), with RL yield increasing threefold, although with a slight delay in synthesis compared to control cells. Furthermore, Cr (VI) exposure induced the transcriptional expression of the targeted genes, leading to a significant increase in di-RL production. The findings confirm that Cr (VI) significantly impacts RL production, altering its structural compositions and enhancing the transcriptional expression of RL-encoded genes in P. aeruginosa RW9. This study represents a novel exploration of Cr (VI)'s influence on RL production, providing valuable insights into the biochemical pathways involved and supporting the potential of RL in Cr (VI) bioremediation.

• 한국작물학회지
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• 제4권1호
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• pp.115-124
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• 1968

1. 양마의 섬유중 단일반응성 엽형 경색 엽병색 삭과색에 관한 제형질에 대하여 개개의 질적형질의 유전 및 그들의 연소를 연구하였다. 량적형질의 유전은 통계유전학적방법을 이용하여 유전인자분석을 하였다. 또 이들 양적형질의 질적형질과의 연소 및 양적형질상호간의 연소를 조사하여 얻어진 지견을 응용하여 선발의 효과를 높이려고 하였다. 2. 본실험에는 양마의 품종 Dashkent, G38F-1의 1교잡을 사용하였다. Dshkent는 우리나라 재래품종으로 경색은 녹색이고 열핵엽형 녹색엽병색 개화일수는 10시간 단일처리하에서 106.9222일이고 호외 포장조건에서 105.8234일이었고 개체당 섬유중은 26.4922 gr였다. G38F-1은 Guatemala에서 도입하여 계통선발된 품종로서 적색경 수원엽형 적색엽병색 개화일수는 10시간단일처리하에서 62.3784일이고 호외포장조건에서 148.8921일였고 개체당 섬유중은 37.1591 gr.였다. 본교잡에 사용된 실험재료는 P, $P_2$, $F_2$, $F_2$, $BC_1$,($F_2$ ${\times}$ Dashkent), $BC_2$($F_2$ ${\times}$ G38F-1)의 각집단이며 1965년 수원작물시험장 포장에 재식하였다. 3. 엽형 엽병색 경색 삭과색 등 제형질의 유전은 수원엽형 녹색엽병 녹색경 녹색삭과등의 제인자가 단인자로서 그의 대립형질인 열각엽형 적색엽병 적색경 황색삭과에 대하여 각각 열성으로서 3:1의 Mendel성단순분리비를 나타내었다. 또 $F_1$과 열성형질과의 여교잡은 각각 1:1의 분리비가 인정되었다. 엽병색(G)과 엽형유전자(L)와의 조환가는 11.9565의 상인연소현상을 보였다. 삭과색(Y) 경색(R) 유전자간에는 어느것이나 연소현상이 보이지 않았다. 4. 단일반응성의 변이는 연소적이며 우성은 거의 인정되지 않았고 인자간의 상호작용도 인정되지 않았으며 상가적 유전을 보였다. 광의와 협의의 유전력은 각각 89.50%로서 실용적으로 대단히 높은 것으로 생각되었으며 단일반응성에 관여하는 유전자수는 2대의 인자로 추정하였고 다시 양친의 유전자형을 aabb AABB라고 측정하여 각인자의 작용가는 11.136일로 산출되었고 분해법에 의한 유전분석결과 유전자형의 관찰빈도분포와 이론빈도분포는 서로 잘 적합되었다. 단일반응성에 있어서 유전력이 대단히 높았으므로 비교적 초기세대에서 본 형질의 선발이 가능할 것 같았다. 5. 단일반응성과 엽형 및 엽병색 유전자와의 사이에 $F_2$, $BC_1$ 및 $BC_2$에서 각각 유의적인 상관관계를 볼 수 있었으므로 이들 형질간에 연소가 있는 것으로 인정되었다. 더욱 엽형과 엽병색과의 연소가 있는 것으로 인정되는 이상단일반응성 유전자와의 사이에 연소군이 인정된다. 6. 섬유중 유전자와 엽병색 및 엽형유전자와의 사이에 $F_2$$BC_1$ 및 $BC_2$에서 각각 유의적 상관관계를 볼 수 있었으므로 이를 형질간에 연소가 있는 것으로 인정되었다. 더욱 엽형과 엽병색과의 연소가 있는 것으로 인정되는 이상 섬유중 유전자와의 사이에 연소군이 인정된다. 7. 경장 경경 개화일수와 주당섬유중의 유전상관과 표현형상관에 있어서 전반적으로 표현형상관보다도 유전상관의 절대치가 크게되는 경향을 나타내었으며 식물체의 크기에 가장 밀접한 관계가 있는 경장 개화일수와 섬유중 형질상호간의 상관이 높은 치를 보였다. 8. 이상의 유전분석 결과 엽형 및 엽병색과 단일반응성경장 섬유중 형질간에는 연소 혹은 다면발현(pleiotropic effect)이 관여하는 것으로 이해하드라도 대과없는 것으로 생각되었고 양마에 있어서 고섬유중을 위한 선발은 엽병색 및 경장의 선발과 엽형 및 개화일수로서 선발을 함께 하면 그 효율이 높아질 것으로 믿어졌다.

• Current Research on Agriculture and Life Sciences
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• 제3권
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• pp.158-165
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• 1985

본(本) 연구(硏究)는 mouse의 육종(育種) 개량(改良)에 필요(必要)한 기초자료(基礎資料)를 얻기 위하여 mouse 4계통(系統) (BALB/c, CBA, C3H, C57-BL)을 양면교잡(兩面交雜)시켜 생산(生産)된 362두(頭)를 공시(供試)하여 평균능력(平均能力), 잡종강세(雜種强勢), 유전변이(遺傳變異) 등(等)을 추정(推定)한 것이다. 공시(供試)된 mouse는 1984년(年) 11월(月)부터 1985년(年) 2월(月)까지 4개월간(個月間) 경북대학교(慶北大學校) 농과대학(農科大學) 부속동물사육장(附屬動物飼育場)에서 사육(飼育)되었으며, 산자수(産仔數), 성비(性比), 생시체중 및 21일령(日齡) 체중과 이유율(離乳率) 등(等)을 조사(調査)하였고 각(各) 형질(形質)에 대(對)한 유전분석(遺傳分析)은 Hayman(1954a, 1954b)의 모형(模型)을 이용(利用)하여 유전변이(遺傳變異)를 추정(推定)하였는데 그 결과(結果)를 요약(要約)하면 다음과 같다. 1. 평균능력(平均能力)에 있어서 산자수(産仔數)는 7.54두(頭), 생시(生時) 체중은 1.55g, 21 일령(日齡), 체중은 10.45g, 성비(性比)는 수컷이 53.2%로 많았으며, 전체 이유율(離乳率)은 94.13%로 나타났다. 2. 잡종강세(雜種强勢)의 크기는 산자수(産仔數)에서 6.97%, 생시(生時) 체중에서 6.08% 및 21 일령((日齡) 체중에서는 3.54%로, 성비(性比)는 7.26% 그리고 이유율(離乳率)에서는 2.05%로 나타났다. 3. 산자수(産仔數), 성비(性比), 생시(生時) 체중, 이유시(離乳時) 체중 및 이유율(離乳率) 등(等)의 형질(形質)에 있어서 상가적(相加的) 유전자(遺傳子)의 효과(效果)는 인정(認定)되지 않았다. 우성(優性) 효과(效果)는 산자수(産仔數)와 이유시(離乳時) 체중에서만 나타났는데 산자수(産仔數)에서는 각(各) 교배조합(交配組合)에 따른 우성효과(優性效果)였고 이유시(離乳時) 체중에 있어서는 parental 계통(系統)의 평균(平均) 우성효과(優性效果)였다. 모체효과(母體效果)는 생시(生時) 체중과 이유시(離乳時) 체중에서만 나타났고, 이유시(離乳時) 체중에 있어서는 상반교잡(相反交雜) 효과(效果)도 인정(認定)되었다.